HTATSF1 - HTATSF1 - Wikipedia

HTATSF1
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	2DIT
Identifikátory
Aliasy	HTATSF1, TAT-SF1, TATSF1, dJ196E23.2, HIV-1 Tat specifický faktor 1
Externí ID	OMIM: 300346 MGI: 1919709 HomoloGene: 40950 Genové karty: HTATSF1
Umístění genu (člověk)
Chr.	X chromozom (lidský)
Konec	136,512,346 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	X chromozom (myš)
Konec	57,067,183 bp
Exprese RNA vzor
	; ;
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• vazba nukleové kyseliny; • Vazba RNA;
Buněčná složka	• Spliceozomální komplex typu U2; • buněčné jádro; • U2 snRNP; • nukleoplazma;
Biologický proces	• regulace transkripce z promotoru RNA polymerázy II; • virová replikace; • regulace transkripce templátované DNA, prodloužení; • regulace transkripce, DNA-šablony; • transkripce, chráněná DNA; • Sestřih mRNA prostřednictvím spliceosomu;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	27336
	72459
	ENSG00000102241
	ENSMUSG00000067873
	O43719
	Q8BGC0
	NM_001163280; NM_014500
	NM_028242; NM_029371
	NP_001156752; NP_055315
	NP_082518; NP_083647
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Faktor specifický pro HIV 1 je protein že u lidí je kódován HTATSF1 gen.^[5]^[6]

Zatímco většina transkripčních faktorů specifických pro sekvenci DNA zvyšuje rychlost iniciace a interaguje s enhancerovou nebo promotorovou DNA, virus lidské imunodeficience-1 (HIV-1) Tat převážně stimuluje prodloužení a interaguje s transkripčně reagujícím (TAR) RNA prvkem. Tat je nezbytný pro replikaci HIV. [Dodává OMIM]^[6]

Interakce

HTATSF1 bylo prokázáno komunikovat s SUPT5H^[7] a GTF2F2.^[7]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000102241 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000067873 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Zhou Q, Sharp PA (listopad 1996). „Tat-SF1: kofaktor pro stimulaci transkripčního prodloužení HIV-1 Tat“. Věda. 274 (5287): 605–10. Bibcode:1996Sci ... 274..605Z. doi:10.1126 / science.274.5287.605. PMID 8849451.
^ ^A ^b „Entrez Gene: HTATSF1 HIV-1 Tat specific factor 1“.
^ ^A ^b Kim, JB; Yamaguchi Y; Wada T; Handa H; Sharp PA (září 1999). „Protein Tat-SF1 se asociuje s proteiny RAP30 a lidskými proteiny SPT5“. Mol. Buňka. Biol. 19 (9): 5960–8. doi:10,1128 / mcb.19,9.5960. ISSN 0270-7306. PMC 84462. PMID 10454543.

Další čtení

Maruyama K, Sugano S (1994). „Oligo-capping: jednoduchá metoda k nahrazení struktury cap eukaryotických mRNA oligoribonukleotidy“. Gen. 138 (1–2): 171–4. doi:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID 8125298.
Suzuki Y, Yoshitomo-Nakagawa K, Maruyama K a kol. (1997). "Konstrukce a charakterizace knihovny cDNA obohacené o celou délku a 5'-end". Gen. 200 (1–2): 149–56. doi:10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3. PMID 9373149.
Zhou Q, Chen D, Pierstorff E, Luo K (1998). „Faktor pro prodloužení transkripce P-TEFb zprostředkovává Tat aktivaci transkripce HIV-1 v několika fázích“. EMBO J.. 17 (13): 3681–91. doi:10.1093 / emboj / 17.13.3681. PMC 1170704. PMID 9649438.
Yan D, Perriman R, Igel H a kol. (1998). „CUS2, kvasinkový homolog lidského Tat-SF1, zachraňuje funkci nesprávně složeného U2 neobvyklým motivem rozpoznávání RNA“. Mol. Buňka. Biol. 18 (9): 5000–9. doi:10.1128 / MCB.18.9.5000. PMC 109085. PMID 9710584.
Li XY, Green MR (1998). „Buněčný koaktivátor Tat-SF1 HIV-1 Tat je obecným faktorem prodloužení transkripce“. Genes Dev. 12 (19): 2992–6. doi:10.1101 / gad.12.19.2992. PMC 317190. PMID 9765201.
Parada CA, Roeder RG (1999). „Nový komplex obsahující RNA polymerázu II umocňuje transkripci HIV-1 se zvýšenou Tat“. EMBO J.. 18 (13): 3688–701. doi:10.1093 / emboj / 18.13.3688. PMC 1171446. PMID 10393184.
Kim JB, Yamaguchi Y, Wada T a kol. (1999). „Protein Tat-SF1 se asociuje s proteiny RAP30 a lidskými proteiny SPT5“. Mol. Buňka. Biol. 19 (9): 5960–8. doi:10,1128 / mcb.19,9.5960. PMC 84462. PMID 10454543.
Fong YW, Zhou Q (2000). „Pro sestavení vícesložkového komplexu pro prodlužování transkripce na promotoru viru lidské imunodeficience typu 1 je vyžadována úleva od dvou zabudovaných autoinhibičních mechanismů v P-TEFb“. Mol. Buňka. Biol. 20 (16): 5897–907. doi:10.1128 / MCB.20.16.5897-5907.2000. PMC 86067. PMID 10913173.
Suñé C, Goldstrohm AC, Peng J a kol. (2000). „In vitro transkripční systém, který rekapituluje koňskou infekční anemii způsobenou tatem inhibici aktivity Tat viru lidské imunodeficience typu 1, demonstruje roli pozitivního transkripčního elongačního faktoru b a souvisejících proteinů v mechanismu aktivace Tat“. Virologie. 274 (2): 356–66. doi:10.1006 / viro.2000.0480. PMID 10964778.
Simmons A, Aluvihare V, McMichael A (2001). „Nef spouští transkripční program v T buňkách imitujících aktivaci T-buněk s jedním signálem a indukujících mediátory virulence HIV“. Imunita. 14 (6): 763–77. doi:10.1016 / S1074-7613 (01) 00158-3. PMID 11420046.
Fong YW, Zhou Q (2002). "Stimulační účinek spojovacích faktorů na transkripční prodloužení". Příroda. 414 (6866): 929–33. doi:10.1038 / 414929a. PMID 11780068.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH a kol. (2003). „Generování a počáteční analýza více než 15 000 lidských a myších cDNA sekvencí plné délky“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (26): 16899–903. Bibcode:2002PNAS ... 9916899M. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
Zhou BY, He JJ (2004). „Inhibice šíření astrocytů, neuronů a negliálních buněk intracelulárně exprimovaným proteinem Tat typu 1 (HIV-1) viru lidské imunodeficience“. Neurosci. Lett. 359 (3): 155–8. doi:10.1016 / j.neulet.2004.02.012. PMID 15050687.
Ballif BA, Villén J, Beausoleil SA a kol. (2005). „Fosfoproteomická analýza vyvíjejícího se myšího mozku“. Mol. Buňka. Proteomika. 3 (11): 1093–101. doi:10,1074 / mcp.M400085-MCP200. PMID 15345747.
Smith MJ, Kulkarni S, Pawson T (2004). „FF domény CA150 váží transkripční a sestřihové faktory prostřednictvím několika slabých interakcí“. Mol. Buňka. Biol. 24 (21): 9274–85. doi:10.1128 / MCB.24.21.9274-9285.2004. PMC 522232. PMID 15485897.
Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA a kol. (2004). „Stav, kvalita a rozšíření projektu cDNA NIH v plné délce: Mammalian Gene Collection (MGC)“. Genome Res. 14 (10B): 2121–7. doi:10,1101 / gr. 2596504. PMC 528928. PMID 15489334.
Zhou M, Deng L, Lacoste V, et al. (2004). „Koordinace fosforylace transkripčního faktoru a methylace histonu kinázou P-TEFb během transkripce viru lidské imunodeficience typu 1“. J. Virol. 78 (24): 13522–33. doi:10.1128 / JVI.78.24.13522-13533.2004. PMC 533906. PMID 15564463.
Ross MT, Grafham DV, Coffey AJ a kol. (2005). „Sekvence DNA lidského chromozomu X“. Příroda. 434 (7031): 325–37. Bibcode:2005 Natur.434..325R. doi:10.1038 / nature03440. PMC 2665286. PMID 15772651.
Missé D, Gajardo J, Oblet C a kol. (2005). „Rozpustný HIV-1 gp120 zvyšuje replikaci HIV-1 v nedělících se CD4 + T buňkách zprostředkovaných buněčnou signalizací a nadměrnou expresí kofaktoru Tat“. AIDS. 19 (9): 897–905. doi:10.1097 / 01.aids.0000171403.07995,92. PMID 15905670.

Tento článek o gen na člověka X chromozom a / nebo související protein je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000102241 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000067873 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid8849451-5] Zhou Q, Sharp PA (listopad 1996). „Tat-SF1: kofaktor pro stimulaci transkripčního prodloužení HIV-1 Tat“. Věda. 274 (5287): 605–10. Bibcode:1996Sci ... 274..605Z. doi:10.1126 / science.274.5287.605. PMID 8849451.

[entrez-6] A ^b „Entrez Gene: HTATSF1 HIV-1 Tat specific factor 1“.

[pmid10454543-7] A ^b Kim, JB; Yamaguchi Y; Wada T; Handa H; Sharp PA (září 1999). „Protein Tat-SF1 se asociuje s proteiny RAP30 a lidskými proteiny SPT5“. Mol. Buňka. Biol. 19 (9): 5960–8. doi:10,1128 / mcb.19,9.5960. ISSN 0270-7306. PMC 84462. PMID 10454543.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]