HS3ST1 - HS3ST1

HS3ST1
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	1ZRH
Identifikátory
Aliasy	HS3ST1, 3OST, 3OST1, heparan sulfát-glukosamin 3-sulfotransferáza 1
Externí ID	OMIM: 603244 MGI: 1201606 HomoloGene: 3751 Genové karty: HS3ST1
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 4 (lidský)
Konec	11,429,564 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 5 (myš)
Konec	39,755,475 bp
Exprese RNA vzor
	; ;
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• aktivita transferázy; • aktivita sulfotransferázy; • [heparan sulfát -glukosamin 3-sulfotransferáza 1 aktivita]; • aktivita heparan sulfát sulfotransferázy;
Buněčná složka	• Golgiho lumen; • integrální součást membrány; • Golgiho aparát;
Biologický proces	• proces biosyntézy glykosaminoglykanu; • proces biosyntézy heparansulfátu proteoglykanu;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	9957
	15476
	ENSG00000002587
	ENSMUSG00000051022
	O14792
	O35310
	NM_005114
	NM_010474
	NP_005105
	NP_034604
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Heparan sulfát glukosamin 3-O-sulfotransferáza 1 je enzym že u lidí je kódován HS3ST1 gen.^[5]^[6]

Funkce

Heparan sulfát biosyntetické enzymy jsou klíčovými složkami při generování nesčetných odlišností jemných struktur heparan sulfátu, které provádějí řadu biologických aktivit. Enzym kódovaný tímto genem je členem rodiny biosyntetických enzymů heparan sulfátu. Má jak aktivitu heparan sulfát glukosaminyl 3-O-sulfotransferázy, antikoagulační aktivitu přeměny heparan sulfátu, tak je enzym omezující rychlost syntézy antikoagulancia heparan. Tento enzym je intraluminální protein rezidenta Golgi.^[6]

Klinický význam

Polymorfismy v HS3ST1 se jeví jako rizikový faktor pro rozvoj Alzheimerova choroba.^[7]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000002587 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000051022 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Shworak NW, Liu J, Petros LM, Zhang L, Kobayashi M, Copeland NG, Jenkins NA, Rosenberg RD (únor 1999). „Několik izoforem heparan sulfátu D-glukosaminyl 3-O-sulfotransferázy. Izolace, charakterizace a exprese lidských cdn a identifikace odlišných genomových lokusů“. The Journal of Biological Chemistry. 274 (8): 5170–84. doi:10.1074 / jbc.274.8.5170. PMID 9988767.
^ ^A ^b „Entrez Gene: HS3ST1 heparan sulfát (glukosamin) 3-O-sulfotransferáza 1“.
^ Witoelar A, Rongve A, Almdahl IS a kol. (2018-12-27). „Metaanalýza Alzheimerovy choroby u 9 751 vzorků z Norska a studie IGAP identifikuje čtyři riziková místa“. Vědecké zprávy. 8 (1): 18088. doi:10.1038 / s41598-018-36429-6. PMC 6308232. PMID 30591712.

Další čtení

Razi N, Lindahl U (květen 1995). „Biosyntéza heparinu / heparansulfátu. D-glukosaminyl-3-O-sulfotransferázová reakce: cílové a inhibiční sacharidy“. The Journal of Biological Chemistry. 270 (19): 11267–75. doi:10.1074 / jbc.270.19.11267. PMID 7744762.
Liu J, Shworak NW, Fritze LM, Edelberg JM, Rosenberg RD (říjen 1996). "Čištění heparansulfátu D-glukosaminyl 3-O-sulfotransferázy". The Journal of Biological Chemistry. 271 (43): 27072–82. doi:10.1074 / jbc.271.43.27072. PMID 8900198.
Shworak NW, Liu J, Fritze LM, Schwartz JJ, Zhang L, Logeart D, Rosenberg RD (říjen 1997). "Molekulární klonování a exprese myších a lidských cDNA kódujících heparan sulfát D-glukosaminyl 3-O-sulfotransferázu". The Journal of Biological Chemistry. 272 (44): 28008–19. doi:10.1074 / jbc.272.44.28008. PMID 9346953.
Liu J, Shworak NW, Sinaÿ P, Schwartz JJ, Zhang L, Fritze LM, Rosenberg RD (únor 1999). „Exprese heparan sulfát D-glukosaminyl 3-O-sulfotransferázových izoforem odhaluje nové substrátové specificity“. The Journal of Biological Chemistry. 274 (8): 5185–92. doi:10.1074 / jbc.274.8.5185. PMID 9988768.
Hernaiz M, Liu J, Rosenberg RD, Linhardt RJ (září 2000). „Enzymatická modifikace heparan sulfátu na biočipu podporuje jeho interakci s antitrombinem III“. Sdělení o biochemickém a biofyzikálním výzkumu. 276 (1): 292–7. doi:10,1006 / bbrc.2000.3453. PMID 11006120.
Edavettal SC, Carrick K, Shah RR, Pedersen LC, Tropsha A, Pope RM, Liu J (duben 2004). „Konformační změna v 3-O-sulfotransferáze-1 heparan sulfátu je vyvolána vazbou na heparan sulfát“. Biochemie. 43 (16): 4680–8. doi:10.1021 / bi0499112. PMID 15096036.

externí odkazy

Přehled všech strukturálních informací dostupných v PDB pro UniProt: O14792 (Lidský heparansulfát glukosamin 3-O-sulfotransferáza 1) na PDBe-KB.
Přehled všech strukturálních informací dostupných v PDB pro UniProt: O35310 (Myší heparansulfát glukosamin 3-O-sulfotransferáza 1) na PDBe-KB.

Tento článek o gen na lidský chromozom 4 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000002587 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000051022 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid9988767-5] Shworak NW, Liu J, Petros LM, Zhang L, Kobayashi M, Copeland NG, Jenkins NA, Rosenberg RD (únor 1999). „Několik izoforem heparan sulfátu D-glukosaminyl 3-O-sulfotransferázy. Izolace, charakterizace a exprese lidských cdn a identifikace odlišných genomových lokusů“. The Journal of Biological Chemistry. 274 (8): 5170–84. doi:10.1074 / jbc.274.8.5170. PMID 9988767.

[entrez-6] A ^b „Entrez Gene: HS3ST1 heparan sulfát (glukosamin) 3-O-sulfotransferáza 1“.

[7] Witoelar A, Rongve A, Almdahl IS a kol. (2018-12-27). „Metaanalýza Alzheimerovy choroby u 9 751 vzorků z Norska a studie IGAP identifikuje čtyři riziková místa“. Vědecké zprávy. 8 (1): 18088. doi:10.1038 / s41598-018-36429-6. PMC 6308232. PMID 30591712.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]