HNRPF - HNRPF
Heterogenní jaderný ribonukleoprotein F je protein že u lidí je kódován HNRNPF gen.[5][6]
Tento gen patří do podčeledi všudypřítomně exprimovaných heterogenních jaderných ribonukleoproteinů (hnRNP ). HnRNP jsou RNA vazebné proteiny, které se komplexují heterogenní nukleární RNA (hnRNA). Tyto proteiny jsou spojeny s pre-mRNA v jádře a regulovat alternativní sestřih, polyadenylace a další aspekty mRNA metabolismus a transport.
Zatímco všechny hnRNP jsou přítomny v jádro, zdá se, že některé létají mezi jádrem a cytoplazma. Proteiny hnRNP se liší nukleová kyselina vazebné vlastnosti. Protein kódovaný tímto genem má tři opakování kvazi-RRM domén, na které se váže RNA které mají guanosin -bohaté sekvence. Tento protein je velmi podobný členu rodiny hnRPH. Bylo identifikováno několik alternativně sestřižených variant kódujících stejný protein.[6]
Reference
- ^ A b C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000169813 - Ensembl, Květen 2017
- ^ A b C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000042079 - Ensembl, Květen 2017
- ^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
- ^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
- ^ Honore B, Rasmussen HH, Vorum H, Dejgaard K, Liu X, Gromov P, Madsen P, Gesser B, Tommerup N, Celis JE (leden 1996). „Heterogenní nukleární ribonukleoproteiny H, H 'a F jsou členy všudypřítomně exprimované podrodiny příbuzných, ale odlišných proteinů kódovaných geny mapujícími různé chromozomy“. J Biol Chem. 270 (48): 28780–9. doi:10.1074 / jbc.270.48.28780. PMID 7499401.
- ^ A b „Entrez Gene: HNRPF heterogenní jaderný ribonukleoprotein F“.
Další čtení
- McDonald H, Smailus D, Jenkins H a kol. (1992). "Identifikace a charakterizace genu na D10S94 v oblasti MEN2A". Genomika. 13 (2): 344–8. doi:10.1016 / 0888-7543 (92) 90251-M. PMID 1351868.
- Matunis MJ, Xing J, Dreyfuss G (1994). „Protein hnRNP F: jedinečná primární struktura, vlastnosti vázající nukleové kyseliny a subcelulární lokalizace“. Nucleic Acids Res. 22 (6): 1059–67. doi:10.1093 / nar / 22.6.1059. PMC 307930. PMID 7512260.
- Gamberi C, Izaurralde E, Beisel C, Mattaj IW (1997). „Interakce mezi lidským jaderným komplexem vázajícím cap a proteinem hnRNP F.“ Mol. Buňka. Biol. 17 (5): 2587–97. doi:10.1128 / MCB.17.5.2587. PMC 232108. PMID 9111328.
- Chou MY, Rooke N, Turck CW, Black DL (1999). „hnRNP H je složka komplexu zesilovače sestřihu, který aktivuje alternativní exon c-src v neuronálních buňkách“. Mol. Buňka. Biol. 19 (1): 69–77. doi:10.1128 / MCB.19.1.69. PMC 83866. PMID 9858532.
- Honoré B, Vorum H, Baandrup U (1999). "hnRNPs H, H 'a F se chovají odlišně s ohledem na posttranslační štěpení a subcelulární lokalizaci". FEBS Lett. 456 (2): 274–80. doi:10.1016 / S0014-5793 (99) 00911-4. PMID 10456323. S2CID 7617501.
- Yoshida T, Kokura K, Makino Y a kol. (2000). „Heterogenní nukleová RNA-ribonukleoprotein F se váže na DNA prostřednictvím oligo (dG) -motivu a je spojen s RNA polymerázou II.“ Geny buňky. 4 (12): 707–19. doi:10.1046 / j.1365-2443.1999.00295.x. PMID 10620016. S2CID 31210778.
- Markovtsov V, Nikolic JM, Goldman JA a kol. (2000). „Kooperativní sestava komplexu hnRNP indukovaná tkáňově specifickým homologem proteinu vázajícího polypyrimidinový trakt“. Mol. Buňka. Biol. 20 (20): 7463–79. doi:10.1128 / MCB.20.20.7463-7479.2000. PMC 86300. PMID 11003644.
- Zhang Y, Lindblom T, Chang A a kol. (2001). „Důkaz, že dim1 se asociuje s proteiny zapojenými do sestřihu pre-mRNA a vymezení zbytků nezbytných pro interakce dim1 s hnRNP F a Npw38 / PQBP-1“. Gen. 257 (1): 33–43. doi:10.1016 / S0378-1119 (00) 00372-3. PMID 11054566.
- Veraldi KL, Arhin GK, Martincic K a kol. (2001). „hnRNP F ovlivňuje vazbu 64kdaldaltonové podjednotky faktoru stimulace štěpení na prekurzory mRNA v myších B buňkách“. Mol. Buňka. Biol. 21 (4): 1228–38. doi:10.1128 / MCB.21.4.1228-1238.2001. PMC 99576. PMID 11158309.
- Jia L, Young MF, Powell J a kol. (2002). "Profil genové exprese stromálních buněk lidské kostní dřeně: vysoce výkonná exprimovaná sekvenční analýza sekvenční značky". Genomika. 79 (1): 7–17. doi:10.1006 / geno.2001.6683. PMID 11827452.
- Jurica MS, Licklider LJ, Gygi SR a kol. (2002). „Čištění a charakterizace nativních spliceosomů vhodných pro trojrozměrnou strukturní analýzu“. RNA. 8 (4): 426–39. doi:10.1017 / S1355838202021088. PMC 1370266. PMID 11991638.
- Angenstein F, Evans AM, Settlage RE a kol. (2002). „Receptor pro aktivovanou C kinázu je součástí messengerových ribonukleoproteinových komplexů asociovaných s polyA-mRNA v neuronech“. J. Neurosci. 22 (20): 8827–37. doi:10.1523 / JNEUROSCI.22-20-08827.2002. PMC 6757688. PMID 12388589.
- Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH a kol. (2003). „Generování a počáteční analýza více než 15 000 lidských a myších cDNA sekvencí plné délky“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (26): 16899–903. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
- Ota T, Suzuki Y, Nishikawa T a kol. (2004). „Kompletní sekvenování a charakterizace 21 243 lidských cDNA plné délky“. Nat. Genet. 36 (1): 40–5. doi:10.1038 / ng1285. PMID 14702039.
- Honoré B, Baandrup U, Vorum H (2004). "Heterogenní nukleární ribonukleoproteiny F a H / H 'vykazují rozdílnou expresi v normálních a vybraných rakovinných tkáních". Exp. Cell Res. 294 (1): 199–209. doi:10.1016 / j.yexcr.2003.11.011. PMID 14980514.
- Deloukas P, Earthrowl ME, Grafham DV a kol. (2004). „Sekvence DNA a srovnávací analýza lidského chromozomu 10“. Příroda. 429 (6990): 375–81. doi:10.1038 / nature02462. PMID 15164054.
- Beausoleil SA, Jedrychowski M, Schwartz D a kol. (2004). „Rozsáhlá charakterizace jaderných fosfoproteinů z buněk HeLa“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 101 (33): 12130–5. doi:10.1073 / pnas.0404720101. PMC 514446. PMID 15302935.
- Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA a kol. (2004). „Stav, kvalita a rozšíření projektu cDNA NIH v plné délce: Mammalian Gene Collection (MGC)“. Genome Res. 14 (10B): 2121–7. doi:10,1101 / gr. 2596504. PMC 528928. PMID 15489334.
- Rush J, Moritz A, Lee KA a kol. (2005). "Imunoafinitní profil fosforylace tyrosinu v rakovinných buňkách". Nat. Biotechnol. 23 (1): 94–101. doi:10.1038 / nbt1046. PMID 15592455. S2CID 7200157.
Galerie PDB | |
|---|---|
|
 | Tento článek o gen na lidský chromozom 10 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to. |