HMBOX1 - HMBOX1 - Wikipedia

HMBOX1
Dostupné struktury
PDBHledání ortologu: PDBe RCSB
Identifikátory
AliasyHMBOX1, HNF1LA, HOT1, PBHNF, homeobox obsahující 1, TAH1
Externí IDMGI: 2445066 HomoloGene: 11589 Genové karty: HMBOX1
Umístění genu (člověk)
Chromozom 8 (lidský)
Chr.Chromozom 8 (lidský)[1]
Chromozom 8 (lidský)
Genomické umístění pro HMBOX1
Genomické umístění pro HMBOX1
Kapela8p21.1-p12Start28,890,395 bp[1]
Konec29,064,764 bp[1]
Ortology
DruhČlověkMyš
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (mRNA)

NM_177338
NM_001347626
NM_001347627

RefSeq (protein)

NP_001334555
NP_001334556
NP_796312

Místo (UCSC)Chr 8: 28,89 - 29,06 MbChr 14: 64,81 - 64,95 Mb
PubMed Vyhledávání[3][4]
Wikidata
Zobrazit / upravit člověkaZobrazit / upravit myš

Homeobox obsahující 1, také známý jako homeobox protein vázající na telomer 1 (HORKÝ1), je protein že u lidí je kódován HMBOX1 gen.[5] HMBOX1 se přímo váže na dvouvláknovou opakující se sekvenci telomery.[6][7]

Bylo původně identifikováno, že HMBOX1 se asociuje s telomerickým chromatinem v rakovinných buňkách pozitivních na telomerázu a v rakovinných buňkách, které si udržují své telomery na základě Alternativní prodloužení telomerů (ALT) mechanismus „zpátečkou Čip „technika PICh (proteomika izolovaných chromatinových segmentů).[6] Následně byla prokázána přímá vazba na telomerickou DNA prostřednictvímKrystalická struktura z Doména vázající DNA HMBOX1 s telomerickou DNA.[7] Experimenty se ztrátou funkce a ziskem z funkce klasifikují HMBOX1 jako pozitivní regulátor délky telomer.[7][8] HMBOX1 byl původně popsán jako transkripční represor založený na testy reportérového genu,[9] ale s využitím přístupu v rámci celého genomu RNA sekvence a ChIP-sekv vidět jen malý nebo žádný takový účinek alespoň u několika rakovinných buněčných linií.[10]

Reference

  1. ^ A b C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000147421 - Ensembl, Květen 2017
  2. ^ A b C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000021972 - Ensembl, Květen 2017
  3. ^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
  4. ^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
  5. ^ „Entrez Gene: Homeobox obsahující 1“.
  6. ^ A b Déjardin J, Kingston RE (leden 2009). "Čištění proteinů spojených se specifickými genomovými lokusy". Buňka. 136 (1): 175–86. doi:10.1016 / j.cell.2008.11.045. PMC  3395431. PMID  19135898.
  7. ^ A b C Kappei D, Butter F, Benda C, Scheibe M, Draškovič I, Stevense M, Novo CL, Basquin C, Araki M, Araki K, Krastev DB, Kittler R, Jessberger R, Londoño-Vallejo JA, Mann M, Buchholz F ( Červen 2013). „HOT1 je savčí protein přímého telomera, který se váže na opakování a přispívá k náboru telomerázy“. Časopis EMBO. 32 (12): 1681–701. doi:10.1038 / emboj.2013.105. PMC  3680732. PMID  23685356.
  8. ^ Zhou S, Xiao Y, Zhuang Y, Liu Y, Zhao H, Yang H, Xie C, Zhou F, Zhou Y (červenec 2017). „Vyřazení homeoboxu obsahujícího 1 zvyšuje radiosenzitivitu buněk rakoviny děložního čípku zkrácením telomer“. Zprávy o onkologii. 38 (1): 515–521. doi:10.3892 / nebo 2017.5707. PMID  28628186.
  9. ^ Chen S, Saiyin H, Zeng X, Xi J, Liu X, Li X, Yu L (2006). „Izolace a funkční analýza lidského HMBOX1, proteinu obsahujícího homeobox s aktivitou transkripčního represoru“. Cytogenetický a genomový výzkum. 114 (2): 131–6. doi:10.1159/000093328. PMID  16825764. S2CID  21067536.
  10. ^ Jahn A, Rane G, Paszkowski-Rogacz M, Sayols S, Bluhm A, Han CT, Draškovič I, Londoño-Vallejo JA, Kumar AP, Buchholz F, Butter F, Kappei D (červen 2017). „ZBTB48 je protein vázající na telomeru obratlovců i transkripční aktivátor“. Zprávy EMBO. 18 (6): 929–946. doi:10.15252 / embr.201744095. PMC  5452029. PMID  28500257.

Další čtení