HIST2H2AB - HIST2H2AB

H2AC21

Protein HIST2H2AB PDB 1aoi.png

Identifikátory

H2AC21, H2AB, histonová klastr 2, H2ab, histonová klastr 2 člen rodiny H2A b, H2A klastrovaný histon 21, HIST2H2AB

Externí ID

OMIM: 615014 MGI: 2448314 HomoloGene: 111318 Genové karty: H2AC21

Umístění genu (člověk)

Chr.	Chromozom 1 (lidský)^[1]

Kapela	1q21.2	Start	149,887,484 bp^[1]
Kapela	1q21.2	Konec	149,888,013 bp^[1]

Umístění genu (myš)

Chr.	Chromozom 3 (myš)^[2]

Kapela	3 \| 3 F2.1	Start	96,219,865 bp^[2]
Kapela	3 \| 3 F2.1	Konec	96,220,308 bp^[2]

Exprese RNA vzor

Další údaje o referenčních výrazech

Genová ontologie
Molekulární funkce	• Vazba DNA • aktivita heterodimerizace proteinu • molekulární funkce
Buněčná složka	• nukleární chromatin • nukleosom • extracelulární exosom • buněčné jádro • chromozóm
Biologický proces	• umlčování chromatinu • organizace chromatinu • biologický proces
Zdroje:Amigo / QuickGO

Druh

Člověk

Myš


317772


621893


ENSG00000184270


ENSMUSG00000063689


Q8IUE6


Q64522

RefSeq (mRNA)


NM_175065


NM_178213

RefSeq (protein)


NP_778235


NP_835585

Místo (UCSC)

Chr 1: 149,89 - 149,89 Mb

Chr 3: 96,22 - 96,22 Mb

PubMed Vyhledávání

^[3]

^[4]

Zobrazit / upravit člověka

Zobrazit / upravit myš

Histon H2A typ 2-B je protein že v lidé je kódovaný podle HIST2H2AB gen.^[5]^[6]

Histony jsou základní jaderné proteiny které jsou odpovědné za nukleosom struktura chromozomální vlákno dovnitř eukaryoty. Nukleosomy se skládají z přibližně 146 bp z DNA omotal kolem a histonový oktamer složený z párů každého ze čtyř hlavních histonů (H2A, H2B, H3 a H4). The chromatin vlákno je dále zhutňováno prostřednictvím interakce a linker histon, H1 s DNA mezi nukleosomy za vzniku chromatinových struktur vyššího řádu. Tento gen je intronless a kóduje člena histon H2A rodina. Transkripty z tohoto genu obsahují palindromický terminační prvek.^[6]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000184270 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání Ensembl 89: ENSMUSG00000063689 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Marzluff WF, Gongidi P, Woods KR, Jin J, Maltais LJ (říjen 2002). "Lidské a myší replikačně závislé histonové geny". Genomika. 80 (5): 487–98. doi:10.1016 / S0888-7543 (02) 96850-3. PMID 12408966.
^ ^A ^b „Entrez Gene: HIST2H2AB histon cluster 2, H2ab“.

Další čtení

El Kharroubi A, Piras G, Zensen R, Martin MA (1998). „Transkripční aktivace integrovaného promotoru viru lidské imunodeficience typu 1 spojeného s chromatinem“. Mol. Buňka. Biol. 18 (5): 2535–44. doi:10,1128 / mcb.18.5.2535. PMC 110633. PMID 9566873.
Deng L, de la Fuente C, Fu P a kol. (2001). „Acetylace HIV-1 Tat pomocí CBP / P300 zvyšuje transkripci integrovaného genomu HIV-1 a zvyšuje vazbu na základní histony“. Virologie. 277 (2): 278–95. doi:10.1006 / viro.2000.0593. PMID 11080476.
Deng L, Wang D, de la Fuente C a kol. (2001). "Zlepšení aktivity p300 HAT pomocí HIV-1 Tat na chromatinové DNA". Virologie. 289 (2): 312–26. doi:10.1006 / viro.2001.1129. PMID 11689053.
Chen A, Kleiman FE, Manley JL a kol. (2002). „Autoubikvitinace ubikvitin ligázy BRCA1 * BARD1 RING“. J. Biol. Chem. 277 (24): 22085–92. doi:10,1074 / jbc.M201252200. PMID 11927591.
Lusic M, Marcello A, Cereseto A, Giacca M (2004). „Regulace exprese genu HIV-1 acetylací histonu a nábor faktorů u promotoru LTR“. EMBO J.. 22 (24): 6550–61. doi:10.1093 / emboj / cdg631. PMC 291826. PMID 14657027.
Zhang Y, Griffin K, Mondal N, Parvin JD (2004). „Fosforylace histonu H2A inhibuje transkripci na chromatinových šablonách“. J. Biol. Chem. 279 (21): 21866–72. doi:10,1074 / jbc.M400099200. PMID 15010469.
Aihara H, Nakagawa T, Yasui K a kol. (2004). „Nukleosomální histon kináza-1 fosforyluje H2A Thr 119 během mitózy v časném embryu Drosophila“. Genes Dev. 18 (8): 877–88. doi:10.1101 / gad.1184604. PMC 395847. PMID 15078818.
Wang H, Wang L, Erdjument-Bromage H a kol. (2004). "Role ubikvitinace histonu H2A v umlčování Polycomb". Příroda. 431 (7010): 873–8. doi:10.1038 / nature02985. PMID 15386022.
Hagiwara T, Hidaka Y, Yamada M (2005). "Omezení histonu H2A a H4 na argininu 3 v HL-60 granulocytech". Biochemie. 44 (15): 5827–34. doi:10.1021 / bi047505c. PMID 15823041.
Cao R, Tsukada Y, Zhang Y (2006). „Role Bmi-1 a Ring1A v ubikvitylaci H2A a umlčení genu Hox“. Mol. Buňka. 20 (6): 845–54. doi:10.1016 / j.molcel.2005.12.002. PMID 16359901.
Bergink S, Salomons FA, Hoogstraten D a kol. (2006). „Poškození DNA spouští nukleotidovou excizi monoubiquitylace histonu H2A závislou na opravě“. Genes Dev. 20 (10): 1343–52. doi:10,1101 / gad.373706. PMC 1472908. PMID 16702407.
Gregory SG, Barlow KF, McLay KE a kol. (2006). „Sekvence DNA a biologická anotace lidského chromozomu 1“. Příroda. 441 (7091): 315–21. doi:10.1038 / nature04727. PMID 16710414.

Galerie PDB

1aoi: KOMPLEX MEZI JADERNÝMI ČÁSTIKY NUCLEOSOMŮ (H3, H4, H2A, H2B) A DLOUHÝM Fragmentem DNA o 146 BP
1 ekv: X-RAY STRUKTURA JADERNÉ ČÁSTI NUCLEOSOMU V ROZLIŠENÍ 2,5 A
1hq3: KRYSTÁLOVÁ STRUKTURA HISTON-JADEROVÉHO OCTAMERU V KCL / FOSFÁTU
1kx3: X-Ray Structure of the Nucleosome Core Particle, NCP146, at 2.0 A Resolution
1kx4: X-Ray Structure of the Nucleosome Core Particle, NCP146b, at 2.6 A Resolution
1kx5: X-Ray Structure of the Nucleosome Core Particle, NCP147, at 1.9 A Resolution
1m18: LIGAND BINDING ALTERS THE STRUCTURE AND DYNAMICS of NUCLEOSOMAL DNA
1m19: LIGAND BINDING ALTERS THE STRUCTURE AND DYNAMICS of NUCLEOSOMAL DNA
1m1a: LIGAND BINDING ALTERS THE STRUCTURE AND DYNAMICS of NUCLEOSOMAL DNA
1p34: Krystalografické studie jaderných nukleosomových částic obsahujících histonové „sin“ mutanty
1p3a: Krystalografické studie jaderných nukleosomových částic obsahujících histonové „sin“ mutanty
1 mp3b: Krystalografické studie jádrových nukleosomových částic obsahujících histonové „sin“ mutanty
1p3f: Krystalografické studie jaderných nukleosomových částic obsahujících histonové „sin“ mutanty
1 mp3g: Krystalografické studie jádrových nukleosomových částic obsahujících histonové „sin“ mutanty
1p3i: Krystalografické studie jádrových nukleosomových částic obsahujících histonové „sin“ mutanty
1 mp3k: Krystalografické studie jaderných nukleosomových částic obsahujících histonové „sin“ mutanty
1 mp3l: Krystalografické studie jádrových nukleosomových částic obsahujících histonové „sin“ mutanty
1 mp3: Krystalografické studie jádrových nukleosomových částic obsahujících histonové „sin“ mutanty
1 mp3o: Krystalografické studie jádrových nukleosomových částic obsahujících histonové „sin“ mutanty
1 mp3p: Krystalografické studie jádrových nukleosomových částic obsahujících histonové „sin“ mutanty
1s32: Molekulární rozpoznávání nukleosomální „supergroove“
1tzy: Krystalová struktura oktameru jádro-histon na rozlišení 1,90 angstromu
1zbb: Struktura tetranukleosomu 4_601_167
1zla: X-ray Structure of a Kaposi's sarkom herpesvirus LANA peptide bound to the nucleosomal core
2aro: Krystalová struktura nativního histonového oktameru na rozlišení 2,1 angstromu, krystalizovaná za přítomnosti S-nitrosoglutathionu
2cv5: Krystalová struktura jádra částice lidského nukleosomu
2f8n: 2.9 Angstromová rentgenová struktura hybridních nukleosomů makroH2A
2fj7: Krystalová struktura částice jádra nukleosomu obsahující prvek sekvence Poly (dA.dT)
2hio: HISTONE OCTAMER (KUŘECÍ), CHROMOSOMÁLNÍ PROTEIN
2nzd: Částice jádra nukleosomu obsahující 145 bp DNA

Tento článek o gen na lidský chromozom 1 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.