HIST1H2AH - HIST1H2AH

H2AC12

Protein HIST1H2AH PDB 1aoi.png

Dostupné struktury

Hledání ortologu: PDBe RCSB

Seznam id kódů PDB
2F8N

Identifikátory

H2AC12, H2A / S, H2AFALii, H2AH, dJ86C11.1, histonová klastr 1, H2ah, histonová klastr 1 člen rodiny H2A h, HIST1H2AH, H2A klastrovaný histon 12

Externí ID

OMIM: 615013 MGI: 2448295 HomoloGene: 119667 Genové karty: H2AC12

Umístění genu (člověk)

Chr.	Chromozom 6 (lidský)^[1]

Kapela	6p22.1	Start	27,147,129 bp^[1]
Kapela	6p22.1	Konec	27,147,515 bp^[1]

Genová ontologie
Molekulární funkce	• aktivita heterodimerizace proteinu • Vazba DNA • molekulární funkce
Buněčná složka	• nukleární chromatin • nukleosom • extracelulární exosom • buněčné jádro • chromozóm
Biologický proces	• umlčování chromatinu • organizace chromatinu • biologický proces
Zdroje:Amigo / QuickGO

Druh

Člověk

Myš


85235


319168


ENSG00000274997


n / a


Q96KK5


Q8CGP6

RefSeq (mRNA)


NM_080596


NM_175659

RefSeq (protein)


NP_542163


NP_783590

Místo (UCSC)

Chr 6: 27,15 - 27,15 Mb

n / a

PubMed Vyhledávání

^[2]

^[3]

Zobrazit / upravit člověka

Zobrazit / upravit myš

Histon H2A typ 1-H je protein že u lidí je kódován HIST1H2AH gen.^[4]^[5]

Histony jsou základní jaderné proteiny, které jsou odpovědné za nukleosom struktura chromozomálního vlákna v eukaryoty. Dvě molekuly každého ze čtyř hlavních histonů (H2A, H2B, H3 a H4) tvoří octamer, kolem kterého přibližně 146 bp DNA je zabalen do opakujících se jednotek, které se nazývají nukleosomy. Linker histon, H1, interaguje s linkerovou DNA mezi nukleosomy a funguje při zhutňování chromatin do struktur vyššího řádu. Tento gen je intronless a kóduje člena rodiny histonů H2A. Transkripty z tohoto genu postrádají ocasy, ale místo toho obsahují palindromický terminační prvek. Tento gen se nachází v histonovém mikroklastru na chromozomu 6p21.33.^[5]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000274997 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Marzluff WF, Gongidi P, Woods KR, Jin J, Maltais LJ (říjen 2002). "Lidské a myší replikačně závislé histonové geny". Genomika. 80 (5): 487–98. doi:10.1016 / S0888-7543 (02) 96850-3. PMID 12408966.
^ ^A ^b „Entrez Gene: HIST1H2AH histon cluster 1, H2ah“.

Další čtení

El Kharroubi A, Piras G, Zensen R, Martin MA (1998). „Transkripční aktivace integrovaného promotoru viru lidské imunodeficience typu 1 spojeného s chromatinem“. Mol. Buňka. Biol. 18 (5): 2535–44. doi:10,1128 / mcb.18.5.2535. PMC 110633. PMID 9566873.
Albig W, Trappe R, Kardalinou E a kol. (1999). "Komplement lidského genu pro H2A a H2B histon". Biol. Chem. 380 (1): 7–18. doi:10.1515 / BC.1999.002. PMID 10064132. S2CID 12807248.
Ahn J, Gruen JR (1999). "Genomická organizace histonových shluků na lidském 6p21.3". Mamm. Genom. 10 (7): 768–70. doi:10,1007 / s003359901089. PMID 10384058. S2CID 28275496.
Deng L, de la Fuente C, Fu P a kol. (2001). „Acetylace HIV-1 Tat pomocí CBP / P300 zvyšuje transkripci integrovaného genomu HIV-1 a zvyšuje vazbu na hlavní histony“. Virologie. 277 (2): 278–95. doi:10.1006 / viro.2000.0593. PMID 11080476.
Deng L, Wang D, de la Fuente C a kol. (2001). "Zlepšení aktivity p300 HAT pomocí HIV-1 Tat na chromatinové DNA". Virologie. 289 (2): 312–26. doi:10.1006 / viro.2001.1129. PMID 11689053.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH a kol. (2003). „Generování a počáteční analýza více než 15 000 lidských a myších cDNA sekvencí plné délky“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (26): 16899–903. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
Mungall AJ, Palmer SA, Sims SK a kol. (2003). „Sekvence DNA a analýza lidského chromozomu 6“. Příroda. 425 (6960): 805–11. Bibcode:2003 Natur.425..805M. doi:10.1038 / nature02055. PMID 14574404.
Lusic M, Marcello A, Cereseto A, Giacca M (2004). „Regulace exprese genu HIV-1 acetylací histonu a nábor faktorů u promotoru LTR“. EMBO J.. 22 (24): 6550–61. doi:10.1093 / emboj / cdg631. PMC 291826. PMID 14657027.
Zhang Y, Griffin K, Mondal N, Parvin JD (2004). „Fosforylace histonu H2A inhibuje transkripci na šablonách chromatinu“. J. Biol. Chem. 279 (21): 21866–72. doi:10,1074 / jbc.M400099200. PMID 15010469.
Aihara H, Nakagawa T, Yasui K a kol. (2004). „Nukleosomální histon kináza-1 fosforyluje H2A Thr 119 během mitózy v časném embryu Drosophila“. Genes Dev. 18 (8): 877–88. doi:10.1101 / gad.1184604. PMC 395847. PMID 15078818.
Wang H, Wang L, Erdjument-Bromage H a kol. (2004). "Role ubikvitinace histonu H2A v umlčování Polycomb". Příroda. 431 (7010): 873–8. Bibcode:2004 Natur.431..873W. doi:10.1038 / nature02985. PMID 15386022. S2CID 4344378.
Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA a kol. (2004). „Stav, kvalita a rozšíření projektu cDNA NIH v plné délce: Sbírka genů savců (MGC)“. Genome Res. 14 (10B): 2121–7. doi:10,1101 / gr. 2596504. PMC 528928. PMID 15489334.
Hagiwara T, Hidaka Y, Yamada M (2005). "Omezení histonu H2A a H4 na argininu 3 v HL-60 granulocytech". Biochemie. 44 (15): 5827–34. doi:10.1021 / bi047505c. PMID 15823041.
Bonenfant D, Coulot M, Towbin H a kol. (2006). „Charakterizace variant histonu H2A a H2B a jejich posttranslační úpravy hmotnostní spektrometrií“. Mol. Buňka. Proteomika. 5 (3): 541–52. doi:10,1074 / mcp.M500288-MCP200. PMID 16319397.
Cao R, Tsukada Y, Zhang Y (2006). „Role Bmi-1 a Ring1A v ubikvitylaci H2A a umlčení genu Hox“. Mol. Buňka. 20 (6): 845–54. doi:10.1016 / j.molcel.2005.12.002. PMID 16359901.
Bergink S, Salomons FA, Hoogstraten D, et al. (2006). „Poškození DNA spouští nukleotidovou excizi monoubiquitylace histonu H2A závislou na opravě“. Genes Dev. 20 (10): 1343–52. doi:10,1101 / gad.373706. PMC 1472908. PMID 16702407.
Kimura H, Takizawa N, Allemand E a kol. (2006). „Nový histonový výměnný faktor, proteinová fosfatáza 2Cγ, zprostředkovává výměnu a defosforylaci H2A – H2B“. J. Cell Biol. 175 (3): 389–400. doi:10.1083 / jcb.200608001. PMC 2064517. PMID 17074886.

Galerie PDB

1aoi: KOMPLEXNÍ MEZI JADERNÝMI ČÁSTIKY NUCLEOSOMŮ (H3, H4, H2A, H2B) A DLOUHÝM Fragmentem DNA o 146 BP
1 ekv: X-RAY STRUKTURA JADERNÉ ČÁSTI NUCLEOSOMU V ROZLIŠENÍ 2,5 A
1hq3: KRYSTÁLOVÁ STRUKTURA HISTON-JADEROVÉHO OCTAMERU V KCL / FOSFÁTU
1kx3: X-Ray Structure of the Nucleosome Core Particle, NCP146, at 2.0 A Resolution
1kx4: X-Ray Structure of the Nucleosome Core Particle, NCP146b, at 2.6 A Resolution
1kx5: X-Ray Structure of the Nucleosome Core Particle, NCP147, at 1.9 A Resolution
1m18: LIGAND BINDING ALTERS THE STRUCTURE AND DYNAMICS of NUCLEOSOMAL DNA
1m19: LIGAND BINDING ALTERS THE STRUCTURE AND DYNAMICS of NUCLEOSOMAL DNA
1m1a: LIGAND BINDING ALTERS THE STRUCTURE AND DYNAMICS of NUCLEOSOMAL DNA
1p34: Krystalografické studie jaderných nukleosomových částic obsahujících histonové „sin“ mutanty
1p3a: Krystalografické studie jaderných nukleosomových částic obsahujících histonové „sin“ mutanty
1 mp3b: Krystalografické studie jaderných nukleosomových částic obsahujících histonové „sin“ mutanty
1p3f: Krystalografické studie jaderných nukleosomových částic obsahujících histonové „sin“ mutanty
1 mp3g: Krystalografické studie jaderných nukleosomových částic obsahujících histonové „sin“ mutanty
1p3i: Krystalografické studie jaderných nukleosomových částic obsahujících histonové „sin“ mutanty
1 mp3k: Krystalografické studie jaderných nukleosomových částic obsahujících histonové „sin“ mutanty
1 mp3l: Krystalografické studie jaderných nukleosomových částic obsahujících histonové „sin“ mutanty
1 mp3: Krystalografické studie jaderných nukleosomových částic obsahujících histonové „sin“ mutanty
1 mp3o: Krystalografické studie jaderných nukleosomových částic obsahujících histonové „sin“ mutanty
1 mp3p: Krystalografické studie jaderných nukleosomových částic obsahujících histonové „sin“ mutanty
1s32: Molekulární rozpoznávání nukleosomální „supergroove“
1tzy: Krystalová struktura oktameru jádro-histon na rozlišení 1,90 angstromu
1zbb: Struktura tetranukleosomu 4_601_167
1zla: X-ray Structure of a Kaposi's sarkom herpesvirus LANA peptide bound to the nucleosomal core
2aro: Krystalová struktura nativního histonového oktameru na rozlišení 2,1 angstromu, krystalizovaná za přítomnosti S-nitrosoglutathionu
2cv5: Krystalová struktura jádra částice lidského nukleosomu
2f8n: 2.9 Angstromová rentgenová struktura hybridních nukleosomů makroH2A
2fj7: Krystalová struktura částice jádra nukleosomu obsahující prvek sekvence Poly (dA.dT)
2hio: HISTONOVÝ OCTAMER (KUŘECÍ), CHROMOSOMÁLNÍ PROTEIN
2nzd: Částice jádra nukleosomu obsahující 145 bp DNA

Tento článek o gen na lidský chromozom 6 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.