HIP2 - HIP2

UBE2K
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	1YLA, 2O25, 3E46, 3F92, 3K9O, 3K9P, 5DFL
Identifikátory
Aliasy	UBE2K, E2-25K, HIP2, HYPG, LIG, UBC1, enzym konjugující s ubikvitinem E2 K
Externí ID	OMIM: 602846 MGI: 1858216 HomoloGene: 3903 Genové karty: UBE2K
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 4 (lidský)
Konec	39,782,792 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 5 (myš)
Konec	65,598,988 bp
Exprese RNA vzor
	; ;
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• aktivita ubikvitin-protein transferázy; • aktivita transferázy; • vazba nukleotidů; • aktivita ubikvitin-ubikvitin ligázy; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • ATP vazba; • vazba ubikvitinové proteinové ligázy; • aktivita enzymu konjugujícího ubikvitin;
Buněčná složka	• cytoplazma; • hrot filopodia; • buněčné jádro; • cytosol;
Biologický proces	• ubikvitinace spojená s proteinem K48; • pozitivní regulace signální dráhy zprostředkované interferonem typu I.; • vnitřní apoptotická signální dráha v reakci na stres endoplazmatického retikula; • polymerace volného ubikvitinového řetězce; • pozitivní regulace fosforylace peptidyl-threoninu; • ubikvitin-dependentní proteinový katabolický proces; • buněčná odpověď na interferon-beta; • proteazomem zprostředkovaný katabolický proces proteinu závislý na ubikvitinu; • regulace proteazomálního ubikvitin-dependentního proteinu katabolického procesu; • ubikvitinace bílkovin;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	3093
	53323
	ENSG00000078140
	ENSMUSG00000029203
	P61086
	P61087
NM_005339; NM_001111112; NM_001111113; NM_001312646; NM_001312647;
	NM_001312648
	NM_016786; NM_001310618; NM_001310619
NP_001104582; NP_001104583; NP_001299575; NP_001299576; NP_001299577;
	NP_005330
	NP_001297547; NP_001297548; NP_058066
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Enzym konjugující s ubikvitinem E2 K. je protein že u lidí je kódován UBE2K gen.^[5]^[6]^[7]

Protein kódovaný tímto genem patří do enzym konjugující s ubikvitinem rodina. Se váže selektivně na velkou oblast na N konci huntingtin. Tato interakce není ovlivněna délkou huntingtinu polyglutaminový trakt. Tento protein se podílí na degradaci huntingtinu a potlačení apoptóza.^[7]

Interakce

Bylo prokázáno, že HIP2 komunikovat s Huntingtin^[5]^[8] a RNF2.^[9]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000078140 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000029203 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ ^A ^b Kalchman MA, Graham RK, Xia G, Koide HB, Hodgson JG, Graham KC, Goldberg YP, Gietz RD, Pickart CM, Hayden MR (září 1996). „Huntingtin je ubikvitinovaný a interaguje se specifickým enzymem konjugujícím s ubikvitinem“. J Biol Chem. 271 (32): 19385–94. doi:10.1074 / jbc.271.32.19385. PMID 8702625.
^ Christensen DE, Brzovic PS, Klevit RE (říjen 2007). „Interakce E2-BRCA1 RING diktují syntézu mono- nebo specifických polyubikvitinových řetězových vazeb“. Nat Struct Mol Biol. 14 (10): 941–8. doi:10.1038 / nsmb1295. PMID 17873885. S2CID 32160828.
^ ^A ^b „Entrez Gene: HIP2 huntingtin interagující protein 2“.
^ Faber PW, Barnes GT, Srinidhi J, Chen J, Gusella JF, MacDonald ME (září 1998). „Huntingtin interaguje s rodinou proteinů WW domény“. Hučení. Mol. Genet. 7 (9): 1463–74. doi:10,1093 / hmg / 7.9.1463. PMID 9700202.
^ Lee SJ, Choi JY, Sung YM, Park H, Rhim H, Kang S (srpen 2001). „E3 ligázová aktivita prstenových proteinů RING, které interagují s Hip-2, lidským enzymem konjugujícím s ubikvitinem“. FEBS Lett. 503 (1): 61–4. doi:10.1016 / S0014-5793 (01) 02689-8. PMID 11513855. S2CID 42977319.

Další čtení

Petersén A, Mani K, Brundin P (1999). "Nedávné pokroky v patogenezi Huntingtonovy choroby". Exp. Neurol. 157 (1): 1–18. doi:10.1006 / ex.1998.7006. PMID 10222105. S2CID 12974652.
Coux O, Goldberg AL (1998). „Enzymy katalyzující ubikvitinaci a proteolytické zpracování prekurzoru p105 nukleárního faktoru kappaB1“. J. Biol. Chem. 273 (15): 8820–8. doi:10.1074 / jbc.273.15.8820. PMID 9535861.
Whitby FG, Xia G, Pickart CM, Hill CP (1999). „Krystalová struktura lidského proteinu podobného ubikvitinu NEDD8 a interakce s enzymy ubikvitinové dráhy“. J. Biol. Chem. 273 (52): 34983–91. doi:10.1074 / jbc.273.52.34983. PMID 9857030.
Kikuchi J, Furukawa Y, Kubo N, Tokura A, Hayashi N, Nakamura M, Matsuda M, Sakurabayashi I (2000). „Indukce enzymu konjugujícího s ubikvitinem agregovaným lipoproteinem s nízkou hustotou v lidských makrofágech a jeho důsledky pro aterosklerózu“. Arterioskler. Tromb. Vasc. Biol. 20 (1): 128–34. doi:10.1161 / 01. ATV.20.1.128. PMID 10634809.
Furukawa Y, Kubo N, Kikuchi J, Tokura A, Fujita N, Sakurabayashi I (2000). "Regulace makrofágově specifické genové exprese degenerovanými lipoproteiny". Elektroforéza. 21 (2): 338–46. doi:10.1002 / (SICI) 1522-2683 (20000101) 21: 2 <338 :: AID-ELPS338> 3.0.CO; 2-9. PMID 10675012.
Lee SJ, Choi JY, Sung YM, Park H, Rhim H, Kang S (2001). „E3 ligázová aktivita prstenových proteinů RING, které interagují s Hip-2, lidským enzymem konjugujícím s ubikvitinem“. FEBS Lett. 503 (1): 61–4. doi:10.1016 / S0014-5793 (01) 02689-8. PMID 11513855. S2CID 42977319.
Gevaert K, Goethals M, Martens L, Van Damme J, Staes A, Thomas GR, Vandekerckhove J (2004). „Zkoumání proteomů a analýza zpracování proteinů hmotnostní spektrometrickou identifikací tříděných N-koncových peptidů“. Nat. Biotechnol. 21 (5): 566–9. doi:10.1038 / nbt810. PMID 12665801. S2CID 23783563.
Goehler H, Lalowski M, Stelzl U, Waelter S, Stroedicke M, Worm U, Droege A, Lindenberg KS, Knoblich M, Haenig C, Herbst M, Suopanki J, Scherzinger E, Abraham C, Bauer B, Hasenbank R, Fritzsche A Ludewig AH, Büssow K, Buessow K, Coleman SH, Gutekunst CA, Landwehrmeyer BG, Lehrach H, Wanker EE (2004). „Síť proteinových interakcí spojuje GIT1, zesilovač agregace huntingtinu, s Huntingtonovou chorobou“. Mol. Buňka. 15 (6): 853–65. doi:10.1016 / j.molcel.2004.09.016. PMID 15383276.
Kimura K, Wakamatsu A, Suzuki Y, Ota T, Nishikawa T, Yamashita R, Yamamoto J, Sekine M, Tsuritani K, Wakaguri H, Ishii S, Sugiyama T, Saito K, Isono Y, Irie R, Kushida N, Yoneyama T , Otsuka R, Kanda K, Yokoi T, Kondo H, Wagatsuma M, Murakawa K, Ishida S, Ishibashi T, Takahashi-Fujii A, Tanase T, Nagai K, Kikuchi H, Nakai K, Isogai T, Sugano S (2006) . „Diverzifikace transkripční modulace: rozsáhlá identifikace a charakterizace domnělých alternativních promotorů lidských genů“. Genome Res. 16 (1): 55–65. doi:10,1101 / gr. 4039406. PMC 1356129. PMID 16344560.
Flierman D, Coleman CS, Pickart CM, Rapoport TA, Chau V (2006). „E2-25K zprostředkovává retranslokaci těžkých řetězců MHC třídy I spouštěnou US11 v permeabilizovaném buněčném systému“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 103 (31): 11589–94. doi:10.1073 / pnas.0605215103. PMC 1520313. PMID 16868077.
de Pril R, Fischer DF, Roos RA, van Leeuwen FW (2007). „Enzym E2-25K konjugující s ubikvitinem zvyšuje tvorbu agregátů a buněčnou smrt u polyglutaminových onemocnění“. Mol. Buňka. Neurosci. 34 (1): 10–9. doi:10.1016 / j.mcn.2006.09.006. PMID 17092742. S2CID 9704303.
Ewing RM, Chu P, Elisma F, Li H, Taylor P, Climie S, McBroom-Cerajewski L, Robinson MD, O'Connor L, Li M, Taylor R, Dharsee M, Ho Y, Heilbut A, Moore L, Zhang S, Ornatsky O, Bukhman YV, Ethier M, Sheng Y, Vasilescu J, Abu-Farha M, Lambert JP, Duewel HS, Stewart II, Kuehl B, Hogue K, Colwill K, Gladwish K, Muskat B, Kinach R, Adams SL, Moran MF, Morin GB, Topaloglou T, Figeys D (2007). „Mapování interakcí lidských proteinů a proteinů ve velkém měřítku hmotnostní spektrometrií“. Mol. Syst. Biol. 3 (1): 89. doi:10.1038 / msb4100134. PMC 1847948. PMID 17353931.

Tento článek o gen na lidský chromozom 4 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000078140 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000029203 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid8702625-5] A ^b Kalchman MA, Graham RK, Xia G, Koide HB, Hodgson JG, Graham KC, Goldberg YP, Gietz RD, Pickart CM, Hayden MR (září 1996). „Huntingtin je ubikvitinovaný a interaguje se specifickým enzymem konjugujícím s ubikvitinem“. J Biol Chem. 271 (32): 19385–94. doi:10.1074 / jbc.271.32.19385. PMID 8702625.

[pmid17873885-6] Christensen DE, Brzovic PS, Klevit RE (říjen 2007). „Interakce E2-BRCA1 RING diktují syntézu mono- nebo specifických polyubikvitinových řetězových vazeb“. Nat Struct Mol Biol. 14 (10): 941–8. doi:10.1038 / nsmb1295. PMID 17873885. S2CID 32160828.

[entrez-7] A ^b „Entrez Gene: HIP2 huntingtin interagující protein 2“.

[pmid9700202-8] Faber PW, Barnes GT, Srinidhi J, Chen J, Gusella JF, MacDonald ME (září 1998). „Huntingtin interaguje s rodinou proteinů WW domény“. Hučení. Mol. Genet. 7 (9): 1463–74. doi:10,1093 / hmg / 7.9.1463. PMID 9700202.

[pmid11513855-9] Lee SJ, Choi JY, Sung YM, Park H, Rhim H, Kang S (srpen 2001). „E3 ligázová aktivita prstenových proteinů RING, které interagují s Hip-2, lidským enzymem konjugujícím s ubikvitinem“. FEBS Lett. 503 (1): 61–4. doi:10.1016 / S0014-5793 (01) 02689-8. PMID 11513855. S2CID 42977319.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]