H2AFV - H2AFV

H2AZ2
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	3WAA
Identifikátory
Aliasy	H2AZ2, H2A.Z-2, H2AV, H2A člen rodiny histonů V, H2A.Z varianta histon 2, H2AFV
Externí ID	MGI: 1924855 HomoloGene: 83271 Genové karty: H2AZ2
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 7 (lidský)
Konec	44,848,083 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 11 (myš)
Konec	6,444,443 bp
Exprese RNA vzor
	; ; ; ;
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• Vazba DNA; • aktivita heterodimerizace proteinu; • molekulární funkce;
Buněčná složka	• nukleární chromatin; • nukleosom; • extracelulární exosom; • buněčné jádro; • chromozóm;
Biologický proces	• umlčování chromatinu; • organizace chromatinu; • biologický proces;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	94239
	77605
	ENSG00000105968
	ENSMUSG00000041126
	Q71UI9
	Q3THW5
	NM_201517; NM_012412; NM_138635; NM_201436; NM_201516
	NM_029938; NM_001347064
	NP_036544; NP_619541; NP_958844; NP_958924; NP_958925
	NP_001333993; NP_084214
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Histon H2A.V je protein že u lidí je kódován H2AFV gen.^[5]

Histony jsou základní jaderné proteiny, které jsou odpovědné za nukleosom struktura chromozomálního vlákna v eukaryoty. Nukleosomy sestávají z přibližně 146 bp DNA omotaný kolem histonu octamer složený z párů každého ze čtyř hlavních histonů (H2A, H2B, H3 a H4). The chromatin vlákno je dále zhutňováno prostřednictvím interakce linkeru histonu, H1, s DNA mezi nukleosomy za vzniku chromatinových struktur vyššího řádu. Tento gen kóduje člena rodiny histonů H2A. Pro tento gen bylo identifikováno několik transkriptů.^[5]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000105968 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000041126 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ ^A ^b "Entrez Gene: H2AFV H2A histonová rodina, člen V".

Další čtení

El Kharroubi A, Piras G, Zensen R, Martin MA (1998). „Transkripční aktivace integrovaného promotoru viru lidské imunodeficience typu 1 spojeného s chromatinem“. Mol. Buňka. Biol. 18 (5): 2535–44. doi:10,1128 / mcb.18.5.2535. PMC 110633. PMID 9566873.
Deng L, de la Fuente C, Fu P a kol. (2001). „Acetylace HIV-1 Tat pomocí CBP / P300 zvyšuje transkripci integrovaného genomu HIV-1 a zvyšuje vazbu na základní histony“. Virologie. 277 (2): 278–295. doi:10.1006 / viro.2000.0593. PMID 11080476.
Deng L, Wang D, de la Fuente C a kol. (2001). "Zlepšení aktivity p300 HAT pomocí HIV-1 Tat na chromatinové DNA". Virologie. 289 (2): 312–326. doi:10.1006 / viro.2001.1129. PMID 11689053.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH a kol. (2003). „Generování a počáteční analýza více než 15 000 lidských a myších cDNA sekvencí plné délky“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (26): 16899–16903. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
Hillier LW, Fulton RS, Fulton LA a kol. (2003). „Sekvence DNA lidského chromozomu 7“. Příroda. 424 (6945): 157–164. doi:10.1038 / nature01782. PMID 12853948.
Lusic M, Marcello A, Cereseto A, Giacca M (2004). „Regulace exprese genu HIV-1 acetylací histonu a nábor faktorů u promotoru LTR“. EMBO J.. 22 (24): 6550–6561. doi:10.1093 / emboj / cdg631. PMC 291826. PMID 14657027.
Ota T, Suzuki Y, Nishikawa T a kol. (2004). „Kompletní sekvenování a charakterizace 21 243 lidských cDNA plné délky“. Nat. Genet. 36 (1): 40–45. doi:10.1038 / ng1285. PMID 14702039.
Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA a kol. (2004). „Stav, kvalita a rozšíření projektu cDNA NIH v plné délce: Mammalian Gene Collection (MGC)“. Genome Res. 14 (10B): 2121–2127. doi:10,1101 / gr. 2596504. PMC 528928. PMID 15489334.
Oh JH, Yang JO, Hahn Y a kol. (2006). "Transkriptomová analýza lidské rakoviny žaludku". Mamm. Genom. 16 (12): 942–954. doi:10.1007 / s00335-005-0075-2. PMID 16341674. S2CID 69278.
Kimura K, Wakamatsu A, Suzuki Y a kol. (2006). „Diverzifikace transkripční modulace: rozsáhlá identifikace a charakterizace domnělých alternativních promotorů lidských genů“. Genome Res. 16 (1): 55–65. doi:10,1101 / gr. 4039406. PMC 1356129. PMID 16344560.
Boyne MT, Pesavento JJ, Mizzen CA, Kelleher NL (2006). "Přesná charakterizace lidských histonů v rodině genů H2A shora dolů hmotnostní spektrometrií". J. Proteome Res. 5 (2): 248–253. doi:10.1021 / pr050269n. PMID 16457589.
Kim SC, Sprung R, Chen Y a kol. (2006). „Substrátová a funkční rozmanitost acetylace lysinu odhalena proteomickým průzkumem“. Mol. Buňka. 23 (4): 607–618. doi:10.1016 / j.molcel.2006.06.026. PMID 16916647.

externí odkazy

PDBe-KB poskytuje přehled všech strukturních informací dostupných v PDB pro Human Histone H2A.V

Tento článek o gen na lidský chromozom 7 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000105968 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000041126 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[entrez-5] A ^b "Entrez Gene: H2AFV H2A histonová rodina, člen V".

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]