GADD45A - GADD45A

GADD45A
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	2KG4
Identifikátory
Aliasy	GADD45A, DDIT1, GADD45, zastavení růstu a poškození DNA indukovatelné alfa
Externí ID	OMIM: 126335 MGI: 107799 HomoloGene: 1449 Genové karty: GADD45A
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 1 (lidský)
Konec	67,688,334 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 6 (myš)
Konec	67,037,457 bp
Exprese RNA vzor
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• GO: 0001948 vazba na proteiny; • vazba kinázy; • aktivita homodimerizace proteinu; • aktivita heterodimerizace proteinu; • vazba N-konce proteinu; • Vazba DNA specifické pro sekvenci jádra promotoru RNA polymerázy II;
Buněčná složka	• cytoplazma; • buněčné jádro; • nukleoplazma; • jaderná skvrna;
Biologický proces	• apoptotický proces; • zástava mitotického buněčného cyklu; • centrosomový cyklus; • regulace aktivity cyklin-dependentního proteinu serin / threonin kináza; • negativní regulace aktivity proteinkinázy; • signální transdukce v reakci na poškození DNA; • reakce na stres; • pozitivní regulace JNK kaskády; • regulace buněčného cyklu; • buněčná odpověď na stimul poškození DNA; • buněčná odpověď na mechanické podněty; • pozitivní regulace metabolického procesu reaktivních forem kyslíku; • zástava buněčného cyklu; • pozitivní regulace apoptotického procesu; • buněčná reakce na ionizující záření; • buněčný cyklus; • aktivace aktivity MAPKKK; • Oprava DNA; • pozitivní regulace kaskády p38MAPK; • Odpověď na poškození DNA, transdukce signálu mediátorem třídy p53 vedoucí k zastavení buněčného cyklu;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	1647
	13197
	ENSG00000116717
	ENSMUSG00000036390
	P24522
	P48316
	NM_001924; NM_001199741; NM_001199742
	NM_007836
	NP_001186670; NP_001186671; NP_001915
	NP_031862
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Zastavení růstu a protein indukovatelný poškozením DNA GADD45 alfa je protein že u lidí je kódován GADD45A gen.^[5]^[6]^[7]

Funkce

Tento gen je členem skupiny genů, GADD45 geny, jejichž hladiny transkriptů se zvyšují po stresujících podmínkách zastavení růstu a léčbě látkami poškozujícími DNA (mutageny ). Transkripce tohoto genu indukovaná poškozením DNA je zprostředkována oběma p53 -závislé a -nezávislé mechanismy. Protein kódovaný tímto genem reaguje na stresy prostředí zprostředkováním aktivace str /JNK cesta přes MTK1 / MEKK4 kináza.^[7]

Aplikace

Skutečnost, že exprese tohoto genu je indikátorem poškození DNA, byla využita ke konstrukci in vitro test pro mutagenita, test GADD45a-GFP GreenScreen HC.^[8] Tento test se skládá z buněčné linie, která byla navržena tak, aby exprese GADD45A vedla k expresi zelený fluorescenční protein, které lze snadno detekovat. K testování mutagenity látky se aplikuje na tyto buňky a měří se fluorescence.

Interakce

GADD45A bylo prokázáno komunikovat s:

AURKA,^[9]
Cdk1,^[10]^[11]^[12]^[13]
CCNB1,^[10]^[13]
GADD45GIP1^[14]
MAP3K4,^[15]
P21,^[12]^[16] a
PCNA.^[12]^[17]^[18]^[19]^[20]

Viz také

Gadd45

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000116717 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000036390 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Papathanasiou MA, Kerr NC, Robbins JH, McBride OW, Alamo I Jr, Barrett SF, Hickson ID, Fornace AJ Jr (březen 1991). „Indukce genu gadd45 v kultivovaných lidských buňkách ionizujícím zářením: nedostatečné zprostředkování proteinovou kinázou C“. Mol Cell Biol. 11 (2): 1009–16. doi:10.1128 / MCB.11.2.1009. PMC 359769. PMID 1990262.
^ Hollander MC, Alamo I, Jackman J, Wang MG, McBride OW, Fornace AJ Jr (prosinec 1993). „Analýza savčího genu gadd45 a jeho reakce na poškození DNA“. J Biol Chem. 268 (32): 24385–93. PMID 8226988.
^ ^A ^b „Entrez Gene: GADD45A zastavování růstu a indukovatelné poškození DNA, alfa“.
^ Walmsley RM, Tate M (2012). „Test GADD45a-GFP GreenScreen HC“. Methods Mol. Biol. Metody v molekulární biologii. 817: 231–50. doi:10.1007/978-1-61779-421-6_12. ISBN 978-1-61779-420-9. PMID 22147576.
^ Sánchez R, Pantoja-Uceda D, Prieto J, Diercks T, Marcaida MJ, Montoya G, Campos-Olivas R, Blanco FJ (červenec 2010). „Struktura řešení zastavování lidského růstu a poškození DNA 45alfa (Gadd45alfa) a jeho interakce s proliferujícím buněčným jaderným antigenem (PCNA) a kinázou Aurora A“. J. Biol. Chem. 285 (29): 22196–201. doi:10.1074 / jbc.M109.069344. PMC 2903397. PMID 20460379.
^ ^A ^b Zhan Q, Antinore MJ, Wang XW, Carrier F, Smith ML, Harris CC, Fornace AJ (květen 1999). „Asociace s Cdc2 a inhibice aktivity kinázy Cdc2 / Cyclin B1 proteinem Gadd45 regulovaným p53“. Onkogen. 18 (18): 2892–900. doi:10.1038 / sj.onc.1202667. PMID 10362260.
^ Jin S, Antinore MJ, Lung FD, Dong X, Zhao H, Fan F, Colchagie AB, Blanck P, Roller PP, Fornace AJ, Zhan Q (červen 2000). „Inhibice GADD45 kinázy Cdc2 koreluje s potlačením růstu zprostředkovaného GADD45“. J. Biol. Chem. 275 (22): 16602–8. doi:10,1074 / jbc.M000284200. PMID 10747892.
^ ^A ^b ^C Yang Q, Manicone A, Coursen JD, Linke SP, Nagashima M, Forgues M, Wang XW (listopad 2000). „Identifikace funkční domény v kontrolním bodě G2 / M zprostředkovaném GADD45“. J. Biol. Chem. 275 (47): 36892–8. doi:10,1074 / jbc.M005319200. PMID 10973963.
^ ^A ^b Vairapandi M, Balliet AG, Hoffman B, Liebermann DA (září 2002). „GADD45b a GADD45g jsou inhibitory kinázy cdc2 / cyklinB1 s rolí v kontrolních bodech buněčného cyklu S a G2 / M vyvolaných genotoxickým stresem“. J. Cell. Physiol. 192 (3): 327–38. doi:10.1002 / jcp.10140. PMID 12124778.
^ Chung HK, Yi YW, Jung NC, Kim D, Suh JM, Kim H, Park KC, Song JH, Kim DW, Hwang ES, Yoon SH, Bae YS, Kim JM, Bae I, Shong M (červenec 2003). „Faktor 1 interagující s CR6 interaguje s proteiny rodiny Gadd45 a moduluje buněčný cyklus“. J. Biol. Chem. 278 (30): 28079–88. doi:10,1074 / jbc.M212835200. PMID 12716909.
^ Takekawa M, Saito H (listopad 1998). "Rodina stresově indukovatelných proteinů podobných GADD45 zprostředkovává aktivaci stresově citlivých MTK1 / MEKK4 MAPKKK". Buňka. 95 (4): 521–30. doi:10.1016 / s0092-8674 (00) 81619-0. PMID 9827804.
^ Zhao H, Jin S, Antinore MJ, Lung FD, Fan F, Blanck P, Roller P, Fornace AJ, Zhan Q (červenec 2000). "Centrální oblast Gadd45 je vyžadována pro její interakci s p21 / WAF1". Exp. Cell Res. 258 (1): 92–100. doi:10,1006 / excr. 2000,4906. PMID 10912791.
^ Smith ML, Chen IT, Zhan Q, Bae I, Chen CY, Gilmer TM, Kastan MB, O'Connor PM, Fornace AJ (listopad 1994). „Interakce proteinu Gadd45 regulovaného p53 s nukleárním antigenem proliferujících buněk“. Věda. 266 (5189): 1376–80. doi:10.1126 / science.7973727. PMID 7973727.
^ Chen IT, Smith ML, O'Connor PM, Fornace AJ (listopad 1995). "Přímá interakce Gadd45 s PCNA a důkaz konkurenční interakce Gadd45 a p21Waf1 / Cip1 s PCNA". Onkogen. 11 (10): 1931–7. PMID 7478510.
^ Vairapandi M, Azam N, Balliet AG, Hoffman B, Liebermann DA (červen 2000). „Charakterizace domén interagujících s MyD118, Gadd45 a proliferujícími buněčnými nukleárními antigeny (PCNA). PCNA brání negativní kontrole růstu zprostředkovanou MyD118 A Gadd45“. J. Biol. Chem. 275 (22): 16810–9. doi:10.1074 / jbc.275.22.16810. PMID 10828065.
^ Hall PA, Kearsey JM, Coates PJ, Norman DG, Warbrick E, Cox LS (červen 1995). "Charakterizace interakce mezi PCNA a Gadd45". Onkogen. 10 (12): 2427–33. PMID 7784094.

Další čtení

Hildesheim J, Fornace AJ (2003). „Gadd45a: nepolapitelný, ale atraktivní kandidátský gen u rakoviny pankreatu“. Clin. Cancer Res. 8 (8): 2475–9. PMID 12171872.
Chen IT, Smith ML, O'Connor PM, Fornace AJ (1995). "Přímá interakce Gadd45 s PCNA a důkaz konkurenční interakce Gadd45 a p21Waf1 / Cip1 s PCNA". Onkogen. 11 (10): 1931–7. PMID 7478510.
Kearsey JM, Coates PJ, Prescott AR a kol. (1995). „Gadd45 je protein regulovaný jaderným buněčným cyklem, který interaguje s p21Cip1“. Onkogen. 11 (9): 1675–83. PMID 7478594.
Hall PA, Kearsey JM, Coates PJ a kol. (1995). "Charakterizace interakce mezi PCNA a Gadd45". Onkogen. 10 (12): 2427–33. PMID 7784094.
Carrier F, Smith ML, Bae I a kol. (1995). "Charakterizace lidského Gadd45, proteinu regulovaného p53". J. Biol. Chem. 269 (51): 32672–7. PMID 7798274.
Smith ML, Chen IT, Zhan Q a kol. (1994). „Interakce proteinu Gadd45 regulovaného p53 s nukleárním antigenem proliferujících buněk“. Věda. 266 (5189): 1376–80. doi:10.1126 / science.7973727. PMID 7973727.
Warbrick E, Lane DP, Glover DM, Cox LS (1997). „Homologní oblasti Fen1 a p21Cip1 soutěží o vazbu na stejné místo na PCNA: potenciální mechanismus ke koordinaci replikace a opravy DNA“. Onkogen. 14 (19): 2313–21. doi:10.1038 / sj.onc.1201072. PMID 9178907.
Warbrick E, Heatherington W, Lane DP, Glover DM (1998). „PCNA vázající proteiny v Drosophila melanogaster: analýza konzervované PCNA vazebné domény“. Nucleic Acids Res. 26 (17): 3925–32. doi:10.1093 / nar / 26.17.3925. PMC 147798. PMID 9705499.
Takekawa M, Saito H (1998). "Rodina stresově indukovatelných proteinů podobných GADD45 zprostředkovává aktivaci stresově citlivých MTK1 / MEKK4 MAPKKK". Buňka. 95 (4): 521–30. doi:10.1016 / S0092-8674 (00) 81619-0. PMID 9827804.
Carrier F, Georgel PT, Pourquier P a kol. (1999). „Gadd45, stresový protein reagující na p53, upravuje dostupnost DNA na poškozeném chromatinu“. Mol. Buňka. Biol. 19 (3): 1673–85. doi:10.1128 / MCB.19.3.1673. PMC 83961. PMID 10022855.
Zhan Q, Antinore MJ, Wang XW a kol. (1999). „Asociace s Cdc2 a inhibice aktivity kinázy Cdc2 / Cyclin B1 proteinem Gadd45 regulovaným p53“. Onkogen. 18 (18): 2892–900. doi:10.1038 / sj.onc.1202667. PMID 10362260.
Jin S, Antinore MJ, Lung FD a kol. (2000). „Inhibice GADD45 kinázy Cdc2 koreluje s potlačením růstu zprostředkovaného GADD45“. J. Biol. Chem. 275 (22): 16602–8. doi:10,1074 / jbc.M000284200. PMID 10747892.
Vairapandi M, Azam N, Balliet AG a kol. (2000). „Charakterizace domén interagujících s MyD118, Gadd45 a proliferujícími buněčnými nukleárními antigeny (PCNA). PCNA brání negativní kontrole růstu zprostředkovanou MyD118 A Gadd45“. J. Biol. Chem. 275 (22): 16810–9. doi:10.1074 / jbc.275.22.16810. PMID 10828065.
Yi YW, Kim D, Jung N a kol. (2000). „Proteiny rodiny Gadd45 jsou koaktivátory jaderných hormonálních receptorů“. Biochem. Biophys. Res. Commun. 272 (1): 193–8. doi:10,1006 / bbrc.2000.2760. PMID 10872826.
Zhao H, Jin S, Antinore MJ a kol. (2000). "Centrální oblast Gadd45 je vyžadována pro její interakci s p21 / WAF1". Exp. Cell Res. 258 (1): 92–100. doi:10,1006 / excr. 2000,4906. PMID 10912791.
Yang Q, Manicone A, Coursen JD a kol. (2001). „Identifikace funkční domény v kontrolním bodě G2 / M zprostředkovaném GADD45“. J. Biol. Chem. 275 (47): 36892–8. doi:10,1074 / jbc.M005319200. PMID 10973963.
Hartley JL, Temple GF, Brasch MA (2001). „Klonování DNA pomocí in vitro místně specifické rekombinace“. Genome Res. 10 (11): 1788–95. doi:10,1101 / gr. 143000. PMC 310948. PMID 11076863.
Kovalsky O, Lung FD, Roller PP, Fornace AJ (2001). „Oligomerizace lidského proteinu Gadd45a“. J. Biol. Chem. 276 (42): 39330–9. doi:10,1074 / jbc.M105115200. PMID 11498536.

externí odkazy

Média související s GADD45A na Wikimedia Commons

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000116717 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000036390 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid1990262-5] Papathanasiou MA, Kerr NC, Robbins JH, McBride OW, Alamo I Jr, Barrett SF, Hickson ID, Fornace AJ Jr (březen 1991). „Indukce genu gadd45 v kultivovaných lidských buňkách ionizujícím zářením: nedostatečné zprostředkování proteinovou kinázou C“. Mol Cell Biol. 11 (2): 1009–16. doi:10.1128 / MCB.11.2.1009. PMC 359769. PMID 1990262.

[pmid8226988-6] Hollander MC, Alamo I, Jackman J, Wang MG, McBride OW, Fornace AJ Jr (prosinec 1993). „Analýza savčího genu gadd45 a jeho reakce na poškození DNA“. J Biol Chem. 268 (32): 24385–93. PMID 8226988.

[entrez-7] A ^b „Entrez Gene: GADD45A zastavování růstu a indukovatelné poškození DNA, alfa“.

[pmid22147576-8] Walmsley RM, Tate M (2012). „Test GADD45a-GFP GreenScreen HC“. Methods Mol. Biol. Metody v molekulární biologii. 817: 231–50. doi:10.1007/978-1-61779-421-6_12. ISBN 978-1-61779-420-9. PMID 22147576.

[pmid20460379-9] Sánchez R, Pantoja-Uceda D, Prieto J, Diercks T, Marcaida MJ, Montoya G, Campos-Olivas R, Blanco FJ (červenec 2010). „Struktura řešení zastavování lidského růstu a poškození DNA 45alfa (Gadd45alfa) a jeho interakce s proliferujícím buněčným jaderným antigenem (PCNA) a kinázou Aurora A“. J. Biol. Chem. 285 (29): 22196–201. doi:10.1074 / jbc.M109.069344. PMC 2903397. PMID 20460379.

[pmid10362260-10] A ^b Zhan Q, Antinore MJ, Wang XW, Carrier F, Smith ML, Harris CC, Fornace AJ (květen 1999). „Asociace s Cdc2 a inhibice aktivity kinázy Cdc2 / Cyclin B1 proteinem Gadd45 regulovaným p53“. Onkogen. 18 (18): 2892–900. doi:10.1038 / sj.onc.1202667. PMID 10362260.

[pmid10747892-11] Jin S, Antinore MJ, Lung FD, Dong X, Zhao H, Fan F, Colchagie AB, Blanck P, Roller PP, Fornace AJ, Zhan Q (červen 2000). „Inhibice GADD45 kinázy Cdc2 koreluje s potlačením růstu zprostředkovaného GADD45“. J. Biol. Chem. 275 (22): 16602–8. doi:10,1074 / jbc.M000284200. PMID 10747892.

[pmid10973963-12] A ^b ^C Yang Q, Manicone A, Coursen JD, Linke SP, Nagashima M, Forgues M, Wang XW (listopad 2000). „Identifikace funkční domény v kontrolním bodě G2 / M zprostředkovaném GADD45“. J. Biol. Chem. 275 (47): 36892–8. doi:10,1074 / jbc.M005319200. PMID 10973963.

[pmid12124778-13] A ^b Vairapandi M, Balliet AG, Hoffman B, Liebermann DA (září 2002). „GADD45b a GADD45g jsou inhibitory kinázy cdc2 / cyklinB1 s rolí v kontrolních bodech buněčného cyklu S a G2 / M vyvolaných genotoxickým stresem“. J. Cell. Physiol. 192 (3): 327–38. doi:10.1002 / jcp.10140. PMID 12124778.

[pmid12716909-14] Chung HK, Yi YW, Jung NC, Kim D, Suh JM, Kim H, Park KC, Song JH, Kim DW, Hwang ES, Yoon SH, Bae YS, Kim JM, Bae I, Shong M (červenec 2003). „Faktor 1 interagující s CR6 interaguje s proteiny rodiny Gadd45 a moduluje buněčný cyklus“. J. Biol. Chem. 278 (30): 28079–88. doi:10,1074 / jbc.M212835200. PMID 12716909.

[pmid9827804-15] Takekawa M, Saito H (listopad 1998). "Rodina stresově indukovatelných proteinů podobných GADD45 zprostředkovává aktivaci stresově citlivých MTK1 / MEKK4 MAPKKK". Buňka. 95 (4): 521–30. doi:10.1016 / s0092-8674 (00) 81619-0. PMID 9827804.

[pmid10912791-16] Zhao H, Jin S, Antinore MJ, Lung FD, Fan F, Blanck P, Roller P, Fornace AJ, Zhan Q (červenec 2000). "Centrální oblast Gadd45 je vyžadována pro její interakci s p21 / WAF1". Exp. Cell Res. 258 (1): 92–100. doi:10,1006 / excr. 2000,4906. PMID 10912791.

[pmid7973727-17] Smith ML, Chen IT, Zhan Q, Bae I, Chen CY, Gilmer TM, Kastan MB, O'Connor PM, Fornace AJ (listopad 1994). „Interakce proteinu Gadd45 regulovaného p53 s nukleárním antigenem proliferujících buněk“. Věda. 266 (5189): 1376–80. doi:10.1126 / science.7973727. PMID 7973727.

[pmid7478510-18] Chen IT, Smith ML, O'Connor PM, Fornace AJ (listopad 1995). "Přímá interakce Gadd45 s PCNA a důkaz konkurenční interakce Gadd45 a p21Waf1 / Cip1 s PCNA". Onkogen. 11 (10): 1931–7. PMID 7478510.

[pmid10828065-19] Vairapandi M, Azam N, Balliet AG, Hoffman B, Liebermann DA (červen 2000). „Charakterizace domén interagujících s MyD118, Gadd45 a proliferujícími buněčnými nukleárními antigeny (PCNA). PCNA brání negativní kontrole růstu zprostředkovanou MyD118 A Gadd45“. J. Biol. Chem. 275 (22): 16810–9. doi:10.1074 / jbc.275.22.16810. PMID 10828065.

[pmid7784094-20] Hall PA, Kearsey JM, Coates PJ, Norman DG, Warbrick E, Cox LS (červen 1995). "Charakterizace interakce mezi PCNA a Gadd45". Onkogen. 10 (12): 2427–33. PMID 7784094.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

[11]

[12]

[13]

[14]

[15]

[16]

[17]

[18]

[19]

[20]