GRAFS - GRAFS - Wikipedia

The GPCR superrodina je největší genová rodina v lidském genomu obsahující přibližně 800 genů.[1] Vzhledem k tomu, že nadčeleď obratlovců lze fylogeneticky seskupit do pěti hlavních rodin, GRAFS byl navržen klasifikační systém.

GRAFS znamená Glutamát, Rhodopsin, Přilnavost, Frizzled /Chuť 2, Secretin.[2] Odpovídají klasickým třídám C (třída C., glutamát), A (podobné rhodopsinu ), B2 (Rodina receptorů sekretinu, dlouhý N-terminál), F (Frizzled /Uhlazen ) a B1 + 3 (další sekretin).[3] Chuť2 v poslední době považuje za bližší Podobný rhodopsinu receptory.[4]

Reference

  1. ^ Lander, ES; Linton, LM; Birren; Mezinárodní sekvenování lidského genomu, konsorcium; et al. (15. února 2001). „Počáteční sekvenování a analýza lidského genomu“ (PDF). Příroda. 409 (6822): 860–921. doi:10.1038/35057062. PMID  11237011.
  2. ^ Fredriksson, R; Lagerström, MC; Lundin, LG; Schiöth, HB (červen 2003). „Receptory spojené s G-proteinem v lidském genomu tvoří pět hlavních rodin. Fylogenetická analýza, paralogonové skupiny a otisky prstů“. Molekulární farmakologie. 63 (6): 1256–72. doi:10,1124 / mol.63.6.1256. PMID  12761335.
  3. ^ Krishnan, A; Almén, MS; Fredriksson, R; Schiöth, HB (2012). „Původ GPCR: identifikace savců, jako je rhodopsin, adheze, glutamát a kadeřavé GPCR v houbách“. PLOS ONE. 7 (1): e29817. doi:10.1371 / journal.pone.0029817. PMC  3251606. PMID  22238661.
  4. ^ Nordström KJ, Sällman Almén M, Edstam MM, Fredriksson R, Schiöth HB (září 2011). „Nezávislé HHsearch, Needleman - založené na Wunschových analýzách a analýzách motivů odhalily celkovou hierarchii většiny rodin receptorů spřažených s G proteinem“. Molekulární biologie a evoluce. 28 (9): 2471–80. doi:10,1093 / molbev / msr061. PMID  21402729.

Viz také