GGA3 - GGA3

GGA3
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	1JPL, 1JUQ, 1LF8, 1P4U, 1WR6, 1RD8
Identifikátory
Aliasy	GGA3, spojené s golgi, ucho obsahující gama adapin, protein vázající ARF 3
Externí ID	OMIM: 606006 MGI: 2384159 HomoloGene: 121703 Genové karty: GGA3
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 17 (lidský)
Konec	75,262,363 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 11 (myš)
Konec	115,604,051 bp
Exprese RNA vzor
	; ;
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• GO: 0001948 vazba na proteiny; • Vazba na ADP-ribosylační faktor; • vazba ubikvitinu;
Buněčná složka	• endozom; • trans-Golgiho síť; • endosomová membrána; • intracelulární; • membrána; • komplex adaptéru clathrin; • Golgiho aparát; • časná endosomová membrána; • recyklace endosomové membrány; • časný endosom; • recyklace endosomu;
Biologický proces	• transport bílkovin; • buněčný proteinový metabolický proces; • transport intracelulárních proteinů; • pozitivní regulace proteinového katabolického procesu; • transport zprostředkovaný vezikuly; • lokalizace proteinu do lysozomu; • regulace stability proteinu; • destabilizace bílkovin; • endocytová recyklace; • lokalizace proteinu na buněčný povrch; • Transport proteinu Golgiho na plazmatickou membránu; • negativní regulace tvorby amyloidu-beta;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	23163
	260302
	ENSG00000125447
	ENSMUSG00000020740
	Q9NZ52
	Q8BMI3
NM_001172703; NM_001172704; NM_001291641; NM_001291642; NM_014001;
	NM_138619
	NM_001252067; NM_173048
NP_001166174; NP_001166175; NP_001278570; NP_001278571; NP_054720;
	NP_619525
	NP_001238996; NP_766636
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Protein vázající ADP-ribosylační faktor GGA3 je protein že u lidí je kódován GGA3 gen.^[5]^[6]

Tento gen kóduje člena rodiny Golgiho lokalizovaného gamma adaptinového ucha obsahujícího rodinu ARF vázajícího (GGA). Tato rodina zahrnuje všudypřítomné obalové proteiny, které regulují přenos proteinů mezi trans-Golgiho sítí a lysozomem. Tyto proteiny sdílejí aminoterminální VHS doménu, která zprostředkovává třídění manózo-6-fosfátových receptorů v trans-Golgiho síti. Obsahují také karboxyterminální oblast s homologií k ušní doméně gama-adapinů. Alternativní sestřih tohoto genu vede ke dvěma variantám transkriptu.^[7]

Interakce

Bylo prokázáno, že GGA3 komunikovat s ARF1^[5]^[8] a ARF3.^[6]^[9]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000125447 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000020740 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ ^A ^b Dell'Angelica EC, Puertollano R, Mullins C, Aguilar RC, Vargas JD, Hartnell LM, Bonifacino JS (duben 2000). „GGA: rodina proteinů vázajících ribosylační faktor ADP souvisejících s adaptéry a spojených s komplexem Golgi“. The Journal of Cell Biology. 149 (1): 81–94. doi:10.1083 / jcb.149.1.81. PMC 2175099. PMID 10747089.
^ ^A ^b Boman AL, Zhang C, Zhu X, Kahn RA (duben 2000). "Rodina efektorů faktoru ADP-ribosylace, které mohou změnit transport membrány přes trans-Golgiho". Molekulární biologie buňky. 11 (4): 1241–55. doi:10,1091 / mbc.11.4.1241. PMC 14844. PMID 10749927.
^ „Entrez Gene: GGA3 golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3“.
^ Puertollano R, Randazzo PA, Presley JF, Hartnell LM, Bonifacino JS (duben 2001). „GGA podporují nábor klathrinu do TGN závislý na ARF“. Buňka. 105 (1): 93–102. doi:10.1016 / S0092-8674 (01) 00299-9. PMID 11301005. S2CID 1158816.
^ Boman AL, Salo PD, Hauglund MJ, Strand NL, Rensink SJ, Zhdankina O (září 2002). „Interakce ADP-ribosylační faktor (ARF) není dostatečná pro funkci nebo lokalizaci kvasinkového GGA proteinu“. Molekulární biologie buňky. 13 (9): 3078–95. doi:10,1091 / mbc.E02-02-0078. PMC 124144. PMID 12221117.

Další čtení

Nagase T, Seki N, Tanaka A, Ishikawa K, Nomura N (srpen 1995). „Predikce kódujících sekvencí neidentifikovaných lidských genů. IV. Kódující sekvence 40 nových genů (KIAA0121-KIAA0160) odvozené analýzou cDNA klonů z lidské buněčné linie KG-1“. Výzkum DNA. 2 (4): 167–74, 199–210. doi:10.1093 / dnares / 2.4.167. PMID 8590280.
Hirst J, Lui WW, Bright NA, Totty N, Seaman MN, Robinson MS (duben 2000). „Rodina proteinů s gama-adapinovými a VHS doménami, které usnadňují obchodování mezi trans-Golgiho sítí a vakuolem / lysozomem“. The Journal of Cell Biology. 149 (1): 67–80. doi:10.1083 / jcb.149.1.67. PMC 2175106. PMID 10747088.
Takatsu H, Yoshino K, Nakayama K (květen 2000). „Adaptační doména gama ušní homologie konzervovaná v gama-adapinových a GGA proteinech, které interagují s gama-synerginem“. Sdělení o biochemickém a biofyzikálním výzkumu. 271 (3): 719–25. doi:10,1006 / bbrc.2000.2700. PMID 10814529.
Puertollano R, Randazzo PA, Presley JF, Hartnell LM, Bonifacino JS (duben 2001). „GGA podporují nábor klathrinu do TGN závislý na ARF“. Buňka. 105 (1): 93–102. doi:10.1016 / S0092-8674 (01) 00299-9. PMID 11301005. S2CID 1158816.
Puertollano R, Aguilar RC, Gorshkova I, Crouch RJ, Bonifacino JS (červen 2001). "Třídění manózo-6-fosfátových receptorů zprostředkovaných GGA". Věda. 292 (5522): 1712–6. Bibcode:2001Sci ... 292.1712P. doi:10.1126 / science.1060750. PMID 11387475. S2CID 30836125.
Misra S, Puertollano R, Kato Y, Bonifacino JS, Hurley JH (únor 2002). "Strukturální základna pro rozpoznání signálu třídění kyselých klastrů-dileucinů podle domén VHS". Příroda. 415 (6874): 933–7. Bibcode:2002 Natur.415..933M. doi:10.1038 / 415933a. PMID 11859375. S2CID 4430757.
Takatsu H, Yoshino K, Toda K, Nakayama K (červenec 2002). „GGA proteiny se asociují s Golgiho membránami prostřednictvím interakce mezi jejich GGAH doménami a ADP-ribosylačními faktory“. The Biochemical Journal. 365 (Pt 2): 369–78. doi:10.1042 / BJ20020428. PMC 1222692. PMID 11950392.
Kato Y, Misra S, Puertollano R, Hurley JH, Bonifacino JS (červenec 2002). „Fosforegulace třídění interakcí signálu a domény VHS přímým elektrostatickým mechanismem“. Přírodní strukturní biologie. 9 (7): 532–6. doi:10.1038 / nsb807. PMID 12032548. S2CID 23740463.
Doray B, Bruns K, Ghosh P, Kornfeld SA (červen 2002). "Autoinhibice vazebného místa pro ligand GGA1 / 3 VHS domén interním kyselým motivem klastru-dileucinu". Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 99 (12): 8072–7. Bibcode:2002PNAS ... 99.8072D. doi:10.1073 / pnas.082235699. PMC 123022. PMID 12060753.
Wasiak S, Legendre-Guillemin V, Puertollano R, Blondeau F, Girard M, de Heuvel E, Boismenu D, Bell AW, Bonifacino JS, McPherson PS (září 2002). „Enthoprotin: nový protein spojený s klatrinem identifikovaný prostřednictvím subcelulární proteomiky“. The Journal of Cell Biology. 158 (5): 855–62. doi:10.1083 / jcb.200205078. PMC 2173151. PMID 12213833.
Doray B, Ghosh P, Griffith J, Geuze HJ, Kornfeld S (září 2002). „Spolupráce GGA a AP-1 při balení MPR v síti trans-Golgi“. Věda. 297 (5587): 1700–3. Bibcode:2002Sci ... 297.1700D. doi:10.1126 / science.1075327. PMID 12215646. S2CID 8810528.
Boman AL, Salo PD, Hauglund MJ, Strand NL, Rensink SJ, Zhdankina O (září 2002). „Interakce ADP-ribosylační faktor (ARF) není dostatečná pro funkci nebo lokalizaci kvasinkového GGA proteinu“. Molekulární biologie buňky. 13 (9): 3078–95. doi:10,1091 / mbc.E02-02-0078. PMC 124144. PMID 12221117.
Mattera R, Arighi CN, Lodge R, Zerial M, Bonifacino JS (leden 2003). „Divalentní interakce GGA s komplexem Rabaptin-5-Rabex-5“. Časopis EMBO. 22 (1): 78–88. doi:10.1093 / emboj / cdg015. PMC 140067. PMID 12505986.
Wakasugi M, Waguri S, Kametaka S, Tomiyama Y, Kanamori S, Shiba Y, Nakayama K, Uchiyama Y (červenec 2003). "Převládající exprese krátké formy GGA3 v lidských buněčných liniích a tkáních". Sdělení o biochemickém a biofyzikálním výzkumu. 306 (3): 687–92. doi:10.1016 / S0006-291X (03) 01032-5. PMID 12810073.
He X, Zhu G, Koelsch G, Rodgers KK, Zhang XC, Tang J (říjen 2003). „Biochemická a strukturní charakterizace interakce cytosolické domény memapsinu 2 (beta-sekretázy) s doménou VHS proteinů GGA“. Biochemie. 42 (42): 12174–80. doi:10.1021 / bi035199h. PMID 14567678.
Ghosh P, Griffith J, Geuze HJ, Kornfeld S (listopad 2003). „Savčí GGA působí společně při třídění manózových 6-fosfátových receptorů“. The Journal of Cell Biology. 163 (4): 755–66. doi:10.1083 / jcb.200308038. PMC 2173681. PMID 14638859.
Shiba Y, Katoh Y, Shiba T, Yoshino K, Takatsu H, Kobayashi H, Shin HW, Wakatsuki S, Nakayama K (únor 2004). „Doména GAT (GGA a Tom1) odpovědná za vazbu ubikvitinu a ubikvitinaci“. The Journal of Biological Chemistry. 279 (8): 7105–11. doi:10,1074 / jbc.M311702200. PMID 14660606.

Tento článek o gen na lidský chromozom 17 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000125447 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000020740 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid10747089-5] A ^b Dell'Angelica EC, Puertollano R, Mullins C, Aguilar RC, Vargas JD, Hartnell LM, Bonifacino JS (duben 2000). „GGA: rodina proteinů vázajících ribosylační faktor ADP souvisejících s adaptéry a spojených s komplexem Golgi“. The Journal of Cell Biology. 149 (1): 81–94. doi:10.1083 / jcb.149.1.81. PMC 2175099. PMID 10747089.

[pmid10749927-6] A ^b Boman AL, Zhang C, Zhu X, Kahn RA (duben 2000). "Rodina efektorů faktoru ADP-ribosylace, které mohou změnit transport membrány přes trans-Golgiho". Molekulární biologie buňky. 11 (4): 1241–55. doi:10,1091 / mbc.11.4.1241. PMC 14844. PMID 10749927.

[entrez-7] „Entrez Gene: GGA3 golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3“.

[pmid11301005-8] Puertollano R, Randazzo PA, Presley JF, Hartnell LM, Bonifacino JS (duben 2001). „GGA podporují nábor klathrinu do TGN závislý na ARF“. Buňka. 105 (1): 93–102. doi:10.1016 / S0092-8674 (01) 00299-9. PMID 11301005. S2CID 1158816.

[pmid12221117-9] Boman AL, Salo PD, Hauglund MJ, Strand NL, Rensink SJ, Zhdankina O (září 2002). „Interakce ADP-ribosylační faktor (ARF) není dostatečná pro funkci nebo lokalizaci kvasinkového GGA proteinu“. Molekulární biologie buňky. 13 (9): 3078–95. doi:10,1091 / mbc.E02-02-0078. PMC 124144. PMID 12221117.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]