Francisella malé RNA - Francisella small RNAs

Několik malé RNA byly identifikovány v Francisella tularensis, patogenní bakterie, která chorobu způsobuje tularémie. Víme jen velmi málo Francisella regulační sítě které umožňují této bakterii přežít v mnoha prostředích.

Ftr A a Ftr B (Francisella tularensis sRNA A a B) byly první sRNA identifikované v F. tularensis, konkrétněji v F. t. holarctica. Experimentální analýza potvrdila výraz známých nekódující RNA: tmRNA a 4,5S RNA, jakož i identifikace 2 nových sRNA Ftr A a Ftr B. V celém genomu in silico Vyhledávání našel několik dalších sRNA. Ftr A a Ftr B podíl č sekvenční podobnost nebo konzervovaný genomový kontext s jakoukoli dříve anotovanou regulační RNA. Delece Ftr A a Ftr B vedla k významným změnám v expresi několika mRNA. Nezměnilo se to však Francisellapřežití během normálního růstu nebo ve stresových podmínkách. Také delece těchto sRNA neovlivnila schopnost bakterií vyvolat onemocnění u a model myši.[1] Hlavní studie v F. t. novicida později prokázáno FtrA být spojen s a Systém CRISPR / Cas a potlačit endogenní transkript kódující bakteriální lipoprotein.[2]

FtrC (Francisella tularensis sRNA C) je první sRNA, která moduluje virulence kapacita F. tularensis. Vysoká exprese FtrC snižuje intracelulární množení bakterií v makrofágy a v orgánech infikovaných myší. Byl také identifikován cílový gen FtrC mRNA, ale není do něj zapojen Francisella násobení.[3]

Reference

  1. ^ Postic, Guillaume; Frapy, Eric; Dupuis, Marion; Dubail, Iharilalao; Livny, Jonathan; Charbit, Alain; Meibom, Karin L. (10.11.2010). „Identifikace malých RNA ve Francisella tularensis“. BMC Genomics. 11: 625. doi:10.1186/1471-2164-11-625. ISSN  1471-2164. PMC  3091763. PMID  21067590.
  2. ^ Sampson, Timothy R .; Saroj, Sunil D .; Llewellyn, Anna C .; Tzeng, Yih-Ling; Weiss, David S. (2013). „Systém CRISPR / Cas zprostředkovává vrozené imunitní úniky a virulenci bakterií“. Příroda. 497 (7448): 254–257. doi:10.1038 / nature12048. ISSN  1476-4687. PMC  3651764. PMID  23584588.
  3. ^ Postic, Guillaume; Dubail, Iharilalao; Frapy, Eric; Dupuis, Marion; Dieppedale, Jennifer; Charbit, Alain; Meibom, Karin L. (2012). „Identifikace nové malé RNA modulující patogenitu Francisella tularensis“. PLOS ONE. 7 (7): e41999. doi:10,1371 / journal.pone.0041999. ISSN  1932-6203. PMC  3405028. PMID  22848684.