Fimbriální usher protein - Fimbrial usher protein
| Fimbrial Usher protein | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 Struktura montážní plošiny pilus typu 1 FimD (25-139).[1] | |||||||||
| Identifikátory | |||||||||
| Symbol | Usher | ||||||||
| Pfam | PF00577 | ||||||||
| InterPro | IPR000015 | ||||||||
| STRÁNKA | PDOC00886 | ||||||||
| TCDB | 1.B.11 | ||||||||
| OPM nadčeleď | 187 | ||||||||
| OPM protein | 4j3o | ||||||||
| |||||||||
The fimbrický usher protein podílí se na biogenezi pilus v Gramnegativní bakterie. Biogeneze fimbrií (nebo pili) vyžaduje dvousložkový montážní a transportní systém, který se skládá z periplazmatického chaperonu a proteinu vnější membrány, který se nazývá molekulární „usher“.[2][3][4]
Uváděcí protein má molekulovou hmotnost v rozmezí od 86 do 100 kDa a je složen z membrány překlenující 24vláknovou doménu beta barelu, která připomíná poriny a čtyř periplazmatických rozpustných domén: N-koncový jeden z přibližně 120 zbytků (NTD),[1] „střední“ doména s přibližně 80 zbytky[5] umístěn jako rozpustná inzerce v oblasti beta hlavně sekvence (zástrčná doména) a dvou IG-podobných domén (každá o délce přibližně 80 zbytků) na C-konci (CTD1 a CTD2).[6] Ačkoli stupeň podobnosti sekvencí těchto proteinů není příliš vysoký, sdílejí řadu charakteristik. Jedním z nich je přítomnost dvou párů cysteinů tvořících disulfidovou vazbu, první se nachází v NTD a druhý v CTD2. Nejlepší konzervovaná oblast sekvence odpovídá zásuvné doméně.
Reference
- ^ A b Nishiyama M, Horst R, Eidam O a kol. (Červen 2005). „Strukturální základ rozpoznávání komplexu chaperon – podjednotka pomocí montážní platformy pilus typu 1 FimD“. EMBO J.. 24 (12): 2075–86. doi:10.1038 / sj.emboj.7600693. PMC 1150887. PMID 15920478.
- ^ Hultgren SJ, Jacob-Dubuisson F, Striker R (1994). "Chaperonem asistovaná samoskladba pili nezávislá na buněčné energii". J. Biol. Chem. 269 (17): 12447–12455. PMID 7909802.
- ^ Schifferli DM, Alrutz MA (1994). „Přípustná místa pro vložení linkeru do proteinu vnější membrány 987P fimbrií Escherichia coli“. J. Bacteriol. 176 (4): 1099–1110. doi:10.1128 / JB.176.4.1099-1110.1994. PMC 205162. PMID 7906265.
- ^ Saier Jr. MH, Van Rosmalen M (1993). "Strukturální a evoluční vztahy mezi dvěma rodinami bakteriálních extracytoplazmatických chaperonových proteinů, které fungují kooperativně ve fimbriálním uspořádání". Res. Microbiol. 144 (7): 507–527. doi:10.1016 / 0923-2508 (93) 90001-I. PMID 7906046.
- ^ Capitani G, Eidam O, Grütter MG (2006). „Důkazy o nové doméně zavaděčů vnější bakteriální membrány“. Proteiny. 65 (4): 816–23. doi:10,1002 / prot.21147. PMID 17066380. S2CID 28766740.
- ^ Phan G, Remaut H, Wang T, Allen WJ, Pirker KF, Lebedev A, et al. (2011). „Krystalová struktura uvaděče FimD vázaná na jeho příbuzný substrát FimC-FimH“. Příroda. 474 (7349): 49–53. doi:10.1038 / příroda10109. PMC 3162478. PMID 21637253.