FBXW7 - FBXW7 - Wikipedia

FBXW7
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	2OVP, 2OVQ, 2OVR, 5IBK
Identifikátory
Aliasy	FBXW7, AGO, CDC4, FBW6, FBW7, FBX30, FBXO30, FBXW6, SEL-10, SEL10, hAgo, hCdc4, F-box a WD opakující se doména obsahující 7
Externí ID	OMIM: 606278 MGI: 1354695 HomoloGene: 117451 Genové karty: FBXW7
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 4 (lidský)
Konec	152,536,092 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 3 (myš)
Konec	84,979,198 bp
Exprese RNA vzor
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• vazba na bílkoviny, přemostění; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • aktivita aktivátoru ubikvitin-protein transferáza; • identická vazba na protein; • vazba ubikvitinové proteinové ligázy; • cyklinová vazba; • vazba fosfotreoninového zbytku; • aktivita ubikvitin-protein transferázy; • ubikvitinová vazba;
Buněčná složka	• cytoplazma; • Komplex ubikvitinové ligázy Parkin-FBXW7-Cul1; • Komplex ubikvitin ligázy SCF; • nukleoplazma; • jádro; • buněčné jádro; • cytosol; • mitochondrie; • endoplazmatické retikulum; • Golgiho aparát; • perinukleární oblast cytoplazmy;
Biologický proces	• pozitivní regulace aktivity receptoru aktivovaného epidermálním růstovým faktorem; • pozitivní regulace cílení proteinů na mitochondrie; • negativní regulace SREBP signální dráhy; • buněčná odpověď na UV záření; • negativní regulace procesu biosyntézy triglyceridů; • stabilizace bílkovin; • negativní regulace proliferace hepatocytů; • soudržnost sesterských chromatid; • buněčná odpověď na stimul poškození DNA; • regulace lokalizace proteinů; • pozitivní regulace neuronu vnitřní apoptotické signální dráhy indukované oxidačním stresem; • SCF-závislý proteazomální ubikvitin-dependentní proteinový katabolický proces; • vývoj vaskulatury; • regulace autofagie mitochondrií; • negativní regulace endoreduplikace DNA; • pozitivní regulace aktivity ubikvitin-protein transferázy; • pozitivní regulace ubikvitinace bílkovin zapojená do katabolického procesu proteinu závislého na ubikvitinu; • ubikvitinace bílkovin; • homeostáza lipidů; • pozitivní regulace kaskády ERK1 a ERK2; • regulace fázového přechodu G1 / S buněčného cyklu; • regulace ukládání lipidů; • GO: virový proces 0022415; • pozitivní regulace katabolického procesu proteinu proteinu; • pozitivní regulace ubikvitinace bílkovin; • negativní regulace signální dráhy Notch; • polyubikvitinace bílkovin; • posttranslační modifikace; • negativní regulace vývoje osteoklastů; • vaskulogeneze; • Signální dráha zářezu; • negativní regulace genové exprese; • recyklace ubikvitinu; • vývoj plic; • destabilizace bílkovin; • proteazomem zprostředkovaný katabolický proces proteinu závislý na ubikvitinu; • regulace buněčné migrace podílející se na klíčení angiogeneze; • negativní regulace vazby DNA specifické pro sekvenci regulační oblasti RNA polymerázy II; • regulace cirkadiánního rytmu; • rytmický proces;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	55294
	50754
	ENSG00000109670
	ENSMUSG00000028086
	Q969H0
	Q8VBV4
	NM_001013415; NM_001257069; NM_018315; NM_033632; NM_001349798
	NM_001177773; NM_001177774; NM_080428
	NP_001013433; NP_001243998; NP_060785; NP_361014; NP_001336727
	NP_001171244; NP_001171245; NP_536353
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Protein obsahující F-box / WD opakovaně 7 je protein že u lidí je kódován FBXW7 gen.^[5]^[6]^[7]

Funkce

Tento gen kóduje člena rodiny proteinů F-box, který se vyznačuje přibližně 40 aminokyselinovým motivem, F-boxem. Proteiny F-boxu tvoří jednu ze čtyř podjednotek komplex ubikvitinové proteinové ligázy nazývané SCF (SKP1-cullin-F-box), které fungují v ubikvitinaci závislé na fosforylaci. F-box proteiny jsou rozděleny do 3 tříd: Fbws obsahující domény WD-40, Fbls obsahující repetice bohaté na leucin a Fbxs obsahující buď různé moduly interakce protein-protein nebo žádné rozpoznatelné motivy. Protein kódovaný tímto genem byl dříve označován jako FBX30 a patří do třídy Fbws; kromě F-boxu tento protein obsahuje 7 tandemových opakování WD40. Tento protein se váže přímo na cyklin E a pravděpodobně se zaměřuje na cyklin E pro degradaci zprostředkovanou ubikvitinem. Další dobře zavedené pro-proliferativní cíle FBXW7 jsou c-Myc a Notch1. Mono alelické mutace v tomto genu jsou detekovány u sporadických rakovin [např. Cholangiokarcinom (35%), T-ALL (31%), karcinom endometria (16%), kolorektální karcinom (16%), rakovina močového měchýře (10%), karcinom žaludku (6%), karcinom plicních spinocelulárních buněk (5%) atd.]. Tato zjištění implikují potenciální roli genu v patogenezi lidských rakovin. Navzdory tomu, že je obecně uznáván jako haploinsufficient tumor supresor, mutace nebyly nalezeny u některých druhů rakoviny, jako je akutní myeloidní leukémie a mnohočetný myelom. Jednou z možností je, že stabilizace substrátu FBXW7 je u těchto novotvarů škodlivá. Například substrát FBXW7 C / EBPα potlačuje AML^[8] a mnohočetné myelomy vyžadují konstitutivní signalizaci NF-kB; proto narušení FBXW7 zprostředkované ubikvitylace IκBd v těchto nádorech vede k buněčné smrti.^[9]^[10]

Pro tento gen byly nalezeny tři varianty transkriptu kódující tři různé izoformy.^[7]

Interakce

FBXW7 bylo prokázáno komunikovat s:

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000109670 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000028086 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Winston JT, Koepp DM, Zhu C, Elledge SJ, Harper JW (prosinec 1999). "Rodina savčích proteinů F-boxu". Curr Biol. 9 (20): 1180–2. doi:10.1016 / S0960-9822 (00) 80021-4. PMID 10531037. S2CID 14341845.
^ Gupta-Rossi N, Le Bail O, Gonen H, Brou C, Logeat F, Six E, Ciechanover A, Israël A (září 2001). „Funkční interakce mezi SEL-10, proteinem F-boxu a jadernou formou aktivovaného receptoru Notch1“. J Biol Chem. 276 (37): 34371–8. doi:10,1074 / jbc.M101343200. PMID 11425854.
^ ^A ^b „Entrez Gene: FBXW7 F-box a WD opakovaná doména obsahující 7“.
^ Bengoechea-Alonso MT, Ericsson J (červen 2010). „Ubikvitin ligáza Fbxw7 řídí diferenciaci adipocytů zaměřením na degradaci C / EBPalfa“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 107 (26): 11817–22. doi:10.1073 / pnas.0913367107. PMC 2900639. PMID 20534483.
^ Busino L, Millman SE, Scotto L, Kyratsous CA, Basrur V, O'Connor O, Hoffmann A, Elenitoba-Johnson KS, Pagano M (březen 2012). „Degradace p100 zprostředkovaná Fbxw7α a GSK3 je mechanismem pro přežití u mnohočetného myelomu“. Přírodní buněčná biologie. 14 (4): 375–85. doi:10.1038 / ncb2463. PMC 3339029. PMID 22388891.
^ Busino L, Millman SE, Pagano M (prosinec 2012). „SCF zprostředkovaná degradace p100 (NF-κB2): mechanismy a význam u mnohočetného myelomu“. Vědecká signalizace. 5 (253): pt14. doi:10.1126 / scisignal.2003408. PMC 3871187. PMID 23211527.
^ Kanei-Ishii C, Nomura T, Takagi T, Watanabe N, Nakayama KI, Ishii S (listopad 2008). „Fbxw7 působí jako ubikvitinová ligáza E3, která cílí na c-Myb pro degradaci indukovanou nemo-jako kinázou (NLK)“. J. Biol. Chem. 283 (45): 30540–8. doi:10,1074 / jbc.M804340200. PMC 2662147. PMID 18765672.
^ Olson BL, Hock MB, Ekholm-Reed S, Wohlschlegel JA, Dev KK, Kralli A, Reed SI (leden 2008). „SCFCdc4 působí antagonisticky na transkripční koaktivátor PGC-1alfa tím, že jej zacílí na proteolýzu zprostředkovanou ubikvitinem“. Genes Dev. 22 (2): 252–64. doi:10.1101 / gad.1624208. PMC 2192758. PMID 18198341.
^ ^A ^b Staropoli JF, McDermott C, Martinat C, Schulman B, Demireva E, Abeliovich A (březen 2003). „Parkin je součástí komplexu ubikvitin ligázy podobného SCF a chrání postmitotické neurony před excitotoxicitou kainátu“. Neuron. 37 (5): 735–49. doi:10.1016 / s0896-6273 (03) 00084-9. PMID 12628165. S2CID 17024826.
^ Wu G, Lyapina S, Das I, Li J, Gurney M, Pauley A, Chui I, Deshaies RJ, Kitajewski J (listopad 2001). „SEL-10 je inhibitor signalizace zářezu, který cílí na zářez pro degradaci proteinu zprostředkovanou ubikvitinem“. Mol. Buňka. Biol. 21 (21): 7403–15. doi:10.1128 / MCB.21.21.7403-7415.2001. PMC 99913. PMID 11585921.

Další čtení

Robertson NG, Khetarpal U, Gutiérrez-Espeleta GA, Bieber FR, Morton CC (1995). „Izolace nových a známých genů z knihovny lidského kochleárního cDNA pomocí subtraktivní hybridizace a diferenciálního screeningu“. Genomika. 23 (1): 42–50. doi:10.1006 / geno.1994.1457. PMID 7829101.
Maruyama K, Sugano S (1994). „Oligo-capping: jednoduchá metoda k nahrazení struktury cap eukaryotických mRNA oligoribonukleotidy“. Gen. 138 (1–2): 171–4. doi:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID 8125298.
Suzuki Y, Yoshitomo-Nakagawa K, Maruyama K, Suyama A, Sugano S (1997). "Konstrukce a charakterizace knihovny cDNA obohacené o celou délku a 5'-end". Gen. 200 (1–2): 149–56. doi:10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3. PMID 9373149.
Oberg C, Li J, Pauley A, Wolf E, Gurney M, Lendahl U (2001). „Nitrobuněčná doména Notch je ubikvitinovaná a negativně regulovaná savčím homologem Sel-10“. J. Biol. Chem. 276 (38): 35847–53. doi:10,1074 / jbc.M103992200. PMID 11461910.
Koepp DM, Schaefer LK, Ye X, Keyomarsi K, Chu C, Harper JW, Elledge SJ (2001). "Fosforylace závislá ubikvitinace cyklinu E pomocí SCFFbw7 ubikvitin ligázy". Věda. 294 (5540): 173–7. doi:10.1126 / science.1065203. PMID 11533444. S2CID 23404627.
Moberg KH, Bell DW, Wahrer DC, Haber DA, Hariharan IK (2001). „Souostroví reguluje hladiny cyklinu E v Drosophile a je mutováno v lidských buněčných liniích rakoviny“. Příroda. 413 (6853): 311–6. doi:10.1038/35095068. PMID 11565033. S2CID 4372821.
Strohmaier H, Spruck CH, Kaiser P, Won KA, Sangfelt O, Reed SI (2001). „Lidský protein F-box hCdc4 se zaměřuje na cyklin E kvůli proteolýze a je mutován v buněčné linii rakoviny prsu“. Příroda. 413 (6853): 316–22. doi:10.1038/35095076. PMID 11565034. S2CID 478973.
Wu G, Lyapina S, Das I, Li J, Gurney M, Pauley A, Chui I, Deshaies RJ, Kitajewski J (2001). „SEL-10 je inhibitorem signalizace zářezu, která cílí na zářez pro degradaci proteinů zprostředkovanou ubikvitinem“. Mol. Buňka. Biol. 21 (21): 7403–15. doi:10.1128 / MCB.21.21.7403-7415.2001. PMC 99913. PMID 11585921.
Spruck CH, Strohmaier H, Sangfelt O, Müller HM, Hubalek M, Müller-Holzner E, Marth C, Widschwendter M, Reed SI (2002). "genové mutace hCDC4 u rakoviny endometria". Cancer Res. 62 (16): 4535–9. PMID 12183400.
Li J, Pauley AM, Myers RL, Shuang R, Brashler JR, Yan R, Buhl AE, Ruble C, Gurney ME (2002). „SEL-10 interaguje s presenilinem 1, usnadňuje jeho ubikvitinaci a mění produkci peptidu A-beta“. J. Neurochem. 82 (6): 1540–8. doi:10.1046 / j.1471-4159.2002.01105.x. PMID 12354302. S2CID 29687815.
Staropoli JF, McDermott C, Martinat C, Schulman B, Demireva E, Abeliovich A (2003). „Parkin je součástí komplexu ubikvitin ligázy podobného SCF a chrání postmitotické neurony před excitotoxicitou kainátu“. Neuron. 37 (5): 735–49. doi:10.1016 / S0896-6273 (03) 00084-9. PMID 12628165. S2CID 17024826.
Calhoun ES, Jones JB, Ashfaq R, Adsay V, Baker SJ, Valentine V, Hempen PM, Hilgers W, Yeo CJ, Hruban RH, Kern SE (2003). „Mutace BRAF a FBXW7 (CDC4, FBW7, AGO, SEL10) v různých podskupinách rakoviny pankreatu: potenciální terapeutické cíle“. Dopoledne. J. Pathol. 163 (4): 1255–60. doi:10.1016 / S0002-9440 (10) 63485-2. PMC 1868306. PMID 14507635.
Welcker M, Singer J, Loeb KR, Grim J, Bloecher A, Gurien-West M, Clurman BE, Roberts JM (2003). „Vícemístná fosforylace pomocí Cdk2 a GSK3 řídí degradaci cyklinu E“. Mol. Buňka. 12 (2): 381–92. doi:10.1016 / S1097-2765 (03) 00287-9. PMID 14536078.
Busino L, Donzelli M, Chiesa M, Guardavaccaro D, Ganoth D, Dorrello NV, Hershko A, Pagano M, Draetta GF (2003). „Degradace Cdc25A beta-TrCP během S fáze a v reakci na poškození DNA“. Příroda. 426 (6962): 87–91. doi:10.1038 / nature02082. PMID 14603323. S2CID 768783.
Cassia R, Moreno-Bueno G, Rodríguez-Perales S, Hardisson D, Cigudosa JC, Palacios J (2004). "Amplifikace genu pro cyklin E (CCNE) a mutace hCDC4 v karcinomu endometria". J. Pathol. 201 (4): 589–95. doi:10,1002 / cesta.1474. PMID 14648662. S2CID 26390858.
Nateri AS, Riera-Sans L, Da Costa C, Behrens A (2004). "Ubikvitin ligáza SCFFbw7 antagonizuje apoptotickou JNK signalizaci". Věda. 303 (5662): 1374–8. doi:10.1126 / science.1092880. PMID 14739463. S2CID 36368075.

Tento článek o gen na lidský chromozom 4 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000109670 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000028086 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid10531037-5] Winston JT, Koepp DM, Zhu C, Elledge SJ, Harper JW (prosinec 1999). "Rodina savčích proteinů F-boxu". Curr Biol. 9 (20): 1180–2. doi:10.1016 / S0960-9822 (00) 80021-4. PMID 10531037. S2CID 14341845.

[pmid11425854-6] Gupta-Rossi N, Le Bail O, Gonen H, Brou C, Logeat F, Six E, Ciechanover A, Israël A (září 2001). „Funkční interakce mezi SEL-10, proteinem F-boxu a jadernou formou aktivovaného receptoru Notch1“. J Biol Chem. 276 (37): 34371–8. doi:10,1074 / jbc.M101343200. PMID 11425854.

[entrez-7] A ^b „Entrez Gene: FBXW7 F-box a WD opakovaná doména obsahující 7“.

[pmid20534483-8] Bengoechea-Alonso MT, Ericsson J (červen 2010). „Ubikvitin ligáza Fbxw7 řídí diferenciaci adipocytů zaměřením na degradaci C / EBPalfa“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 107 (26): 11817–22. doi:10.1073 / pnas.0913367107. PMC 2900639. PMID 20534483.

[pmid22388891-9] Busino L, Millman SE, Scotto L, Kyratsous CA, Basrur V, O'Connor O, Hoffmann A, Elenitoba-Johnson KS, Pagano M (březen 2012). „Degradace p100 zprostředkovaná Fbxw7α a GSK3 je mechanismem pro přežití u mnohočetného myelomu“. Přírodní buněčná biologie. 14 (4): 375–85. doi:10.1038 / ncb2463. PMC 3339029. PMID 22388891.

[pmid23211527-10] Busino L, Millman SE, Pagano M (prosinec 2012). „SCF zprostředkovaná degradace p100 (NF-κB2): mechanismy a význam u mnohočetného myelomu“. Vědecká signalizace. 5 (253): pt14. doi:10.1126 / scisignal.2003408. PMC 3871187. PMID 23211527.

[pmid18765672-11] Kanei-Ishii C, Nomura T, Takagi T, Watanabe N, Nakayama KI, Ishii S (listopad 2008). „Fbxw7 působí jako ubikvitinová ligáza E3, která cílí na c-Myb pro degradaci indukovanou nemo-jako kinázou (NLK)“. J. Biol. Chem. 283 (45): 30540–8. doi:10,1074 / jbc.M804340200. PMC 2662147. PMID 18765672.

[pmid18198341-12] Olson BL, Hock MB, Ekholm-Reed S, Wohlschlegel JA, Dev KK, Kralli A, Reed SI (leden 2008). „SCFCdc4 působí antagonisticky na transkripční koaktivátor PGC-1alfa tím, že jej zacílí na proteolýzu zprostředkovanou ubikvitinem“. Genes Dev. 22 (2): 252–64. doi:10.1101 / gad.1624208. PMC 2192758. PMID 18198341.

[pmid12628165-13] A ^b Staropoli JF, McDermott C, Martinat C, Schulman B, Demireva E, Abeliovich A (březen 2003). „Parkin je součástí komplexu ubikvitin ligázy podobného SCF a chrání postmitotické neurony před excitotoxicitou kainátu“. Neuron. 37 (5): 735–49. doi:10.1016 / s0896-6273 (03) 00084-9. PMID 12628165. S2CID 17024826.

[pmid11585921-14] Wu G, Lyapina S, Das I, Li J, Gurney M, Pauley A, Chui I, Deshaies RJ, Kitajewski J (listopad 2001). „SEL-10 je inhibitor signalizace zářezu, který cílí na zářez pro degradaci proteinu zprostředkovanou ubikvitinem“. Mol. Buňka. Biol. 21 (21): 7403–15. doi:10.1128 / MCB.21.21.7403-7415.2001. PMC 99913. PMID 11585921.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

[11]

[12]

[13]

[14]