FAM114A2 - FAM114A2

FAM114A2
Identifikátory
Aliasy	FAM114A2, 133K02, C5orf3, rodina se sekvenční podobností 114 členů A2
Externí ID	MGI: 1917629 HomoloGene: 10270 Genové karty: FAM114A2
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 5 (lidský)
Konec	154,038,936 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 11 (myš)
Konec	57,518,617 bp
Exprese RNA vzor
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• vazba purinových nukleotidů;
Buněčná složka	• buněčná složka;
Biologický proces	• biologický proces;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	10827
	67726
	ENSG00000055147
	ENSMUSG00000020523
	Q9NRY5
	Q8VE88
	NM_018691; NM_001317993; NM_001317994; NM_001317995
	NM_001168667; NM_001168668; NM_026342
	NP_001304922; NP_001304923; NP_001304924; NP_061161
	NP_001162138; NP_001162139; NP_080618
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

FAM114A2 (chromozom 5 otevřený čtecí rámec 3) je a gen na chromozomu 5 u lidí, který kóduje a protein FAM114A2. Funkce bílkovin není dobře známa. FAM114A2 je však v roce velmi konzervativní savci s homology jak u hub, tak u rostlin.

Druh	Přístupové číslo	Identita
macaca mulatta	XM_001102467	78.1%
Pan troglodyty	XM_518045	89.7%
bos taurus	NP_001033166	85.6%
Pongo abelii	XM_002816109	87.8%
Mus musculus	NM_026342.3	79%
Callithrix jacchus	XP_002744467	94.7%

Protein

Protein FAM114A2 je dlouhý 505 aminokyselin^[5] s molekulovou hmotností 55,5 kdal a izoelektrickým bodem 4,66.^[6] Předpokládá se, že po překladu zůstane v jádru ^[7]Existují důkazy, že c5orf3 interaguje s jiným proteinem s neznámou funkcí z chromozomu 5, c5orf4 ^[8]Předpokládá se, že tento protein obsahuje a P smyčka ^[9] což naznačuje roli v ATP - a / nebo GTP -vazba ^[10]

Gen

Gen FAM114A2 je lokalizován na chromozomu 5 (5q31-33).^[11] Tento gen má 14 exony překlenující jeho sekvenci.^[5] The sekvence kódování je 2886 základní páry s 5 'UTR 94 párů bází a 3' UTR 1273 párů bází.^[5] Je exprimován ve vysokých hladinách ve většině tkání lidského těla.^[11] Rovněž je vysoce exprimován v tkáních v lidském mozku ^[12]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000055147 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000020523 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ ^A ^b ^C Rodina Homo sapiens se sekvenční podobností 114, člen A2 (FAM114A2) - Nucleotide - NCBI
^ Pracovní stůl biologie: http://seqtool.sdsc.edu/CGI/BW.cgi#^{[trvalý mrtvý odkaz ]}!
^ PSORT WWW server
^ TĚTIVA: http://string-db.org/newstring_cgi/show_network_section.pl.
^ http://string-db.org/newstring_cgi/show_textmining_evidence.pl.
^ Saraste M, Sibbald PR, Wittinghofer A (listopad 1990). „P-smyčka - běžný motiv v ATP- a GTP-vazebných proteinech“. Trends Biochem. Sci. 15 (11): 430–4. doi:10.1016 / 0968-0004 (90) 90281-f. PMID 2126155.
^ ^A ^b FAM114A2 Gene - GeneCards | F1142 Protein | F1142 Protilátka
^ Atlas mozku Allen: http://human.brain-map.org/search?type=mi Archivováno 18.08.2011 na Wayback Machine

externí odkazy

Člověk FAM114A2 umístění genomu a FAM114A2 stránka s podrobnostmi o genu v UCSC Genome Browser.

Další čtení

Kimura K, Wakamatsu A, Suzuki Y a kol. (2006). „Diverzifikace transkripční modulace: rozsáhlá identifikace a charakterizace domnělých alternativních promotorů lidských genů“. Genome Res. 16 (1): 55–65. doi:10,1101 / gr. 4039406. PMC 1356129. PMID 16344560.
Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA a kol. (2004). „Stav, kvalita a rozšíření projektu cDNA NIH v plné délce: Mammalian Gene Collection (MGC)“. Genome Res. 14 (10B): 2121–7. doi:10,1101 / gr. 2596504. PMC 528928. PMID 15489334.
Ota T, Suzuki Y, Nishikawa T a kol. (2004). „Kompletní sekvenování a charakterizace 21 243 lidských cDNA plné délky“. Nat. Genet. 36 (1): 40–5. doi:10.1038 / ng1285. PMID 14702039.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH a kol. (2003). „Generování a počáteční analýza více než 15 000 lidských a myších cDNA sekvencí plné délky“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (26): 16899–903. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
Suzuki Y, Yoshitomo-Nakagawa K, Maruyama K a kol. (1997). "Konstrukce a charakterizace cDNA knihovny obohacené o celou délku a 5'-end". Gen. 200 (1–2): 149–56. doi:10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3. PMID 9373149.
Maruyama K, Sugano S (1994). „Oligo-capping: jednoduchá metoda k nahrazení struktury cap eukaryotických mRNA oligoribonukleotidy“. Gen. 138 (1–2): 171–4. doi:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID 8125298.

Tento článek o gen na lidský chromozom 5 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000055147 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000020523 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[ncbi-5] A ^b ^C Rodina Homo sapiens se sekvenční podobností 114, člen A2 (FAM114A2) - Nucleotide - NCBI

[6] Pracovní stůl biologie: http://seqtool.sdsc.edu/CGI/BW.cgi#^{[trvalý mrtvý odkaz ]}!

[7] PSORT WWW server

[8] TĚTIVA: http://string-db.org/newstring_cgi/show_network_section.pl.

[9] ttp://string-db.org/newstring_cgi/show_textmining_evidence.pl.

[10] Saraste M, Sibbald PR, Wittinghofer A (listopad 1990). „P-smyčka - běžný motiv v ATP- a GTP-vazebných proteinech“. Trends Biochem. Sci. 15 (11): 430–4. doi:10.1016 / 0968-0004 (90) 90281-f. PMID 2126155.

[www.genecards.org-11] A ^b FAM114A2 Gene - GeneCards | F1142 Protein | F1142 Protilátka

[12] Atlas mozku Allen: http://human.brain-map.org/search?type=mi Archivováno 18.08.2011 na Wayback Machine

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

[11]

[12]