Virus netopýrů Entebbe - Entebbe bat virus - Wikipedia


Virus netopýrů Entebbe
Klasifikace virů E
(bez hodnocení):Virus
Oblast:Riboviria
Království:Orthornavirae
Kmen:Kitrinoviricota
Třída:Flasuviricetes
Objednat:Amarillovirales
Rodina:Flaviviridae
Rod:Flavivirus
Druh:
Virus netopýrů Entebbe

Virus netopýrů Entebbe je infekční onemocnění způsobené a Flavivirus s čím úzce souvisí žlutá zimnice.

O symptomech způsobených virem netopýrů Entebbe je známo jen málo a není známo, zda může virus infikovat člověka. Virus netopýrů Entebbe byl zpočátku a přenášeno komáry patogen, který byl schopen infikovat netopýry a použít je jako rezervoár viru. Zdá se však, že virus nemá na svého hostitele žádné nežádoucí vedlejší účinky.

Virus netopýrů Entebbe byl poprvé izolován z malého netopýra volného (Chaerephon pumilus ) v Uganda v roce 1957, ale nebyl detekovatelný po počáteční izolaci. V roce 2011 byl virus netopýra Entebbe izolován z netopýra sledovaného v podkroví domu, kde byl původně nalezen. Infekční virus byl získán z slezina a plíce. Virová RNA byla sekvenována a porovnána s RNA původního izolátu (Kading et al. 2015).

Virus netopýrů Entebbe je (+) jednovláknová RNA (ssRNA) genomový virus. Je to virus s obalem s icosahedral nukleokapsid. Jeho genom má přibližně 10 000 až 12 000 kilobází.

Virová klasifikace

Virus Entebbe Bat patří do rodu Flavivirus v rodině Flaviviredae. Jeho pořadí je nepřiřazené. Založeno na Baltimorský klasifikační systém, Entebbe Bat Virus je (+) ssRNA genomový virus, který nepotřebuje DNA meziprodukt k vytvoření virových proteinů (Flint).

Virová struktura

O struktuře viru Entebbe Bat není známo mnoho; virus je však velmi podobný viru žluté zimnice. Vzhledem k tomu, že virus Enebbe Bat je v rodu Flavivirus, je struktura podobná ikosadedru se symetrií Pseudo T = 3 o průměru přibližně 50 nm. The kapsid protein je obalen. Genomické uspořádání je lineární (+) ssRNA. Jeho genomová segmentace je Monopartitní (Pazourek).

Virový genom

Genom viru Entebbe Bat je (+) jednovláknová RNA ((+) ssRNA) s lineární charakteristikou. Genom kóduje 3 strukturní proteiny (Capsid, prM a Envelope) a 8 nestrukturálních proteinů (NS1, NS2A, NS2B, NS3, NS4A, NS4B, NS5 a NS5B).

Genomický RNA je modifikován na 5 'konci genomové RNA s pozitivním řetězcem se strukturou cap-1. (+) SsRNA nemá poly-A ocas a na 5 'konci a 3' konci, pokud je jeho genomem RNA, má promotorové místo UTR.

Replikace

Vstup do buňky

Virus Entebbe Bat je obalený virus, což znamená, že musí vázat své obalové proteiny na a povrch buňky protein na buňce, kterou nakazí. U flavivirových virionů se fúzní peptid je pohřben v stmívačích fúzního glykoproteinu E. Při nízkém pH jsou stmívače narušeny, proteiny rotují za vzniku trimerů a fúzní peptid je směrován k buněčná membrána Virový obalový protein E se váže na hostitelské receptory, které zprostředkovávají zprostředkované receptory endocytóza.. Virový nukleokapsid, jako RNP, se uvolňuje do cytoplazma, kde začíná syntéza RNA. Mechanismus, kterým jsou kontakty mezi virovou nukleokapsidem a M proteinem, které tvoří obal pod lipidovou dvojvrstvou, přerušeny, aby se usnadnilo uvolnění nukleokapsidu, není znám (Flint).

Replikace a přepis

Vzhledem k tomu, že virus Entebbe Bat je v rodině Flaviviridae a protože má genom (+) ssRNA, musí mít stejný replikační proces jako v rodině Flavivirdae. Virus Entebbe Bat se replikuje v cytoplazmě hostitelských buněk. Genom je podobný hostitelské buněčné mRNA s tím rozdílem, že virové (+) ssRNA chybí poly-A ocas. Nedostatek poly-A ocasu umožňuje viru používat buněčné stroje k jeho syntéze genom a proteiny, které potřebuje Kromě toho genom kóduje 3 strukturní proteiny (Capsid, prM a Envelope) a 8 nestrukturálních proteinů (NS1, NS2A, NS2B, NS3, NS4A, NS4B, NS5 a NS5B). Genomová RNA je modifikována na 5 'konci genomové RNA s pozitivním řetězcem se strukturou cap-1.

Struktury víčka buněčné RNA jsou tvořeny působením RNA trifosfatáza, s guanylyltransferáza, N7-methyltransferáza a 2'-O methyltransferáza. Jedná se o produkty virové transkripce. Protein NS3 v sobě kóduje RNA trifosfatázu helikáza doména. Využívá ATP helikázy hydrolýza místo k odstranění γ-fosfátu z 5 'konce RNA. The N-terminál doména NS5 je nezbytná pro produkci zralé RNA. Vazebná afinita k RNA je snížena přítomností ATP nebo GTP a zvýšena S-adenosylmethioninem (Henderson et al. 2011).

Montáž a uvolnění

Po translaci je polyprotein štěpen kombinací virových a hostitelských proteáz za uvolnění zralého polypeptidy. Nicméně, protože mobilní mRNA potřebují poly-A ocas, aby byly považovány za dospělé. Virus proto produkuje a polyprotein který je schopen štěpit přeložený virový polypeptid. Polyprotein obsahuje autokatalytický funkce, která automaticky uvolňuje první peptid, což je enzym. Tento enzym je poté schopen štěpit zbývající polyprotein. Jedním ze štěpených produktů je a polymeráza, zodpovědný za syntézu (-) ssRNA molekuly. Nově vyrobená (-) ssRNA bude fungovat jako templát pro konstrukci (+) ssRNA, která bude genomem pro nové virionové částice (Flint).

Flavivirová genomová RNA se replikuje hrubě endoplazmatické retikulum membrány.

Sestavují se nové virové částice. K tomu dochází během pučícího procesu, který je důležitý pro výrobu lipid obálka, která obklopí nově vzniklou virionovou částici a lýzu buněk.

Přidružené viry

Viry, které jsou spojeny s virem Entebbe Bat, jsou virus Sokolul a Virus Yokose. Oba tyto viry jsou kategorizovány pod virem Entebbe. Tyto dva viry navíc nemají členovec vektor jako většina virů z čeledi Flaviviridae.

Tropismus

Infekce netopýra virem Entebbe Bat Virus není známa, protože již nepotřebuje vektor přenosu. Virus Entebbe Bat byl lokalizován pouze ve dvou typech buněk a tyto typy buněk se nacházejí v plicích a slezině.

Reference

  • Allison, S. L., J. Schalich, K. Stiasny, C. W. Mandl a F. X. Heinz. „Mutační důkazy pro interní fúzní peptid v proteinu E. Flavivirus Envelope.“ Journal of Virology 75.9 (2001): 4268–275. Web. 12. prosince 2015.
  • Flint, S. Jane, Anna M. Skalka, L. W. Enquist a V. R. Racaniello. Principy virologie. 3. vyd. N.p .: n.p., n.d. Tisk.
  • Henderson, Brittney R., Bejan J. Saeedi, Grace Campagnola a Brian J. Geiss. „Analýza vazby RNA virem dengue NS5 RNA Capping Enzyme.“ PLoS ONE 6.10 (2011): n. pag. Web. 12. prosince 2015.
  • Kading, R. C., R. Kityo, T. Nakayiki, J. Ledermann, M. B. Crabtree, J. Lutwama a B. R. Miller. „Detekce viru Entebbe Bat po 54 letech.“ American Journal of Tropical Medicine and Hygiene 93.3 (2015): 475–77. Web. 12. prosince 2015.
  • Sommer, Caroline Le, Nicholas J. Barrows, Shelton S. Bradrick, James L. Pearson a Mariano A. Garcia-Blanco. „Receptor kináza 2 spojená s proteinem G podporuje vstup a replikaci Flaviviridae.“ PLoS Negl Trop Dis PLoS zanedbané tropické nemoci 6.9 (2012): n. pag. Web. 12. prosince 2015.