Virus Yokose - Yokose virus

Virus Yokose
Klasifikace virů E
(bez hodnocení):Virus
Oblast:Riboviria
Království:Orthornavirae
Kmen:Kitrinoviricota
Třída:Flasuviricetes
Objednat:Amarillovirales
Rodina:Flaviviridae
Rod:Flavivirus
Druh:
Virus Yokose
Synonyma.[1]

Yokase virus

Virus Yokose (YOKV) je v rodu Flavivirus z rodiny Flaviviridae.[2] Flaviviridae se často vyskytují v členovci, jako jsou komáři a klíšťata, a mohou také infikovat člověka. Rod Flavivirus zahrnuje více než 50 známých virů, včetně Žlutá zimnice, Virus západního Nilu, Virus Zika, a Japonská encefalitida. Virus Yokose je novým členem rodiny Flavivirů, který byl identifikován pouze u několika druhů netopýrů. Netopýři byli spojováni s několika objevujícími se zoonotický nemoci jako Ebola a SARS.[3]

Virová klasifikace

Obrázek hory Mount, která se nachází na ostrově Kyushu v Japonsku, kde byl poprvé izolován virus Yokose.

Virus Yokose je v rodu Flavivirus z rodiny Flaviviridae. Byl identifikován v roce 1971 v Jokosuce na ostrově Kjúšú v Japonsku. Kmen Oita-36 byl izolován z druhů netopýrů Miniopterus fuliginosus.[4] Molekulárně genetická analýza ukázala, že virus Yokose je novým členem rodu Flavivirus.[4] Flaviviry se obvykle dělí do tří skupin: přenášené komáry, klíšťaty nebo bez vektorů. Virus Yokose je klasifikován jako NKV nebo jako neznámý vektor. To znamená, že nemá žádný známý vektor členovce. Existují však určité důkazy, které naznačují, že může infikovat členovce, konkrétně jsou zprostředkovány komáry. Bylo zjištěno, že virus Yokose je geneticky blízký Virus žluté zimnice s aminokyselinovými sekvencemi vykazujícími blízkou identifikaci s Virus Entebbe Bat.[4]

Virová struktura a genom

Virus Yokose je pozitivní sense jednovláknový RNA virus. Je zabalený a má icosohedral symetrie s triangulační číslo (T) ze dne 3.[5] Má průměr přibližně 50 nm. Genom je nesegmentovaný a obsahuje 10 857 nukleotidů.[4] Existuje jeden otevřený čtecí rámec (ORF) 3425 aminokyselinového polyproteinu, který kóduje tři strukturní proteiny a osm nestrukturálních proteinů.[4] Mezi strukturní proteiny patří kapsida (C), premembrána / membrána (prM) a obálka (E). Mezi nestrukturální proteiny patří NS1, NS2A, NS2B, NS3, NS4A, 2K, NS4B a NS5. Protein 2K se nenachází v mnoha jiných flavivirech. NS3 funguje jako a proteáza a helikáza. NS5 funguje jako RNA-dependentní RNA polymeráza. NS1 je důležitý v procesu virové replikace. NS2A interaguje s NS3 a NS5, pomáhá při shromažďování virů a rekrutuje genom virové RNA do komplexu replikace vázaného na membránu. Sekundární struktury tvořené 5 'a 3' netranslační oblasti (NTR) ovlivňují transkripci a translaci. Virus Yokose má v 3 'NTR motiv CS1, který je konzervován ve flavivirech přenášených komáry, což naznačuje schopnost infikovat členovce.[4]

Replikační cyklus

Vstup do buňky

Protein virové obálky (E) se váže na receptory hostitelské buňky a je přijímán do buňky prostřednictvím endocytóza. Obalový protein poté prochází konformační změnou uvnitř endosom po vystavení kyselé povaze endosomu.[5] Obalový protein a endozomální membrána se fúzují a virus se uvolňuje do cytoplazmy.

Replikace a přepis

Virová RNA je přeložena do a polyproteiny a poté štěpen virovým a buněčným proteázy do strukturních (C, prM a E) a nestrukturálních proteinů (NS1, NS2A, NS2B, NS3, NS4A, 2K, NS4B a NS5).[6] Replikace probíhá na povrchu endoplazmatické retikulum uvnitř membránových cév. Prostřednictvím RNA-dependentní RNA polymerázy (nestrukturální protein NS5) se tvoří komplementární negativní sense RNA vlákno, aby se vytvořila dvouvláknová RNA.[6] DsRNA je transkribována za produkce viru mRNA.

Montáž a uvolnění

Virus je sestaven uvnitř endoplazmatické retikulum. A nukleokapsid je tvořen a pohlcuje viry glykoproteiny. O procesu montáže flavivirů je však známo velmi málo. Důkazy naznačují, že několik nestrukturálních proteinů, jako je NS2A, přispívá k sestavení.[6] Shromážděná vize se poté zvedne k Golgiho aparát kde je prM protein štěpen, což vede k maturaci.[5] Virus se poté uvolní z buňky prostřednictvím exocytóza a je vypnutý k infikování dalších hostitelských buněk.

Kaloň z oblasti, kde byly u netopýrů nalezeny protilátky proti viru Yokose.

Hostitel a umístění

Hodně není známo o patogenita a virulence viru Yokose včetně netopýrů. Bylo zjištěno, že kmen XYBX1332 izolovaný v Číně způsobuje cytopatické účinky v savčích buňkách.[7] Při studiu ovocných netopýrů infikovaných virem Yokose nepozorovali žádné klinické příznaky choroby.[8]

V současné době byly identifikovány pouze druhy netopýrů nesoucích virové kmeny Yokose. Kmen Oita-36 byl izolován z druhů netopýrů Miniopterus fuliginosus a je v současné době primárním kmenem viru Yokose. Bylo zjištěno dne Ostrov Kjúšú u japonského pobřeží. Virus Yokose není geograficky omezen na japonské ostrovy, ale byl izolován také ve vnitrozemské Číně. Kmen XYBX1332 byl izolován z druhů netopýrů Myotis daubentonii v provincii Yunnan v Číně.[7] Tento kmen má však genomové rozdíly ve srovnání s původním kmenem Oita-36 a měl by být proveden další výzkum, aby se zjistilo, zda se jedná o nový druh flaviviru. Protilátky proti viru Yokose byly nalezeny u ovocných netopýrů, Rousettus leschenaultii, také na Filipínách a Maylasii.[8] To ukazuje, že virus Yokose není geograficky omezen na japonské ostrovy, ale může existovat také ve vnitrozemských oblastech Asie.

Doposud nebyly hlášeny žádné infekce virem Yokose u lidí ani jiných zvířat. Vědci zjistili, že s Yokose lze manipulovat tak, aby infikoval lidské buňky a reagoval na protilátky jiného flaviviru přítomného v buňkách. Bylo zjištěno, že Očkování proti žluté zimnici byl účinný při neutralizaci viru Yokose v lidských buňkách.[4]

Patogenita a virulence

O patogenitě a virulenci viru Yokose není známo mnoho. Bylo zjištěno, že kmen XYBX1332 izolovaný v Číně způsobuje cytopatické účinky v savčích buňkách.[7] Při studiu ovocných netopýrů infikovaných virem Yokose nepozorovali žádné klinické příznaky choroby.[8] Studie provedená na netopýru alveolární epiteliální buňky a ledvinové buňky zjistily, že infekce virem Yokose vedla krátce poté k virové replikaci a buněčné smrti.[3]

Reference

  1. ^ 1 ICTV 7. zpráva van Regenmortel, MHV, Fauquet, CM, Bishop, DHL, Carstens, EB, Estes, MK, Lemon, SM, Maniloff, J., Mayo, MA, McGeoch, DJ, Pringle, CR a Wickner, RB (2000 ). Taxonomie virů. Sedmá zpráva Mezinárodního výboru pro taxonomii virů. Academic Press, San Diego. 1162 stran. https://talk.ictvonline.org/ictv/proposals/ICTV%207th%20Report.pdf Archivováno 12.06.2018 na Wayback Machine
  2. ^ "Yokose virus". www.genome.jp. Archivováno od originálu na 2019-12-13. Citováno 2019-12-13.
  3. ^ A b Omatsu, Tsutomu; Watanabe, Shumpei; Akashi, Hiroomi; Yoshikawa, Yasuhiro (01.09.2007). „Biologické znaky netopýrů ve vztahu k přirozenému rezervoáru vznikajících virů“. Srovnávací imunologie, mikrobiologie a infekční nemoci. Zvláštní vydání: Nedávný pokrok ve výzkumu nových infekčních chorob v Asii a Oceánii. 30 (5): 357–374. doi:10.1016 / j.cimid.2007.05.006. ISSN  0147-9571. PMC  7112585. PMID  17706776.
  4. ^ A b C d E F G Tajima, Shigeru; Takasaki, Tomohiko; Matsuno, Shigeo; Nakayama, Mikio; Kurane, Ichiro (05.02.2005). "Genetická charakterizace viru Yokose, flaviviru izolovaného z netopýra v Japonsku". Virologie. 332 (1): 38–44. doi:10.1016 / j.virol.2004.06.052. ISSN  0042-6822. PMID  15661139.
  5. ^ A b C "Stránka Flavivirus ~ ViralZone". viruszone.expasy.org. Archivováno z původního dne 2019-05-03. Citováno 2019-12-13.
  6. ^ A b C Apte-Sengupta, Swapna; Sirohi, Devika; Kuhn, Richard J. (2014). „Spojení replikace a shromáždění u flavivirů“. Aktuální názor na virologii. 0: 134–142. doi:10.1016 / j.coviro.2014.09.020. ISSN  1879-6257. PMC  4268268. PMID  25462445.
  7. ^ A b C Feng, Yun; Ren, Xiaojie; Xu, Ziqian; Fu, Shihong; Li, Xiaolong; Zhang, Hailin; Yang, Weihong; Zhang, Yuzhen; Liang, Guodong (11.01.2019). „Genetická rozmanitost viru Yokose, XYBX1332, izolovaného z netopýrů (Myotis daubentonii) v Číně“. Virology Journal. 16 (1): 8. doi:10.1186 / s12985-018-1107-3. ISSN  1743-422X. PMC  6330390. PMID  30634973.
  8. ^ A b C Watanabe, Shumpei; Omatsu, Tsutomu; Miranda, Mary E. G .; Masangkay, Joseph S .; Ueda, Naoya; Endo, Maiko; Kato, Kentaro; Tohya, Yukinobu; Yoshikawa, Yasuhiro; Akashi, Hiroomi (2010). "Epizootologie a experimentální infekce Yokose viru u netopýrů". Srovnávací imunologie, mikrobiologie a infekční nemoci. 33 (1): 25–36. doi:10.1016 / j.cimid.2008.07.008. ISSN  1878-1667. PMC  7112705. PMID  18789527.