EPRS - EPRS

EPRS1
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	1FYJ, 4HVC, 4K86, 4K87, 4K88, 5A34, 5 BMU, 5A1N, 5A5H
Identifikátory
Aliasy	EPRS1, UŠI, GLUPRORY, PARS, QARS, QPRS, PIG32, glutamyl-prolyl-tRNA syntetáza, HLD15, glutamyl-prolyl-tRNA syntetáza 1, EPRS
Externí ID	OMIM: 138295 MGI: 97838 HomoloGene: 5870 Genové karty: EPRS1
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 1 (lidský)
Konec	220,046,530 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 1 (myš)
Konec	185,428,360 bp
Exprese RNA vzor
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• vazba nukleotidů; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • Vazba kmenové smyčky RNA; • ATP vazba; • katalytická aktivita; • ligázová aktivita; • aktivita aminoacyl-tRNA ligázy; • Vazba GTPázy; • Vazba RNA; • aktivita glutamát-tRNA ligázy; • aktivita prolin-tRNA ligázy; • vazba iontů zinku; • aktivita homodimerizace proteinu; • vazba kovových iontů; • identická vazba na protein;
Buněčná složka	• membrána; • Komplex GAIT; • cytoplazma; • multienzymový komplex aminoacyl-tRNA syntetázy; • cytosol; • buněčná membrána; • ribonukleoprotein;
Biologický proces	• regulace překladu; • Aminoacylace tRNA; • metabolismus; • biosyntéza bílkovin; • Aminoacylace tRNA pro translaci proteinu; • negativní regulace překladu; • buněčná odpověď na interferon-gama; • aminoacylace glutamyl-tRNA; • aminoacylace prolyl-tRNA; • buněčná odpověď na inzulínový stimul; • import mastných kyselin s dlouhým řetězcem; • sestava makromolekulárního komplexu; • regulace dovozu mastných kyselin s dlouhým řetězcem do buňky;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	2058
	107508
	ENSG00000136628
	ENSMUSG00000026615
	P07814
	Q8CGC7
	NM_004446
	NM_029735; NM_001357474
	NP_004437
	NP_084011; NP_001344403
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Bifunkční aminoacyl-tRNA syntetáza je enzym že u lidí je kódován EPRS gen.^[5]^[6]

Gen

U tohoto genu bylo pozorováno alternativní sestřih, ale nebyla stanovena úplná povaha a biologická platnost varianty.^[6]

Funkce

Aminoacyl-tRNA syntetázy jsou třídou enzymů, které nabíjejí tRNA svými příbuznými aminokyselinami. Protein kódovaný tímto genem je multifunkční aminoacyl-tRNA syntetáza, která katalyzuje aminoacylaci kyseliny glutamové a prolinové tRNA.^[6]

Fosforylace EPRS je považována za nezbytnou pro tvorbu komplexu GAIT (gama-interferonem aktivovaný inhibitor translace), který reguluje translaci více genů v monocyty a makrofágy.^[7]

Interakce

Bylo prokázáno, že EPRS komunikovat s POU2F1,^[8] Protein tepelného šoku 90 kDa alfa (cytosolický), člen A1^[9] a IARS.^[10]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000136628 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000026615 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Fett R, Knippers R (únor 1991). "Primární struktura lidské glutaminyl-tRNA syntetázy. Vysoce konzervované jádro, aminokyselinové opakující se oblasti a homologie s faktory prodloužení translace". J Biol Chem. 266 (3): 1448–55. PMID 1988429.
^ ^A ^b ^C "Entrez Gene: EPRS glutamyl-prolyl-tRNA syntetáza".
^ Arif A, Jia J, Mukhopadhyay R, Willard B, Kinter M, Fox PL (červenec 2009). „Dvoumístná fosforylace EPRS koordinuje multimodální regulaci nekanonické translační kontrolní aktivity“. Mol. Buňka. 35 (2): 164–80. doi:10.1016 / j.molcel.2009.05.028. PMC 2752289. PMID 19647514.
^ Nie, J; Sakamoto S; Píseň D; Qu Z; Ota K; Taniguchi T (březen 1998). "Interakce 1. – 1. A doména automatické modifikace poly (ADP-ribóza) syntetázy". FEBS Lett. 424 (1–2): 27–32. doi:10.1016 / S0014-5793 (98) 00131-8. PMID 9537509.
^ Kang, J; Kim T; Ko Y G; Rho S B; Park SG; Kim M J; Kwon H J; Kim S (říjen 2000). "Protein tepelného šoku 90 zprostředkovává interakce protein-protein mezi lidskými aminoacyl-tRNA syntetázami". J. Biol. Chem. 275 (41): 31682–8. doi:10,1074 / jbc.M909965199. ISSN 0021-9258. PMID 10913161.
^ Rho, SB; Lee J S; Jeong E J; Kim KS; Kim Y G; Kim S (květen 1998). „Multifunkční opakovaný motiv je přítomen v lidské bifunkční tRNA syntetáze“. J. Biol. Chem. 273 (18): 11267–73. doi:10.1074 / jbc.273.18.11267. ISSN 0021-9258. PMID 9556618.

Další čtení

Kaiser E, Eberhard D, Knippers R (1992). "Exony kódující vysoce konzervovanou část lidské glutaminyl-tRNA syntetázy". J. Mol. Evol. 34 (1): 45–53. Bibcode:1992JMolE..34 ... 45K. doi:10.1007 / BF00163851. PMID 1556743.
Norcum MT (1991). „Strukturní analýza komplexu aminoacyl-tRNA syntetázy s vysokou molekulovou hmotností. Účinky neutrálních solí a detergentů“. J. Biol. Chem. 266 (23): 15398–405. PMID 1651330.
Cerini C, Kerjan P, Astier M a kol. (1992). „Součástí komplexu multisynthetase je multifunkční aminoacyl-tRNA syntetáza“. EMBO J.. 10 (13): 4267–77. doi:10.1002 / j.1460-2075.1991.tb05005.x. PMC 453179. PMID 1756734.
Kunze N, Bittler E, Fett R a kol. (1990). „Lidský QARS lokus: přiřazení lidského genu pro glutaminyl-tRNA syntetázu k chromozomu 1q32-42.“. Hučení. Genet. 85 (5): 527–30. doi:10.1007 / BF00194231. PMID 2227938.
Thömmes P, Fett R, Schray B a kol. (1988). „Základní oblast homologií lidské glutaminyl-tRNA syntetázy s Escherichia coli a kvasinkovými enzymy“. Nucleic Acids Res. 16 (12): 5391–406. doi:10.1093 / nar / 16.12.5391. PMC 336774. PMID 3290852.
Kaiser E, Hu B, Becher S a kol. (1994). „Lidský lokus EPRS (dříve lokus QARS): gen kódující aminoacyl-tRNA syntetázu třídy I a třídy II“. Genomika. 19 (2): 280–90. doi:10.1006 / geno.1994.1059. PMID 8188258.
Hillier LD, Lennon G, Becker M a kol. (1997). „Generování a analýza 280 000 lidských sekvenčních značek“. Genome Res. 6 (9): 807–28. doi:10,1101 / gr. 6.807. PMID 8889549.
Rho SB, Lee JS, Jeong EJ a kol. (1998). „Multifunkční opakovaný motiv je přítomen v lidské bifunkční tRNA syntetáze“. J. Biol. Chem. 273 (18): 11267–73. doi:10.1074 / jbc.273.18.11267. PMID 9556618.
Quevillon S, Robinson JC, Berthonneau E a kol. (1999). „Makromolekulární shromáždění aminoacyl-tRNA syntetáz: identifikace interakcí protein-protein a charakterizace jádrového proteinu“. J. Mol. Biol. 285 (1): 183–95. doi:10.1006 / jmbi.1998.2316. PMID 9878398.
Kang J, Kim T, Ko YG a kol. (2000). "Protein tepelného šoku 90 zprostředkovává interakce protein-protein mezi lidskými aminoacyl-tRNA syntetázami". J. Biol. Chem. 275 (41): 31682–8. doi:10,1074 / jbc.M909965199. PMID 10913161.
Jeong EJ, Hwang GS, Kim KH a kol. (2001). „Strukturní analýza multifunkčních peptidových motivů v lidské bifunkční tRNA syntetáze: identifikace zbytků vázajících RNA a funkční důsledky pro tandemové repetice“. Biochemie. 39 (51): 15775–82. doi:10.1021 / bi001393h. PMID 11123902.
Sang Lee J, Gyu Park S, Park H a kol. (2002). „Interakční síť lidských aminoacyl-tRNA syntetáz a podjednotek komplexu elongačního faktoru 1“. Biochem. Biophys. Res. Commun. 291 (1): 158–64. doi:10.1006 / bbrc.2002.6398. PMID 11829477.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH a kol. (2003). „Generování a počáteční analýza více než 15 000 lidských a myších cDNA sekvencí plné délky“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (26): 16899–903. Bibcode:2002PNAS ... 9916899M. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
Bouwmeester T, Bauch A, Ruffner H a kol. (2004). "Fyzická a funkční mapa lidské signální transdukční dráhy TNF-alfa / NF-kappa B". Nat. Cell Biol. 6 (2): 97–105. doi:10.1038 / ncb1086. PMID 14743216.
Beausoleil SA, Jedrychowski M, Schwartz D a kol. (2004). „Rozsáhlá charakterizace jaderných fosfoproteinů z buněk HeLa“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 101 (33): 12130–5. Bibcode:2004PNAS..10112130B. doi:10.1073 / pnas.0404720101. PMC 514446. PMID 15302935.
Sampath P, Mazumder B, Seshadri V, et al. (2004). "Nekanonická funkce glutamyl-prolyl-tRNA syntetázy: genově specifické umlčení translace". Buňka. 119 (2): 195–208. doi:10.1016 / j.cell.2004.09.030. PMID 15479637.
Kato T, Daigo Y, Hayama S a kol. (2005). „Nová lidská tRNA-dihydrouridinsyntáza podílející se na plicní karcinogenezi“. Cancer Res. 65 (13): 5638–46. doi:10.1158 / 0008-5472.CAN-05-0600. PMID 15994936.
Beausoleil SA, Villén J, Gerber SA a kol. (2006). „Přístup založený na pravděpodobnosti pro vysoce výkonnou analýzu fosforylace proteinů a lokalizaci místa“. Nat. Biotechnol. 24 (10): 1285–92. doi:10.1038 / nbt1240. PMID 16964243.
Ewing RM, Chu P, Elisma F a kol. (2007). „Mapování interakcí lidských proteinů a proteinů ve velkém měřítku hmotnostní spektrometrií“. Mol. Syst. Biol. 3 (1): 89. doi:10.1038 / msb4100134. PMC 1847948. PMID 17353931.

Tento článek o gen na lidský chromozom 1 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000136628 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000026615 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid1988429-5] Fett R, Knippers R (únor 1991). "Primární struktura lidské glutaminyl-tRNA syntetázy. Vysoce konzervované jádro, aminokyselinové opakující se oblasti a homologie s faktory prodloužení translace". J Biol Chem. 266 (3): 1448–55. PMID 1988429.

[entrez-6] A ^b ^C "Entrez Gene: EPRS glutamyl-prolyl-tRNA syntetáza".

[pmid19647514-7] Arif A, Jia J, Mukhopadhyay R, Willard B, Kinter M, Fox PL (červenec 2009). „Dvoumístná fosforylace EPRS koordinuje multimodální regulaci nekanonické translační kontrolní aktivity“. Mol. Buňka. 35 (2): 164–80. doi:10.1016 / j.molcel.2009.05.028. PMC 2752289. PMID 19647514.

[pmid9537509-8] Nie, J; Sakamoto S; Píseň D; Qu Z; Ota K; Taniguchi T (březen 1998). "Interakce 1. – 1. A doména automatické modifikace poly (ADP-ribóza) syntetázy". FEBS Lett. 424 (1–2): 27–32. doi:10.1016 / S0014-5793 (98) 00131-8. PMID 9537509.

[pmid10913161-9] Kang, J; Kim T; Ko Y G; Rho S B; Park SG; Kim M J; Kwon H J; Kim S (říjen 2000). "Protein tepelného šoku 90 zprostředkovává interakce protein-protein mezi lidskými aminoacyl-tRNA syntetázami". J. Biol. Chem. 275 (41): 31682–8. doi:10,1074 / jbc.M909965199. ISSN 0021-9258. PMID 10913161.

[pmid9556618-10] Rho, SB; Lee J S; Jeong E J; Kim KS; Kim Y G; Kim S (květen 1998). „Multifunkční opakovaný motiv je přítomen v lidské bifunkční tRNA syntetáze“. J. Biol. Chem. 273 (18): 11267–73. doi:10.1074 / jbc.273.18.11267. ISSN 0021-9258. PMID 9556618.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]