ELP3 - ELP3

ELP3
Identifikátory
Aliasy	ELP3, KAT9, elongátorová podjednotka acetyltransferázového komplexu 3
Externí ID	OMIM: 612722 MGI: 1921445 HomoloGene: 7105 Genové karty: ELP3
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 8 (lidský)
Konec	28,191,156 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 14 (myš)
Konec	65,593,075 bp
Exprese RNA vzor
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• aktivita transferázy; • Vazba na jádro RNA polymerázy II; • vazba klastru železo-síra; • Aktivita histon acetyltransferázy H4; • Aktivita histon acetyltransferázy H3; • vazba kovových iontů; • aktivita histon acetyltransferázy; • aktivita regulátoru fosforylázy kinázy; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • katalytická aktivita; • aktivita transferázy, přenos acylových skupin; • aktivita acetyltransferázy;
Buněčná složka	• cytoplazma; • Komplex prodlužovacího holoenzymu; • jádro; • komplex histon-acetyltransferáza; • komplex faktoru prodloužení transkripce; • buněčné jádro;
Biologický proces	• regulace transkripce, DNA-šablony; • pozitivní regulace buněčné migrace; • regulace transkripce z promotoru RNA polymerázy II; • prodloužení transkripce z promotoru RNA polymerázy II; • migrace neuronů; • transkripce, chráněná DNA; • vývoj nervového systému; • vývoj centrálního nervového systému; • acetylace histonu H3; • acetylace histonu H4; • regulace aktivity proteinkinázy; • 5-methoxykarbonylmethyl-2-thiouridinylace na bázi wobble tRNA; • acetylace histonů;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	55140
	74195
	ENSG00000134014
	ENSMUSG00000022031
	Q9H9T3
	Q9CZX0
NM_001284220; NM_001284222; NM_001284224; NM_001284225; NM_001284226;
	NM_018091
	NM_001253812; NM_028811
NP_001271149; NP_001271151; NP_001271153; NP_001271154; NP_001271155;
	NP_060561
	NP_001240741; NP_083087
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Protein komplexu Elongator 3, také pojmenovaný KAT9, je a protein že u lidí je kódován ELP3 gen.^[5]^[6] ELP3 je katalytický histon acetyltransferáza podjednotka RNA polymeráza II prodlužovací komplex, který je součástí RNA polymerázy II (Pol II) holoenzym a podílí se na prodloužení transkripce. ELP3 podporuje migraci a větvení systému projekční neurony přes acetylace alfa-tubulinu ve vývoji mozková kůra.^[7] U savců je ELP3 pro otce důležitý Demetylace DNA po oplodnění.^[8] ELP3 je potenciálně zapojen do buněčného redoxu homeostáza zprostředkováním acetylace glukóza-6-fosfátdehydrogenáza.^[9] Kromě toho může ELP3 hrát roli v remodelace chromatinu a podílí se na acetylaci histony H3 a pravděpodobně H4.

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000134014 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000022031 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Hawkes NA, Otero G, Winkler GS, Marshall N, Dahmus ME, Krappmann D, Scheidereit C, Thomas CL, Schiavo G, Erdjument-Bromage H, Tempst P, Svejstrup JQ (leden 2002). „Čištění a charakterizace komplexu lidského elongátoru“. J Biol Chem. 277 (4): 3047–52. doi:10,1074 / jbc.M110445200. PMID 11714725.
^ „Entrez Gene: ELP3 elongation protein 3 homolog (S. cerevisiae)“.
^ Creppe C, Malinouskaya L, Volvert ML, Gillard M, Close P, Malaise O, Laguesse S, Cornez I, Rahmouni S, Ormenese S, Belachew S, Malgrange B, Chapelle JP, Siebenlist U, Moonen G, Chariot A, Nguyen L (Únor 2009). „Elongator řídí migraci a diferenciaci kortikálních neuronů prostřednictvím acetylace alfa-tubulinu“. Buňka. 136 (3): 551–64. doi:10.1016 / j.cell.2008.11.043. PMID 19185337. S2CID 18351772.
^ Okada Y, Yamagata K, Hong K, Wakayama T, Zhang Y (leden 2010). „Role komplexu elongator v demetylaci zygotické otcovské genomu“. Příroda. 463 (7280): 554–8. doi:10.1038 / nature08732. PMC 2834414. PMID 20054296.
^ Wang YP, Zhou LS, Zhao YZ, Wang SW, Chen LL, Liu LX, Ling ZQ, Hu FJ, Sun YP, Zhang JY, Yang C, Yang Y, Xiong Y, Guan KL, Ye D (červen 2014). „Regulace acetylace G6PD pomocí SIRT2 a KAT9 moduluje homeostázu NADPH a přežití buněk během oxidačního stresu“. Časopis EMBO. 33 (12): 1304–20. doi:10.1002 / embj.201387224. PMC 4194121. PMID 24769394.

Další čtení

Rengo F, Brevetti G, Piscione F a kol. (1977). "[Chování některých metabolických parametrů během postischemické a postkontrakční vazodilatace u normálních subjektů]". Bollettino della Società italiana di cardiologia. 20 (12): 1801–6. PMID 10936.
Maruyama K, Sugano S (1994). „Oligo-capping: jednoduchá metoda k nahrazení struktury cap eukaryotických mRNA oligoribonukleotidy“. Gen. 138 (1–2): 171–4. doi:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID 8125298.
Ninomiya Y, Okada M, Kotomura N a kol. (1996). "Genomická organizace a izoformy myšího genu ELP". J. Biochem. 118 (2): 380–9. doi:10.1093 / oxfordjournals.jbchem.a124918. PMID 8543574.
Suzuki Y, Yoshitomo-Nakagawa K, Maruyama K a kol. (1997). "Konstrukce a charakterizace cDNA knihovny obohacené o celou délku a 5'-end". Gen. 200 (1–2): 149–56. doi:10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3. PMID 9373149.
Hartley JL, Temple GF, Brasch MA (2001). „Klonování DNA pomocí in vitro místně specifické rekombinace“. Genome Res. 10 (11): 1788–95. doi:10,1101 / gr. 143000. PMC 310948. PMID 11076863.
Wiemann S, Weil B, Wellenreuther R a kol. (2001). „Směrem ke katalogu lidských genů a proteinů: sekvenování a analýza 500 nových kompletních proteinů kódujících lidské cDNA“. Genome Res. 11 (3): 422–35. doi:10,1101 / gr. GR1547R. PMC 311072. PMID 11230166.
Simpson JC, Wellenreuther R, Poustka A a kol. (2001). „Systematická subcelulární lokalizace nových proteinů identifikovaných sekvenováním cDNA ve velkém měřítku“. EMBO Rep. 1 (3): 287–92. doi:10.1093 / embo-reports / kvd058. PMC 1083732. PMID 11256614.
Kim JH, Lane WS, Reinberg D (2002). „Human Elongator usnadňuje transkripci RNA polymerázy II prostřednictvím chromatinu“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (3): 1241–6. doi:10.1073 / pnas.251672198. PMC 122174. PMID 11818576.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH a kol. (2003). „Generování a počáteční analýza více než 15 000 lidských a myších cDNA sekvencí plné délky“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (26): 16899–903. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
Ota T, Suzuki Y, Nishikawa T a kol. (2004). „Kompletní sekvenování a charakterizace 21 243 lidských cDNA plné délky“. Nat. Genet. 36 (1): 40–5. doi:10.1038 / ng1285. PMID 14702039.
Bouwmeester T, Bauch A, Ruffner H a kol. (2004). "Fyzická a funkční mapa lidské signální transdukční cesty TNF-alfa / NF-kappa B". Nat. Cell Biol. 6 (2): 97–105. doi:10.1038 / ncb1086. PMID 14743216. S2CID 11683986.
Wiemann S, Arlt D, Huber W a kol. (2004). „Od ORFeome k biologii: funkční plynovod genomiky“. Genome Res. 14 (10B): 2136–44. doi:10,1101 / gr. 2576704. PMC 528930. PMID 15489336.
Kouskouti A, Talianidis I (2005). „Modifikace histonu definující aktivní geny přetrvávají po transkripční a mitotické inaktivaci“. EMBO J.. 24 (2): 347–57. doi:10.1038 / sj.emboj.7600516. PMC 545808. PMID 15616580.
Barrios-Rodiles M, Brown KR, Ozdamar B a kol. (2005). "Vysoce výkonné mapování dynamické signalizační sítě v savčích buňkách". Věda. 307 (5715): 1621–5. doi:10.1126 / science.1105776. PMID 15761153. S2CID 39457788.
Mehrle A, Rosenfelder H, Schupp I a kol. (2006). „Databáze LIFEdb v roce 2006“. Nucleic Acids Res. 34 (Problém s databází): D415–8. doi:10.1093 / nar / gkj139. PMC 1347501. PMID 16381901.
Han Q, Hou X, Su D a kol. (2007). „hELP3 podjednotka komplexu Elongator reguluje transkripci genu HSP70 v lidských buňkách“. Acta Biochim. Biophys. Hřích. (Šanghaj). 39 (6): 453–61. doi:10.1111 / j.1745-7270.2007.00293.x. PMID 17558451.

Tento článek o gen na lidský chromozom 8 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000134014 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000022031 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid11714725-5] Hawkes NA, Otero G, Winkler GS, Marshall N, Dahmus ME, Krappmann D, Scheidereit C, Thomas CL, Schiavo G, Erdjument-Bromage H, Tempst P, Svejstrup JQ (leden 2002). „Čištění a charakterizace komplexu lidského elongátoru“. J Biol Chem. 277 (4): 3047–52. doi:10,1074 / jbc.M110445200. PMID 11714725.

[entrez-6] „Entrez Gene: ELP3 elongation protein 3 homolog (S. cerevisiae)“.

[7] Creppe C, Malinouskaya L, Volvert ML, Gillard M, Close P, Malaise O, Laguesse S, Cornez I, Rahmouni S, Ormenese S, Belachew S, Malgrange B, Chapelle JP, Siebenlist U, Moonen G, Chariot A, Nguyen L (Únor 2009). „Elongator řídí migraci a diferenciaci kortikálních neuronů prostřednictvím acetylace alfa-tubulinu“. Buňka. 136 (3): 551–64. doi:10.1016 / j.cell.2008.11.043. PMID 19185337. S2CID 18351772.

[8] Okada Y, Yamagata K, Hong K, Wakayama T, Zhang Y (leden 2010). „Role komplexu elongator v demetylaci zygotické otcovské genomu“. Příroda. 463 (7280): 554–8. doi:10.1038 / nature08732. PMC 2834414. PMID 20054296.

[9] Wang YP, Zhou LS, Zhao YZ, Wang SW, Chen LL, Liu LX, Ling ZQ, Hu FJ, Sun YP, Zhang JY, Yang C, Yang Y, Xiong Y, Guan KL, Ye D (červen 2014). „Regulace acetylace G6PD pomocí SIRT2 a KAT9 moduluje homeostázu NADPH a přežití buněk během oxidačního stresu“. Časopis EMBO. 33 (12): 1304–20. doi:10.1002 / embj.201387224. PMC 4194121. PMID 24769394.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]