EEGLAB - EEGLAB

EEGLAB je MATLAB sada nástrojů distribuovaná pod bezplatnou BSD licence na zpracování údajů z elektroencefalografie (EEG), magnetoencefalografie (MEG) a další elektrofyziologické signály. Spolu se všemi základními nástroji pro zpracování implementuje EEGLAB analýza nezávislých komponent (ICA), analýza času / frekvence, odmítnutí artefaktu a několik režimů vizualizace dat. EEGLAB umožňuje uživatelům importovat jejich elektrofyziologická data ve zhruba 20 formátech binárních souborů, předzpracovávat data, vizualizovat aktivitu v jednotlivých pokusech a provádět ICA. Od dat lze odečíst umělé komponenty ICA. Alternativně mohou být ICA komponenty představující mozkovou aktivitu dále zpracovávány a analyzovány. EEGLAB také umožňuje uživatelům seskupovat data od několika subjektů a seskupovat jejich nezávislé komponenty.

Dějiny

V roce 1997 byl soubor funkcí pro zpracování dat poprvé uveden na internet Scottem Makeigem v Laboratoři výpočetní neurobiologie pod vedením Terry Sejnowski na Salk Institute pod názvem „sada nástrojů ICA / EEG“. V roce 2000 Arnaud Delorme navrhl a grafické uživatelské prostředí kromě těchto funkcí spolu s některými jeho vlastními funkcemi odstraňování artefaktů a vydal první verzi „softwaru EEGLAB pro odstraňování artefaktů“. V roce 2003 se Delorme a Makeig spojily v úsilí o vydání první stabilní a plně zdokumentované verze EEGLAB. V roce 2004 získal EEGLAB financování od NIH pro další vývoj výzkumného softwaru.

Statistika

EEGLAB byl během prvních tří let (2003–2006) stažen přibližně 25 000krát ze 73 zemí světa a v roce 2011 byl údajně nejpoužívanějším prostředím zpracování signálu pro zpracování dat EEG kognitivními neurovědy (výsledky průzkumu ). Jeho referenční dokument (Delorme & Makeig, 2004) obdržel více než 12 400 citací (02/2013).

EEGLAB obsahuje více než 380 samostatných funkcí MATLAB a více než 50 000 řádků kódu a hostuje více než 20 zásuvných modulů poskytovaných uživateli. Významné moduly plug-in nástrojů i nadále píší a publikují vědci v Swartz Center, UCSD a mnoho dalších skupin. Mezi hlavní plug-iny patří:

  • DIPFIT, pro lokalizaci zdrojů ICA komponentních zdrojů dat EEG;
  • ERPLAB, pro odvozování opatření z průměrných potenciálů souvisejících s událostmi;
  • RYCHLEJŠÍ plně automatizovaná metoda zpracování dat EEG s vysokou hustotou bez dozoru;
  • NBT soubor nástrojů pro výpočet a integraci neurofyziologických biomarkerů;
  • NFT, pro vytváření modelů elektrických předních hlav z MR obrazů a / nebo pozic elektrod;
  • PROSÍT, sada nástrojů pro tok informací o zdroji;
  • BCILAB, rozsáhlé prostředí pro vytváření a testování rozhraní mozek-počítač modely;

Stovky vědců přispěly k softwaru přímo nebo nepřímo programovacími funkcemi nebo hlášením chyb. Aktuální e-mailový seznam eeglablist má více než 5 000 členů po celém světě (2013).

Viz také

Domovská stránka EEGLAB;

Zdroje

Hlavní reference:

  • Delorme, Arnaud; Makeig, Scott (2004). „EEGLAB: soubor nástrojů open source pro analýzu jednorázové dynamiky EEG včetně analýzy nezávislých komponent“. Journal of Neuroscience Methods. Elsevier BV. 134 (1): 9–21. doi:10.1016 / j.jneumeth.2003.10.009. ISSN  0165-0270. PMID  15102499.

Teorie:

Panely nástrojů:

  • Zeynep Akalin Acar a Scott Makeig, Neuroelektromagnetické čelní modelování nástrojů Toolbox J Neurosci Meth doi: 10.1016 / jneumeth.2010.04.031 (2010)
  • Nolan, H., Whelan, R. a Reilly, R. B. „RYCHLEJŠÍ: Plně automatizované statistické prahové hodnoty pro odmítnutí artefaktu EEG“. Journal of Neuroscience Methods 192 (1): 152–162 (2010)
  • Delorme, A., Mullen, T., Kothe, C., Bigdely-Shamlo, N., Akalin, Z., Vankov, A., Makeig, S. EEGLAB, MPT, NetSIFT, NFT, BCILAB a ERICA: Nové nástroje pro pokročilé zpracování EEG / MEG. Computational Intelligence, ID článku 130714 (2011)
  • N Bigdely-Shamlo, T. Mullen, K. Kreutz-Delgado, S Makeig. Analýza projekce opatření: Pravděpodobnostní přístup ke srovnání zdrojů EEG a odvození od více subjektů. doi: //10.1016/j.neuroimage.2013.01.040 (2013)

externí odkazy