EDF1 - EDF1

EDF1
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	1X57
Identifikátory
Aliasy	EDF1„EDF-1, MBF1, CFAP280, faktor 1 související s diferenciací endotelu
Externí ID	OMIM: 605107 MGI: 1891227 HomoloGene: 2809 Genové karty: EDF1
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 9 (lidský)
Konec	136,866,308 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 2 (myš)
Konec	25,562,082 bp
Exprese RNA vzor
	; ;
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• aktivita methyltransferázy; • sekvenčně specifická vazba DNA; • Vazba DNA; • GO: 0001131, GO: 0001151, GO: 0001130, GO: 0001204 Aktivita transkripčního faktoru vázajícího DNA; • GO: Aktivita transkripčního koaktivátoru 0001105; • kalmodulinová vazba; • aktivita histon acetyltransferázy; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • Vazba RNA; • Vazba transkripčního faktoru třídy TFIID;
Buněčná složka	• cytoplazma; • transkripční faktor TFIID komplex; • intracelulární; • jádro; • extracelulární exosom; • buněčné jádro; • cytosol;
Biologický proces	• diferenciace buněk; • regulace transkripce, DNA-šablony; • transkripce, chráněná DNA; • vývoj mnohobuněčných organismů; • pozitivní regulace transkripce, chráněná DNA; • regulace metabolismu lipidů; • diferenciace endotelových buněk; • pozitivní regulace vazby DNA;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	8721
	59022
	ENSG00000107223
	ENSMUSG00000015092
	O60869
	Q9JMG1
	NM_153200; NM_001281297; NM_001281298; NM_001281299; NM_003792
	NM_021519
	NP_001268226; NP_001268227; NP_001268228; NP_003783; NP_694880
	NP_067494
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Faktor související s endoteliální diferenciací 1 je protein že u lidí je kódován EDF1 gen.^[5]^[6]^[7]

Funkce

Tento gen kóduje protein, který může regulovat diferenciaci endotelových buněk. Předpokládá se, že protein funguje jako přemosťující molekula, která propojuje regulační proteiny a bazální transkripční aparát, čímž moduluje transkripci genů zapojených do endoteliální diferenciace. Bylo také zjištěno, že tento protein působí jako transkripční koaktivátor propojením obecného proteinu vázajícího transkripční faktor na TATA prvek (TBP) a genově specifických aktivátorů. Pro tento gen byly nalezeny dva alternativně sestřižené transkripty, které kódují odlišné proteiny.^[7]

Interakce

Bylo prokázáno, že EDF1 komunikovat s:

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000107223 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000015092 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Dragoni I, Mariotti M, Consalez GG, Soria MR, Maier JA (prosinec 1998). „EDF-1, nový genový produkt down-regulovaný v diferenciaci lidských endoteliálních buněk“. J Biol Chem. 273 (47): 31119–24. doi:10.1074 / jbc.273.47.31119. PMID 9813014.
^ Ballabio E, Mariotti M, De Benedictis L, Maier JA (duben 2004). „Dvojí role faktoru 1 souvisejícího s endoteliální diferenciací v cytosolu a jádru: modulace proteinovou kinázou A“. Cell Mol Life Sci. 61 (9): 1069–74. doi:10.1007 / s00018-004-4016-0. PMID 15112053. S2CID 861006.
^ ^A ^b „Entrez Gene: EDF1 endoteliální diferenciace související s faktorem 1“.
^ ^A ^b ^C Brendel C, Gelman L, Auwerx J (červen 2002). „Multiproteinový můstkový faktor-1 (MBF-1) je kofaktorem pro jaderné receptory, které regulují metabolismus lipidů“. Mol. Endokrinol. 16 (6): 1367–77. doi:10.1210 / oprava.16.6.0843. PMID 12040021.
^ Mariotti M, De Benedictis L, Avon E, Maier JA (srpen 2000). „Interakce mezi faktorem 1 souvisejícím s endoteliální diferenciací a kalmodulinem in vitro a in vivo“. J. Biol. Chem. 275 (31): 24047–51. doi:10,1074 / jbc.M001928200. PMID 10816571.
^ Kabe Y, Goto M, Shima D, Imai T, Wada T, Morohashi Ki, Shirakawa M, Hirose S, Handa H (listopad 1999). „Role lidského MBF1 jako transkripčního koaktivátoru“. J. Biol. Chem. 274 (48): 34196–202. doi:10.1074 / jbc.274.48.34196. PMID 10567391.

Další čtení

Li FQ, Ueda H, Hirose S (1994). "Zprostředkovatelé aktivace transkripce genu fushi tarazu BmFTZ-F1". Mol. Buňka. Biol. 14 (5): 3013–21. doi:10,1128 / mcb.14.5.3013. PMC 358669. PMID 8164657.
Ozaki J, Takemaru KI, Ikegami T, Mishima M, Ueda H, Hirose S, Kabe Y, Handa H, Shirakawa M (1999). Msgstr "Identifikace hlavní domény a sekundární struktury transkripčního koaktivátoru MBF1". Geny buňky. 4 (7): 415–24. doi:10.1046 / j.1365-2443.1999.00267.x. PMID 10469174. S2CID 17825943.
Mariotti M, De Benedictis L, Avon E, Maier JA (2000). „Interakce mezi faktorem 1 souvisejícím s endoteliální diferenciací a kalmodulinem in vitro a in vivo“. J. Biol. Chem. 275 (31): 24047–51. doi:10,1074 / jbc.M001928200. PMID 10816571.
Brendel C, Gelman L, Auwerx J (2003). „Multiproteinový můstkový faktor-1 (MBF-1) je kofaktorem pro jaderné receptory, které regulují metabolismus lipidů“. Mol. Endokrinol. 16 (6): 1367–77. doi:10.1210 / oprava.16.6.0843. PMID 12040021.
Rual JF, Venkatesan K, Hao T, Hirozane-Kishikawa T, Dricot A, Li N, Berriz GF, Gibbons FD, Dreze M, Ayivi-Guedehoussou N, Klitgord N, Simon C, Boxem M, Milstein S, Rosenberg J, Goldberg DS, Zhang LV, Wong SL, Franklin G, Li S, Albala JS, Lim J, Fraughton C, Llamosas E, Cevik S, Bex C, Lamesch P, Sikorski RS, Vandenhaute J, Zoghbi HY, Smolyar A, Bosak S, Sequerra R, Doucette-Stamm L, Cusick ME, Hill DE, Roth FP, Vidal M (2005). „Směrem k mapě interakční sítě lidský protein-protein v měřítku proteomu“. Příroda. 437 (7062): 1173–8. doi:10.1038 / nature04209. PMID 16189514. S2CID 4427026.
Bolognese F, Pitarque-Martì M, Lo Cicero V, Mantovani R, Maier JA (2006). "Charakterizace minimálního promotoru lidského EDF-1: účast NFY a Sp1 na regulaci bazální transkripce". Gen. 374: 87–95. doi:10.1016 / j.gene.2006.01.030. PMID 16567061.

Tento článek o gen na lidský chromozom 9 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000107223 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000015092 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid9813014-5] Dragoni I, Mariotti M, Consalez GG, Soria MR, Maier JA (prosinec 1998). „EDF-1, nový genový produkt down-regulovaný v diferenciaci lidských endoteliálních buněk“. J Biol Chem. 273 (47): 31119–24. doi:10.1074 / jbc.273.47.31119. PMID 9813014.

[pmid15112053-6] Ballabio E, Mariotti M, De Benedictis L, Maier JA (duben 2004). „Dvojí role faktoru 1 souvisejícího s endoteliální diferenciací v cytosolu a jádru: modulace proteinovou kinázou A“. Cell Mol Life Sci. 61 (9): 1069–74. doi:10.1007 / s00018-004-4016-0. PMID 15112053. S2CID 861006.

[entrez-7] A ^b „Entrez Gene: EDF1 endoteliální diferenciace související s faktorem 1“.

[pmid12040021-8] A ^b ^C Brendel C, Gelman L, Auwerx J (červen 2002). „Multiproteinový můstkový faktor-1 (MBF-1) je kofaktorem pro jaderné receptory, které regulují metabolismus lipidů“. Mol. Endokrinol. 16 (6): 1367–77. doi:10.1210 / oprava.16.6.0843. PMID 12040021.

[pmid10816571-9] Mariotti M, De Benedictis L, Avon E, Maier JA (srpen 2000). „Interakce mezi faktorem 1 souvisejícím s endoteliální diferenciací a kalmodulinem in vitro a in vivo“. J. Biol. Chem. 275 (31): 24047–51. doi:10,1074 / jbc.M001928200. PMID 10816571.

[pmid10567391-10] Kabe Y, Goto M, Shima D, Imai T, Wada T, Morohashi Ki, Shirakawa M, Hirose S, Handa H (listopad 1999). „Role lidského MBF1 jako transkripčního koaktivátoru“. J. Biol. Chem. 274 (48): 34196–202. doi:10.1074 / jbc.274.48.34196. PMID 10567391.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]