DecisionDx-UM - DecisionDx-UM

DecisionDx-UM je prognostický test, který přesně určuje metastatické riziko spojené s očním melanomem nádory oka. Oční melanom je termín běžně používaný k popisu nádorů uveální traktu, jako je uveální melanom, choroidální melanom, melanom ciliárního těla a melanom duhovky. Test DecisionDx-UM byl klinicky validován na těchto nádorech uveálního traktu. DecisionDx-UM hodnotí profil genové exprese (GEP) podskupiny genů, které jsou rozdílně exprimovány v primárních nádorových buňkách ve srovnání s buňkami, které prošly transformací na metastazující fenotyp.

Test klasifikuje nádory jako:

  • Třída 1A (nízké riziko metastáz),
  • Třída 1B (dlouhodobé metastatické riziko),
  • Třída 2 (okamžité, vysoké riziko metastáz).[1]

Test, který se také označuje jako profil genové exprese, byl přímo srovnáván se všemi ostatními klinický a patologické faktory, jako např chromozóm 3 stav (monosomie 3), cytopatologie a velikost nádoru a test DecisionDx-UM se ukázal být přesnější než tyto další faktory.[2] Test DecisionDx-UM se stal ve většině případů standardem péče oční onkologie střediska v USA a je doporučována Americký smíšený výbor pro rakovinu (AJCC). AJCC doporučuje toto testování u všech pacientů s diagnózou uveálního melanomu, protože výsledky jsou „klinicky významné“. Přesných výsledků je dosaženo použitím obou biopsie s aspirátem jemné jehly (FNAB) nebo formalín pevný, parafín zabudovaná (FFPE) nádorová tkáň. Prognostické informace poskytované pomocí rozhodnutí Dx-UM pomáhají lékařům a jejich pacientům přijímat individualizovaná rozhodnutí o nejvhodnějších možnostech dohledu a léčby. Test DecisionDx-UM byl výhradně licencován od Washingtonská univerzita v St. Louis a je k dispozici pouze prostřednictvím hradu Biologické vědy, Incorporated.

Uvealní melanom

I když je vzácný, uveální melanom (oční melanom) je nejčastější formou rakoviny oka a druhou nejčastější formou melanom. Nádory uveálního melanomu vznikají v uveálním traktu oka, který zahrnuje duhovka, řasnaté tělo, a cévnatka. Léčba primárního očního nádoru spočívá v oční šetřící terapii (radioterapie plaku nebo ozáření protonovým paprskem ) nebo odstranění očí (enukleace ). Oba jsou vysoce účinné s mírou „vyléčení“ nad 90%. Jak však bylo dobře zdokumentováno v několika publikacích, včetně Kolaborativní studie očního melanomu (COMS), u téměř 50% pacientů melanom pravděpodobně již metastázoval v době, kdy byl diagnostikován a léčen primární oční nádor.[3][4] Většina těchto metastáz je v době primární diagnostiky nádoru mikroskopická a klinicky nezjistitelná.[5] Bohužel mnoho současných diagnostických technik (včetně zobrazovacích a jaterních funkčních testů) není schopno přesně detekovat mikrometastázy, dokud nádorové uzlíky značně nevyrostou a pravděpodobně nebudou rezistentní vůči terapii.[6][7]

Nedostatek přesných prognostických testů k identifikaci, u kterých pacientů je riziko vzniku klinicky zjevného metastatického onemocnění, byl významným problémem v léčbě jednotlivých pacientů s uveálním melanomem. Bez přesných měření individuálního rizika metastáz není možné určit, u kterých pacientů je vysoké riziko klinických metastáz, což může vést k nadměrné nebo nedostatečné léčbě daného pacienta. Test DecisionDx-UM byl vyvinut, aby poskytoval lepší individuální hodnocení rizika metastáz, což umožňuje vhodnější sledování a plánování léčby.

Stanovení GEP pro rozhodnutí Dx-UM

Objev

Profil genové exprese měřený pomocí rozhodnutí Dx-UM byl objeven v laboratoři J. William Harbor v Washingtonská univerzita v St. Louis.[8][9] Aplikace analýzy microarray na primární neošetřené uveální melanomy odhalila, že se nádory shlukly do dvou diskrétních skupin na základě jejich profilů exprese.[8] Filtrace odlišně exprimované genové sady vedla k identifikaci sady genů schopných rozlišovat mezi nádory třídy 1 a třídy 2.

V následujících experimentech skupina Dr. Harbourse shromáždila informace z mikroarray z větší podskupiny vzorků tumoru uveálního melanomu a byla schopna identifikovat kandidátské diskriminační geny pro další analýzu.[9] Profily genetické exprese těchto rozlišujících genů byly ověřeny v nádorech uveálního melanomu pomocí kvantitativní polymerázová řetězová reakce (qPCR) a prediktivní modelování bylo provedeno za účelem identifikace optimální sady genů schopných přesně předpovědět metastatické riziko a hlásit přiřazení tříd.[9][10] Konečný test hodnotil 12 diskriminačních genů a 3 kontrolní geny pro stanovení nádorů třídy 1 (nízké riziko) a třídy 2 (vysoké riziko) a byl validován v multicentrické studii 609 pacientů, která zahrnovala vzorky FNAB a FFPE.[9]

Prognostická přesnost

Současná platforma DecisionDx-UM byla klinicky validována ve studii COOG, která zahrnovala 514 pacientů s UM léčených ve 12 očních onkologických centrech v Spojené státy v letech 1998 až 2010.[1] Zpráva poskytuje data prokazující, že DecisionDx-UM má vysokou technickou úspěšnost (> 95%).

Klinický technický úspěch

Od počáteční nabídky rozhodnutí Dx-UM v prosinci 2009 bylo od společnosti Castle Biosciences obdrženo více než 800 klinických objednávek z více než 55 očních onkologických center v USA. Technický úspěch a stanovení třídy bylo dosaženo u 96,2% vzorků.[11] Většina selhání byla způsobena nesprávným biopsie sběr a / nebo manipulace. Odběr biopsie tumoru je rozhodující pro úspěšné hlášení přiřazení třídy metastatického rizika po testování DecisionDx-UM.

OrderDx-UM Objednávání a podávání zpráv

Castle Biosciences, Incorporated přijímá objednávky služeb pro DecisionDx-UM pouze od licencovaných lékařů (nejčastěji očních onkologů, oftalmologů nebo sítnice specialisté), kteří pečují o pacienty s diagnostikovaným uveálním melanomem. Lékaři, kteří jsou prvními zákazníky, musí kontaktovat Castle's pro informace a založit účet. Odeslání vzorku vyžaduje vyplnění formuláře žádosti o rozhodnutí Dx-UM, který musí být vyplněn a odeslán faxem na Castle. Vzorky FNAB vyžadují použití sady pro odběr vzorků poskytnuté společností Castle, aby se vzorek stabilizoval a snížila se pravděpodobnost technického selhání. Tuto soupravu musí před objednáním obdržet objednající lékař. Zaměstnanci hradu jsou k dispozici pro pomoc s logistikou týkající se odběru a přepravy vzorků.

Castle poskytuje objednávajícímu lékaři zprávu, která klasifikuje nádor jako třídu 1A, třídu 1B nebo třídu 2. Zpráva bude také popisovat statistiky spojené s klasifikací a poskytne diskriminační hodnotu, která odráží důvěru ohledně klasifikace. Informace poskytnuté ve zprávě od Castle identifikují, jak je pravděpodobné, že nádor metastázuje (šíří se), přičemž toto riziko je kategorizováno jako nízké (třída 1A), střední (třída 1B) nebo vysoké (třída 2).

Další prognostické faktory metastázy UM

Histopatologické faktory a zobrazovací techniky

Historicky existuje několik klinických a patologických rysů, které byly staticky spojeny s metastázami.[12][13] Velikost nádoru, umístění nádoru, věk pacienta a cévní Uvádí se, že struktura všech korelovala s metastatickým nástupem a přežitím pacientů.[2][12][13][14] I když lze na základě těchto faktorů učinit obecné informace týkající se populace pacientů s UM jako celku, žádný, samostatně nebo společně, neprokázal prediktivní přesnost s ohledem na metastatickou aktivitu.

Zobrazovací techniky používané k detekci metastatické aktivity mají také svá omezení. Systémové metastázy jsou detekovány pomocí Pozitronová emisní tomografie (PET) zobrazování v době původní diagnózy u méně než 4% pacientů s UM [6] Magnetická rezonance (MRI) byla nedávno identifikována citlivější než PET k identifikaci metastáz z choroidální melanom, ale MRI vyžaduje nádorovou hmotu větší než 5 mm.[15] Současné zobrazovací technologii tedy chybí citlivost pro detekci mikrometastázy které mohou být přítomny v době primární diagnózy uveálního melanomu.

Genetické faktory

Techniky genetické analýzy vedly k identifikaci chromozomálních abnormalit spojených s progresí metastatického nádoru uveálního melanomu. Ztráta heterozygotnost, ztráta celku alely z chromozomů, částečné přidání chromozomů a chromozomální delece a jednonukleotidové polymorfismy (SNP) byly spojeny s metastázujícími lézemi uveálního melanomu.[16][17][18][19][20] Zejména chromozomy 1, 3, 6 a 8 byly rozsáhle studovány kvůli jejich spojitosti s kratší dobou přežití a rozvojem metastatického onemocnění.[17][19][20][21][22][23][24]

Zatímco genetické aberace v chromozomech 1, 6 a 8 nedokázaly nezávisle předpovědět progresi onemocnění, cytogenetické profilování chromozomu 3 odhalilo důležitou genetickou oblast vysoce spojenou s metastatickým nástupem u pacientů s uveálním melanomem.[16][23] Abnormality chromozomu 3 byly analyzovány pomocí různých technik, včetně fluorescenční in situ hybridizace (FISH), chromozomální in situ hybridizace (CISH), pole komparativní genomová hybridizace (aCGH), SNP, zesílení sondy závislé na multiplexní ligaci (MLPA) a mikrosatelitní analýza.[16][21][25][26][27][28]

Přes velké množství údajů, které identifikovaly asociaci chromozomu 3 mutace s UM metastázami, klinická aplikace těchto dat musí být ještě realizována.[29] Důvody nejistoty klinického použití chromozomu 3 zahrnují:

  • vysoká míra falešně pozitivních nálezů (v rozmezí 5-22%)
  • vysoké míry falešně negativních nálezů (v rozmezí od 4 do 50%)
  • vysoká míra technických poruch (až 50%) kvůli velkému požadavku na tkáň pro současné analytické techniky
  • nepříznivé účinky buněk heterogenita na chromozom 3 cytogenetická analýza.[2][26][29][30][31][32][33][34]

Kromě toho na rozdíl od testu DecisionDx-UM neexistují žádné publikované, recenzované studie, které by prokázaly klinickou validaci u nezávislé skupiny pacientů.

Castle Biosciences, Incorporated

Castle Biosciences, Inc.
Obchodováno jakoNASDAQ: CSTL

Castle Biosciences, Incorporated je společnost pro molekulární diagnostiku, která vyvíjí diagnostické a prognostické testy pro vzácné druhy rakoviny. Posláním společnosti Castle je sloužit jednotlivcům postiženým vzácnými druhy rakoviny nabídkou přesných prognostických testů, které poskytují informace pro kritická rozhodnutí týkající se režimů sledování a léčby jednotlivce. Kromě DecisionDx-UM nabízí Castle prognostické testy pro glioblastoma multiforme (DecisionDx-GBM) a nízké kvality gliom (DecisionDx-LGG). Castle sídlí v Friendswood, TX, a má operace v Phoenix, AZ.

Reference

  1. ^ A b Harbour, J.W., Retina Times 2011; 29: 36-7.
  2. ^ A b C Worley, L.A., et al., Clinical Cancer Research, 2007. 13 (5): str. 1466-71.
  3. ^ Archiv oftalmologie, 2006. 124 (12): str. 1684-93.
  4. ^ Diener-West, M. a kol., Archives of Ophthalmology, 2001. 119 (7): str. 969-82.
  5. ^ Harbor, J.W., Klinický přehled uveálního melanomu: úvod do nádorů oka., Ed. D.M. Albert, Polans, A.2003: Marcel Dekker. 1-18.
  6. ^ A b Finger, P.T. a kol., The British Journal of Ophthalmology, 2005. 89 (10): str. 1270-4.
  7. ^ Kurli, M. a kol., American Journal of Ophthalmology, 2005. 140 (2): str. 193-9.
  8. ^ A b Onken, M.D. a kol., Cancer research, 2004. 64 (20): str. 7205-9.
  9. ^ A b C d Onken, M.D. a kol., The Journal of molekulární diagnostiky: JMD, 2010. 12 (4): str. 461-8.
  10. ^ Onken, M.D. a kol., The Journal of molekulární diagnostiky: JMD, 2006. 8 (5): str. 567-73.
  11. ^ Bergstrom, C.S., Hovland, P. G., Stone, J. F., Oelschlager, K. a Cook, R. W., 2011.
  12. ^ A b Augsburger, J.J. a J.W. Gamel, Cancer, 1990. 66 (7): str. 1596-600.
  13. ^ A b McLean, I.W., K.S. Keefe a M.N. Burnier, Ophthalmology, 1997. 104 (5): str. 777-80.
  14. ^ Foss, A.J. a kol., Cancer research, 1996. 56 (13): str. 2900-3.
  15. ^ Servois, V. a kol., Evropský časopis chirurgické onkologie: časopis Evropské společnosti pro chirurgickou onkologii a Britské asociace chirurgické onkologie, 2010. 36 (2): str. 189-94.
  16. ^ A b C Harbor, J.W. a kol., Science, 2010. 330 (6009): str. 1410-3.
  17. ^ A b Kilic, E. a kol., Investigativní oftalmologie a vizuální věda, 2006. 47 (9): str. 3703-7.
  18. ^ Onken, M.D., L.A.Worley a J.W. Harbour, Clinical Cancer Research, 2008. 14 (12): str. 3737-45.
  19. ^ A b Prescher, G., N. Bornfeld a R. Becher, Journal of the National Cancer Institute, 1990. 82 (22): str. 1765-9.
  20. ^ A b Sisley, K. a kol., Genes, Chromosomes & Cancer, 1990. 2 (3): str. 205-9.
  21. ^ A b Damato, B., J.A. Dopierala a S.E. Coupland, Clinical Cancer Research, 2010. 16 (24): str. 6083-92.
  22. ^ Sisley, K. a kol., Genes, Chromosomes & Cancer, 1997. 19 (1): str. 22-8.
  23. ^ A b Prescher, G. a kol., Lancet, 1996. 347 (9010): str. 1222-5.
  24. ^ Singh, A.D. a kol., Archives of Pathology & Laboratory Medicine, 2009. 133 (8): str. 1223-7.
  25. ^ Naus, N.C. a kol., Clinical Cancer Research, 2002. 8 (2): str. 534-9.
  26. ^ A b Onken, M.D. a kol., Clinical Cancer Research, 2007. 13 (10): str. 2923-7.
  27. ^ Sandinha, M.T., M.A. Farquharson a F. Roberts, The British Journal of Ophthalmology, 2004. 88 (12): str. 1527-32.
  28. ^ Tschentscher, F. a kol., Cancer genetics and cytogenetics, 2000. 122 (1): str. 13-7.
  29. ^ A b Damato, B. a S.E. Coupland, Archiv oftalmologie, 2009. 127 (4): str. 423-9.
  30. ^ Maat, W. a kol., Archives of Pathology & Laboratory Medicine, 2007. 131 (1): str. 91-6.
  31. ^ Mensink, H. W. a kol., Investigativní oftalmologie a vizuální věda, 2009. 50 (2): str. 500-4.
  32. ^ Midena, E. a kol., European journal of oftalmology, 2006. 16 (3): str. 422-5.
  33. ^ Shields, C.L., et al., Transaction of the American Ophthalmological Society, 2007. 105: s. 43-52; diskuse 52-3.
  34. ^ Young, T.A., et al., Ophthalmology, 2007. 114 (1): str. 142-6.

externí odkazy