DOT1L - DOT1L

DOT1L
Dostupné struktury
PDB	Lidské vyhledávání UniProt: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	1NW3, 2MV7, 3QOW, 3QOX, 3SR4, 3SX0, 3UWP, 4EK9, 4EKG, 4EKI, 4EQZ, 4ER0, 4ER3, 4ER5, 4ER6, 4ER7, 4HRA, 4WVL, 5DSX, 5JUW, 5 DRT, 5DTM, 5DTQ, 5DT2, 5DRY, 5 DTR
Identifikátory
Aliasy	DOT1L, DOT1, KMT4, DOT1 jako histon lysin methyltransferáza
Externí ID	OMIM: 607375 MGI: 2143886 HomoloGene: 32779 Genové karty: DOT1L
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 19 (lidský)
Konec	2,232,578 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 10 (myš)
Konec	80,795,461 bp
Exprese RNA vzor
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• aktivita methyltransferázy; • aktivita transferázy; • Vazba DNA; • transkripční faktor vazba; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • aktivita histonmethyltransferázy; • aktivita histon-lysin N-methyltransferázy; • aktivita histonmethyltransferázy (specifická pro H3-K79);
Buněčná složka	• nukleoplazma; • buněčné jádro; • chromozom, telomerická oblast; • intracelulární membránou vázaná organela; • makromolekulární komplex;
Biologický proces	• organizace telomer; • methylace; • umlčování chromatinu; • regulace transkripce regulační oblasti vázání DNA; • regulace kaskády JAK-STAT; • pozitivní regulace transkripce z promotoru RNA polymerázy II; • pozitivní regulace buněčné proliferace; • methylace histonu H3-K79; • Kontrolní bod poškození DNA; • Oprava DNA; • umlčování chromatinu na telomerě; • organizace chromatinu; • regulace buněčného cyklu;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	84444
	208266
	ENSG00000104885
	ENSMUSG00000061589
	Q8TEK3
	n / a
	NM_032482
	NM_199322
	NP_115871
	n / a
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

DOT1 (Disruptor telomerického umlčování 1-like), histon H3K79 methyltransferáza (S. cerevisiae), také známý jako DOT1L, je protein nalézt u lidí, stejně jako u jiných eukaryot.^[5]^[6]The methylace histonu H3 lysinu 79 (H3K79) pomocí DOT1L, který je konzervovaný epigenetický značka v mnoha eukaryotických epigenomech, zvyšuje se postupně podél stárnutí proces, což naznačuje, že „DOT1L může fungovat jako životně důležité hodiny a nenápadně tikat hodiny“.^[7]

Uvádí se, že DOT1L hraje důležitou roli v procesech smíšená linie leukémie (MLL) - předělané leukémie^[8]

Byly vyvinuty malé molekulové inhibitory katalytické aktivity Dot1L.^[9]^[10]

Všechny tři formy methylace H3K79 (H3K79me1; H3K79me2; H3K79me3) jsou katalyzovány DOT1 v kvasinkách nebo DOT1L u savců. Methylace H3K79 se účastní reakce poškození DNA a má několik rolí v opravě excizí nukleotidů a rekombinační opravě sesterských chromatidů.^[11]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000104885 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání Ensembl 89: ENSMUSG00000061589 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ "Entrez Gene: DOT1L DOT1, histon H3 methyltransferáza (S. cerevisiae)".
^ Vlaming H, van Leeuwen F (2016). "Upstreams a downstreams methylace H3K79 od DOT1L". Chromozom. 125 (4): 1–13. doi:10.1007 / s00412-015-0570-5. PMID 26728620. S2CID 18876283.
^ Soria-Valles C, Osorio FG, López-Otín C (2015). "Přeprogramování stárnutí pomocí inhibice DOT1L". Buněčný cyklus. 14 (21): 3345–3346. doi:10.1080/15384101.2015.1093443. PMC 4825545. PMID 26375309.
^ Slany RK (2016). "Molekulární mechanika smíšené linie leukémie". Onkogen. 35 (40): 5215–5223. doi:10.1038 / dne 2016.30. PMID 26923329. S2CID 34116587.
^ Yao Y, Chen P, Diao J, Cheng G, Deng L, Anglin JL, Prasad BV, Song Y (2011). „Selektivní inhibitory histonmethyltransferázy DOT1L: design, syntéza a krystalografické studie“. Journal of the American Chemical Society. 133 (42): 16746–9. doi:10.1021 / ja206312b. PMC 3492951. PMID 21936531.
^ Chen S, Li L, Chen Y, Hu J, Liu J, Liu YC, Liu R, Zhang Y, Meng F, Zhu K, Lu J, Zheng M, Chen K, Zhang J, Jiang H, Yao Z, Luo C (2016). „Identifikace nového disruptoru inhibitorů typu Telomeric Silencing 1 (DOT1L) prostřednictvím strukturního virtuálního screeningu a biologických testů“. Journal of Chemical Information and Modeling. 56 (3): 527–34. doi:10.1021 / acs.jcim.5b00738. PMID 26914852.
^ Chen Y, Zhu WG (červenec 2016). „Biologická funkce a regulace methylace histonového a nehistonového lysinu v reakci na poškození DNA“. Acta Biochim. Biophys. Hřích. (Šanghaj). 48 (7): 603–16. doi:10.1093 / abbs / gmw050. PMID 27217472.

Další čtení

Nagase T, Nakayama M, Nakajima D, Kikuno R, Ohara O (duben 2001). „Predikce kódujících sekvencí neidentifikovaných lidských genů. XX. Kompletní sekvence 100 nových cDNA klonů z mozku, které kódují velké proteiny in vitro“. Výzkum DNA. 8 (2): 85–95. doi:10.1093 / dnares / 8.2.85. PMID 11347906.
Feng Q, Wang H, Ng HH, Erdjument-Bromage H, Tempst P, Struhl K, Zhang Y (červen 2002). „Methylace H3-lysinu 79 je zprostředkována novou rodinou HMTáz bez domény SET“. Aktuální biologie. 12 (12): 1052–8. doi:10.1016 / S0960-9822 (02) 00901-6. PMID 12123582. S2CID 17263035.
Min J, Feng Q, Li Z, Zhang Y, Xu RM (březen 2003). "Struktura katalytické domény lidské DOT1L, nukleosomální histonmethyltransferázy jiné než SET domény". Buňka. 112 (5): 711–23. doi:10.1016 / S0092-8674 (03) 00114-4. PMID 12628190. S2CID 17822742.
Jikuya H, Takano J, Kikuno R, Hirosawa M, Nagase T, Nomura N, Ohara O (únor 2003). „Charakterizace dlouhých klonů cDNA z lidské dospělé sleziny. II. Kompletní sekvence 81 klonů cDNA“. Výzkum DNA. 10 (1): 49–57. doi:10.1093 / dnares / 10.1.49. PMID 12693554.
Okada Y, Feng Q, Lin Y, Jiang Q, Li Y, Coffield VM, Su L, Xu G, Zhang Y (duben 2005). "hDOT1L spojuje methylaci histonu s leukemogenezí". Buňka. 121 (2): 167–78. doi:10.1016 / j.cell.2005.02.020. PMID 15851025. S2CID 15638573.
Sistayanarain A, Tsuneyama K, Zheng H, Takahashi H, Nomoto K, Cheng C, Murai Y, Tanaka A, Takano Y (2006). "Exprese Aurora-B kinázy a fosforylovaného histonu H3 v hepatocelulárním karcinomu". Protinádorový výzkum. 26 (5A): 3585–93. PMID 17094487.

externí odkazy

Přehled všech strukturálních informací dostupných v PDB pro UniProt: Q8TEK3 (Histon-lysin N-methyltransferáza, specifická pro H3 lysin-79) na PDBe-KB.

Tento článek o gen na lidský chromozom 19 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000104885 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání Ensembl 89: ENSMUSG00000061589 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[entrez-5] "Entrez Gene: DOT1L DOT1, histon H3 methyltransferáza (S. cerevisiae)".

[6] Vlaming H, van Leeuwen F (2016). "Upstreams a downstreams methylace H3K79 od DOT1L". Chromozom. 125 (4): 1–13. doi:10.1007 / s00412-015-0570-5. PMID 26728620. S2CID 18876283.

[7] Soria-Valles C, Osorio FG, López-Otín C (2015). "Přeprogramování stárnutí pomocí inhibice DOT1L". Buněčný cyklus. 14 (21): 3345–3346. doi:10.1080/15384101.2015.1093443. PMC 4825545. PMID 26375309.

[pmid26923329-8] Slany RK (2016). "Molekulární mechanika smíšené linie leukémie". Onkogen. 35 (40): 5215–5223. doi:10.1038 / dne 2016.30. PMID 26923329. S2CID 34116587.

[pmid21936531-9] Yao Y, Chen P, Diao J, Cheng G, Deng L, Anglin JL, Prasad BV, Song Y (2011). „Selektivní inhibitory histonmethyltransferázy DOT1L: design, syntéza a krystalografické studie“. Journal of the American Chemical Society. 133 (42): 16746–9. doi:10.1021 / ja206312b. PMC 3492951. PMID 21936531.

[pmid26914852-10] Chen S, Li L, Chen Y, Hu J, Liu J, Liu YC, Liu R, Zhang Y, Meng F, Zhu K, Lu J, Zheng M, Chen K, Zhang J, Jiang H, Yao Z, Luo C (2016). „Identifikace nového disruptoru inhibitorů typu Telomeric Silencing 1 (DOT1L) prostřednictvím strukturního virtuálního screeningu a biologických testů“. Journal of Chemical Information and Modeling. 56 (3): 527–34. doi:10.1021 / acs.jcim.5b00738. PMID 26914852.

[pmid27217472-11] Chen Y, Zhu WG (červenec 2016). „Biologická funkce a regulace methylace histonového a nehistonového lysinu v reakci na poškození DNA“. Acta Biochim. Biophys. Hřích. (Šanghaj). 48 (7): 603–16. doi:10.1093 / abbs / gmw050. PMID 27217472.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

[11]