DHX29 - DHX29 - Wikipedia

DHX29
Identifikátory
Aliasy	DHX29, DDX29, DEAH-box helicase 29, DExH-box helicase 29
Externí ID	OMIM: 612720 MGI: 2145374 HomoloGene: 10387 Genové karty: DHX29
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 5 (lidský)
Konec	55,307,694 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 13 (myš)
Konec	112,969,432 bp
Genová ontologie
Molekulární funkce	• aktivita faktoru iniciace translace; • ATP vazba; • aktivita hydrolázy; • vazba nukleotidů; • vazba nukleové kyseliny; • GO: Aktivita helikázy 0008026; • ribozomální vazba malé podjednotky; • kadherinová vazba; • Vazba RNA; • Aktivita RNA helikázy; • aktivita hydrolázy, působící na anhydridy kyselin, v anhydridech obsahujících fosfor; • GO: 0034459 aktivita 3'-5 'RNA helikázy;
Buněčná složka	• cytoplazma; • eukaryotický preiniciační komplex 43S; • mitochondrie;
Biologický proces	• Zpracování RNA; • překladová iniciace; • biosyntéza bílkovin; • pozitivní regulace iniciace translace;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	54505
	218629
	ENSG00000067248
	ENSMUSG00000042426
	Q7Z478
	Q6PGC1
	NM_019030; NM_001345964; NM_001345965
	NM_172594
	NP_001332893; NP_001332894; NP_061903
	NP_766182
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

DExH-box helicase 29 (DHX29) je 155 kDa protein že u lidí je kódován DHX29 gen.^[5]

Funkce

Tento gen kóduje člena NEBEZPEČÍ (Asp-Glu-Ala-His) podrodina proteinů, součást MRTVÝ (Asp-Glu-Ala-Asp) boxová rodina RNA helikázy. Kódovaný protein funguje v zahájení překladu, a je specificky vyžadován pro ribozomální skenování přes stabilní mRNA sekundární struktury během iniciace kodon výběr.^[6] Tento protein může také hrát roli při snímání virově odvozených cytosolických nukleových kyselin.^[7] Porážka tohoto genu vede ke snížení překlad bílkovin a zhoršená proliferace rakovinných buněk.^[8]

Interakce

Bylo prokázáno, že DHX29 komunikovat s eukaryotická malá ribozomální podjednotka (40S) a eIF3.^[9]^[10]^[11]^[12]

Viz také

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000067248 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000042426 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Entrez Gene: DExH-box helicase 29“.
^ Pisareva VP, Pisarev AV, Komar AA, Hellen CU, Pestova TV (prosinec 2008). „Spuštění translace na savčích mRNA se strukturovanými 5'UTR vyžaduje protein DHX29 DExH-boxu“. Buňka. 135 (7): 1237–50. doi:10.1016 / j.cell.2008.10.037. PMC 2948571. PMID 19109895.
^ Sugimoto N, Mitoma H, Kim T, Hanabuchi S, Liu YJ (květen 2014). „Helikázové proteiny DHX29 a RIG-I cosense cytosolické nukleové kyseliny v systému dýchacích cest člověka“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 111 (21): 7747–52. doi:10.1073 / pnas.1400139111. PMC 4040624. PMID 24821782.
^ Parsyan A, Shahbazian D, Martineau Y, Petroulakis E, Alain T, Larsson O, Mathonnet G, Tettweiler G, Hellen CU, Pestova TV, Svitkin YV, Sonenberg N (prosinec 2009). „Helikázový protein DHX29 podporuje iniciaci translace, buněčnou proliferaci a tumorigenezi“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 106 (52): 22217–22. doi:10.1073 / pnas.0909773106. PMC 2799747. PMID 20018725.
^ Hashem Y, des Georges A, Dhote V, Langlois R, Liao HY, Grassucci RA, Hellen CU, Pestova TV, Frank J (květen 2013). "Struktura savčího ribozomálního preiniciačního komplexu 43S vázaného na skenovací faktor DHX29". Buňka. 153 (5): 1108–19. doi:10.1016 / j.cell.2013.04.036. PMC 3730827. PMID 23706745.
^ Hashem Y, des Georges A, Dhote V, Langlois R, Liao HY, Grassucci RA, Pestova TV, Hellen CU, Frank J (listopad 2013). „Interní vstupní místa ribozomu podobná viru hepatitidy C vytlačují eIF3, aby získali přístup k podjednotce 40S“. Příroda. 503 (7477): 539–43. doi:10.1038 / příroda12658. PMC 4106463. PMID 24185006.
^ VP Pisareva, Pisarev AV (prosinec 2016). „DHX29 a eIF3 spolupracují při ribozomálním skenování na strukturovaných mRNA během zahájení translace“. RNA. 22 (12): 1859–1870. doi:10.1261 / rna.057851.116. PMC 5113206. PMID 27733651.
^ des Georges A, Dhote V, Kuhn L, Hellen CU, Pestova TV, Frank J, Hashem Y (září 2015). „Struktura savčího eIF3 v kontextu preinitačního komplexu 43S“. Příroda. 525 (7570): 491–5. doi:10.1038 / příroda14891. PMC 4719162. PMID 26344199.

Další čtení

Hendrickson SL, Lautenberger JA, Chinn LW, Malasky M, Sezgin E, Kingsley LA, Goedert JJ, Kirk GD, Gomperts ED, Buchbinder SP, Troyer JL, O'Brien SJ (září 2010). „Genetické varianty v jaderně kódovaných mitochondriálních genech ovlivňují progresi AIDS“. PLOS ONE. 5 (9): e12862. doi:10.1371 / journal.pone.0012862. PMC 2943476. PMID 20877624.
Dhote V, Sweeney TR, Kim N, Hellen CU, Pestova TV (listopad 2012). „Role jednotlivých domén ve funkci DHX29, základní faktor vyžadovaný pro translaci strukturovaných savčích mRNA“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 109 (46): E3150-9. doi:10.1073 / pnas.1208014109. PMC 3503174. PMID 23047696.
VP Pisareva, Pisarev AV (květen 2016). „DHX29 snižuje netěsné skenování přes upstream AUG kodon bez ohledu na jeho nukleotidový kontext“. Výzkum nukleových kyselin. 44 (9): 4252–65. doi:10.1093 / nar / gkw240. PMC 4872109. PMID 27067542.

Tento článek včlení text z United States National Library of Medicine, který je v veřejná doména.

Tento článek o gen na lidský chromozom 5 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000067248 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000042426 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[entrez-5] „Entrez Gene: DExH-box helicase 29“.

[Pisareva_2008-6] Pisareva VP, Pisarev AV, Komar AA, Hellen CU, Pestova TV (prosinec 2008). „Spuštění translace na savčích mRNA se strukturovanými 5'UTR vyžaduje protein DHX29 DExH-boxu“. Buňka. 135 (7): 1237–50. doi:10.1016 / j.cell.2008.10.037. PMC 2948571. PMID 19109895.

[Sugimoto_2014-7] Sugimoto N, Mitoma H, Kim T, Hanabuchi S, Liu YJ (květen 2014). „Helikázové proteiny DHX29 a RIG-I cosense cytosolické nukleové kyseliny v systému dýchacích cest člověka“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 111 (21): 7747–52. doi:10.1073 / pnas.1400139111. PMC 4040624. PMID 24821782.

[Parsyan_2009-8] Parsyan A, Shahbazian D, Martineau Y, Petroulakis E, Alain T, Larsson O, Mathonnet G, Tettweiler G, Hellen CU, Pestova TV, Svitkin YV, Sonenberg N (prosinec 2009). „Helikázový protein DHX29 podporuje iniciaci translace, buněčnou proliferaci a tumorigenezi“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 106 (52): 22217–22. doi:10.1073 / pnas.0909773106. PMC 2799747. PMID 20018725.

[Hashem_2013-9] Hashem Y, des Georges A, Dhote V, Langlois R, Liao HY, Grassucci RA, Hellen CU, Pestova TV, Frank J (květen 2013). "Struktura savčího ribozomálního preiniciačního komplexu 43S vázaného na skenovací faktor DHX29". Buňka. 153 (5): 1108–19. doi:10.1016 / j.cell.2013.04.036. PMC 3730827. PMID 23706745.

[Hashem_2013b-10] Hashem Y, des Georges A, Dhote V, Langlois R, Liao HY, Grassucci RA, Pestova TV, Hellen CU, Frank J (listopad 2013). „Interní vstupní místa ribozomu podobná viru hepatitidy C vytlačují eIF3, aby získali přístup k podjednotce 40S“. Příroda. 503 (7477): 539–43. doi:10.1038 / příroda12658. PMC 4106463. PMID 24185006.

[Pisarev_2016-11] VP Pisareva, Pisarev AV (prosinec 2016). „DHX29 a eIF3 spolupracují při ribozomálním skenování na strukturovaných mRNA během zahájení translace“. RNA. 22 (12): 1859–1870. doi:10.1261 / rna.057851.116. PMC 5113206. PMID 27733651.

[des_Georges_2015-12] s Georges A, Dhote V, Kuhn L, Hellen CU, Pestova TV, Frank J, Hashem Y (září 2015). „Struktura savčího eIF3 v kontextu preinitačního komplexu 43S“. Příroda. 525 (7570): 491–5. doi:10.1038 / příroda14891. PMC 4719162. PMID 26344199.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

[11]

[12]