DEFB105A - DEFB105A

DEFB105A
Identifikátory
Aliasy	DEFB105A„BD-5, DEFB-5, DEFB105, defensin beta 105A
Externí ID	MGI: 1924924 HomoloGene: 17531 Genové karty: DEFB105A
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 8 (lidský)
Konec	7,823,889 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 8 (myš)
Konec	19,114,839 bp
Ortology
	245908
	77674
	ENSG00000186562
	ENSMUSG00000043787
	Q8NG35
	Q8K4N3
	NM_152250
	NM_152802
	NP_689463
	NP_690015
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Beta-defensin 105 je protein který je kódován DEFB105A gen u lidí.^[5]^[6]^[7]

Defensiny tvoří rodinu mikrobicidních a cytotoxických peptidů vyrobených neutrofily. Defensiny jsou krátké, zpracované peptid molekuly, které jsou strukturně rozděleny do tří skupin: Alfa defensiny, Beta defensiny a Theta defensiny. Všechny geny pro beta-defensin jsou hustě seskupeny ve čtyřech až pěti syntenických chromozomálních oblastech. Chromozóm 8p23 obsahuje alespoň dvě kopie duplikovaného klastru beta-defensinu. Tato duplikace vede ke dvěma identickým kopiím defensinu, beta 105, DEFB105A a DEFB105B, v ocasní orientaci. Tento gen, DEFB105A, představuje více centromerický kopírovat.^[7]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000186562 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000043787 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Schutte BC, Mitros JP, Bartlett JA, Walters JD, Jia HP, Welsh MJ, Casavant TL, McCray PB Jr (únor 2002). „Objev pěti konzervovaných shluků genů beta-defeninu pomocí výpočetní vyhledávací strategie“. Proc Natl Acad Sci U S A. 99 (4): 2129–33. doi:10.1073 / pnas.042692699. PMC 122330. PMID 11854508.
^ Semple CA, Rolfe M, Dorin JR (květen 2003). „Duplikace a selekce ve vývoji genů beta-defensinu primátů“. Genome Biol. 4 (5): R31. doi:10.1186 / gb-2003-4-5-r31. PMC 156587. PMID 12734011.
^ ^A ^b „Entrez Gene: DEFB105A defensin, beta 105A“.

Další čtení

Patil AA, Cai Y, Sang Y a kol. (2006). „Mezidruhová analýza rodiny genů savců pro beta-defensin: přítomnost shluků syntenických genů a preferenční exprese v mužském reprodukčním traktu“. Physiol. Genomika. 23 (1): 5–17. doi:10.1152 / physiolgenomics.00104.2005. PMID 16033865.
Boniotto M, Ventura M, Eskdale J a kol. (2005). "Důkazy o duplikaci lidského genu defensinu DEFB4 v chromozomální oblasti 8p22-23 a důsledky pro analýzu distribuce alely SNP". Genet. Test. 8 (3): 325–7. doi:10.1089 / gte.2004.8.325. PMID 15727258.
Taudien S, Galgoczy P, Huse K a kol. (2006). „Polymorfní segmentové duplikace na 8p23.1 zpochybňují stanovení jednotlivých repertoárů jednotlivých genů defensinu a sestavení souvislé lidské referenční sekvence“. BMC Genomics. 5 (1): 92. doi:10.1186/1471-2164-5-92. PMC 544879. PMID 15588320.
Hollox EJ, Armor JA, Barber JC (2003). „Rozsáhlá normální variace počtu kopií klastru beta-defensinového antimikrobiálního genu“. Dopoledne. J. Hum. Genet. 73 (3): 591–600. doi:10.1086/378157. PMC 1180683. PMID 12916016.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH a kol. (2003). „Generování a počáteční analýza více než 15 000 lidských a myších cDNA sekvencí plné délky“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (26): 16899–903. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
Yamaguchi Y, Nagase T, Makita R a kol. (2002). „Identifikace několika nových izoforem beta-defensinu specifických pro epididymis u lidí a myší“. J. Immunol. 169 (5): 2516–23. doi:10,4049 / jimmunol.169.5.2516. PMID 12193721.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000186562 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000043787 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid11854508-5] Schutte BC, Mitros JP, Bartlett JA, Walters JD, Jia HP, Welsh MJ, Casavant TL, McCray PB Jr (únor 2002). „Objev pěti konzervovaných shluků genů beta-defeninu pomocí výpočetní vyhledávací strategie“. Proc Natl Acad Sci U S A. 99 (4): 2129–33. doi:10.1073 / pnas.042692699. PMC 122330. PMID 11854508.

[pmid12734011-6] Semple CA, Rolfe M, Dorin JR (květen 2003). „Duplikace a selekce ve vývoji genů beta-defensinu primátů“. Genome Biol. 4 (5): R31. doi:10.1186 / gb-2003-4-5-r31. PMC 156587. PMID 12734011.

[entrez-7] A ^b „Entrez Gene: DEFB105A defensin, beta 105A“.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]