Cyano-2 RNA motiv - Cyano-2 RNA motif

Cyano-2 RNA motiv
Kyano-2-RNA.svg
Konsenzuální sekundární struktura kyano-2 RNA
Identifikátory
SymbolKyano-2
RfamRF01702
Další údaje
RNA typsRNA
DoménySynechococcus
PDB strukturPDBe

The Cyano-2 RNA motiv je konzervovaný RNA struktura identifikována bioinformatika.[1] Cyano-2 RNA se nacházejí v Sinice druhy zařazené do rod Synechococcus. Mnoho koncových smyček ve dvou zachováno kmenové smyčky obsahují nukleotidovou sekvenci GCGA a tyto sekvence mohou v některých případech tvořit stabilní GNRA tetraloops. Jelikož jsou tyto dvě kmenové smyčky od sebe trochu vzdálené, je možné, že představují dvě nezávislé nekódující RNA které jsou často nebo vždypřepsal. V regionu tisíc základní páry upstream předpovězených kyano-2 RNA obvykle neobsahuje anotované rysy, jako je RNA nebo protein -kódování geny. Tato absence anotovaných genů v rámci jednoho tisíce párů bází je uvnitř relativně neobvyklá bakterie.

Viz také

Reference

  1. ^ Weinberg Z, Wang JX, Bogue J a kol. (Březen 2010). „Srovnávací genomika odhaluje 104 kandidátských strukturovaných RNA z bakterií, archea a jejich metagenomů“. Genome Biol. 11 (3): R31. doi:10.1186 / gb-2010-11-3-r31. PMC  2864571. PMID  20230605.

externí odkazy