Kontakt 2 - Contactin 2

CNTN2
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	2OM5
Identifikátory
Aliasy	CNTN2, AXT, FAME5, TAG-1, TAX, TAX1, contactin 2, transient axonal glycoprotein-1
Externí ID	OMIM: 190197 MGI: 104518 HomoloGene: 3720 Genové karty: CNTN2
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 1 (lidský)
Konec	205,078,289 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 1 (myš)
Konec	132,543,256 bp
Exprese RNA vzor
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• proteinová asociace; • identická vazba na protein; • vázání sacharidů; • vazba na proteiny podílející se na adhezi mezi buňkami;
Buněčná složka	• membrána; • myelin; • komplex draslíkových kanálů s napětím; • buněčná membrána; • uzel Ranvier; • synapse; • integrální součást plazmatické membrány; • povrch buňky; • axon; • tělo neuronových buněk; • ukotvená součást membrány; • neuronová projekce; • juxtaparanode oblast axonu; • ukotvená součást postsynaptické membrány;
Biologický proces	• shlukování napěťově řízených draslíkových kanálů; • negativní regulace neuronové diferenciace; • myelinace centrálního nervového systému; • internalizace receptoru; • migrace neuronů; • učení se; • organizace presynaptické membrány; • regulace diferenciace astrocytů; • regulace průměru axonu; • buněčná adheze; • pozitivní regulace zpracování bílkovin; • vytvoření lokalizace proteinu do juxtaparanodové oblasti axonu; • pozitivní regulace signální dráhy receptoru adenosinu; • mozková kůra GABAergní migrace interneuronů; • regulace neuronální synaptické plasticity; • lokalizace proteinu do juxtaparanodové oblasti axonu; • regulace buněčné morfogeneze podílející se na diferenciaci; • vývoj neuronové projekce; • axonální fasciculace; • organizace mikrotubulů cytoskeletu; • chování dospělých při chůzi; • axonové vedení; • vývoj nervového systému; • homofilní buněčná adheze prostřednictvím molekul adheze na plazmatické membráně; • dendrite vyhýbání se sobě;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	6900
	21367
	ENSG00000184144
	ENSMUSG00000053024
	Q02246
	Q61330
	NM_005076; NM_001346083
	NM_011531; NM_177129
	NP_001333012; NP_005067
	NP_796103
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Contactin-2 je protein že u lidí je kódován CNTN2 gen.^[5]^[6]^[7]

Funkce

Protein kódovaný tímto genem je členem nadrodiny imunoglobulinů. Jedná se o protein neuronové membrány kotvený glykosylfosfatidylinositolem (GPI), který funguje jako molekula buněčné adheze. Může hrát roli při tvorbě axonových spojení ve vyvíjejícím se nervovém systému. Může se také podílet na gliové tumorigenezi a může poskytnout potenciální cíl pro terapeutický zásah.^[7]

Interakce

CNTN2 bylo prokázáno komunikovat s CNTNAP2^[8] a NFYB.^[9]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000184144 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000053024 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Tsiotra PC, Karagogeos D, Theodorakis K, Michaelidis TM, Modi WS, Furley AJ, Jessell TM, Papamatheakis J (prosinec 1993). „Izolace cDNA a chromozomální lokalizace genu (TAX1) kódujícího lidský axonální glykoprotein TAG-1“. Genomika. 18 (3): 562–7. doi:10.1016 / S0888-7543 (05) 80357-X. PMID 8307567.
^ Yoshihara Y, Kawasaki M, Tamada A, Nagata S, Kagamiyama H, Mori K (září 1995). „Překrývající se a diferenciální exprese BIG-2, BIG-1, TAG-1 a F3: čtyři členové podskupiny buněčné adhezní molekuly spojené s axonem nadrodiny imunoglobulinů“. Journal of Neurobiology. 28 (1): 51–69. doi:10,1002 / neu.480280106. PMID 8586965.
^ ^A ^b „Entrez Gene: CNTN2 contactin 2 (axonal)“.
^ Traka M, Goutebroze L, Denisenko N, Bessa M, Nifli A, Havaki S, Iwakura Y, Fukamauchi F, Watanabe K, Soliven B, Girault JA, Karagogeos D (září 2003). „Sdružení TAG-1 s Caspr2 je nezbytné pro molekulární organizaci juxtaparanodálních oblastí myelinovaných vláken“. The Journal of Cell Biology. 162 (6): 1161–72. doi:10.1083 / jcb.200305078. PMC 2172849. PMID 12975355.
^ Pise-Masison CA, Dittmer J, Clemens KE, Brady JN (březen 1997). „Fyzická a funkční interakce mezi proteinem Tax1 lidského lymfotropního viru typu 1 Tax1 a proteinem vázajícím CCAAT NF-Y“. Molekulární a buněčná biologie. 17 (3): 1236–43. doi:10,1128 / mcb.17.3.1236. PMC 231848. PMID 9032250.

externí odkazy

Člověk CNTN2 umístění genomu a CNTN2 stránka s podrobnostmi o genu v UCSC Genome Browser.

Další čtení

Walsh FS, Doherty P (listopad 1991). „Glykosylfosfatidylinositol zakotvil rozpoznávací molekuly, které fungují v axonální fascikulaci, růstu a vedení v nervovém systému“. Cell Biology International Reports. 15 (11): 1151–66. doi:10.1016 / 0309-1651 (91) 90061-M. PMID 1838307.
Kuhn TB, Stoeckli ET, Condrau MA, Rathjen FG, Sonderegger P (listopad 1991). „Neuritový růst na imobilizovaném axoninu-1 je zprostředkován heterofilní interakcí s L1 (G4)“. The Journal of Cell Biology. 115 (4): 1113–26. doi:10.1083 / jcb.115.4.1113. PMC 2289947. PMID 1720120.
Dodd J, Morton SB, Karagogeos D, Yamamoto M, Jessell TM (duben 1988). "Prostorová regulace exprese axonálních glykoproteinů na podskupiny embryonálních spinálních neuronů". Neuron. 1 (2): 105–16. doi:10.1016/0896-6273(88)90194-8. PMID 3272160. S2CID 36629050.
Kenwrick S, Leversha M, Rooke L, Hasler T, Sonderegger P (září 1993). „Lokalizace lidského genu TAX-1 na 1q32.1: oblast zapojená do mikrocefalie a Van der Woudeova syndromu“ (PDF). Lidská molekulární genetika. 2 (9): 1461–2. doi:10,1093 / hmg / 2,9.1461. PMID 8242070.
Rader C, Stoeckli ET, Ziegler U, Osterwalder T, Kunz B, Sonderegger P (červenec 1993). "Adheze buněk a buněk homofilní interakcí neuronové rozpoznávací molekuly axoninu-1". European Journal of Biochemistry / FEBS. 215 (1): 133–41. doi:10.1111 / j.1432-1033.1993.tb18015.x. PMID 8344273.
Hasler TH, Rader C, Stoeckli ET, Zuellig RA, Sonderegger P (leden 1993). "klonování cDNA, strukturní rysy a eukaryotická exprese lidského TAG-1 / axoninu-1". European Journal of Biochemistry / FEBS. 211 (1–2): 329–39. doi:10.1111 / j.1432-1033.1993.tb19902.x. PMID 8425542.
Kozlov SV, Giger RJ, Hasler T, Korvatska E, Schorderet DF, Sonderegger P (listopad 1995). „Lidský gen TAX1 kódující s axonem asociovanou buněčnou adhezní molekulu TAG-1 / axonin-1: genomová struktura a základní promotor“. Genomika. 30 (2): 141–8. doi:10.1006 / geno.1995.9892. PMID 8586412.
Milev P, Maurel P, Häring M, Margolis RK, Margolis RU (červen 1996). „TAG-1 / axonin-1 je vysoce afinitní ligand neurokanu, fosfakanu / proteinu-tyrosin fosfatázy-zeta / beta a N-CAM“. The Journal of Biological Chemistry. 271 (26): 15716–23. doi:10.1074 / jbc.271.26.15716. PMID 8663515.
Pise-Masison CA, Dittmer J, Clemens KE, Brady JN (březen 1997). „Fyzická a funkční interakce mezi proteinem Tax1 lymfomu z lidských T-buněk typu 1 Tax1 a proteinem vázajícím CCAAT NF-Y“. Molekulární a buněčná biologie. 17 (3): 1236–43. doi:10,1128 / mcb.17.3.1236. PMC 231848. PMID 9032250.
Williams H, Schachner M, Wang B, Kenwrick S (listopad 1997). „Radiační hybridní mapování genů pro tenascin-R (TNR), fosducin (PDC), laminin C1 (LAMC1) a TAX v 1q25-q32“. Genomika. 46 (1): 165–6. doi:10.1006 / geno.1997.4994. PMID 9403076.
Malhotra JD, Tsiotra P, Karagogeos D, Hortsch M (prosinec 1998). „Cis-aktivace náboru ankyrinů zprostředkovaných L1 homogenní buněčnou adhezí TAG-1“. The Journal of Biological Chemistry. 273 (50): 33354–9. doi:10.1074 / jbc.273.50.33354. PMID 9837910.
Freigang J, Proba K, Leder L, Diederichs K, Sonderegger P, Welte W (květen 2000). „Krystalová struktura modulu vázajícího ligand axoninu-1 / TAG-1 naznačuje mechanismus zipu pro adhezi nervových buněk“ (PDF). Buňka. 101 (4): 425–33. doi:10.1016 / S0092-8674 (00) 80852-1. PMID 10830169. S2CID 15440572.
Rickman DS, Tyagi R, Zhu XX, Bobek MP, Song S, Blaivas M, Misek DE, Israel MA, Kurnit DM, Ross DA, Kish PE, Hanash SM (březen 2001). "Gen pro axonální buněčnou adhezní molekulu TAX-1 je amplifikován a aberantně exprimován v maligních gliomech". Výzkum rakoviny. 61 (5): 2162–8. PMID 11280781.
Pavlou O, Theodorakis K, Falk J, Kutsche M, Schachner M, Faivre-Sarrailh C, Karagogeos D (červenec 2002). „Analýza interakcí adhezní molekuly TAG-1 a jejích domén s dalšími členy nadrodiny imunoglobulinů“. Molekulární a buněčné neurovědy. 20 (3): 367–81. doi:10.1006 / mcne.2002.1105. PMID 12139915. S2CID 714233.
Traka M, Goutebroze L, Denisenko N, Bessa M, Nifli A, Havaki S, Iwakura Y, Fukamauchi F, Watanabe K, Soliven B, Girault JA, Karagogeos D (září 2003). „Sdružení TAG-1 s Caspr2 je nezbytné pro molekulární organizaci juxtaparanodálních oblastí myelinovaných vláken“. The Journal of Cell Biology. 162 (6): 1161–72. doi:10.1083 / jcb.200305078. PMC 2172849. PMID 12975355.
Nagaraja GM, Kandpal RP (leden 2004). „Chromozom 13q12 kódovaný Rho GTPáza aktivující protein potlačuje růst buněk karcinomu prsu a kvasinkový dvouhybridní screening ukazuje jeho interakci s několika proteiny“. Sdělení o biochemickém a biofyzikálním výzkumu. 313 (3): 654–65. doi:10.1016 / j.bbrc.2003.12.001. PMID 14697242.

Tento článek o gen na lidský chromozom 1 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000184144 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000053024 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid8307567-5] Tsiotra PC, Karagogeos D, Theodorakis K, Michaelidis TM, Modi WS, Furley AJ, Jessell TM, Papamatheakis J (prosinec 1993). „Izolace cDNA a chromozomální lokalizace genu (TAX1) kódujícího lidský axonální glykoprotein TAG-1“. Genomika. 18 (3): 562–7. doi:10.1016 / S0888-7543 (05) 80357-X. PMID 8307567.

[pmid8586965-6] Yoshihara Y, Kawasaki M, Tamada A, Nagata S, Kagamiyama H, Mori K (září 1995). „Překrývající se a diferenciální exprese BIG-2, BIG-1, TAG-1 a F3: čtyři členové podskupiny buněčné adhezní molekuly spojené s axonem nadrodiny imunoglobulinů“. Journal of Neurobiology. 28 (1): 51–69. doi:10,1002 / neu.480280106. PMID 8586965.

[entrez-7] A ^b „Entrez Gene: CNTN2 contactin 2 (axonal)“.

[pmid12975355-8] Traka M, Goutebroze L, Denisenko N, Bessa M, Nifli A, Havaki S, Iwakura Y, Fukamauchi F, Watanabe K, Soliven B, Girault JA, Karagogeos D (září 2003). „Sdružení TAG-1 s Caspr2 je nezbytné pro molekulární organizaci juxtaparanodálních oblastí myelinovaných vláken“. The Journal of Cell Biology. 162 (6): 1161–72. doi:10.1083 / jcb.200305078. PMC 2172849. PMID 12975355.

[pmid9032250-9] Pise-Masison CA, Dittmer J, Clemens KE, Brady JN (březen 1997). „Fyzická a funkční interakce mezi proteinem Tax1 lidského lymfotropního viru typu 1 Tax1 a proteinem vázajícím CCAAT NF-Y“. Molekulární a buněčná biologie. 17 (3): 1236–43. doi:10,1128 / mcb.17.3.1236. PMC 231848. PMID 9032250.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]