Doména chladného šoku - Cold-shock domain - Wikipedia
| CSD | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 struktura řešení jednořetězcové domény studeného šoku vázající se na dna (csd) lidského proteinu y-box 1 (yb1) stanovená pomocí NMR (10 struktur s nejnižší energií) | |||||||||
| Identifikátory | |||||||||
| Symbol | CSD | ||||||||
| Pfam | PF00313 | ||||||||
| Pfam klan | CL0021 | ||||||||
| InterPro | IPR002059 | ||||||||
| STRÁNKA | PDOC00304 | ||||||||
| SCOP2 | 1 mil / Rozsah / SUPFAM | ||||||||
| CDD | cd04458 | ||||||||
| |||||||||
V molekulární biologii se doména chladného šoku (CSD) je proteinová doména asi 70 aminokyseliny který byl nalezen v prokaryotický a eukaryotický DNA -vazba bílkoviny.[1][2][3] Část této domény je velmi podobná RNP-1 RNA -vazba motiv.[4]
Když Escherichia coli je vystaven poklesu teploty z 37 na 10 stupňů Celsia, nastává 4–5 hodinová zpožďovací fáze, po které růst je obnoveno se sníženou hodnotou hodnotit.[5] Během fáze zpoždění je exprese přibližně 13 proteinů, které obsahují domény studeného šoku, zvýšena 2–10krát.[6] Tyto tzv.chladný šok ' bílkoviny se předpokládá, že pomáhají buňce přežít teploty nižší než optimální teplota růstu, na rozdíl od tepelný šok bílkoviny, které pomáhají buňka přežít při teplotách vyšších, než je optimální, případně kondenzací chromozóm a organizace prokaryotický nukleoid.[5]
Reference
- ^ Doniger J, Landsman D, Gonda MA, Wistow G (duben 1992). „Produkt unr, vysoce konzervovaný gen před N-ras, obsahuje několik repetic podobných doméně studeného šoku (CSD), domnělý motiv vázající DNA“. New Biol. 4 (4): 389–95. PMID 1622933.
- ^ Wistow G (duben 1990). „Chladný šok a vazba DNA“. Příroda. 344 (6269): 823–4. doi:10.1038 / 344823c0. PMID 2184368. S2CID 4307500.
- ^ Jones PG, Inouye M (březen 1994). „Reakce na chladný šok - horké téma“. Mol. Microbiol. 11 (5): 811–8. doi:10.1111 / j.1365-2958.1994.tb00359.x. PMID 8022259.
- ^ Landsman D (červen 1992). „RNP-1, motiv vázající RNA je konzervován v doméně chladného šoku vázající DNA“. Nucleic Acids Res. 20 (11): 2861–4. doi:10.1093 / nar / 20.11.2861. PMC 336933. PMID 1614871.
- ^ A b Obokata J, Ohme M, Hayashida N (říjen 1991). „Nukleotidová sekvence klonu cDNA kódující domnělý protein bohatý na glycin 19,7 kDa v Nicotiana sylvestris“. Plant Mol. Biol. 17 (4): 953–5. doi:10.1007 / bf00037080. PMID 1912512. S2CID 11927654.
- ^ Tafuri SR, Wolffe AP (listopad 1990). „Transkripční faktory Y-boxu Xenopus: molekulární klonování, funkční analýza a vývojová regulace“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 87 (22): 9028–32. doi:10.1073 / pnas.87.22.9028. PMC 55094. PMID 2247479.