Chryseobacterium - Chryseobacterium

Chryseobacterium
Chryseobacterium oleae DSM25575.jpg
Chryseobacterium oleae Bakterie DSM25575 pěstované na pevném LB médiu
Vědecká klasifikace E
Doména:Bakterie
Kmen:Bacteroidetes
Třída:Flavobakterie
Objednat:Flavobacteriales
Rodina:Flavobacteriaceae
Rod:Chryseobacterium
Vandamme a kol. 1994
Druh

Viz text.

Chryseobacterium je rod Gramnegativní bakterie. Chryseobacterium druhy jsou chemoorganotrofní, gramnegativní bakterie ve tvaru tyčinky. Chryseobacterium tvoří typické žlutooranžové barevné kolonie díky pigmentu typu flexirubinu. Rod obsahuje více než 100 popsaných druhů z různých stanovišť, včetně sladkovodních zdrojů, půdy, mořských ryb a lidských hostitelů.[1]

Dějiny

Rod Chryseobacterium byl původně vytvořen v roce 1994 společností Vandamme et al.[2] pro šest bakteriálních taxonů, které byly v té době klasifikovány jako členové rodu Flavobacterium: F. balustinum, F. indologeny, F. gleum, F. meningosepticum, F. indoltheticum, a F. scophthalmum. V roce 2005 další rod, Elizabethkingia, byl vytvořen pro dva druhy rodu Chryseobacterium; a to, C. meningosepticum a C. miricola.[3] V roce 2002 normy a pokyny pro popis nových taxonů v rodině Flavobacteriaceae byly publikovány Bernardetem et al.[4] Do roku 2006 se rod Chryseobacterium se rozšířil na 10 druhů, do roku 2014 více než 60 druhů[5] a aktuálně více než 100.

Ekologie

Chryseobacterium spp. byly získány z půd, kořenů rostlin, květů, rozpadajícího se rostlinného materiálu a javorové mízy. Některé spojené s rostlinou Chryseobacterium kmeny jsou schopné inhibovat rostlinné patogenní houby. Chryseobacterium spp. byly také získány ze sladkovodních potoků, jezer, jejich sedimentů, vodních chladicích systémů, pitné vody, nápojů s kyselinou mléčnou, závodů na stáčení piva, kalů z bioreaktorů, znečištěné půdy, mořských sedimentů a permafrost.[5] Chryseobacterium spp. jsou spojeny s velkým množstvím zvířat - byla detekována ve středním střevě komárů, uvnitř švábů, výkalů stonožek a tučňáka guana, střevních homogenátů sladkovodních copepodů, ptačího peří, kravského mléka, surového masa a kuřete. Chryseobacterium spp. byly získány z hlenu zjevně zdravých ryb, ale někdy jsou považovány za zkažený organismus.[5] Tři romány tolerantní vůči chladu druhy Chryseobacterium, C. oranimense C. haifense, a C. bovis, byly zjištěny v syrovém mléce v Izraeli.[6]

Patogeneze

Nejpatogennější Flavobacterium spp., Chryseobacterium meningosepticum, který způsoboval četné infekce, byl překlasifikován do rodu Elizabethkingia.[3] Chryseobacterium indologenes Ačkoli je v přírodě všudypřítomný, hlavně v půdě a ve vodě, je neobvyklým lidským patogenem. Ve vzácných případech však může způsobit závažné infekce, zejména u imunokompromitovaných.[7] Infekce jsou většinou získávány v nemocnici, často spojené s imunosupresí nebo zavedenými katétry. Bylo hlášeno jako původce v bakteremie, zánět pobřišnice, zápal plic, empyém, pyelonefritida, cystitida, meningitida a infekce spojené s centrálním žilním katétrem. Počty hlášených C. indologeny infekce se zvyšuje. Většina hlášených infekcí byla z Tchaj-wanu a jen asi 10% bylo mimo Asii. Několik zpráv přišlo z Austrálie, Indie, Evropy a USA.[7] C. indologeny je také patogenní pro měkké klíště, zatímco jiné Chryseobacterium spp. byly získány zejména z nemocných želv, žab a ryb C. scophthalmum, C. joostei, C. piscicola, C. chaponense, C. viscerum a C. oncorhynchi, C. aahli, C. hominis, C. shigense stejně jako C. indologeny který je spojen s lidskými nemocemi.[5]

Určitý Chryseobacterium druhy byly hlášeny jako ty, které mají neobvyklé vlastnosti trávení matricí a jsou schopné degradovat nejobtížnější kolagenní matrice, jako jsou peří nebo exoskeletony. Tyto vlastnosti jsou pravděpodobně zprostředkovány působením konkrétních chitinázy a kolagenáza -jako metaloproteázy. Některé druhy, jako např Chryseobacterium nematophagum Bylo prokázáno, že jsou schopné infikovat, zabíjet a nakonec konzumovat všechny tkáně hlístic, včetně normálně vysoce nerozpustného kutikulárního exoskeletu.[8] Byly spojeny aktivity chitinázy, geleatinázy a kolagenázy metaloproteázy Chryseobacterium klouzavá pohyblivost vyvíjená sekrečními systémy typu IX. Některé z těchto enzymů skutečně vlastní sekreční signály C-terminálního typu IX.[9] Chryseobacterium samy o sobě nemají ani kolagen, ani chitinové proteiny ani struktury. Chryseobacterium druhy patří do Bacteriodetes kmen, jehož členové jsou stále častěji popisováni jako mající neobvykle spojenou motilitu a sekreční systém.[8][9]

Botulotoxin toxiny podobné (BoNT) byly detekovány v genomu Chryseobacterium piperi str. CTM a představují vysoce odlišnou skupinu toxinů podobných BoNT. Jeden z předpovězených C. piperi Toxiny podobné BoNT indukovaly smrt nekrotických buněk v lidských ledvinových buňkách, ale nebylo zjištěno, že štěpí běžné SNARE substráty BoNT.[10]

Odolnost proti antibiotikům

Chryseobacterium spp. jsou neodmyslitelně odolné vůči širokému spektru antibiotika, počítaje v to tetracykliny, erythromycin, linezolid, polymyxiny, aminoglykosidy, chloramfenikol, a mnoho beta-laktamy, přičemž je zároveň středně citlivý na vankomycin a klindamycin a liší se v jejich citlivosti na trimethoprim-sulfamethoxazol.[5]

Druh

Druhy zahrnují:[11]

Viz také

Reference

  1. ^ Matu A, Lum Nde A, Oosthuizen L, Hitzeroth A, Badenhorst M, Duba L, Gidaga M, Klinck J, Kriek IM, Lekoma PJ, Nel L, Dos Ramos SM, Rossouw J, Salomane N, Segone N, Serobe S, Tiyani T, Hugo CJ, Newman JD (leden 2019). "Kmeny typu Chryseobacterium". Oznámení o mikrobiologických zdrojích. 8 (1): e01518–18. doi:10.1128 / MRA.01518-18. PMC  6318376. PMID  30637405.
  2. ^ Vandamme P, Bernardet JF, Segers P, Kersters K, Holmes B (01.10.1994). „POZNÁMKY: Nové perspektivy v klasifikaci flavobakterií: Popis Chryseobacterium gen. Nov., Bergeyella gen. Nov. A Empedobacter nom. Rev“. International Journal of Systematic Bacteriology. 44 (4): 827–831. doi:10.1099/00207713-44-4-827. ISSN  0020-7713.
  3. ^ A b Kim KK, Kim MK, Lim JH, Park HY, Lee ST (květen 2005). "Převod Chryseobacterium meningosepticum a Chryseobacterium miricola do Elizabethkingia gen. Nov. Jako Elizabethkingia meningoseptica comb. Nov. A Elizabethkingia miricola comb. Nov". International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology. 55 (Pt 3): 1287–93. doi:10.1099 / ijs.0.63541-0. PMID  15879269.
  4. ^ Bernardet JF, Nakagawa Y, Holmes B a kol. (Podvýbor pro taxonomii bakterií Flavobacterium a Cytophaga podobných bakteriím Mezinárodního výboru pro systematiku prokaryot) (květen 2002). „Navrhované minimální standardy pro popis nových taxonů čeledi Flavobacteriaceae a upravený popis čeledi“. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology. 52 (Pt 3): 1049–70. doi:10.1099/00207713-52-3-1049. PMID  12054224.
  5. ^ A b C d E Loch TP, Faisal M (květen 2015). „Objevující se flavobakteriální infekce u ryb: recenze“. Journal of Advanced Research. 6 (3): 283–300. doi:10.1016 / j.jare.2014.10.009. PMC  4522593. PMID  26257926.
  6. ^ Hantsis-Zacharov E, Shakéd T, Senderovich Y, Halpern M (listopad 2008). „Chryseobacterium oranimense sp. Nov., Psychrotolerantní, proteolytická a lipolytická bakterie izolovaná ze syrového kravského mléka“. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology. 58 (Pt 11): 2635–9. doi:10.1099 / ijs.0.65819-0. PMID  18984706. Shrnutí ležel – EurekAlert!.
  7. ^ A b Mukerji R, Kakarala R, Smith SJ, Kusz HG (duben 2016). „Chryseobacterium indologenes: objevující se infekce v USA“. Případové zprávy BMJ. 2016: bcr2016214486. doi:10.1136 / bcr-2016-214486. PMC  4840731. PMID  27053540.
  8. ^ A b Page AP, Roberts M, Félix MA, Pickard D, stránka A, Weir W (únor 2019). „Zlatý bacil smrti Chryseobacterium nematophagum je nová matrice trávící patogen hlístic“. Biologie BMC. 17 (1): 10. doi:10.1186 / s12915-019-0632-x. PMC  6394051. PMID  30813925.
  9. ^ A b McBride MJ, Zhu Y (leden 2013). „Klouzavost pohyblivosti a geny sekrečního systému Por jsou rozšířené mezi členy kmenů bakteroidetes“. Journal of Bacteriology. 195 (2): 270–8. doi:10.1128 / JB.01962-12. PMC  3553832. PMID  23123910.
  10. ^ Mansfield MJ, Doxey AC (červen 2018). „Genomické vhledy do vývoje a ekologie botulinových neurotoxinů“. Patogeny a nemoci. 76 (4). doi:10.1093 / femspd / fty040. PMID  29684130.
  11. ^ "Rod Chryseobacterium". LPSN.