CNTNAP4 - CNTNAP4

CNTNAP4
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	4NXQ
Identifikátory
Aliasy	CNTNAP4, CASPR4, protein spojený s kontaktem jako 4, člen rodiny proteinů spojený s kontaktem 4
Externí ID	OMIM: 610518 MGI: 2183572 HomoloGene: 24912 Genové karty: CNTNAP4
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 16 (lidský)
Konec	76,560,757 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 8 (myš)
Konec	112,882,717 bp
Genová ontologie
Molekulární funkce	• GO: 0001948 vazba na proteiny;
Buněčná složka	• integrální součást membrány; • buněčné spojení; • buněčná membrána; • dendrit; • synapse; • presynaptická membrána; • membrána; • GABA-ergická synapse; • integrální součást presynaptické membrány;
Biologický proces	• regulace synaptického přenosu, dopaminergní; • regulace chování při péči; • buněčná adheze; • regulace synaptického přenosu, GABAergic; • regulace organizace synapsí;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	85445
	170571
	ENSG00000152910
	ENSMUSG00000031772
	Q9C0A0
	Q99P47
NM_033401; NM_138994; NM_001322178; NM_001322179; NM_001322180;
	NM_001322181; NM_001322187; NM_001322188; NM_001322189; NM_001322190; NM_001322191
	NM_130457
NP_001309107; NP_001309108; NP_001309109; NP_001309110; NP_001309116;
	NP_001309117; NP_001309118; NP_001309119; NP_001309120; NP_207837; NP_620481
	NP_569724
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

S proteinem spojené jako s kontaktem 4 je protein že u lidí je kódován CNTNAP4 gen.^[5]^[6]

Tento genový produkt patří do neurexin rodina, jejíž členové fungují u obratlovců nervový systém tak jako buněčná adheze molekuly a receptory. Tento protein, stejně jako jiné neurexinové proteiny, obsahuje epidermální růstový faktor opakuje a laminin G domény. Kromě toho obsahuje doménu F5 / 8 typu C, discoidin /neuropilin - a fibrinogen domény podobné trombospondinu a domény podobné N-terminálu. Alternativní sestřih má za následek dvě varianty přepisu kódující různé izoformy.^[6]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000152910 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000031772 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Spiegel I, Salomon D, Erne B, Schaeren-Wiemers N, Peles E (červenec 2002). „Caspr3 a caspr4, dva noví členové rodiny caspr jsou exprimováni v nervovém systému a interagují s doménami PDZ“. Mol Cell Neurosci. 20 (2): 283–97. doi:10.1006 / mcne.2002.1110. PMID 12093160. S2CID 25024421.
^ ^A ^b "Entrez Gene: CNTNAP4 kontaktin asociovaný s proteinem podobný 4".

externí odkazy

Člověk CNTNAP4 umístění genomu a CNTNAP4 stránka s podrobnostmi o genu v UCSC Genome Browser.

Další čtení

Kim JM, Lee KH, Jeon YJ a kol. (2007). "Identifikace genů souvisejících s Parkinsonovou chorobou pomocí expresních značek sekvence". DNA Res. 13 (6): 275–86. doi:10.1093 / dnares / dsl016. PMID 17213182.
Kimura K, Wakamatsu A, Suzuki Y a kol. (2006). „Diverzifikace transkripční modulace: rozsáhlá identifikace a charakterizace domnělých alternativních promotorů lidských genů“. Genome Res. 16 (1): 55–65. doi:10,1101 / gr. 4039406. PMC 1356129. PMID 16344560.
Ota T, Suzuki Y, Nishikawa T a kol. (2004). „Kompletní sekvenování a charakterizace 21 243 lidských cDNA plné délky“. Nat. Genet. 36 (1): 40–5. doi:10.1038 / ng1285. PMID 14702039.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH a kol. (2003). „Generování a počáteční analýza více než 15 000 lidských a myších cDNA sekvencí plné délky“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (26): 16899–903. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
Nakayama M, Kikuno R, Ohara O (2003). „Interakce proteinů a proteinů mezi velkými proteiny: dvouhybridní screening využívající funkčně klasifikovanou knihovnu složenou z dlouhých cDNA“. Genome Res. 12 (11): 1773–84. doi:10,1101 / gr. 406902. PMC 187542. PMID 12421765.
Nagase T, Kikuno R, Hattori A a kol. (2001). „Predikce kódujících sekvencí neidentifikovaných lidských genů. XIX. Kompletní sekvence 100 nových klonů cDNA z mozku, které kódují velké proteiny in vitro“. DNA Res. 7 (6): 347–55. doi:10.1093 / dnares / 7.6.347. PMID 11214970.
Auffray C, Behar G, Bois F a kol. (1995). "[OBRÁZEK: molekulární integrace analýzy lidského genomu a jeho exprese]". Comptes Rendus de l'Académie des Sciences, Série III. 318 (2): 263–72. PMID 7757816.

Tento článek o gen na lidský chromozom 16 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000152910 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000031772 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid12093160-5] Spiegel I, Salomon D, Erne B, Schaeren-Wiemers N, Peles E (červenec 2002). „Caspr3 a caspr4, dva noví členové rodiny caspr jsou exprimováni v nervovém systému a interagují s doménami PDZ“. Mol Cell Neurosci. 20 (2): 283–97. doi:10.1006 / mcne.2002.1110. PMID 12093160. S2CID 25024421.

[entrez-6] A ^b "Entrez Gene: CNTNAP4 kontaktin asociovaný s proteinem podobný 4".

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]