CNOT8 - CNOT8

CNOT8
Identifikátory
Aliasy	CNOT8, CAF1, CALIF, Caf1b, POP2, hCAF1, CCR4-NOT transkripční komplexní podjednotka 8
Externí ID	OMIM: 603731 MGI: 1916375 HomoloGene: 48304 Genové karty: CNOT8
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 5 (lidský)
Konec	154,876,793 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 11 (myš)
Konec	58,118,594 bp
Exprese RNA vzor
	; ; ; ;
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• poly (A) specifická aktivita ribonukleázy; • Aktivita 3'-5'-exoribonukleázy; • GO: 0001131, GO: 0001151, GO: 0001130, GO: 0001204 Aktivita transkripčního faktoru vázajícího DNA; • vazba kovových iontů; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • Vazba RNA; • vazba nukleové kyseliny; • aktivita nukleázy; • aktivita exonukleázy; • aktivita hydrolázy;
Buněčná složka	• cytoplazma; • cytosol; • Komplex CCR4-NOT; • intracelulární; • buněčné jádro; • P-tělo; • CCR4-NOT základní komplex;
Biologický proces	• regulace transkripce, DNA-šablony; • hydrolýza fosfodiesterové vazby nukleové kyseliny; • pozitivní regulace katabolického procesu mRNA; • transkripce, chráněná DNA; • umlčení genů miRNA; • pozitivní regulace buněčné proliferace; • exonukleolytický nukleární transkribovaný katabolický proces mRNA zapojený do rozpadu závislého na deadenylaci; • umlčování genů pomocí RNA; • regulace překladu; • negativní regulace buněčné proliferace; • Odpověď na poškození DNA, transdukce signálu mediátorem třídy p53 vedoucí k zastavení buněčného cyklu; • Hydrolýza RNA fosfodiesterovou vazbou, exonukleolytická; • zkrácení ocasu nukleární transkribované mRNA poly (A); • negativní regulace překladu;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	9337
	69125
	ENSG00000155508
	ENSMUSG00000020515
	Q9UFF9
	Q9D8X5
NM_001301073; NM_001301074; NM_001301075; NM_001301077; NM_001301080;
	NM_001301082; NM_001301083; NM_001301086; NM_004779
	NM_026949; NM_001356477; NM_001363084; NM_001363085; NM_001363086
NP_001288002; NP_001288003; NP_001288004; NP_001288006; NP_001288009;
	NP_001288011; NP_001288012; NP_001288015; NP_004770
	NP_081225; NP_001343406; NP_001350013; NP_001350014; NP_001350015
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Podjednotka komplexu transkripce CCR4-NOT 8 je protein že u lidí je kódován CNOT8 gen.^[5]^[6]^[7] Je to podjednotka CCR4-ne Deadenylase komplex.

Interakce

CNOT8 bylo prokázáno komunikovat s BTG2,^[8] BTG1,^[8]^[9] CNOT1^[6]^[10] a CNOT3.^[6]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000155508 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000020515 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Fidler C, Wainscoat JS, Boultwood J (květen 1999). „Lidský gen POP2: identifikace, sekvenování a mapování do kritické oblasti syndromu 5q“. Genomika. 56 (1): 134–6. doi:10.1006 / geno.1998.5687. PMID 10036195.
^ ^A ^b ^C Albert TK, Lemaire M, van Berkum NL, Gentz R, Collart MA, Timmers HT (březen 2000). "Izolace a charakterizace lidských ortologů kvasinkových komplexů CCR4-NOT". Nucleic Acids Res. 28 (3): 809–17. doi:10.1093 / nar / 28.3.809. PMC 102560. PMID 10637334.
^ „Entrez Gene: CNOT8 CCR4-NOT transkripční komplex, podjednotka 8“.
^ ^A ^b Prévôt D, Morel AP, Voeltzel T, Rostan MC, Rimokh R, Magaud JP, Corbo L (březen 2001). „Vztahy antiproliferativních proteinů BTG1 a BTG2 s CAF1, lidským homologem složky kvasinkového transkripčního komplexu CCR4: účast na signální dráze alfa receptoru estrogenu“. J. Biol. Chem. 276 (13): 9640–8. doi:10,1074 / jbc.M008201200. PMID 11136725.
^ Rual JF, Venkatesan K, Hao T, Hirozane-Kishikawa T, Dricot A, Li N, Berriz GF, Gibbons FD, Dreze M, Ayivi-Guedehoussou N, Klitgord N, Simon C, Boxem M, Milstein S, Rosenberg J, Goldberg DS, Zhang LV, Wong SL, Franklin G, Li S, Albala JS, Lim J, Fraughton C, Llamosas E, Cevik S, Bex C, Lamesch P, Sikorski RS, Vandenhaute J, Zoghbi HY, Smolyar A, Bosak S, Sequerra R, Doucette-Stamm L, Cusick ME, Hill DE, Roth FP, Vidal M (říjen 2005). „Směrem k mapě lidské interakční sítě protein-protein v měřítku proteomu“. Příroda. 437 (7062): 1173–8. Bibcode:2005 Natur.437.1173R. doi:10.1038 / nature04209. PMID 16189514. S2CID 4427026.
^ Ewing RM, Chu P, Elisma F, Li H, Taylor P, Climie S, McBroom-Cerajewski L, Robinson MD, O'Connor L, Li M, Taylor R, Dharsee M, Ho Y, Heilbut A, Moore L, Zhang S, Ornatsky O, Bukhman YV, Ethier M, Sheng Y, Vasilescu J, Abu-Farha M, Lambert JP, Duewel HS, Stewart II, Kuehl B, Hogue K, Colwill K, Gladwish K, Muskat B, Kinach R, Adams SL, Moran MF, Morin GB, Topaloglou T, Figeys D (2007). „Mapování interakcí lidských proteinů a proteinů ve velkém měřítku hmotnostní spektrometrií“. Mol. Syst. Biol. 3 (1): 89. doi:10.1038 / msb4100134. PMC 1847948. PMID 17353931.

Další čtení

Bogdan JA, Adams-Burton C, Pedicord DL, Sukovich DA, Benfield PA, Corjay MH, Stoltenborg JK, Dicker IB (1998). „Lidský uhlíkový katabolitový represorový protein (CCR4) - asociační faktor 1: klonování, exprese a charakterizace jeho interakce s translokačním proteinem B-buněk BTG1“. Biochem. J. 336 (Pt 2): 471–81. doi:10.1042 / bj3360471. PMC 1219893. PMID 9820826.
Hartley JL, Temple GF, Brasch MA (2000). „Klonování DNA pomocí in vitro místně specifické rekombinace“. Genome Res. 10 (11): 1788–95. doi:10,1101 / gr. 143000. PMC 310948. PMID 11076863.
Prévôt D, Morel AP, Voeltzel T, Rostan MC, Rimokh R, Magaud JP, Corbo L (2001). „Vztahy antiproliferativních proteinů BTG1 a BTG2 s CAF1, lidským homologem složky kvasinkového transkripčního komplexu CCR4: účast na signální dráze alfa receptoru estrogenu“. J. Biol. Chem. 276 (13): 9640–8. doi:10,1074 / jbc.M008201200. PMID 11136725.
Wiemann S, Weil B, Wellenreuther R, Gassenhuber J, Glassl S, Ansorge W, Böcher M, Blöcker H, Bauersachs S, Blum H, Lauber J, Düsterhöft A, Beyer A, Köhrer K, Strack N, Mewes HW, Ottenwälder B Obermaier B, Tampe J, Heubner D, Wambutt R, Korn B, Klein M, Poustka A (2001). „Směrem ke katalogu lidských genů a proteinů: sekvenování a analýza 500 nových kompletních proteinů kódujících lidské cDNA“. Genome Res. 11 (3): 422–35. doi:10,1101 / gr. GR1547R. PMC 311072. PMID 11230166.
Simpson JC, Wellenreuther R, Poustka A, Pepperkok R, Wiemann S (2000). „Systematická subcelulární lokalizace nových proteinů identifikovaných sekvenováním cDNA ve velkém měřítku“. EMBO Rep. 1 (3): 287–92. doi:10.1093 / embo-reports / kvd058. PMC 1083732. PMID 11256614.
Morel AP, Sentis S, Bianchin C, Le Romancer M, Jonard L, Rostan MC, Rimokh R, Corbo L (2003). „Antiproliferativní protein BTG2 interaguje s lidským komplexem CCR4 existujícím in vivo ve třech formách regulovaných buněčným cyklem“. J. Cell Sci. 116 (Pt 14): 2929–36. doi:10,1242 / jcs.00480. PMID 12771185.
Wiemann S, Arlt D, Huber W, Wellenreuther R, Schleeger S, Mehrle A, Bechtel S, Sauermann M, Korf U, Pepperkok R, Sültmann H, Poustka A (2004). „Od ORFeome k biologii: funkční plynovod genomiky“. Genome Res. 14 (10B): 2136–44. doi:10,1101 / gr. 2576704. PMC 528930. PMID 15489336.
Mehrle A, Rosenfelder H, Schupp I, del Val C, Arlt D, Hahne F, Bechtel S, Simpson J, Hofmann O, Hide W, Glatting KH, Huber W, Pepperkok R, Poustka A, Wiemann S (2006). „Databáze LIFEdb v roce 2006“. Nucleic Acids Res. 34 (Problém s databází): D415-8. doi:10.1093 / nar / gkj139. PMC 1347501. PMID 16381901.
Dorfleutner A, Bryan NB, Talbott SJ, Funya KN, Rellick SL, Reed JC, Shi X, Rojanasakul Y, Flynn DC, Stehlik C (2007). „Buněčný protein pouze s pyrinovou doménou 2 je kandidátským regulátorem aktivace inflammasomu“. Infikovat. Immun. 75 (3): 1484–92. doi:10.1128 / IAI.01315-06. PMC 1828547. PMID 17178784.

externí odkazy

Člověk CNOT8 umístění genomu a CNOT8 stránka s podrobnostmi o genu v UCSC Genome Browser.

Tento článek o gen na lidský chromozom 5 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000155508 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000020515 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid10036195-5] Fidler C, Wainscoat JS, Boultwood J (květen 1999). „Lidský gen POP2: identifikace, sekvenování a mapování do kritické oblasti syndromu 5q“. Genomika. 56 (1): 134–6. doi:10.1006 / geno.1998.5687. PMID 10036195.

[pmid10637334-6] A ^b ^C Albert TK, Lemaire M, van Berkum NL, Gentz R, Collart MA, Timmers HT (březen 2000). "Izolace a charakterizace lidských ortologů kvasinkových komplexů CCR4-NOT". Nucleic Acids Res. 28 (3): 809–17. doi:10.1093 / nar / 28.3.809. PMC 102560. PMID 10637334.

[entrez-7] „Entrez Gene: CNOT8 CCR4-NOT transkripční komplex, podjednotka 8“.

[pmid11136725-8] A ^b Prévôt D, Morel AP, Voeltzel T, Rostan MC, Rimokh R, Magaud JP, Corbo L (březen 2001). „Vztahy antiproliferativních proteinů BTG1 a BTG2 s CAF1, lidským homologem složky kvasinkového transkripčního komplexu CCR4: účast na signální dráze alfa receptoru estrogenu“. J. Biol. Chem. 276 (13): 9640–8. doi:10,1074 / jbc.M008201200. PMID 11136725.

[pmid16189514-9] Rual JF, Venkatesan K, Hao T, Hirozane-Kishikawa T, Dricot A, Li N, Berriz GF, Gibbons FD, Dreze M, Ayivi-Guedehoussou N, Klitgord N, Simon C, Boxem M, Milstein S, Rosenberg J, Goldberg DS, Zhang LV, Wong SL, Franklin G, Li S, Albala JS, Lim J, Fraughton C, Llamosas E, Cevik S, Bex C, Lamesch P, Sikorski RS, Vandenhaute J, Zoghbi HY, Smolyar A, Bosak S, Sequerra R, Doucette-Stamm L, Cusick ME, Hill DE, Roth FP, Vidal M (říjen 2005). „Směrem k mapě lidské interakční sítě protein-protein v měřítku proteomu“. Příroda. 437 (7062): 1173–8. Bibcode:2005 Natur.437.1173R. doi:10.1038 / nature04209. PMID 16189514. S2CID 4427026.

[pmid17353931-10] Ewing RM, Chu P, Elisma F, Li H, Taylor P, Climie S, McBroom-Cerajewski L, Robinson MD, O'Connor L, Li M, Taylor R, Dharsee M, Ho Y, Heilbut A, Moore L, Zhang S, Ornatsky O, Bukhman YV, Ethier M, Sheng Y, Vasilescu J, Abu-Farha M, Lambert JP, Duewel HS, Stewart II, Kuehl B, Hogue K, Colwill K, Gladwish K, Muskat B, Kinach R, Adams SL, Moran MF, Morin GB, Topaloglou T, Figeys D (2007). „Mapování interakcí lidských proteinů a proteinů ve velkém měřítku hmotnostní spektrometrií“. Mol. Syst. Biol. 3 (1): 89. doi:10.1038 / msb4100134. PMC 1847948. PMID 17353931.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]