CNOT1 - CNOT1
CCR4-ne složitá složka, Not1 | |||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Identifikátory | |||||||||
Symbol | Not1 | ||||||||
Pfam | PF04054 | ||||||||
InterPro | IPR007196 | ||||||||
|
Podjednotka komplexu transkripce CCR4-NOT 1 je protein že u lidí je kódován CNOT1 gen.[5][6]
Je součástí CCR4-ne komplex, který deadenyláty mRNA.[7] CNOT1 působí jako protein lešení a váže další podjednotky komplexu.[8][9][10]
Interakce
CNOT1 bylo prokázáno komunikovat s CNOT8.[11][12]
Reference
- ^ A b C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000125107 - Ensembl, Květen 2017
- ^ A b C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000036550 - Ensembl, Květen 2017
- ^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
- ^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
- ^ Ota T, Suzuki Y, Nishikawa T, Otsuki T, Sugiyama T, Irie R a kol. (Leden 2004). „Kompletní sekvenování a charakterizace 21 243 lidských cDNA plné délky“. Genetika přírody. 36 (1): 40–5. doi:10.1038 / ng1285. PMID 14702039.
- ^ „Entrez Gene: CNOT1 CCR4-NOT transkripční komplex, podjednotka 1“.
- ^ Garneau NL, Wilusz J, Wilusz CJ (únor 2007). "Dálnice a odbočky mRNA se rozpadají". Nat. Rev. Mol. Cell Biol. 8 (2): 113–26. doi:10.1038 / nrm2104. PMID 17245413. S2CID 14107577.
- ^ Sandler H, Kreth J, Timmers HT, Stoecklin G (květen 2011). „Not1 zprostředkovává nábor deadenylázy Caf1 do mRNA cílených na degradaci tristetraprolinem“. Nucleic Acids Res. 39 (10): 4373–86. doi:10.1093 / nar / gkr011. PMC 3105394. PMID 21278420.
- ^ Petit AP, Wohlbold L, Bawankar P, Huntzinger E, Schmidt S, Izaurralde E, Weichenrieder O (listopad 2012). „Strukturální základ pro interakci mezi nukleázou CAF1 a skeletem NOT1 lidského komplexu CCR4-NOT Deadenylase“. Nucleic Acids Res. 40 (21): 11058–72. doi:10.1093 / nar / gks883. PMC 3510486. PMID 22977175.
- ^ Basquin J, Roudko VV, Rode M, Basquin C, Séraphin B, Conti E (26. října 2012). „Architektura nukleázového modulu kvasinkového komplexu Ccr4-not: interakce Not1-Caf1-Ccr4“. Mol. Buňka. 48 (2): 207–18. doi:10.1016 / j.molcel.2012.08.014. PMID 22959269.
- ^ Ewing RM, Chu P, Elisma F, Li H, Taylor P, Climie S, McBroom-Cerajewski L, Robinson MD, O'Connor L, Li M, Taylor R, Dharsee M, Ho Y, Heilbut A, Moore L, Zhang S, Ornatsky O, Bukhman YV, Ethier M, Sheng Y, Vasilescu J, Abu-Farha M, Lambert JP, Duewel HS, Stewart II, Kuehl B, Hogue K, Colwill K, Gladwish K, Muskat B, Kinach R, Adams SL, Moran MF, Morin GB, Topaloglou T, Figeys D (2007). „Mapování interakcí lidských proteinů a proteinů ve velkém měřítku hmotnostní spektrometrií“. Mol. Syst. Biol. 3 (1): 89. doi:10.1038 / msb4100134. PMC 1847948. PMID 17353931.
- ^ Albert TK, Lemaire M, van Berkum NL, Gentz R, Collart MA, Timmers HT (únor 2000). "Izolace a charakterizace lidských ortologů kvasinkových komplexů CCR4-NOT". Nucleic Acids Res. 28 (3): 809–17. doi:10.1093 / nar / 28.3.809. PMC 102560. PMID 10637334.
Další čtení
- Bonaldo MF, Lennon G, Soares MB (1996). „Normalizace a odčítání: dva přístupy k usnadnění objevování genů“. Genome Res. 6 (9): 791–806. doi:10,1101 / gr. 6.9.791. PMID 8889548.
- Nagase T, Ishikawa K, Suyama M, Kikuno R, Hirosawa M, Miyajima N, Tanaka A, Kotani H, Nomura N, Ohara O (1999). „Predikce kódujících sekvencí neidentifikovaných lidských genů. XIII. Kompletní sekvence 100 nových cDNA klonů z mozku, které kódují velké proteiny in vitro“. DNA Res. 6 (1): 63–70. doi:10.1093 / dnares / 6.1.63. PMID 10231032.
- Chen J, Rappsilber J, Chiang YC, Russell P, Mann M, Denis CL (2001). „Purifikace a charakterizace komplexu 1,0 MDa CCR4-NOT identifikuje dvě nové složky komplexu“. J. Mol. Biol. 314 (4): 683–94. doi:10.1006 / jmbi.2001.5162. PMID 11733989.
- Laveder P, De Pittà C, Toppo S, Valle G, Lanfranchi G (2002). „Dvoustupňová strategie pro konstrukci specificky odečítaných knihoven cDNA“. Nucleic Acids Res. 30 (9): 38e – 38. doi:10.1093 / nar / 30.9.e38. PMC 113861. PMID 11972353.
- Winkler GS, Mulder KW, Bardwell VJ, Kalkhoven E, Timmers HT (2006). „Lidský komplex Ccr4-Not je represorem závislým na ligandu transkripce zprostředkované jadernými receptory“. EMBO J.. 25 (13): 3089–99. doi:10.1038 / sj.emboj.7601194. PMC 1500986. PMID 16778766.
externí odkazy
- Zdroj eukaryotického lineárního motivu třída motivů LIG_CNOT1_NIM_1
- Člověk CNOT1 umístění genomu a CNOT1 stránka s podrobnostmi o genu v UCSC Genome Browser.
- Přehled všech strukturálních informací dostupných v PDB pro UniProt: A5YKK6 (CCR4-NOT transkripční komplexní podjednotka 1) na PDBe-KB.
Tento článek o gen na lidský chromozom 16 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to. |