CDC42EP1 - CDC42EP1

CDC42EP1
Identifikátory
Aliasy	CDC42EP1, BORG5, CEP1, MSE55, CDC42 efektorový protein 1
Externí ID	OMIM: 606084 MGI: 1929763 HomoloGene: 5128 Genové karty: CDC42EP1
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 22 (lidský)
Konec	37,569,405 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 15 (myš)
Konec	78,850,897 bp
Exprese RNA vzor
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• Vazba GTP-Rho; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • GO: 0005097, GO: 0005099, GO: 0005100 Aktivátor aktivity GTPázy; • vazba kadherinu zapojená do adheze mezi buňkami;
Buněčná složka	• cytoskelet; • membrána; • endomembránový systém; • ohnisková adheze; • cytoplazma; • buněčná membrána;
Biologický proces	• pozitivní regulace sestavy pseudopodia; • pozitivní regulace polymerace aktinových vláken; • Rho proteinová signální transdukce; • regulace tvaru buňky; • GO: 0032320, GO: 0032321, GO: 0032855, GO: 0043089, GO: 0032854 pozitivní regulace aktivity GTPázy; • buněčná adheze;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	11135
	104445
	ENSG00000128283
	ENSMUSG00000049521
	Q00587
	Q91W92
	NM_152243
	NM_027219
	NP_689449
	NP_081495
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Cdc42 efektorový protein 1 je protein že u lidí je kódován CDC42EP1 gen.^[5]^[6]^[7]

CDC42 je členem Rodina Rho GTPase který reguluje více buněčných aktivit, včetně aktin polymerizace. Protein kódovaný tímto genem je protein vázající CDC42, který zprostředkovává aktinový cytoskelet reorganizace na plazmatická membrána. Kódovaný protein, který je vylučován, se primárně nachází v kostní dřeň. Dvě varianty přepisu kódující různé izoformy byly nalezeny pro tento gen.^[7]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000128283 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000049521 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Bahou WF, Campbell AD, Wicha MS (srpen 1992). „cDNA klonování a molekulární charakterizace MSE55, nového proteinu tvořícího součást lidského séra, který vykazuje specifickou expresi stromálních / endoteliálních buněk kostní dřeně“. J Biol Chem. 267 (20): 13986–92. PMID 1629197.
^ Burbelo PD, Snow DM, Bahou W, Spiegel S (září 1999). „MSE55, efektorový protein Cdc42, indukuje dlouhé buněčné extenze ve fibroblastech“. Proc Natl Acad Sci U S A. 96 (16): 9083–8. doi:10.1073 / pnas.96.16.9083. PMC 17736. PMID 10430899.
^ ^A ^b "Entrez gen: CDC42EP1 CDC42 efektorový protein (vazba Rho GTPázy) 1".

externí odkazy

Člověk CDC42EP1 umístění genomu a CDC42EP1 stránka s podrobnostmi o genu v UCSC Genome Browser.

Další čtení

Joberty G, Perlungher RR, Macara IG (2000). „Borgové, nová rodina proteinů interagujících s Cdc42 a TC10 GTPázou“. Mol. Buňka. Biol. 19 (10): 6585–97. doi:10.1128 / MCB.19.10.6585. PMC 84628. PMID 10490598.
Dunham I, Shimizu N, Roe BA a kol. (1999). „Sekvence DNA lidského chromozomu 22“. Příroda. 402 (6761): 489–95. doi:10.1038/990031. PMID 10591208.
Hirsch DS, Pirone DM, Burbelo PD (2001). „Nová rodina efektorových proteinů Cdc42, CEP, funguje při změnách tvaru fibroblastů a epiteliálních buněk“. J. Biol. Chem. 276 (2): 875–83. doi:10,1074 / jbc.M007039200. PMID 11035016.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH a kol. (2003). „Generování a počáteční analýza více než 15 000 lidských a myších cDNA sekvencí plné délky“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (26): 16899–903. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
Gevaert K, Goethals M, Martens L a kol. (2004). „Zkoumání proteomů a analýza zpracování proteinů hmotnostní spektrometrickou identifikací tříděných N-koncových peptidů“. Nat. Biotechnol. 21 (5): 566–9. doi:10.1038 / nbt810. PMID 12665801.
Ballif BA, Villén J, Beausoleil SA a kol. (2005). „Fosfoproteomická analýza vyvíjejícího se myšího mozku“. Mol. Buňka. Proteomika. 3 (11): 1093–101. doi:10,1074 / mcp.M400085-MCP200. PMID 15345747.
Collins JE, Wright CL, Edwards CA a kol. (2005). „Přístup ke klonování lidského ORFeome založený na anotaci genomu“. Genome Biol. 5 (10): R84. doi:10.1186 / gb-2004-5-10-r84. PMC 545604. PMID 15461802.
Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA a kol. (2004). „Stav, kvalita a rozšíření projektu cDNA NIH v plné délce: Sbírka genů savců (MGC)“. Genome Res. 14 (10B): 2121–7. doi:10,1101 / gr. 2596504. PMC 528928. PMID 15489334.
Zhang J, Zhu J, Bu X a kol. (2005). „Aktivace Cdc42 a RhoB je vyžadována u fagocytózy zprostředkované manózovými receptory lidskými alveolárními makrofágy“. Mol. Biol. Buňka. 16 (2): 824–34. doi:10,1091 / mbc.E04-06-0463. PMC 545914. PMID 15574879.
Rual JF, Venkatesan K, Hao T a kol. (2005). „Směrem k mapě lidské interakční sítě protein-protein v měřítku proteomu“. Příroda. 437 (7062): 1173–8. doi:10.1038 / nature04209. PMID 16189514.
Kimura K, Wakamatsu A, Suzuki Y a kol. (2006). „Diverzifikace transkripční modulace: identifikace a charakterizace domnělých alternativních promotorů lidských genů ve velkém měřítku“. Genome Res. 16 (1): 55–65. doi:10,1101 / gr. 4039406. PMC 1356129. PMID 16344560.
Olsen JV, Blagoev B, Gnad F a kol. (2006). „Globální, in vivo a místně specifická dynamika fosforylace v signálních sítích“. Buňka. 127 (3): 635–48. doi:10.1016 / j.cell.2006.09.026. PMID 17081983.

Tento článek o gen na lidský chromozom 22 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000128283 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000049521 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid1629197-5] Bahou WF, Campbell AD, Wicha MS (srpen 1992). „cDNA klonování a molekulární charakterizace MSE55, nového proteinu tvořícího součást lidského séra, který vykazuje specifickou expresi stromálních / endoteliálních buněk kostní dřeně“. J Biol Chem. 267 (20): 13986–92. PMID 1629197.

[pmid10430899-6] Burbelo PD, Snow DM, Bahou W, Spiegel S (září 1999). „MSE55, efektorový protein Cdc42, indukuje dlouhé buněčné extenze ve fibroblastech“. Proc Natl Acad Sci U S A. 96 (16): 9083–8. doi:10.1073 / pnas.96.16.9083. PMC 17736. PMID 10430899.

[entrez-7] A ^b "Entrez gen: CDC42EP1 CDC42 efektorový protein (vazba Rho GTPázy) 1".

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]