CCNC (gen) - CCNC (gene)

CCNC
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	3RGF, 4F6S, 4F6U, 4F6W, 4F70, 4F7J, 4F7L, 4F7N, 4F7S, 4G6L, 4CRL, 5HBE, 5HBH, 5BNJ, 5HBJ, 5FGK, 5 CEI, 5HNB, 5HVY, 5I5Z
Identifikátory
Aliasy	CCNC, CycC, cyklin C, hSRB11, SRB11
Externí ID	OMIM: 123838 MGI: 1858199 HomoloGene: 3803 Genové karty: CCNC
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 6 (lidský)
Konec	99,568,825 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 4 (myš)
Konec	21,759,922 bp
Exprese RNA vzor
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• GO: 0001948 vazba na proteiny; • aktivita proteinové serin / threoninkinázy; • aktivita regulátoru proteinu serin / threonin kinázy závislá na cyklinu;
Buněčná složka	• komplex mediátorů; • komplex cyklin-dependentní protein kinázy s holoenzymem; • buněčné jádro; • nukleoplazma;
Biologický proces	• pozitivní regulace fosforylace C-terminální domény RNA polymerázy II; • iniciace transkripce z promotoru RNA polymerázy II; • regulace transkripce, DNA-šablony; • pozitivní regulace aktivity cyklin-dependentního proteinu serin / threonin kinázy; • pozitivní regulace transkripce z promotoru RNA polymerázy II; • fosforylace bílkovin; • transkripce, chráněná DNA; • regulace aktivity cyklin-dependentního proteinu serin / threonin kináza; • regulace transkripce z promotoru RNA polymerázy II; • regulace aktivity proteinkinázy;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	892
	51813
	ENSG00000112237
	ENSMUSG00000028252
	P24863
	Q62447
	NM_001013399; NM_005190; NM_001363537
	NM_001122982; NM_001290420; NM_001290422; NM_016746
	NP_001013417; NP_005181; NP_001350466
	NP_001116454; NP_001277349; NP_001277351; NP_058026
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Cyklin-C je protein že u lidí je kódován CCNC gen.^[5]^[6]

Protein kódovaný tímto genem je členem rodiny cyklinových proteinů. Kódovaný protein interaguje s cyklin-dependentní kinázou 8 a indukuje fosforylaci karboxy-terminální domény velké podjednotky RNA polymeráza II. Hladina mRNA pro tento gen vrcholí ve fázi G1 buněčného cyklu. Pro tento gen byly nalezeny dvě varianty transkriptu kódující různé izoformy.^[6]

Interakce

Bylo prokázáno, že CCNC (gen) komunikovat s Estrogenový receptor alfa^[7] a Cyklin-dependentní kináza 8.^[7]^[8]^[9]^[10]^[11]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000112237 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000028252 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Lew DJ, Dulic V, Reed SI (říjen 1991). "Izolace tří nových lidských cyklinů záchranou funkce G1 cyklinu (Cln) v kvasinkách". Buňka. 66 (6): 1197–206. doi:10.1016 / 0092-8674 (91) 90042-W. PMID 1833066. S2CID 12166415.
^ ^A ^b „Entrez Gene: CCNC cyklin C“.
^ ^A ^b Kang, Yun Kyoung; Guermah Mohamed; Yuan Chao-Xing; Roeder Robert G (březen 2002). „Komplex koaktivátoru TRAP / Mediator interaguje přímo s estrogenovými receptory α a β prostřednictvím podjednotky TRAP220 a přímo zvyšuje funkci estrogenového receptoru in vitro“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA 99 (5): 2642–7. Bibcode:2002PNAS ... 99,2642K. doi:10.1073 / pnas.261715899. ISSN 0027-8424. PMC 122401. PMID 11867769.
^ Zhang, Y; Iratni R; Erdjument-Bromage H; Tempst P; Reinberg D (květen 1997). „Histonové deacetylázy a SAP18, nový polypeptid, jsou složkami lidského komplexu Sin3“. Buňka. 89 (3): 357–64. doi:10.1016 / S0092-8674 (00) 80216-0. ISSN 0092-8674. PMID 9150135.
^ Cho, H; Orphanides G; Sun X; Yang X J; Ogryzko V; Lees E; Nakatani Y; Reinberg D (září 1998). „Komplex lidské RNA polymerázy II obsahující faktory, které mění strukturu chromatinu“. Mol. Buňka. Biol. 18 (9): 5355–63. doi:10.1128 / MCB.18.9.5355. ISSN 0270-7306. PMC 109120. PMID 9710619.
^ Wang, G; Kantin GT; Stevens JL; Berk A J (červenec 2001). „Charakterizace komplexů mediátorů z jaderného extraktu buněk HeLa“. Mol. Buňka. Biol. 21 (14): 4604–13. doi:10.1128 / MCB.21.14.4604-4613.2001. ISSN 0270-7306. PMC 87123. PMID 11416138.
^ Tassan, J. P.; Jaquenoud M; Léopold P; Schultz S J; Nigg E A (září 1995). „Identifikace lidské cyklin-dependentní kinázy 8, domnělého proteinkinázového partnera pro cyklin C“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA 92 (19): 8871–5. Bibcode:1995PNAS ... 92.8871T. doi:10.1073 / pnas.92.19.8871. ISSN 0027-8424. PMC 41069. PMID 7568034.

externí odkazy

Člověk CCNC umístění genomu a CCNC stránka s podrobnostmi o genu v UCSC Genome Browser.

Další čtení

Nozawa T, Hatano M, Yamamoto H, Kwan T (1976). „Magnetický kruhový dichroismus na reverzibilní oxygenaci dimethylmesoporfyrin-IX-atopyridinokobaltu (II)“. Bioanorganická chemie. 5 (3): 267–73. doi:10.1016 / S0006-3061 (00) 82025-6. PMID 1260071.
Tassan JP, Jaquenoud M, Léopold P a kol. (1995). „Identifikace lidské cyklin-dependentní kinázy 8, domnělého proteinkinázového partnera pro cyklin C“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 92 (19): 8871–5. Bibcode:1995PNAS ... 92.8871T. doi:10.1073 / pnas.92.19.8871. PMC 41069. PMID 7568034.
Demetrick DJ, Matsumoto S, Hannon GJ a kol. (1995). "Chromozomální mapování genů pro proteiny lidského buněčného cyklu cyklin C (CCNC), cyklin E (CCNE), p21 (CDKN1) a KAP (CDKN3)". Cytogenet. Cell Genet. 69 (3–4): 190–2. doi:10.1159/000133960. PMID 7698009.
Yoshizumi M, Lee WS, Hsieh CM a kol. (1995). „Zmizení cyklinu A koreluje s trvalým odebráním kardiomyocytů z buněčného cyklu v lidských a krysích srdcích“. J. Clin. Investovat. 95 (5): 2275–80. doi:10.1172 / JCI117918. PMC 295840. PMID 7738192.
Maruyama K, Sugano S (1994). „Oligo-capping: jednoduchá metoda k nahrazení struktury cap eukaryotických mRNA oligoribonukleotidy“. Gen. 138 (1–2): 171–4. doi:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID 8125298.
Rickert P, Seghezzi W, Shanahan F a kol. (1996). „Cyclin C / CDK8 je nová CTD kináza spojená s RNA polymerázou II“. Onkogen. 12 (12): 2631–40. PMID 8700522.
Li H, Lahti JM, Valentine M a kol. (1997). „Molekulární klonování a chromozomální lokalizace genů lidského cyklinu C (CCNC) a cyklinu E (CCNE): delece genu CCNC v lidských nádorech“. Genomika. 32 (2): 253–9. doi:10.1006 / geno.1996.0112. PMID 8833152.
Cujec TP, Cho H, Maldonado E a kol. (1997). „Transaktivátor viru lidské imunodeficience Tat interaguje s holoenzymem RNA polymerázy II“. Mol. Buňka. Biol. 17 (4): 1817–23. doi:10.1128 / MCB.17.4.1817. PMC 232028. PMID 9121429.
Suzuki Y, Yoshitomo-Nakagawa K, Maruyama K a kol. (1997). "Konstrukce a charakterizace knihovny cDNA obohacené o celou délku a 5'-end". Gen. 200 (1–2): 149–56. doi:10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3. PMID 9373149.
Neish AS, Anderson SF, Schlegel BP a kol. (1998). "Faktory spojené s holoenzymem savčí RNA polymerázy II". Nucleic Acids Res. 26 (3): 847–53. doi:10.1093 / nar / 26.3.847. PMC 147327. PMID 9443979.
Cho H, Orphanides G, Sun X a kol. (1998). „Komplex lidské RNA polymerázy II obsahující faktory, které mění strukturu chromatinu“. Mol. Buňka. Biol. 18 (9): 5355–63. doi:10.1128 / MCB.18.9.5355. PMC 109120. PMID 9710619.
Sun X, Zhang Y, Cho H a kol. (1998). "NAT, lidský komplex obsahující Srb polypeptidy, který funguje jako negativní regulátor aktivované transkripce". Mol. Buňka. 2 (2): 213–22. doi:10.1016 / S1097-2765 (00) 80131-8. PMID 9734358.
Gu W, Malik S, Ito M a kol. (1999). "Nový lidský komplex kofaktorů obsahujících SRB / MED, SMCC, zapojený do regulace transkripce". Mol. Buňka. 3 (1): 97–108. doi:10.1016 / S1097-2765 (00) 80178-1. PMID 10024883.
Ito M, Yuan CX, Malik S a kol. (1999). „Identita mezi komplexy TRAP a SMCC naznačuje nové cesty pro funkci jaderných receptorů a různých savčích aktivátorů“. Mol. Buňka. 3 (3): 361–70. doi:10.1016 / S1097-2765 (00) 80463-3. PMID 10198638.
Rachez C, Lemon BD, Suldan Z a kol. (1999). „Aktivace transkripce závislá na ligandu jadernými receptory vyžaduje komplex DRIP“. Příroda. 398 (6730): 824–8. Bibcode:1999 Natur.398..824R. doi:10.1038/19783. PMID 10235266. S2CID 204992765.
Wang G, Cantin GT, Stevens JL, Berk AJ (2001). „Charakterizace komplexů mediátorů z jaderného extraktu buněk HeLa“. Mol. Buňka. Biol. 21 (14): 4604–13. doi:10.1128 / MCB.21.14.4604-4613.2001. PMC 87123. PMID 11416138.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH a kol. (2003). „Generování a počáteční analýza více než 15 000 lidských a myších cDNA sekvencí plné délky“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (26): 16899–903. Bibcode:2002PNAS ... 9916899M. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
Sato S, Tomomori-Sato C, Banks CA a kol. (2003). "Identifikace savčích podjednotek Mediator s podobnostmi s kvasinkami Mediator podjednotek Srb5, Srb6, Med11 a Rox3". J. Biol. Chem. 278 (17): 15123–7. doi:10,1074 / jbc.C300054200. PMID 12584197.
Ueberham U, Hessel A, Arendt T (2003). „Exprese cyklinu C se podílí na patogenezi Alzheimerovy choroby“. Neurobiol. Stárnutí. 24 (3): 427–35. doi:10.1016 / S0197-4580 (02) 00132-X. PMID 12600719. S2CID 12604491.

Tento článek o gen na lidský chromozom 6 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000112237 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000028252 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid1833066-5] Lew DJ, Dulic V, Reed SI (říjen 1991). "Izolace tří nových lidských cyklinů záchranou funkce G1 cyklinu (Cln) v kvasinkách". Buňka. 66 (6): 1197–206. doi:10.1016 / 0092-8674 (91) 90042-W. PMID 1833066. S2CID 12166415.

[entrez-6] A ^b „Entrez Gene: CCNC cyklin C“.

[pmid11867769-7] A ^b Kang, Yun Kyoung; Guermah Mohamed; Yuan Chao-Xing; Roeder Robert G (březen 2002). „Komplex koaktivátoru TRAP / Mediator interaguje přímo s estrogenovými receptory α a β prostřednictvím podjednotky TRAP220 a přímo zvyšuje funkci estrogenového receptoru in vitro“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA 99 (5): 2642–7. Bibcode:2002PNAS ... 99,2642K. doi:10.1073 / pnas.261715899. ISSN 0027-8424. PMC 122401. PMID 11867769.

[pmid9150135-8] Zhang, Y; Iratni R; Erdjument-Bromage H; Tempst P; Reinberg D (květen 1997). „Histonové deacetylázy a SAP18, nový polypeptid, jsou složkami lidského komplexu Sin3“. Buňka. 89 (3): 357–64. doi:10.1016 / S0092-8674 (00) 80216-0. ISSN 0092-8674. PMID 9150135.

[pmid9710619-9] Cho, H; Orphanides G; Sun X; Yang X J; Ogryzko V; Lees E; Nakatani Y; Reinberg D (září 1998). „Komplex lidské RNA polymerázy II obsahující faktory, které mění strukturu chromatinu“. Mol. Buňka. Biol. 18 (9): 5355–63. doi:10.1128 / MCB.18.9.5355. ISSN 0270-7306. PMC 109120. PMID 9710619.

[pmid11416138-10] Wang, G; Kantin GT; Stevens JL; Berk A J (červenec 2001). „Charakterizace komplexů mediátorů z jaderného extraktu buněk HeLa“. Mol. Buňka. Biol. 21 (14): 4604–13. doi:10.1128 / MCB.21.14.4604-4613.2001. ISSN 0270-7306. PMC 87123. PMID 11416138.

[pmid7568034-11] Tassan, J. P.; Jaquenoud M; Léopold P; Schultz S J; Nigg E A (září 1995). „Identifikace lidské cyklin-dependentní kinázy 8, domnělého proteinkinázového partnera pro cyklin C“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA 92 (19): 8871–5. Bibcode:1995PNAS ... 92.8871T. doi:10.1073 / pnas.92.19.8871. ISSN 0027-8424. PMC 41069. PMID 7568034.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

[11]