CACYBP - CACYBP

CACYBP
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	1X5M, 2A25, 2A26
Identifikátory
Aliasy	CACYBP„GIG5, S100A6BP, SIP, PNAS-107, protein vázající kalcyklin
Externí ID	OMIM: 606186 MGI: 1270839 HomoloGene: 7649 Genové karty: CACYBP
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 1 (lidský)
Konec	175,012,027 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 1 (myš)
Konec	160,212,875 bp
Exprese RNA vzor
	; ; ; ;
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• GO: 0001948 vazba na proteiny; • aktivita homodimerizace proteinu; • specifické vazby na proteinovou doménu; • vazba ubikvitinové proteinové ligázy; • tubulinová vazba; • Vazba na protein S100;
Buněčná složka	• lumen jaderné obálky; • extracelulární exosom; • komplex ničení beta-kateninem; • buněčné jádro; • nukleoplazma; • neuronová projekce; • buněčné tělo; • cytoplazma; • cytosol; • Komplex ubikvitin ligázy SCF;
Biologický proces	• diferenciace buněk srdečního svalu; • pozitivní regulace replikace DNA; • stárnutí; • negativní regulace buněčné smrti; • buněčná odpověď na iont vápníku; • vývoj srdce; • reakce na růstový hormon; • buněčná odpověď na faktor inhibující leukémii;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	27101
	12301
	ENSG00000116161
	ENSMUSG00000014226
	Q9HB71
	Q9CXW3
	NM_014412; NM_001007214
	NM_009786
	NP_001007215; NP_055227
	NP_033916
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Protein vázající kalcyklin je protein že u lidí je kódován CACYBP gen.^[5]^[6]^[7]

Protein kódovaný tímto genem je protein vázající kalcyklin. Může se podílet na ubikvitinaci závislé na vápníku a následné proteosomální degradaci cílových proteinů. Pravděpodobně slouží jako molekulární můstek v komplexech ubikvitinu E3 a podílí se na ubikvitinem zprostředkované degradaci beta-kateninu. Pro tento gen byly nalezeny dvě alternativně sestříhané varianty transkriptu kódující různé izoformy.^[7]

Interakce s proteiny

CACYBP bylo prokázáno komunikovat s SKP1A^[8] a SIAH1.^[5]

Místo toho je známo, že komplex CacyBP / SIP je součástí stresové reakce, protože interaguje s chaperonem HSP90.^[9]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000116161 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000014226 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ ^A ^b Matsuzawa SI, Reed JC (květen 2001). „Siah-1, SIP a Ebi spolupracují na nové cestě degradace beta-kateninu spojené s odpověďmi p53“. Molekulární buňka. 7 (5): 915–26. doi:10.1016 / S1097-2765 (01) 00242-8. PMID 11389839.
^ Matsuzawa S, Li C, Ni CZ, Takayama S, Reed JC, Ely KR (leden 2003). „Strukturní analýza Siah1 a jeho interakcí s proteinem interagujícím se Siah (SIP)“. The Journal of Biological Chemistry. 278 (3): 1837–40. doi:10,1074 / jbc.M210263200. PMID 12421809.
^ ^A ^b „Entrez Gene: CACYBP calcyclin binding protein“.
^ Matsuzawa SI, Reed JC (květen 2001). „Siah-1, SIP a Ebi spolupracují na nové cestě degradace beta-kateninu spojené s odpověďmi p53“. Molekulární buňka. 7 (5): 915–26. doi:10.1016 / S1097-2765 (01) 00242-8. PMID 11389839.
^ Filipek, Anna; Leśniak, Wiesława (2018-12-29). „Aktualny pogląd na komórkową funkcję S100A6 i jego ligandów, CacyBP / SIP i Sgt1“. Postępy Biochemii (v polštině). 64 (3): 242–252. doi:10.18388 / pb.2018_136. ISSN 0032-5422.

externí odkazy

Člověk CACYBP umístění genomu a CACYBP stránka s podrobnostmi o genu v UCSC Genome Browser.

Další čtení

Filipek A, Jastrzebska B, Nowotny M, Kwiatkowska K, Hetman M, Surmacz L a kol. (Červen 2002). „Translokace proteinu vázajícího kalcyklin v neuronech a buňkách NB-2a závislých na Ca2 +“. The Journal of Biological Chemistry. 277 (23): 21103–9. doi:10,1074 / jbc.M111010200. PMID 11927578.
Liu WX, Wu J, Zhao Z, Zhou Y, Peng XZ, Yuan JG, Qiang BQ (březen 2002). "[Klonování a exprese genu pro lidský protein vázající kalcyklin (hCacyBP)]". Sheng Wu Hua Xue Yu Sheng Wu Wu Li Xue Bao Acta Biochimica et Biophysica Sinica. 34 (2): 181–6. PMID 12006993.
Filipek A, Jastrzebska B, Nowotny M, Kuznicki J (srpen 2002). „CacyBP / SIP, kalcyklin a protein interagující se Siah-1, váže proteiny EF-hand z rodiny S100“. The Journal of Biological Chemistry. 277 (32): 28848–52. doi:10,1074 / jbc.M203602200. PMID 12042313.
Wu J, Tan X, Peng X, Yuan J, Qiang B (červenec 2003). „Translokace a fosforylace proteinu vázajícího kalcyklin během neuronové diferenciace neuroblastomových buněk SH-SY5Y indukované kyselinou retinovou“. Journal of Biochemistry and Molecular Biology. 36 (4): 354–8. doi:10,5483 / bmbrep.2003.36.4.354. PMID 12895292.
Santelli E, Leone M, Li C, Fukushima T, Preece NE, Olson AJ a kol. (Říjen 2005). „Strukturní analýza interakcí proteinů interagujících se Siah1-Siah a poznatky o sestavení multiproteinového komplexu E3 ligázy“. The Journal of Biological Chemistry. 280 (40): 34278–87. doi:10,1074 / jbc.M506707200. PMID 16085652.
Rual JF, Venkatesan K, Hao T, Hirozane-Kishikawa T, Dricot A, Li N a kol. (Říjen 2005). „Směrem k mapě lidské interakční sítě protein-protein v měřítku proteomu“. Příroda. 437 (7062): 1173–8. Bibcode:2005 Natur.437.1173R. doi:10.1038 / nature04209. PMID 16189514.
Ewing RM, Chu P, Elisma F, Li H, Taylor P, Climie S a kol. (2007). „Mapování interakcí lidských proteinů a proteinů ve velkém měřítku hmotnostní spektrometrií“. Molekulární systémy biologie. 3 (1): 89. doi:10.1038 / msb4100134. PMC 1847948. PMID 17353931.
Sun S, Ning X, Liu J, Liu L, Chen Y, Han S a kol. (Květen 2007). „Nadměrně exprimovaný CacyBP / SIP vede k potlačení růstu u karcinomu ledvinových buněk“. Komunikace pro biochemický a biofyzikální výzkum. 356 (4): 864–71. doi:10.1016 / j.bbrc.2007.03.080. PMID 17400182.

Tento článek o gen na lidský chromozom 1 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000116161 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000014226 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid11389839-5] A ^b Matsuzawa SI, Reed JC (květen 2001). „Siah-1, SIP a Ebi spolupracují na nové cestě degradace beta-kateninu spojené s odpověďmi p53“. Molekulární buňka. 7 (5): 915–26. doi:10.1016 / S1097-2765 (01) 00242-8. PMID 11389839.

[pmid12421809-6] Matsuzawa S, Li C, Ni CZ, Takayama S, Reed JC, Ely KR (leden 2003). „Strukturní analýza Siah1 a jeho interakcí s proteinem interagujícím se Siah (SIP)“. The Journal of Biological Chemistry. 278 (3): 1837–40. doi:10,1074 / jbc.M210263200. PMID 12421809.

[entrez-7] A ^b „Entrez Gene: CACYBP calcyclin binding protein“.

[autogenerated1-8] Matsuzawa SI, Reed JC (květen 2001). „Siah-1, SIP a Ebi spolupracují na nové cestě degradace beta-kateninu spojené s odpověďmi p53“. Molekulární buňka. 7 (5): 915–26. doi:10.1016 / S1097-2765 (01) 00242-8. PMID 11389839.

[9] Filipek, Anna; Leśniak, Wiesława (2018-12-29). „Aktualny pogląd na komórkową funkcję S100A6 i jego ligandów, CacyBP / SIP i Sgt1“. Postępy Biochemii (v polštině). 64 (3): 242–252. doi:10.18388 / pb.2018_136. ISSN 0032-5422.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]