Bibliome - Bibliome

The bibliome je souhrn biologického textu korpus. Tento termín byl vytvořen kolem roku 2000 v EBI (Evropský bioinformatický institut ) k označení důležitosti biologických textových informací. Podobné termíny, které se používají méně často, jsou literaturome a textom.[Citace je zapotřebí ] Přibližnou analogií k široce používaným výrazům jako genom, metabolome, proteom a transkriptom by tento -ome správně odkazoval na literaturu specifikovaného nebo kontextově implikovaného pole, tedy: biologický bibliome, politický bibliome, atd.[Citace je zapotřebí ] Tento termín však (dosud) nebyl aplikován mimo biologické a lékařské vědy, takže se v současnosti standardně vztahuje pouze na biomedicínské obory. Nemělo by smysl ho aplikovat na určitý soubor textů, jako je MEDLINE, navzdory přirozené analogii, která by to mohla naznačovat: termíny genom, proteom, channelome, metabolome, a přepis všichni obvykle předpokládají určitý organismus nebo sadu buněk a (kromě genomu) konkrétní časový bod. Důvod, který sleduje tuto analogii, by nedával smysl, je, že pro tento účel již existuje ustálený termín, korpus.

Z bibliome, biologové a počítačoví vědci datamin objevovat nové genové cíle a léky. Bibliomics je bioinformatika studium bibliomu. Bibliome není a pseudoome protože je to užitečný koncept, který používají bioinformatici.

Online aplikace

EAGLi je biomedicínský vyhledávací modul pro MEDLINE. GOCat je automatický kategorizátor / prohlížeč GO, který pomáhá funkční anotaci z biomedicínských textů; užitečné také pro funkční charakterizaci seznamů názvů proteinů a genů generovaných vysoce výkonnými experimenty.

externí odkazy

  • „Těžba bibliomu“ (abstrakt)
  • Grivell, Les (15. března 2002). „Těžba bibliomu: hledání jehly v kupce sena?“. Zprávy EMBO. 3 (3): 200–203. doi:10.1093 / embo-reports / kvf059. PMC  1084023. PMID  11882534.