Bayesova věta - Bayes theorem - Wikipedia
v teorie pravděpodobnosti a statistika, Bayesova věta (alternativně Bayesův zákon nebo Bayesovo pravidlo), pojmenovaný po reverendovi Thomas Bayes, popisuje pravděpodobnost z událost, na základě předchozí znalosti podmínek, které mohou souviset s událostí.[1] Například pokud je známo, že riziko rozvoje zdravotních problémů s věkem stoupá, Bayesova věta umožňuje, aby bylo riziko pro jedince známého věku posouzeno přesněji (podmíněno jeho věkem), než jednoduše předpokládat, že jedinec je typické pro populaci jako celek.
Jednou z mnoha aplikací Bayesovy věty je Bayesovský závěr, zvláštní přístup k statistická inference. Pokud se použijí, pravděpodobnosti zapojené do věty se mohou lišit pravděpodobnostní interpretace. S Bayesova pravděpodobnost interpretace, věta vyjadřuje, jak by se měl stupeň víry, vyjádřený jako pravděpodobnost, racionálně změnit, aby zohledňoval dostupnost souvisejících důkazů. Bayesiánský závěr je základem Bayesovské statistiky.
Výrok věty
Bayesova věta je uvedena matematicky jako následující rovnice:[2]
kde a jsou Události a .
- je podmíněná pravděpodobnost: pravděpodobnost události vzhledem k tomu je pravda.
- je také podmíněná pravděpodobnost: pravděpodobnost události vzhledem k tomu je pravda.
- a jsou pravděpodobnosti pozorování a respektive; oni jsou známí jako mezní pravděpodobnost.
- A a B musí být různé události.
Příklady
Testování drog
Předpokládejme, že konkrétní test, zda někdo užíval konopí, je 90% citlivý, což znamená skutečná kladná sazba (TPR) = 0,90. Proto vede k 90% skutečně pozitivních výsledků (správná identifikace užívání drog) pro uživatele konopí.
Test je také 80% charakteristický, význam skutečná záporná sazba (TNR) = 0,80. Proto test správně identifikuje 80% nepoužívání pro uživatele, ale také generuje 20% falešných poplachů, nebo míra falešně pozitivních výsledků (FPR) = 0,20, pro uživatele, kteří nejsou uživateli.
Za předpokladu 0,05 prevalence, což znamená, že 5% lidí užívá konopí, což je pravděpodobnost že náhodný člověk, který má pozitivní testy, je ve skutečnosti uživatelem konopí?
The Pozitivní prediktivní hodnota (PPV) testu je podíl osob, které jsou ve skutečnosti pozitivní ze všech testovaných pozitivních, a lze jej vypočítat ze vzorku jako:
- PPV = True positive / Tested positive
Pokud je známa citlivost, specificita a prevalence, lze PPV vypočítat pomocí Bayesovy věty. Nechat znamená „pravděpodobnost, že někdo je uživatelem konopí vzhledem k tomu, že má pozitivní test,“ což znamená PPV. Můžeme psát:
Skutečnost, že je přímá aplikace Zákon totální pravděpodobnosti. V tomto případě se říká, že pravděpodobnost, že někdo pozitivně testuje, je pravděpodobnost, že uživatel testuje pozitivně, krát pravděpodobnost, že bude uživatelem, plus pravděpodobnost, že ne-uživatel testuje pozitivně, krát, pravděpodobnost, že nebude uživatelem .
To je pravda, protože klasifikace uživatele a neuživatele tvoří a oddíl sady, a to soubor lidí, kteří podstoupí test na přítomnost drog. To v kombinaci s definicí podmíněná pravděpodobnost má za následek výše uvedené prohlášení.
I když někdo testuje pozitivně, pravděpodobnost, že je uživatelem konopí, je pouze 19%, protože v této skupině je uživateli pouze 5% lidí, většina pozitiv je falešných pozitiv pocházejících ze zbývajících 95%.
Pokud bylo testováno 1 000 lidí:
- 950 nepoužívá a 190 z nich dává falešně pozitivní výsledky (0,20 × 950)
- 50 z nich jsou uživatelé a 45 z nich dává skutečně kladné hodnoty (0,90 × 50)
1 000 lidí tak přináší 235 pozitivních testů, z nichž pouze 45 jsou skuteční uživatelé drog, přibližně 19%. Viz obrázek 1 pro ilustraci pomocí frekvenčního pole a všimněte si, jak malá je růžová oblast skutečných pozitivů ve srovnání s modrou oblastí falešných pozitiv.
Citlivost nebo specificita
Důležitost specifičnost lze vidět na ukázce, že i když je citlivost zvýšena na 100% a specificita zůstává na 80%, pravděpodobnost, že někdo bude mít pozitivní test ve skutečnosti, že je uživatelem konopí, vzroste pouze z 19% na 21%, ale pokud je citlivost udržována na 90% a specificita se zvýší na 95%, pravděpodobnost se zvýší na 49%.
|
|
|
Míra rakoviny
I když 100% pacientů s rakovinou pankreatu má určitý příznak, když má někdo stejný příznak, neznamená to, že tato osoba má 100% šanci na rakovinu pankreatu. Předpokládejme, že míra výskytu rakoviny pankreatu je 1/100 000, zatímco 1/10 000 zdravých jedinců má po celém světě stejné příznaky, pravděpodobnost výskytu rakoviny pankreatu je u těchto příznaků pouze 9,1% a dalších 90,9% může být „falešně pozitivních“ ( to je, mylně řečeno, že má rakovinu; „pozitivní“ je matoucí termín, když jako zde test dává špatné zprávy).
Na základě míry výskytu uvádí následující tabulka odpovídající počty na 100 000 lidí.
Rakovina Příznak | Ano | Ne | Celkový | |
---|---|---|---|---|
Ano | 1 | 10 | 11 | |
Ne | 0 | 99989 | 99989 | |
Celkový | 1 | 99999 | 100000 |
Který lze poté použít k výpočtu pravděpodobnosti rakoviny, když máte příznaky:
Složitější příklad
Stav Stroj | Vadný | Bezchybný | Celkový | |
---|---|---|---|---|
A | 10 | 190 | 200 | |
B | 9 | 291 | 300 | |
C | 5 | 495 | 500 | |
Celkový | 24 | 976 | 1000 |
Továrna vyrábí položku pomocí tří strojů - A, B a C - které tvoří 20%, 30% a 50% jejího výkonu. Z položek vyrobených strojem A je vadných 5%; podobně 3% položek stroje B a 1% stroje C jsou vadné. Pokud je náhodně vybraná položka vadná, jaká je pravděpodobnost, že byla vyrobena strojem C?
Odpovědi lze opět dosáhnout bez použití vzorce použitím podmínek na hypotetický počet případů. Například pokud továrna vyrobí 1 000 položek, 200 bude vyrobeno strojem A, 300 strojem B a 500 strojem C. Stroj A vyrobí 5% × 200 = 10 vadných položek, stroj B 3% × 300 = 9 a stroj C 1% × 500 = 5, celkem 24. Tudíž pravděpodobnost, že strojem C byla vyrobena náhodně vybraná vadná položka, je 5/24 (~ 20,83%).
Tento problém lze vyřešit také pomocí Bayesovy věty: Let Xi označuje událost, že náhodně vybraná položka byla vytvořena i th stroj (pro i = A, B, C). Nechat Y označuje událost, že náhodně vybraná položka je vadná. Poté dostaneme následující informace:
Pokud byla položka vyrobena prvním strojem, pak je pravděpodobnost, že je vadná, 0,05; to je P(Y | XA) = 0,05. Celkově ano
Abychom odpověděli na původní otázku, nejprve najdeme P(Y). To lze provést následujícím způsobem:
Proto je vadných 2,4% z celkového výkonu.
Dostali jsme to Y došlo a chceme vypočítat podmíněnou pravděpodobnost XC. Podle Bayesovy věty,
Vzhledem k tomu, že je položka vadná, je pravděpodobnost, že byla vyrobena strojem C, 5/24. Ačkoli stroj C produkuje polovinu celkového výkonu, produkuje mnohem menší zlomek vadných položek. Proto nám znalost, že vybraná položka byla vadná, umožňuje nahradit předchozí pravděpodobnost P(XC) = 1/2 menší pravděpodobností zezadu P(XC | Y) = 5/24.
Výklady
Výklad Bayesova pravidla závisí na interpretace pravděpodobnosti připisované podmínkám. Níže jsou popsány dva hlavní výklady. Obrázek 2 ukazuje geometrickou vizualizaci podobnou obrázku 1. Gerd Gigerenzer a spoluautoři usilovně prosazovali výuku Bayes Rule tímto způsobem, se zvláštním důrazem na výuku lékařů.[3] Příkladem je webová stránka Willa Kurta „Bayesova věta s legem“, která se později změnila v knihu, Bayesian Statistics the Fun Way: Understanding Statistics and Probability with Star Wars, LEGO, and Rubber Ducks. Zhu a Gigerenzer v roce 2006 zjistili, že zatímco 0% žáků 4., 5. a 6. ročníku může řešit slovní úlohy poté, co byli vyučováni pomocí vzorců, 19%, 39% a 53% by mohli poté, co byli vyučováni pomocí frekvenčních boxů, a že učení byla buď důkladná, nebo nulová.[4]
Bayesovská interpretace
V Bayesiánská (nebo epistemologická) interpretace, pravděpodobnost měří „stupeň víry“. Bayesova věta spojuje míru víry v propozici před a po započítání důkazů. Předpokládejme například, že se s 50% jistotou věří, že u mince je dvakrát větší pravděpodobnost, že přistane hlavou než ocasem. Pokud je mince otočena několikrát a budou pozorovány výsledky, bude tento stupeň víry pravděpodobně stoupat nebo klesat, ale podle výsledků může dokonce zůstat stejný. Pro nabídku A a důkazy B,
- P (A), předchozí, je počáteční stupeň víry v A.
- P (A | B), zadní, je míra víry po začlenění zpráv, které B je pravda.
- kvocient P(B | A)/P(B) představuje podporu B zajišťuje A.
Další informace o použití Bayesovy věty podle Bayesovské interpretace pravděpodobnosti viz Bayesovský závěr.
Častá interpretace
V frekventovaný výklad, pravděpodobnost měří „podíl výsledků“. Předpokládejme například, že je experiment proveden mnohokrát. P(A) je podíl výsledků s majetkem A (předchozí) a P(B) je poměr s majetkem B. P(B | A) je podíl výsledků s majetkem B mimo výsledky s majetkem A, a P(A | B) je podíl osob s A mimo ti sB (zadní).
Role Bayesovy věty je nejlépe vizualizována pomocí stromových diagramů, jako je obrázek 3. Dva diagramy rozdělují stejné výsledky podle A a B v opačném pořadí, abychom získali inverzní pravděpodobnosti. Bayesova věta spojuje různá rozdělení.
Příklad
An entomolog skvrny, které by mohly být kvůli vzoru na zádech vzácné poddruh z brouk. Celých 98% členů vzácného poddruhu má tento vzorec, takže P(Vzor | Vzácné) = 98%. Pouze 5% členů společného poddruhu má vzor. Vzácný poddruh tvoří 0,1% z celkové populace. Jak pravděpodobný je brouk se vzorem vzácný: co je P(Vzácné | Vzor)?
Z rozšířené formy Bayesovy věty (protože každý brouk je vzácný nebo běžný),
formuláře
Události
Jednoduchá forma
Pro události A a B, za předpokladu, že P(B) ≠ 0,
V mnoha aplikacích, například v Bayesovský závěr, událost B je stanovena v diskusi a my bychom chtěli zvážit dopad jejího pozorování na naši víru v různé možné události A. V takové situaci jmenovatel posledního výrazu, pravděpodobnost daného důkazu B, je opraveno; to, co se chceme lišit, je A. Bayesova věta pak ukazuje, že zadní pravděpodobnosti jsou úměrný do čitatele, takže poslední rovnice bude:
- .
Řečeno slovy, posterior je úměrný předchozím časům pravděpodobnosti.[5]
Pokud události A1, A2, ..., se vzájemně vylučují a jsou vyčerpávající, tj. jeden z nich se jistě vyskytne, ale nemohou se vyskytnout dva společně, můžeme určit konstantu proporcionality pomocí skutečnosti, že jejich pravděpodobnosti se musí sčítat k jedné. Například pro danou událost A, událost A sám o sobě a jeho doplněk ¬A jsou exkluzivní a vyčerpávající. Označení konstanty proporcionality pomocí C my máme
Přidáním těchto dvou vzorců to odvodíme
nebo
Alternativní forma
Pozadí Tvrzení | B | ¬B (ne B) | Celkový | |
---|---|---|---|---|
A | P (B | A) · P (A) = P (A | B) · P (B) | P (¬B | A) · P (A) = P (A | ¬B) · P (¬B) | P (A) | |
¬A (ne A) | P (B | ¬A) · P (¬A) = P (¬A | B) · P (B) | P (¬B | ¬A) · P (¬A) = P (¬A | ¬B) · P (¬B) | P (¬A) = 1 − P (A) | |
Celkový | P (B) | P (¬B) = 1 − P (B) | 1 |
Další forma Bayesovy věty pro dvě konkurenční tvrzení nebo hypotézy je:
Pro epistemologický výklad:
Pro nabídku A a důkazy nebo pozadí B,[6]
- je předchozí pravděpodobnost, počáteční stupeň víry v A.
- je odpovídající počáteční stupeň víry v ne-A, že A je nepravdivé, kde
- je podmíněná pravděpodobnost nebo pravděpodobnost, stupeň víry v B vzhledem k tomuto návrhu A je pravda.
- je podmíněná pravděpodobnost nebo pravděpodobnost, stupeň víry v B vzhledem k tomuto návrhu A je nepravdivé.
- je zadní pravděpodobnost, pravděpodobnost A po zohlednění B.
Rozšířená forma
Pro některé často rozdělit {Aj} z ukázkový prostor, prostor události je uveden v termínech P(Aj) a P(B | Aj). Je pak užitečné počítat P(B) za použití zákon celkové pravděpodobnosti:
Ve zvláštním případě, kdy A je binární proměnná:
Náhodné proměnné
Zvažte a ukázkový prostor Ω generovaný dvěma náhodné proměnné X a Y. V zásadě platí pro události Bayesova věta A = {X = X} a B = {Y = y}.
Termíny se však stanou 0 v bodech, kde má každá proměnná konečnou hodnotu hustota pravděpodobnosti. Aby zůstal užitečný, musí být Bayesova věta formulována z hlediska příslušných hustot (viz Derivace ).
Jednoduchá forma
Li X je spojitý a Y je diskrétní,
kde každý je funkce hustoty.
Li X je diskrétní a Y je spojitý,
Pokud obojí X a Y jsou spojité,
Rozšířená forma
Kontinuální prostor událostí je často pojat z hlediska čitatelů. Potom je užitečné eliminovat jmenovatele pomocí zákon celkové pravděpodobnosti. Pro FY(y), stává se integrálem:
Bayesovo pravidlo
Bayesova věta v kurzový formulář je:
kde
se nazývá Bayesův faktor nebo míra pravděpodobnosti. Kurz mezi dvěma událostmi je jednoduše poměr pravděpodobností těchto dvou událostí. Tím pádem
Pravidlo tedy říká, že zadní kurzy jsou předchozí kurzy krát Bayesův faktor, nebo jinými slovy, zadní část je úměrná předchozím časům pravděpodobnosti.
Ve zvláštním případě a , píše jeden a používá podobnou zkratku pro Bayesův faktor a pro podmíněné kurzy. Šance na je podle definice šance pro a proti . Bayesovo pravidlo pak lze napsat ve zkrácené formě
nebo, slovy, zadní šance na se rovná předchozímu kurzu na násobek poměru pravděpodobnosti pro dané informace . Ve zkratce, zadní šance se rovnají předchozím poměrům šancí a pravděpodobnosti.
Derivace
Pro události
Bayesova věta může být odvozena z definice podmíněná pravděpodobnost:
kde je společná pravděpodobnost že A i B jsou pravdivé. Protože
- ,
Pro náhodné proměnné
Pro dva nepřetržité náhodné proměnné X a Y, Bayesova věta může být analogicky odvozena z definice podmíněná hustota:
Proto,
Korespondence s jinými matematickými rámci
Výroková logika
Bayesova věta představuje zobecnění kontrapozice v kterém výroková logika lze vyjádřit jako:
Odpovídající vzorec, pokud jde o počet pravděpodobnosti, je Bayesova věta, která je ve své rozšířené formě vyjádřena jako:
V rovnici nad podmíněná pravděpodobnost zobecňuje logické tvrzení , tj. kromě přiřazení PRAVDA nebo NEPRAVDA můžeme výkazu přiřadit i jakoukoli pravděpodobnost. Termín označuje předchozí pravděpodobnost (aka základní sazba ) z . Předpokládat, že je ekvivalentní k být PRAVDA, a to je ekvivalentní k být FALSE. To je pak snadno vidět když tj. kdy je pravda. To je proto, že takže zlomek na pravé straně výše uvedené rovnice je roven 1, a tedy což odpovídá být PRAVDA. Bayesova věta tedy představuje zobecnění kontrapozice.[7]
Subjektivní logika
Bayesova věta představuje speciální případ podmíněné inverze v subjektivní logika vyjádřeno jako:
kde označuje operátor podmíněné inverze. Argument označuje dvojici binomických podmíněných názorů poskytnutých zdrojem a argument označuje předchozí pravděpodobnost (aka základní sazba ) z . Je označena dvojice obrácených podmíněných názorů . Podmíněné stanovisko zobecňuje pravděpodobnostní podmínku , tj. kromě přiřazení pravděpodobnosti zdroje může k podmíněnému tvrzení přiřadit jakýkoli subjektivní názor . Binomický subjektivní názor je víra v pravdivost tvrzení se stupni epistemické nejistoty, jak je vyjádřeno zdrojem . Každý subjektivní názor má odpovídající předpokládanou pravděpodobnost . Aplikace Bayesovy věty na předpokládané pravděpodobnosti názorů je a homomorfismus, což znamená, že Bayesovu teorém lze vyjádřit z hlediska předpokládaných pravděpodobností názorů:
Subjektivní Bayesova věta tedy představuje zobecnění Bayesovy věty.[8]
Zobecnění
Podmíněná verze
Podmíněná verze Bayesovy věty[9] výsledky přidání třetí události na kterých jsou podmíněny všechny pravděpodobnosti:
Derivace
Za použití řetězové pravidlo
A na druhou stranu
Požadovaný výsledek se získá identifikací výrazů a řešením pro .
Bayesovo pravidlo se 3 událostmi
V případě 3 událostí - A, B a C - lze ukázat, že:
Dějiny
Bayesova věta je pojmenována po reverendovi Thomas Bayes (/beɪz/; 1701? –1761), který nejprve použil podmíněnou pravděpodobnost k poskytnutí algoritmu (jeho Propozice 9), který používá důkazy pro výpočet limitů pro neznámý parametr, publikovaný jako Esej k řešení problému v Nauce o šancích (1763). Studoval, jak vypočítat distribuci pro parametr pravděpodobnosti a binomická distribuce (v moderní terminologii). Bayesův nepublikovaný rukopis významně upravil Richard Price než to bylo posmrtně přečteno v královská společnost. Cena upravena[11] Bayesovo hlavní dílo “Esej k řešení problému v Nauce o šancích "(1763), který se objevil v Filozofické transakce,[12] a obsahuje Bayesovu větu. Price napsal úvod k článku, který poskytuje některé z filozofických základů Bayesovské statistiky. V roce 1765 byl zvolen členem Královské společnosti jako uznání jeho práce na odkazu Bayes.[13][14] V tom, co nazýval scholium, rozšířil Bayes svůj algoritmus na jakoukoli neznámou předchozí příčinu.
Nezávisle na Bayes, Pierre-Simon Laplace v roce 1774 a později v roce 1812 Théorie analytique des probabilités, používá podmíněnou pravděpodobnost k formulaci vztahu aktualizovaného zadní pravděpodobnost z předchozí pravděpodobnosti, podaný důkaz. Reprodukoval a rozšířil Bayesovy výsledky v roce 1774, očividně nevěděl o Bayesově práci.[poznámka 1][15] The Bayesovská interpretace pravděpodobnosti vyvinul hlavně Laplace.[16]
Sir Harold Jeffreys dát Bayesův algoritmus a Laplaceovu formulaci na axiomatický základ, psaní, že Bayesova věta "je k teorii pravděpodobnosti, co Pythagorova věta je geometrie ".[17]
Stephen Stigler použil Bayesiánský argument k závěru, že Bayesovu teorii objevil Nicholas Saunderson, slepý anglický matematik, nějaký čas před Bayesem;[18][19] tento výklad však byl zpochybněn.[20]Martyn Hooper[21] a Sharon McGrayne[22] argumentovali tím Richard Price Příspěvek byl značný:
Podle moderních standardů bychom měli odkazovat na pravidlo Bayes – Price. Price objevil Bayesovu práci, uznal její důležitost, opravil ji, přispěl k článku a našel pro ni využití. Samotná moderní konvence zaměstnávající Bayesovo jméno je nespravedlivá, ale tak zakořeněná, že nic jiného nedává smysl.[22]
Použití v genetice
V genetice lze Bayesovu větu použít k výpočtu pravděpodobnosti, že jedinec bude mít určitý genotyp. Mnoho lidí se snaží přiblížit své šance na ovlivnění genetickým onemocněním nebo jejich pravděpodobnost, že budou nositelem recesivního genu zájmu. Bayesiánskou analýzu lze provést na základě rodinné anamnézy nebo genetického testování, aby bylo možné předpovědět, zda se u jednotlivce vyvine nemoc nebo ji předá svým dětem. Genetické testování a predikce jsou běžnou praxí mezi páry, které plánují mít děti, ale obávají se, že oba mohou být nositeli nemoci, zejména v komunitách s nízkou genetickou variabilitou.[Citace je zapotřebí ]
Prvním krokem Bayesovské analýzy pro genetiku je navrhnout vzájemně se vylučující hypotézy: pro konkrétní alelu je jedinec buď nositelem, nebo není. Dále se vypočítají čtyři pravděpodobnosti: Pravděpodobnost předchozí (pravděpodobnost každé hypotézy s ohledem na informace, jako je rodinná anamnéza nebo předpovědi založené na Mendelově dědičnosti), Podmíněná pravděpodobnost (určitého výsledku), Společná pravděpodobnost (produkt prvních dvou) a Zadní Pravděpodobnost (vážený součin vypočítaný dělením společné pravděpodobnosti pro každou hypotézu součtem obou společných pravděpodobností). Tento typ analýzy lze provést čistě na základě rodinné anamnézy stavu nebo ve shodě s genetickým testováním.[Citace je zapotřebí ]
Pomocí rodokmenu k výpočtu pravděpodobností
Hypotéza | Hypotéza 1: Pacient je nosičem | Hypotéza 2: Pacient není nosičem |
---|---|---|
Předchozí pravděpodobnost | 1/2 | 1/2 |
Podmíněná pravděpodobnost, že všichni čtyři potomci nebudou ovlivněni | (1/2) · (1/2) · (1/2) · (1/2) = 1/16 | Přibližně 1 |
Společná pravděpodobnost | (1/2) · (1/16) = 1/32 | (1/2) · 1 = 1/2 |
Zadní pravděpodobnost | (1/32) / (1/32 + 1/2) = 1/17 | (1/2) / (1/32 + 1/2) = 16/17 |
Příklad Bayesovské analytické tabulky pro riziko ženského onemocnění pro nemoc na základě znalosti, že nemoc je přítomna u jejích sourozenců, ale ne u jejích rodičů nebo u některého z jejích čtyř dětí. Pouze na základě stavu sourozenců a rodičů subjektu je pravděpodobné, že bude přenašečem i nepřenášencem (tato pravděpodobnost je označena předchozí hypotézou). Pravděpodobnost, že by všichni čtyři synové subjektu nebyli ovlivněni, je však 1/16 (½ · ½ · ½ · ½), pokud je nositelkou, přibližně 1, pokud není nositelkou (jedná se o podmíněnou pravděpodobnost). Společná pravděpodobnost spojuje tyto dvě předpovědi jejich vynásobením. Poslední řádek (zadní pravděpodobnost) se vypočítá vydělením společné pravděpodobnosti pro každou hypotézu součtem obou společných pravděpodobností.[23]
Pomocí výsledků genetických testů
Genetické testování rodičů, přestože je stále kontroverzní praxí, dokáže u rodičů detekovat přibližně 90% známých alel onemocnění, které mohou vést k přenosu nebo ovlivnění stavu jejich dítěte. Cystická fibróza je dědičné onemocnění způsobené autozomálně recesivní mutací genu CFTR,[24] nachází se na rameni q chromozomu 7.[25]
Bayesiánská analýza pacientky s rodinnou anamnézou cystické fibrózy (CF), u které byl negativní test na CF, demonstruje, jak byla tato metoda použita k určení jejího rizika narození dítěte s CF:
Protože pacientka není ovlivněna, je buď homozygotní pro alelu divokého typu, nebo heterozygotní. Pro stanovení dřívějších pravděpodobností se používá Punnettův čtverec na základě znalosti, že žádný z rodičů nebyl postižen nemocí, ale oba mohli být nositeli:
Matka Otec | Ž Homozygot pro divočinu | M Heterozygot (nosič CF) |
---|---|---|
Ž Homozygot pro divočinu | WW | MW |
M Heterozygot (nosič CF) | MW | MM (postiženo cystickou fibrózou) |
Vzhledem k tomu, že pacient není ovlivněn, existují pouze tři možnosti. V rámci těchto tří existují dva scénáře, ve kterých pacient nese mutovanou alelu. Předchozí pravděpodobnosti jsou tedy ⅔ a ⅓.
Poté pacient podstoupí genetické testování a negativní testy na cystickou fibrózu. Tento test má 90% míru detekce, takže podmíněné pravděpodobnosti negativního testu jsou 1/10 a 1. Nakonec se vypočítají společné a zadní pravděpodobnosti jako dříve.
Hypotéza | Hypotéza 1: Pacient je nosičem | Hypotéza 2: Pacient není nosičem |
---|---|---|
Předchozí pravděpodobnost | 2/3 | 1/3 |
Podmíněná pravděpodobnost negativního testu | 1/10 | 1 |
Společná pravděpodobnost | 1/15 | 1/3 |
Zadní pravděpodobnost | 1/6 | 5/6 |
Po provedení stejné analýzy na pacientově mužském partnerovi (s negativním výsledkem testu) se šance na postižení jejich dítěte rovnají součinu příslušných zadních pravděpodobností rodičů, že budou nositeli, krát šance, že dva nositelé vytvoří postižený potomek (¼).
Genetické testování prováděno souběžně s identifikací dalších rizikových faktorů.
Bayesiánskou analýzu lze provést pomocí fenotypových informací souvisejících s genetickým stavem a v kombinaci s genetickým testováním se tato analýza stává mnohem komplikovanější. Například cystická fibróza může být u plodu identifikována pomocí ultrazvuku, který hledá echogenní střevo, což znamená ten, který se na skenování jeví jasnější než obvykle2. Nejedná se o spolehlivý test, protože u dokonale zdravého plodu může být přítomno echogenní střevo. Rodičovské genetické testování je v tomto případě velmi vlivné, kde fenotypový aspekt může mít příliš velký vliv na výpočet pravděpodobnosti. V případě plodu s echogenním střevem, u matky, která byla testována a je známo, že je nositelkou CF, je zadní pravděpodobnost, že plod skutečně má toto onemocnění, velmi vysoká (0,64). Jakmile však otec negativně testuje na CF, zadní pravděpodobnost významně klesá (na 0,16).[23]
Výpočet rizikových faktorů je mocným nástrojem v genetickém poradenství a reprodukčním plánování, nelze jej však považovat za jediný důležitý faktor, který je třeba vzít v úvahu. Jak je uvedeno výše, neúplné testování může přinést falešně vysokou pravděpodobnost stavu dopravce a testování může být finančně nepřístupné nebo neproveditelné, pokud není přítomen rodič.
Viz také
- Indukční pravděpodobnost
- Kvantový bayesianismus
- Proč jsou většina zveřejněných zjištění výzkumu nepravdivá
Poznámky
- ^ Laplace v průběhu desetiletí vylepšil Bayesovu větu:
- Laplace oznámil svůj nezávislý objev Bayesovy věty v: Laplace (1774) „Mémoire sur la pravděpodobnosti příčin par les événements,“ „Mémoires de l'Académie royale des Sciences de MI (Savants étrangers),“ 4: 621–656. Přetištěno v: Laplace, „Oeuvres complètes“ (Paříž, Francie: Gauthier-Villars et fils, 1841), sv. 8, s. 27–65. Dostupné online na: Gallica. Bayesova věta se objevuje na str. 29.
- Laplace představil zdokonalení Bayesovy věty v: Laplace (přečteno: 1783 / publikováno: 1785) „Mémoire sur les aproximations des formules qui sont fonctions de très grands nombres,“ „Mémoires de l'Académie royale des Sciences de Paris,“ 423 –467. Přetištěno v: Laplace, „Oeuvres complètes“ (Paříž, Francie: Gauthier-Villars et fils, 1844), sv. 10, str. 295–338. Dostupné online na: Gallica. Bayesova věta je uvedena na straně 301.
- Viz také: Laplace, „Essai philosophique sur les probabilités“ (Paříž, Francie: Mme. Ve. Courcier [Madame veuve (tj. Vdova) Courcier], 1814), strana 10. Anglický překlad: Pierre Simon, markýz de Laplace s F. W. Truscottem a F. L. Emorym, trans., „A Philosophical Essay on Probabilities“ (New York, New York: John Wiley & Sons, 1902), strana 15.
Reference
- ^ Joyce, James (2003), „Bayesova věta“, ve Zalta, Edward N. (ed.), Stanfordská encyklopedie filozofie (Jaro 2019 ed.), Metaphysics Research Lab, Stanford University, vyvoláno 2020-01-17
- ^ Stuart, A .; Ord, K. (1994), Kendallova pokročilá teorie statistiky: Svazek I - teorie distribuce, Edward Arnold, §8.7
- ^ Gigerenzer, Gerd; Hoffrage, Ulrich (1995). "How to improve Bayesian reasoning without instruction: Frequency formats". Psychologický přehled. 102 (4): 684–704. CiteSeerX 10.1.1.128.3201. doi:10.1037/0033-295X.102.4.684.
- ^ Zhu, Liqi; Gigerenzer, Gerd (January 2006). "Children can solve Bayesian problems: the role of representation in mental computation". Poznání. 98 (3): 287–308. doi:10.1016/j.cognition.2004.12.003. hdl:11858/00-001M-0000-0024-FEFD-A. PMID 16399266.
- ^ Lee, Peter M. (2012). "Kapitola 1". Bayesian Statistics. Wiley. ISBN 978-1-1183-3257-3.
- ^ "Bayes' Theorem: Introduction". Trinity University. Archivovány od originál on 21 August 2004. Citováno 5. srpna 2014.
- ^ Audun Jøsang, 2016, Subjective Logic; A formalism for Reasoning Under Uncertainty. Springer, Cham, ISBN 978-3-319-42337-1
- ^ Audun Jøsang, 2016, Generalising Bayes' Theorem in Subjective Logic. IEEE International Conference on Multisensor Fusion and Integration for Intelligent Systems (MFI 2016), Baden-Baden, September 2016
- ^ Koller, D.; Friedman, N. (2009). Pravděpodobnostní grafické modely. Massachusetts: MIT Press. p. 1208. ISBN 978-0-262-01319-2. Archivovány od originál on 2014-04-27.
- ^ Graham Kemp (https://math.stackexchange.com/users/135106/graham-kemp ), Bayes' rule with 3 variables, URL (version: 2015-05-14): https://math.stackexchange.com/q/1281558
- ^ Allen, Richard (1999). David Hartley on Human Nature. SUNY Stiskněte. pp. 243–4. ISBN 978-0-7914-9451-6. Citováno 16. června 2013.
- ^ Bayes, Thomas & Price, Richard (1763). "An Essay towards solving a Problem in the Doctrine of Chance. By the late Rev. Mr. Bayes, communicated by Mr. Price, in a letter to John Canton, A. M. F. R. S." (PDF). Filozofické transakce Královské společnosti v Londýně. 53: 370–418. doi:10.1098 / rstl.1763.0053. Archivovány od originál (PDF) on 2011-04-10. Citováno 2003-12-27.
- ^ Holland, pp. 46–7.
- ^ Price, Richard (1991). Price: Political Writings. Cambridge University Press. p. xxiii. ISBN 978-0-521-40969-8. Citováno 16. června 2013.
- ^ Daston, Lorraine (1988). Classical Probability in the Enlightenment. Princeton Univ Press. p. 268. ISBN 0-691-08497-1.
- ^ Stigler, Stephen M. (1986). "Inverse Probability". The History of Statistics: The Measurement of Uncertainty Before 1900. Harvard University Press. pp. 99–138. ISBN 978-0-674-40341-3.
- ^ Jeffreys, Harold (1973). Scientific Inference (3. vyd.). Cambridge University Press. p.31. ISBN 978-0-521-18078-8.
- ^ Stigler, Stephen M. (1983). "Who Discovered Bayes' Theorem?". Americký statistik. 37 (4): 290–296. doi:10.1080/00031305.1983.10483122.
- ^ de Vaux, Richard; Velleman, Paul; Bock, David (2016). Stats, Data and Models (4. vydání). Pearson. 380–381. ISBN 978-0-321-98649-8.
- ^ Edwards, A. W. F. (1986). "Is the Reference in Hartley (1749) to Bayesian Inference?". Americký statistik. 40 (2): 109–110. doi:10.1080/00031305.1986.10475370.
- ^ Hooper, Martyn (2013). "Richard Price, Bayes' theorem, and God". Význam. 10 (1): 36–39. doi:10.1111/j.1740-9713.2013.00638.x. S2CID 153704746.
- ^ A b McGrayne, S. B. (2011). The Theory That Would Not Die: How Bayes' Rule Cracked the Enigma Code, Hunted Down Russian Submarines & Emerged Triumphant from Two Centuries of Controversy. Yale University Press. ISBN 978-0-300-18822-6.
- ^ A b Ogino, Shuji; Wilson, Robert B; Gold, Bert; Hawley, Pamela; Grody, Wayne W (October 2004). "Bayesian analysis for cystic fibrosis risks in prenatal and carrier screening". Genetika v medicíně. 6 (5): 439–449. doi:10.1097/01.GIM.0000139511.83336.8F. PMID 15371910.
- ^ "Types of CFTR Mutations". Cystic Fibrosis Foundation, www.cff.org/What-is-CF/Genetics/Types-of-CFTR-Mutations/.
- ^ "CFTR Gene – Genetics Home Reference". U.S. National Library of Medicine, National Institutes of Health, ghr.nlm.nih.gov/gene/CFTR#location.
Další čtení
- Grunau, Hans-Christoph (24 January 2014). "Preface Issue 3/4-2013". Jahresbericht der Deutschen Mathematiker-Vereinigung. 115 (3–4): 127–128. doi:10.1365/s13291-013-0077-z.
- Gelman, A, Carlin, JB, Stern, HS, and Rubin, DB (2003), "Bayesian Data Analysis," Second Edition, CRC Press.
- Grinstead, CM and Snell, JL (1997), "Introduction to Probability (2nd edition)," American Mathematical Society (free pdf available) [1].
- "Bayes formula", Encyclopedia of Mathematics, Stiskněte EMS, 2001 [1994]
- McGrayne, SB (2011). The Theory That Would Not Die: How Bayes' Rule Cracked the Enigma Code, Hunted Down Russian Submarines & Emerged Triumphant from Two Centuries of Controversy. Yale University Press. ISBN 978-0-300-18822-6.
- Laplace, Pierre Simon (1986). "Memoir on the Probability of the Causes of Events". Statistická věda. 1 (3): 364–378. doi:10.1214/ss/1177013621. JSTOR 2245476.
- Lee, Peter M (2012), "Bayesian Statistics: An Introduction," 4th edition. Wiley. ISBN 978-1-118-33257-3.
- Puga JL, Krzywinski M, Altman N (31 March 2015). "Bayes' theorem". Přírodní metody. 12 (4): 277–278. doi:10.1038/nmeth.3335. PMID 26005726.
- Rosenthal, Jeffrey S (2005), "Struck by Lightning: The Curious World of Probabilities". HarperCollins. (Granta, 2008. ISBN 9781862079960).
- Stigler, Stephen M. (August 1986). "Laplace's 1774 Memoir on Inverse Probability". Statistická věda. 1 (3): 359–363. doi:10.1214/ss/1177013620.
- Stone, JV (2013), download chapter 1 of "Bayes' Rule: A Tutorial Introduction to Bayesian Analysis", Sebtel Press, England.
- Bayesian Reasoning for Intelligent People, An introduction and tutorial to the use of Bayes' theorem in statistics and cognitive science.
- Morris, Dan (2016), Read first 6 chapters for free of "Bayes' Theorem Examples: A Visual Introduction For Beginners " Blue Windmill ISBN 978-1549761744. A short tutorial on how to understand problem scenarios and find P(B), P(A), and P(B|A).
externí odkazy
- Bayesova věta na Encyklopedie Britannica
- The Theory That Would Not Die by Sharon Bertsch McGrayne New York Times Book Review by John Allen Paulos dne 5. srpna 2011
- Visual explanation of Bayes using trees (video)
- Bayes' frequentist interpretation explained visually (video)
- Earliest Known Uses of Some of the Words of Mathematics (B). Contains origins of "Bayesian", "Bayes' Theorem", "Bayes Estimate/Risk/Solution", "Empirical Bayes", and "Bayes Factor".
- Weisstein, Eric W. "Bayes' Theorem". MathWorld.
- Bayesova věta na PlanetMath.
- Bayes Theorem and the Folly of Prediction
- A tutorial on probability and Bayes' theorem devised for Oxford University psychology students
- An Intuitive Explanation of Bayes' Theorem by Eliezer S. Yudkowsky
- Online demonstrator of the subjective Bayes' theorem