BRMS1 - BRMS1

BRMS1
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	2XUS, 4AUV
Identifikátory
Aliasy	BRMS1, supresor 1 metastázy rakoviny prsu, transkripční represor a regulátor anoikis, BRMS1 transkripční represor a regulátor anoikis
Externí ID	OMIM: 606259 MGI: 2388804 HomoloGene: 32260 Genové karty: BRMS1
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 11 (lidský)
Konec	66,345,125 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 19 (myš)
Konec	5,049,917 bp
Exprese RNA vzor
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• vazba histon-deacetylázy; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • Vazba NF-kappaB; • aktivita histon-deacetylázy;
Buněčná složka	• cytoplazma; • Komplex typu Sin3; • buněčné jádro; • nukleoplazma;
Biologický proces	• pozitivní regulace deacetylace bílkovin; • pozitivní regulace anoikis; • negativní regulace transkripce, chráněná DNA; • negativní regulace aktivity transkripčního faktoru NF-kappaB; • negativní regulace transkripce z promotoru RNA polymerázy II; • histonová deacetylace; • regulace transkripce, DNA-šablony; • transkripce, chráněná DNA; • apoptotický proces; • regulace apoptotického procesu;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	25855
	107392
	ENSG00000174744
	ENSMUSG00000080268
	Q9HCU9
	Q99N20
	NM_015399; NM_001024957; NM_001024958
	NM_134155; NM_001374047; NM_001374048
	NP_001020128; NP_056214
	NP_598916; NP_001360976; NP_001360977
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Rakovina prsu supresor metastáz 1 je protein že v lidé je kódován BRMS1 gen.^[5]^[6]

Tento gen snižuje metastazující potenciál, ale nikoli tumorogenita, lidského karcinomu prsu a melanom buněčné linie.^[7] Protein kódovaný tímto genem se lokalizuje primárně na jádro, a je součástí rodiny mSin3a histon deacetyláza komplexy (HDAC). Protein obsahuje dva svinutá cívka motivy a několik nedokonalých leucin motivy zipu. Alternativní sestřih výsledky ve dvou přepis varianty kódování různé izoformy.^[6]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000174744 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000080268 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Seraj MJ, Samant RS, Verderame MF, Welch DR (červen 2000). „Funkční důkaz pro nový supresor metastáz lidského karcinomu prsu, BRMS1, kódovaný na chromozomu 11q13“. Výzkum rakoviny. 60 (11): 2764–9. PMID 10850410.
^ ^A ^b "Entrez Gene: BRMS1 potlačující metastázy rakoviny prsu 1".
^ Vědci z Penn State našli gen potlačující metastázy v rakovině prsu

externí odkazy

Člověk BRMS1 umístění genomu a BRMS1 stránka s podrobnostmi o genu v UCSC Genome Browser.

Další čtení

Meehan WJ, Welch DR (2003). "Supresor 1 metastázy rakoviny prsu: aktualizace". Clin. Exp. Metastáza. 20 (1): 45–50. doi:10.1023 / A: 1022542519586. PMID 12650606. S2CID 26142383.
Bonaldo MF, Lennon G, Soares MB (1997). „Normalizace a odčítání: dva přístupy k usnadnění objevování genů“. Genome Res. 6 (9): 791–806. doi:10,1101 / gr. 6.9.791. PMID 8889548.
Samant RS, Debies MT, Shevde LA a kol. (2002). "Identifikace a charakterizace myšího ortologu (brms1) supresoru 1 metastáz rakoviny prsu (BRMS1)". Int. J. Cancer. 97 (1): 15–20. doi:10.1002 / ijc.1569. PMID 11774238. S2CID 19747938.
Shevde LA, Samant RS, Goldberg SF a kol. (2002). „Suprese metastáz lidského melanomu genem potlačujícím metastázy, BRMS1“. Exp. Cell Res. 273 (2): 229–39. doi:10.1006 / excr.2001.5452. PMID 11822878.
Janneau JL, Maldonado-Estrada J, Tachdjian G a kol. (2002). "Transkripční exprese genů zapojených do buněčné invaze a migrace normálními a nádorovými trofoblastovými buňkami". J. Clin. Endokrinol. Metab. 87 (11): 5336–9. doi:10.1210 / jc.2002-021093. PMID 12414911.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH a kol. (2003). „Generování a počáteční analýza více než 15 000 lidských a myších cDNA sekvencí plné délky“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA 99 (26): 16899–903. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
Meehan WJ, Samant RS, Hopper JE a kol. (2004). „Supresor 1 metastázy rakoviny prsu (BRMS1) tvoří komplexy s proteinem vázajícím retinoblastom 1 (RBP1) a komplexem histon-deacetylázy mSin3 a potlačuje transkripci.“. J. Biol. Chem. 279 (2): 1562–9. doi:10,1074 / jbc.M307969200. PMID 14581478.
Cicek M, Samant RS, Kinter M a kol. (2004). „Identifikace proteinů asociovaných s metastázami pomocí proteinové analýzy metastatických buněk MDA-MB-435 a buněk MDA-MB-435 transfektovaných s potlačením metastáz“. Clin. Exp. Metastáza. 21 (2): 149–57. doi:10.1023 / B: CLIN.0000024729.19084.f0. PMID 15168732. S2CID 19383717.
Nikolaev AY, Papanikolaou NA, Li M a kol. (2004). "Identifikace nového BRMS1-homologního proteinu p40 jako složky komplexu mSin3A / p33 (ING1b) / HDAC1 deacetylázy". Biochem. Biophys. Res. Commun. 323 (4): 1216–22. doi:10.1016 / j.bbrc.2004.08.227. PMID 15451426.
Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA a kol. (2004). „Stav, kvalita a rozšíření projektu cDNA NIH v plné délce: Sbírka genů savců (MGC)“. Genome Res. 14 (10B): 2121–7. doi:10,1101 / gr. 2596504. PMC 528928. PMID 15489334.
Stark AM, Tongers K, Maass N a kol. (2005). "Snížená exprese mRNA genu potlačujícího metastázy v mozkových metastázách rakoviny prsu". J. Cancer Res. Clin. Oncol. 131 (3): 191–8. doi:10.1007 / s00432-004-0629-9. PMID 15592684. S2CID 12411341.
DeWald DB, Torabinejad J, Samant RS a kol. (2005). „Potlačení metastáz potlačujícím 1 metastázu rakoviny prsu zahrnuje redukci signalizace fosfoinositidu v buňkách karcinomu prsu MDA-MB-435“. Cancer Res. 65 (3): 713–7. PMID 15705865.
Cicek M, Fukuyama R, Welch DR a kol. (2005). „Supresor 1 metastázování rakoviny prsu inhibuje genovou expresi zaměřením na aktivitu nukleárního faktoru-kappaB“. Cancer Res. 65 (9): 3586–95. doi:10.1158 / 0008-5472.CAN-04-3139. PMID 15867352.
Hurst DR, Mehta A, Moore BP a kol. (2006). „Supresor 1 metastázy rakoviny prsu (BRMS1) je stabilizován chaperonem Hsp90“. Biochem. Biophys. Res. Commun. 348 (4): 1429–35. doi:10.1016 / j.bbrc.2006.08.005. PMC 1557677. PMID 16919237.
Samant RS, Clark DW, Fillmore RA a kol. (2007). „Supresor 1 metastázy rakoviny prsu (BRMS1) inhibuje transkripci osteopontinu zrušením aktivace NF-kB“. Mol. Rakovina. 6: 6. doi:10.1186/1476-4598-6-6. PMC 1796551. PMID 17227585.
Rivera J, Megias D, Bravo J (2007). „Strategie založená na proteomice k vymezení molekulárních mechanismů genu pro potlačování metastáz BRMS1“. J. Proteome Res. 6 (10): 4006–18. doi:10.1021 / pr0703167. PMID 17854218.

Tento článek o gen na lidský chromozom 11 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000174744 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000080268 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid10850410-5] Seraj MJ, Samant RS, Verderame MF, Welch DR (červen 2000). „Funkční důkaz pro nový supresor metastáz lidského karcinomu prsu, BRMS1, kódovaný na chromozomu 11q13“. Výzkum rakoviny. 60 (11): 2764–9. PMID 10850410.

[entrez-6] A ^b "Entrez Gene: BRMS1 potlačující metastázy rakoviny prsu 1".

[7] Vědci z Penn State našli gen potlačující metastázy v rakovině prsu

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]