BH11960 - BH11960
 | tento článek ne uvést žádný Zdroje. (Srpna 2019) (Zjistěte, jak a kdy odstranit tuto zprávu šablony) |
Bartonella henselae hypotetický protein 11960 (BH11960) je kódován BH11960 gen. Tento hypotetický protein je zachována ve všech Bartonella druhy, jejichž genomy jsou seřazeny doposud a jsou zvýrazněny na následujícím obrázku.
Vlastnosti
| Nukleotidy | 2085 |
| Aminokyseliny | 934 |
| Pozice zapnuta genom | 1328993-1331797 |
| Molekulární váha | 104093.4 |
| Motivy | Aerotolerance N-svorka regulátoru (E-hodnota 5,3e-17) |
| Isoelektrický bod | 9.23 |
| AA složení | 14.2% leucin |
| Odhadovaný poločas rozpadu | > 10 hodin E-coli, in vivo, 30 hodin u savců retikulocyty |
| Index nestability | 41,68 nestabilní |
"Hypotetický protein BH11960 (Bartonella henselaei str. Houston-1".) [1].
Funkce
Funkce proteinu BH11960 není známa. Předpokládá se však, že je zahrnuta jeho funkce signální transdukce který reguluje aerotoleranci ve spojení s ostatními geny v jeho klastru. Důkazy pro takovou funkci jsou následující:
- Přítomnost PRKEL signální peptid doména na N-konec bílkovin na všech ortology.
- Přítomnost proteinu rodiny MoxR-AAA ve čtyřech genový shluk o kterém se předpokládá, že bude sloužit jako a garde.
- Hypotéza: Signální peptid PRKEL umožňuje štěpení N-terminálního regulátoru aerotolerance, který se uvolňuje do cytoplazma a složený interagujícím chaperonem. Tento štěpený a upravený protein slouží jako senzor pro kyslík změny koncentrace a mohou pokračovat v interakci s jinými částmi buňky k vyvolání mechanismu reakce.
Sekvence proteinů
Význam tohoto proteinu spočívá na začátku sekvence a je představen v níže uvedeném koncepčním překladu. Tato oblast obsahuje aerotoleranční motiv, transmembránu hydrofobní segment zvýrazněný žlutě a oblast vysoké ochrany zastoupená ve všech studovaných ortologech. Kromě toho je v této oblasti přítomen signální peptidový protein, který umožňuje transport proteinu.
Na základě sekvenční analýza provádí program PSortB, tento protein se nachází v cytoplazmatická membrána z toho gramnegativní bakterie a obsahuje dvojitou transmembránovou doménu.
Genové sousedství
Čtyři genové shluky BH11940, BH11950, BH11960 a BH11970 jsou všechny proteiny neznámé funkce transkribované na sense strand a kódováno stejným způsobem promotér. Promotor je všudypřítomně konzervován u ostatních druhů Bartonella a obsahuje a TATA box.BH11960 je největší ze čtyř proteinů.
Bartonella henselae: BH11960 “. Databáze KEGG. [2].
Homology
| Rod / druh | Genové jméno | Přístupové číslo | Délka sekvence | Sekvenční podobnost |
|---|---|---|---|---|
| Bartonella henselae | Hypotetický protein | BX897699.1 | 2805nt / 934aa | 100 |
| Bartonella quintana | Hypotetický protein | BX897700.1 | 2805nt / 934aa | 91 |
| Bartonella grahamii | Regulátor transkripce | CP001562.1 | 2799nt / 932aa | 87 |
| Bartonella tribocorum | Alanyl-tRNA syntetáza | AM260525.1 | 2799nt / 932aa | 87 |
| Methylobacterium nodulans | Hypotetický protein | YP_002500318.1 | 2820nt / 939aa | 53 |
| Nitrobacter hamburgensis | Dvojitá transmembránová oblast jako | YP_578448.1 | 2817nt / 938aa | 53 |
| Hyphomicrobium denitrificans | Konzervovaný hypotetický protein | ZP_05374729.1 | 2973nt / 990aa | 53 |
| Rhodopseudomonas palustris | Dvojitá transmembránová oblast jako | YP_568432.1 | 2826nt / 941aa | 54 |
| Hoeflea phototrophica | Dvojitá transmembránová oblast jako | YP_002289983.1 | 1832nt / 943aa | 55 |
| Oceanicola batsensis | hypotetický protein OB2597_11306 | ZP_00998791.1 | 2771nt / 923aa | 48 |
Další čtení
- Aslmark, C.M., et al. 2004. Lidský patogen přenášený veš Bartonella Quintana je genomický derivát zoonotického původce Bartonella henselae. Prohlášení Národní akademie věd. 26: 9716-9721.