ATUM - ATUM - Wikipedia

ATUM
TypSoukromé
PrůmyslBiotechnologie
Založený2003
ZakladateléSridhar Govindarajan, Claes Gustafsson, Jeremy Minshull, Jon Ness
Hlavní sídlo
Newark, Kalifornie
,
Spojené státy
produktyGenová syntéza, Proteinové inženýrství, Produkce bílkovin, Bioinformatika, Vývoj buněčných linií, Leap-In transpozázy

ATUM je Američan biotechnologie společnost, která poskytuje nástroje pro biologické vědy, od návrhu a syntézy optimalizované DNA až po produkci proteinů a vývoj buněčných linií GMP.

Společnost

ATUM (dříve DNA2.0) byla založena v roce 2003 v Menlo Park, Kalifornie. Společnost je v soukromém vlastnictví[1] a nadále má veškerý výzkum, vývoj a výrobu v Kalifornii, v současné době v jejich 50 000 čtverečních stopách v Newarku.[2] Začalo to a pokračuje jako genová syntéza a proteinové inženýrství poskytovatel pro akademickou sféru, vládu a farmaceutický, chemický, zemědělský a biotechnologický průmysl. Gene Synthesis rychle nahradil molekulární klonování pro mnoho akademických a podnikových laboratoří, jako „slévárny pro věk biotechnologie“ umožňující geny na zakázku pro biologický výzkum.[3]

DNA2.0 byl uveden na PBS ukázat Nova ScienceNow[4] ukázat, jak se v laboratoři syntetizují geny. V roce 2008 společnost dodala část úseků DNA použitých k vytvoření syntetické bakterie genom.[5]

Dan Rather Reports zahrnuty DNA2.0 do své epizody dne Syntetická biologie[6] a jak řeší „některé z nejdůležitějších problémů, kterým svět čelí“.[6]

V roce 2009, Vědec pojmenoval algoritmy návrhu kodonu[7] (nyní pod ochrannou známkou jako GeneGPS) vyvinutá společností DNA2.0 jako jedna z 10 nejlepších inovací roku pro vědy o životě.[8] Společnost ATUM vyvinula univerzální systém Electra Vector System klonování systém, který využívá typ IIS restrikční enzym SapI a T4 DNA ligáza v reakci s jednou trubicí.[9] ATUM zpřístupnil některé molekulární komponenty, jako jsou syntetické fluorescenční proteiny, v otevřených sbírkách částí DNA (Nadace BioBricks ).[10] Atum je zakládajícím členem International Gene Synthesis Consortium (IGSC) na podporu biologické bezpečnosti v průmyslu genové syntézy.[11][12] Existuje více než 1200[13] publikované vědecké články využívající produkty a / nebo služby DNA2.0, z toho 44[14] zahrnout zaměstnance společnosti jako autory.

Výzkumné nástroje

Partnerství

  • The Perelman School of Medicine na University of Pennsylvania využije technologii GeneGPS vyvinutou společností ATUM především k podpoře prací na programu genové terapie HIV-1 vývoj vakcíny optimalizací in vivo exprese proteinu.[20][21]
  • Centrum pro výzkum infekcí a imunity v St. George’s, University of London a Atum uzavřely partnerství při vývoji rostlinných léčiv.[22]
  • Adimab LLC. a ATUM zaměstnávají alianci v oblasti protilátka objev a biologická výroba prostřednictvím designu a konstrukce knihoven protilátek.
  • Cytovance Biologics využívá GeneGPS od ATUM jako součást svého Keystone Expression System pro vývoj mikrobiálních kmenů pro úspěšnou biovýrobu.
  • Archer Daniels Midland Company aplikuje na ADM patentovanou technologii proteinového inženýrství ATUM, ProteinGPS průmyslový enzym inženýrské procesy.[23]
  • ATUM je sponzorem BioBuilder, zdroje pro praktické aktivity a informativní animace o syntetické biologii pro studenty a učitele středních a středních škol; založil Dr. Natalie Kuldell na MIT.

Reference

  1. ^ Duan, Mary (18. října 2009). „Genová syntéza: není to žádný kmen pro DNA 2.0“. Obchodní deník Silicon Valley. San Jose, CA.
  2. ^ „DNA2.0 staví nejmodernější bioprodukční zařízení v Newarku v Kalifornii“. MercuryNews.com. San Jose Mercury News. Citováno 22. března 2016.
  3. ^ Pollack (12. září 2007). „Jak se vám líbí vaše geny? Biofabs přijímají objednávky“. The New York Times. New York.
  4. ^ "Umělý život". Nova ScienceNow. 18. října 2005. PBS.
  5. ^ Pollack (24. ledna 2008). „Vědci učinili nový krok směrem k člověkem vytvořenému životu“. The New York Times. New York.
  6. ^ A b „Ostří“. Dan Rather Reports. 30.dubna 2013. AXS TV.
  7. ^ Welch; Govindarajan; Ness; Villalobos; Gurney; Minshull; Gustafsson (14. září 2009). "Konstrukční parametry pro kontrolu exprese syntetického genu v Escherichia coli". PLOS ONE. 4 (9): e7002. doi:10,1371 / journal.pone.0007002. PMC  2736378. PMID  19759823.
  8. ^ „Top 10 inovací roku 2009“. Vědec. 23 (12): 41–52. 1. prosince 2009.
  9. ^ Whitman; Gore; Ness; Theodorou; Minshull (červen 2013), „Rychlé klonování genových fragmentů bez jizev pomocí SapI, T4 DNA ligázy a DNA2.0 Electra Vector System“ (PDF), NEB výrazy, II: 8
  10. ^ Ledford, Heidi (4. července 2013). „Bioinženýři hledají více než patenty“. Příroda. Macmillan Publishers Limited. 499: 16–17. doi:10.1038 / 499016a. PMID  23823774.
  11. ^ Hayden, Erika Check (18. listopadu 2009). „Tvůrci genů tvoří bezpečnostní koalici“. Příroda. doi:10.1038 / novinky.2009.1095.
  12. ^ „Firmy vyrábějící genovou syntézu nastavily protokol biologické bezpečnosti“, Novinky z genetického inženýrství a biotechnologie, 18. listopadu 2009
  13. ^ "Hledat v databázi literatury". 29.dubna 2016.
  14. ^ "Přidružení autora vyhledávání v databázi literatury: DNA2.0". 29.dubna 2016.
  15. ^ Villalobos, Alan; Ness, Jon E; Gustafsson, Claes; Minshull, Jeremy; Govindarajan, Sridhar (2006). „Gene Designer: Syntetický biologický nástroj pro konstrukci segmentů umělé DNA“. BMC bioinformatika. 7: 285. doi:10.1186/1471-2105-7-285. PMC  1523223. PMID  16756672.
  16. ^ Villalobos, Alan; Welch, Mark; Minshull, Jeremy (2012). „In Silico Design of Functional DNA Constructs“. Genová syntéza. Metody v molekulární biologii. 852: 197–213. doi:10.1007/978-1-61779-564-0_15. ISBN  978-1-61779-563-3. PMID  22328435.
  17. ^ Welch, M; Villalobos, A; Gustafsson, C; Minshull, J (2011). "Navrhování genů pro úspěšnou expresi proteinů". Metody v enzymologii. 498: 43–66. doi:10.1016 / B978-0-12-385120-8.00003-6. PMID  21601673.
  18. ^ Dance, Amber (1. července 2012). „Mover Over, matka příroda“. Vědec.
  19. ^ "Nejlepší na webu". Novinky z genetického inženýrství. 15. dubna 2007.
  20. ^ „Optimalizace genové exprese pomocí technologie DNA2.0“. GEN. 14. listopadu 2012.
  21. ^ McEnery, Regina (4. února 2013), „Dodání DNA“, VAX: Bulletin o výzkumu vakcín proti AIDS, 11 (1), archivovány od originál 29. listopadu 2014, vyvoláno 19. listopadu 2014
  22. ^ Cohen, Bryan (24. prosince 2013). „DNA2.0 ohlašuje biofarmaceutické partnerství se společností St. George's“. Novinky o vakcínách.
  23. ^ „ADM a DNA2.0 uzavírají dohodu o přístupu a službách v oblasti technologie proteinového inženýrství“. San Jose Mercury News. San Jose, CA. 17. listopadu 2014.