Asporin - Asporin

ASPN
Identifikátory
Aliasy	ASPN, OS3, PLAP-1, PLAP1, SLRR1C, asporin
Externí ID	OMIM: 608135 MGI: 1913945 HomoloGene: 32357 Genové karty: ASPN
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 9 (lidský)
Konec	92,482,506 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 13 (myš)
Konec	49,567,565 bp
Exprese RNA vzor
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• vazba iontů vápníku; • aktivita inhibitoru proteinkinázy; • vazba kolagenu; • strukturní složka extracelulární matrice udělující kompresní odolnost;
Buněčná složka	• cytoplazma; • extracelulární matrix; • extracelulární oblast; • extracelulární matrix obsahující kolagen;
Biologický proces	• mineralizace kostí; • vývoj biominerální tkáně; • negativní regulace signální dráhy receptoru beta transformujícího růstového faktoru; • negativní regulace mineralizace zubů; • negativní regulace aktivity proteinkinázy; • cytokiny zprostředkovanou signální cestu; • negativní regulace kaskády JAK-STAT;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	54829
	66695
	ENSG00000106819
	ENSMUSG00000021388
	Q9BXN1
	Q99MQ4
	NM_017680; NM_001193335
	NM_001172481; NM_025711
	NP_001180264; NP_060150
	NP_001165952; NP_079987
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Asporin je protein že u lidí je kódován ASPN gen.^[5]

Funkce

ASPN patří do rodiny opakování bohaté na leucin (LRR) proteiny spojené s chrupavkovou matricí. Název asporin odráží jedinečný aspartát -rich N terminus a celková podobnost s dekor (MIM 125255) (Lorenzo et al., 2001).^[5]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000106819 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000021388 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ ^A ^b „Entrez Gene: ASPN asporin“.

externí odkazy

Člověk ASPN umístění genomu a ASPN stránka s podrobnostmi o genu v UCSC Genome Browser.

Další čtení

Lorenzo P, Aspberg A, Onnerfjord P, Bayliss MT, Neame PJ, Heinegard D (duben 2001). „Identifikace a charakterizace asporinu. Nový člen rodiny opakovaných proteinů bohatých na leucin, která úzce souvisí s dekrinem a biglykanem“. The Journal of Biological Chemistry. 276 (15): 12201–11. doi:10,1074 / jbc.M010932200. PMID 11152692.
Henry SP, Takanosu M, Boyd TC, Mayne PM, Eberspaecher H, Zhou W, de Crombrugghe B, Hook M, Mayne R (duben 2001). „Expresní vzorec a genová charakterizace asporinu. Nově objevený člen rodiny proteinů opakujících se proteinů bohatých na leucin“. The Journal of Biological Chemistry. 276 (15): 12212–21. doi:10,1074 / jbc.M011290200. PMID 11152695.
Yamada S, Murakami S, Matoba R, Ozawa Y, Yokokoji T, Nakahira Y, Ikezawa K, Takayama S, Matsubara K, Okada H (září 2001). "Expresní profil aktivních genů v lidském periodontálním vazu a izolace PLAP-1, nového genu rodiny SLRP". Gen. 275 (2): 279–86. doi:10.1016 / S0378-1119 (01) 00683-7. PMID 11587855.
Clark HF, Gurney AL, Abaya E, Baker K, Baldwin D, Brush J, Chen J, Chow B, Chui C, Crowley C, Currell B, Deuel B, Dowd P, Eaton D, Foster J, Grimaldi C, Gu Q , Hass PE, Heldens S, Huang A, Kim HS, Klimowski L, Jin Y, Johnson S, Lee J, Lewis L, Liao D, Mark M, Robbie E, Sanchez C, Schoenfeld J, Seshagiri S, Simmons L, Singh J, Smith V, Stinson J, Vagts A, Vandlen R, Watanabe C, Wieand D, Woods K, Xie MH, Yansura D, Yi S, Yu G, Yuan J, Zhang M, Zhang Z, Goddard A, Wood WI, Godowski P, Gray A (říjen 2003). „Iniciativa pro objevování vylučovaných proteinů (SPDI), rozsáhlé úsilí o identifikaci nových lidských vylučovaných a transmembránových proteinů: hodnocení bioinformatiky“. Výzkum genomu. 13 (10): 2265–70. doi:10,1101 / gr. 1293003. PMC 403697. PMID 12975309.
Kizawa H, Kou I, Iida A, Sudo A, Miyamoto Y, Fukuda A, Mabuchi A, Kotani A, Kawakami A, Yamamoto S, Uchida A, Nakamura K, Notoya K, Nakamura Y, Ikegawa S (únor 2005). „Polymorfismus kyseliny asparagové v asporinu inhibuje chondrogenezi a zvyšuje náchylnost k osteoartritidě“. Genetika přírody. 37 (2): 138–44. doi:10.1038 / ng1496. PMID 15640800. S2CID 6771016.
Rodriguez-Lopez J, Pombo-Suarez M, Liz M, Gomez-Reino JJ, Gonzalez A (2006). „Nedostatečná asociace variabilního počtu zbytků kyseliny asparagové v asporinovém genu s náchylností k osteoartróze: případové kontrolní studie u španělských bělochů“. Výzkum a terapie artritidy. 8 (3): R55. doi:10.1186 / ar1920. PMC 1526645. PMID 16542493.
Yamada S, Ozawa Y, Tomoeda M, Matoba R, Matsubara K, Murakami S (květen 2006). "Regulace exprese PLAP-1 v buňkách periodontálních vazů". Journal of Dental Research. 85 (5): 447–51. doi:10.1177/154405910608500510. PMID 16632759. S2CID 40160016.
Jiang Q, Shi D, Yi L, Ikegawa S, Wang Y, Nakamura T, Qiao D, Liu C, Dai J (2007). „Replikace asociace polymorfismu opakování kyseliny asparagové v asporinovém genu s náchylností ke kolenní osteoartritidě v čínštině Han“. Journal of Human Genetics. 51 (12): 1068–72. doi:10.1007 / s10038-006-0065-6. PMID 17024313.
Nakamura T, Shi D, Tzetis M, Rodriguez-Lopez J, Miyamoto Y, Tsezou A, Gonzalez A, Jiang Q, Kamatani N, Loughlin J, Ikegawa S (červenec 2007). "Metaanalýza asociace mezi ASPN D-opakováním a osteoartritidou". Lidská molekulární genetika. 16 (14): 1676–81. doi:10,1093 / hmg / ddm115. PMID 17517696.
Shi D, Nakamura T, Dai J, Yi L, Qin J, Chen D, Xu Z, Wang Y, Ikegawa S, Jiang Q (2007). „Sdružení polymorfismu kyseliny asparagové s opakováním v asporinovém genu s věkem na počátku osteoartrózy kolene u čínské populace Han“. Journal of Human Genetics. 52 (8): 664–7. doi:10.1007 / s10038-007-0166-x. PMID 17603749.
Kou I, Nakajima M, Ikegawa S (listopad 2007). "Exprese a regulace proteinu asporinu spojeného s osteoartritidou". The Journal of Biological Chemistry. 282 (44): 32193–9. doi:10,1074 / jbc.M706262200. PMID 17804408.
Nakajima M, Kizawa H, Saitoh M, Kou I, Miyazono K, Ikegawa S (listopad 2007). "Mechanismy pro funkci a regulaci asporinu v kloubní chrupavce". The Journal of Biological Chemistry. 282 (44): 32185–92. doi:10,1074 / jbc.M700522200. PMID 17827158.

Tento článek o gen na lidský chromozom 9 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000106819 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000021388 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[entrez-5] A ^b „Entrez Gene: ASPN asporin“.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]