Allograftový zánětlivý faktor 1 - Allograft inflammatory factor 1

AIF1
Protein AIF1 PDB 2d58.png
Dostupné struktury
PDBHledání ortologu: PDBe RCSB
Identifikátory
AliasyAIF1, AIF-1, IBA1, IRT-1, IRT1, aloimplantátový zánětlivý faktor 1
Externí IDOMIM: 601833 MGI: 1343098 HomoloGene: 1226 Genové karty: AIF1
Umístění genu (člověk)
Chromozom 6 (lidský)
Chr.Chromozom 6 (lidský)[1]
Chromozom 6 (lidský)
Genomická poloha pro AIF1
Genomická poloha pro AIF1
Kapela6p21.33Start31,615,217 bp[1]
Konec31,617,021 bp[1]
Exprese RNA vzor
PBB GE AIF1 215051 x na fs.png

PBB GE AIF1 209901 x na fs.png

PBB GE AIF1 213095 x na fs.png
Další údaje o referenčních výrazech
Ortology
DruhČlověkMyš
Entrez

199

11629

Ensembl

ENSMUSG00000024397

UniProt

P55008
Q4V347

O70200

RefSeq (mRNA)

NM_001623
NM_004847
NM_032955
NM_001318970

NM_019467
NM_001361501
NM_001361502

RefSeq (protein)

NP_001305899
NP_001614
NP_116573
NP_001614.3

NP_062340
NP_001348430
NP_001348431

Místo (UCSC)Chr 6: 31,62 - 31,62 MbChr 17: 35,17 - 35,18 Mb
PubMed Vyhledávání[3][4]
Wikidata
Zobrazit / upravit člověkaZobrazit / upravit myš

Allograftový zánětlivý faktor 1 (AIF-1) také známý jako ionizovaná molekula adaptéru vázajícího vápník 1 (IBA1) je protein že u lidí je kódován AIF1 gen.[5][6]

Gen

Gen AIF1 se nachází v segmentu hlavní komplex histokompatibility region třídy III. Bylo prokázáno, že tento gen je vysoce exprimován ve varlatech, slezině a mozku, ale slabě exprimován v plicích a ledvinách. Mezi mozkovými buňkami je gen Iba1 silně a specificky exprimován v mikrogliích. Cirkulující makrofágy také vyjadřují Iba1.

Funkce

AIF1 je protein, který existuje v cytoplazma, a je vysoce evolučně konzervativní. Je také možná identický se třemi dalšími proteiny, Iba-2, MRF-1 (faktor odpovědi na mikroglie) a daintain. Úplné funkční profily všech tří proteinů a jejich překrývání však nejsou známy.[7] IBA1 je 17-kDa EF ruka protein, který je specificky exprimován v makrofágy / mikroglie a je upregulován během aktivace těchto buněk. Exprese Iba1 je u mikroglií po poranění nervu up-regulovaná,[8] ischemie centrálního nervového systému a několik dalších onemocnění mozku.

AIF1 byl původně objeven v aterosklerotický léze u krysího modelu chronické aloštěp srdeční odmítnutí. Bylo zjištěno, že je upregulován v makrofágy a neutrofily v reakci na cytokin IFN-y.[9] Bylo pozorováno, že exprese AIF1 roste ve vaskulární tkáni v reakci na arteriální poranění, konkrétně se nachází v aktivovaných buňkách hladkého svalstva cév v reakci na IFN-y, IL-1 p a média upravená T-buňkami.[10] v cévní hladký sval buněk je aktivace zodpovědná za zesílení tepen v aloštěpech prostřednictvím nadměrné proliferace. Bylo zjištěno, že AIF1 zvyšuje růst a podporuje proliferaci v buňkách hladkého svalstva cév prostřednictvím deregulace buněčného cyklu. Dělá to zkrácením buněčného cyklu a změnou exprese cyklinů.[11] Ačkoli je histologicky odlišný, bylo také prokázáno, že AIF1 podporuje proliferaci a aktivaci endoteliální buňky (EC). Aktivace EC vede k proliferaci a migraci buněk, které se účastní mnoha normálních vaskulárních procesů, jako je ateroskleróza, angiogeneze a hojení ran. V současné době se předpokládá, že AIF1 pracuje na řízení proliferace a migrace endoteliálních buněk prostřednictvím akce v signální transdukce cesty.[12] Má vlastnosti cytoplazmatického signálního proteinu, včetně několika domén, které umožňují vazbu na multiproteinové komplexy, tzv. Domény PDZ.[13] V endoteliálních buňkách bylo prokázáno, že AIF1 reguluje vaskulogeneze, včetně tvorby klíčení aorty a trubicových útvarů. Ukázalo se, že AIF1 interaguje s kinázou p44 / 42 a PAK1, dvě dříve známé molekuly přenosu signálu, při regulaci těchto procesů. AIF1 také vykazuje výrazné rozdíly v drahách, kterými reguluje endoteliální buňky, makrofágy a buňky hladkého svalstva cév.[12]

Klinický význam

Allograftový zánětlivý faktor 1 se nachází v aktivovaných makrofázích. Aktivované makrofágy se nacházejí ve tkáních se zánětem. Bylo zjištěno, že hladiny AIF1 u zdravých lidí pozitivně korelují s metabolickými ukazateli, jako je index tělesné hmotnosti, triglyceridy a hladiny glukózy v plazmě nalačno. Zjistilo se, že přebytek tukové tkáně nalezený u obézních pacientů způsobuje chronický zánět se zvýšením počtu aktivovaných makrofágů. Následně může být AIF1 přesným indikátorem aktivace makrofágů v těle.[14] Existují také důkazy, že AIF1 by mohl být markerem diabetická nefropatie při detekci v séru.[15] Jelikož diabetická nefropatie je důsledkem dlouhodobého diabetu typu 1 a typu 2, odpovídá to důkazům, že AIF1 může být spojován s dalšími aspekty diabetu. Nachází se v aktivovaných makrofágech v pankreatické ostrůvky a bylo prokázáno, že snižuje sekreci inzulínu a současně zhoršuje eliminaci glukózy.[16]

Reference

  1. ^ A b C ENSG00000235985, ENSG00000235588, ENSG00000234836, ENSG00000237727, ENSG00000204472 GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000206428, ENSG00000235985, ENSG00000235588, ENSG00000234836, ENSG00000234836, ENSG00000234836, ENSG00000234836, ENSG00000234836, ENSG00000234836 - Ensembl, Květen 2017
  2. ^ A b C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000024397 - Ensembl, Květen 2017
  3. ^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
  4. ^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
  5. ^ Autieri MV (prosinec 1996). „cDNA klonování lidského aloimplantátového zánětlivého faktoru-1: distribuce ve tkáních, indukce cytokinů a exprese mRNA v poraněných krčních tepnách krysy“. Biochem Biophys Res Commun. 228 (1): 29–37. doi:10.1006 / bbrc.1996.1612. PMID  8912632.
  6. ^ „Entrez Gene: AIF1 aloimplantátový zánětlivý faktor 1“.
  7. ^ Deininger MH, Meyermann R, Schluesener HJ (březen 2002). "Rodina proteinů aloimplantátového zánětlivého faktoru 1". FEBS Lett. 514 (2–3): 115–21. doi:10.1016 / S0014-5793 (02) 02430-4. PMID  11943136. S2CID  34086133.
  8. ^ Ito D, Imai Y, Ohsawa K, Nakajima K, Fukuuchi Y, Kohsaka S (červen 1998). "Microglia-specifická lokalizace nového proteinu vázajícího vápník, Iba1". Brain Res. Mol. Brain Res. 57 (1): 1–9. doi:10.1016 / s0169-328x (98) 00040-0. PMID  9630473.
  9. ^ Utans U, Arceci RJ, Yamashita Y, Russell ME (červen 1995). „Klonování a charakterizace zánětlivého faktoru aloštěpu-1: nový makrofágový faktor identifikovaný u srdečních aloštěpů potkanů ​​s chronickou rejekcí“. J. Clin. Investovat. 95 (6): 2954–62. doi:10.1172 / JCI118003. PMC  295984. PMID  7769138.
  10. ^ Autieri MV, Carbone C, Mu A (červenec 2000). „Exprese aloimplantátového zánětlivého faktoru-1 je markerem aktivovaných buněk lidského vaskulárního hladkého svalstva a poškození tepen“. Arterioskler. Tromb. Vasc. Biol. 20 (7): 1737–44. doi:10.1161 / 01. ATV.20.7.1737. PMID  10894811.
  11. ^ Autieri MV, Carbone CM (září 2001). „Nadměrná exprese aloimplantátového zánětlivého faktoru-1 podporuje proliferaci buněk hladkého svalstva cév deregulací buněčného cyklu“. Arterioskler. Tromb. Vasc. Biol. 21 (9): 1421–6. doi:10.1161 / hq0901.095566. PMID  11557666.
  12. ^ A b Tian Y, Jain S, Kelemen SE, Autieri MV (únor 2009). "Exprese AIF-1 reguluje aktivaci endoteliálních buněk, signální transdukci a vaskulogenezi". Dopoledne. J. Physiol., Cell Physiol. 296 (2): C256–66. doi:10.1152 / ajpcell.00325.2008. PMC  2643850. PMID  18787073.
  13. ^ Hung AY, Sheng M (únor 2002). „Domény PDZ: strukturální moduly pro sestavení proteinového komplexu“. J. Biol. Chem. 277 (8): 5699–702. doi:10,1074 / jbc.R100065200. PMID  11741967.
  14. ^ Fukui M, Tanaka M, Toda H, Asano M, Yamazaki M, Hasegawa G, Imai S, Fujinami A, Ohta M, Nakamura N (červenec 2012). „Sérová koncentrace aloimplantátového zánětlivého faktoru-1 koreluje s metabolickými parametry u zdravých subjektů.“ Metab. Clin. Exp. 61 (7): 1021–5. doi:10.1016 / j.metabol.2011.12.001. PMID  22225958.
  15. ^ Fukui M, Tanaka M, Asano M, Yamazaki M, Hasegawa G, Imai S, Fujinami A, Ohta M, Obayashi H, Nakamura N (červenec 2012). „Sérový aloštěpový zánětlivý faktor-1 je novým markerem pro diabetickou nefropatii.“ Diabetes Res. Clin. Cvič. 97 (1): 146–50. doi:10.1016 / j.diabres.2012.04.009. PMID  22560794.
  16. ^ Chen ZW, Ahren B, Ostenson CG, Cintra A, Bergman T, Möller C, Fuxe K, Mutt V, Jörnvall H, Efendic S (prosinec 1997). „Identifikace, izolace a charakterizace daintainu (aloimplantátového zánětlivého faktoru 1), makrofágového polypeptidu s účinky na sekreci inzulínu a hojně přítomného v pankreatu prediabetických potkanů ​​BB“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 94 (25): 13879–84. Bibcode:1997PNAS ... 9413879C. doi:10.1073 / pnas.94.25.13879. PMC  28401. PMID  9391121.

externí odkazy

  • Člověk AIF1 umístění genomu a AIF1 stránka s podrobnostmi o genu v UCSC Genome Browser.
  • PDBe-KB poskytuje přehled všech strukturních informací dostupných v PDB pro zánětlivý faktor 1 lidského aloštěpu

Další čtení