ASRGL1 - ASRGL1

ASRGL1
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	3TKJ, 4ET0, 4O0C, 4O0D, 4O0E, 4O0F, 4O0G, 4O0H, 4OSX, 4OSY, 4PVP, 4PVQ, 4PVR, 4PVS, 4ZM9
Identifikátory
Aliasy	ASRGL1, ALP, ALP1, CRASH, asparagináza jako 1, asparagináza a isoaspartyl peptidáza 1
Externí ID	OMIM: 609212 MGI: 1913764 HomoloGene: 11825 Genové karty: ASRGL1
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 11 (lidský)
Konec	62,393,412 bp
Exprese RNA vzor
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• aktivita peptidázy; • aktivita beta-aspartyl-peptidázy; • aktivita hydrolázy; • Aktivita N4- (beta-N-acetylglukosaminyl) -L-asparaginázy; • aktivita asparaginázy;
Buněčná složka	• cytoplazma; • cytosol; • buněčné jádro; • vnitřní segment fotoreceptoru;
Biologický proces	• asparagin katabolický proces přes L-aspartát; • Katabolický proces L-fenylalaninu; • proteolýza; • zrání bílkovin;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	80150
	66514
	ENSG00000162174
	ENSMUSG00000024654
	Q7L266
	Q8C0M9
	NM_001083926; NM_025080
	NM_025610
	NP_001077395; NP_079356
	NP_079886
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

L-asparagináza je enzym že u lidí je kódován ASRGL1 gen.^[4]

Funkce

Protein ASRGL1 se skládá z 308 aminokyselin a je aktivován autokleací na aminokyselině 168 za vzniku alfa- a beta-řetězce, které mohou dimerizovat na heterodimer.^[5] Enzym ASRGL1 má aktivitu L-asparaginázy i beta-aspartylpeptidázy a může se podílet na produkci L-aspartátu, který může v některých oblastech mozku působit jako excitační neurotransmiter.

Podle profilování založeného na protilátkách a transkriptomické analýzy je protein ASRGL1 přítomen ve všech analyzovaných lidských tkáních s nejvyšší expresí v mozku, v ženských tkáních, jako je děložního čípku a vejcovod, a v mužských tkáních jako varle.^[6] Na základě konfokální mikroskopie ASRGL1 je lokalizován hlavně na mikrotubuly.^[7]

Klinický význam

ASRGL1 je vysoce vyjádřen v normálu endometrium a rozdílně vyjádřeno v rakovina endometria. Ztráta exprese ASRGL1 je nepříznivým prognostickým rysem u pacientů s rakovinou endometria.^[8]^[9]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000162174 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ "Entrez Gene: ASRGL1 asparagináza jako 1".
^ Li, Wenzong; Cantor, Jason R .; Yogesha, S. D .; Yang, Shirley; Chantranupong, Lynne; Liu, červen Qingxia; Agnello, Giulia; Georgiou, George; Kámen, Everett M. (2012-11-16). „Odpojení intramolekulárního zpracování a hydrolýza substrátu v N-koncové nukleofilní hydroláze hASRGL1 kruhovou permutací“. ACS Chemická biologie. 7 (11): 1840–1847. doi:10.1021 / cb300232n. ISSN 1554-8929. PMC 3514461. PMID 22891768.
^ "Tkáňová exprese ASRGL1 - Shrnutí - Atlas lidského proteinu". www.proteinatlas.org. Citováno 2017-10-03.
^ "Atlas buněk - ASRGL1 - Atlas lidských proteinů". www.proteinatlas.org. Citováno 2017-10-03.
^ "Exprese ASRGL1 v rakovině endometria - Atlas lidského proteinu". www.proteinatlas.org. Citováno 2017-10-03.
^ Edqvist, Per-Henrik D .; Huvila, Jutta; Forsström, Björn; Talve, Lauri; Carpén, Olli; Salvesen, Helga B .; Krakstad, Camilla; Grénman, Seija; Johannesson, Henrik (2015). „Ztráta exprese ASRGL1 je nezávislým biomarkerem pro přežití specifické pro onemocnění u endometrioidního karcinomu endometria“. Gynekologická onkologie. 137 (3): 529–537. doi:10.1016 / j.ygyno.2015.03.055. PMID 25858696.

externí odkazy

Výraz ASRGL1 v Atlas lidských bílkovin
Člověk ASRGL1 umístění genomu a ASRGL1 stránka s podrobnostmi o genu v UCSC Genome Browser.

Další čtení

Kim JM, Lee KH, Jeon YJ, Oh JH, Jeong SY, Song IS, Kim JM, Lee DS, Kim NS (2006). "Identifikace genů souvisejících s Parkinsonovou chorobou pomocí expresních značek sekvence". DNA Res. 13 (6): 275–86. doi:10.1093 / dnares / dsl016. PMID 17213182.
Kimura K, Wakamatsu A, Suzuki Y, Ota T, Nishikawa T, Yamashita R, Yamamoto J, Sekine M, Tsuritani K, Wakaguri H, Ishii S, Sugiyama T, Saito K, Isono Y, Irie R, Kushida N, Yoneyama T , Otsuka R, Kanda K, Yokoi T, Kondo H, Wagatsuma M, Murakawa K, Ishida S, Ishibashi T, Takahashi-Fujii A, Tanase T, Nagai K, Kikuchi H, Nakai K, Isogai T, Sugano S (2006) . „Diverzifikace transkripční modulace: rozsáhlá identifikace a charakterizace domnělých alternativních promotorů lidských genů“. Genome Res. 16 (1): 55–65. doi:10,1101 / gr. 4039406. PMC 1356129. PMID 16344560.
Suzuki Y, Yamashita R, Shirota M, Sakakibara Y, Chiba J, Mizushima-Sugano J, Nakai K, Sugano S (2004). „Porovnání sekvencí lidských a myších genů odhaluje homologní blokovou strukturu v promotorových oblastech“. Genome Res. 14 (9): 1711–8. doi:10,1101 / gr. 2435604. PMC 515316. PMID 15342556.
Bush LA, Herr JC, Wolkowicz M, Sherman NE, Shore A, Flickinger CJ (2002). „Nový protein podobný asparagináze je autoantigen spermií u potkanů.“ Mol. Reprod. Dev. 62 (2): 233–47. doi:10,1002 / mrd.10092. PMID 11984834. S2CID 32206911.
Suzuki Y, Yoshitomo-Nakagawa K, Maruyama K, Suyama A, Sugano S (1997). "Konstrukce a charakterizace knihovny cDNA obohacené o celou délku a 5'-end". Gen. 200 (1–2): 149–56. doi:10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3. PMID 9373149.
Maruyama K, Sugano S (1994). „Oligo-capping: jednoduchá metoda k nahrazení struktury cap eukaryotických mRNA oligoribonukleotidy“. Gen. 138 (1–2): 171–4. doi:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID 8125298.

Tento článek o gen na lidský chromozom 11 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000162174 - Ensembl, Květen 2017

[2] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[3] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[entrez-4] "Entrez Gene: ASRGL1 asparagináza jako 1".

[5] Li, Wenzong; Cantor, Jason R .; Yogesha, S. D .; Yang, Shirley; Chantranupong, Lynne; Liu, červen Qingxia; Agnello, Giulia; Georgiou, George; Kámen, Everett M. (2012-11-16). „Odpojení intramolekulárního zpracování a hydrolýza substrátu v N-koncové nukleofilní hydroláze hASRGL1 kruhovou permutací“. ACS Chemická biologie. 7 (11): 1840–1847. doi:10.1021 / cb300232n. ISSN 1554-8929. PMC 3514461. PMID 22891768.

[6] "Tkáňová exprese ASRGL1 - Shrnutí - Atlas lidského proteinu". www.proteinatlas.org. Citováno 2017-10-03.

[7] "Atlas buněk - ASRGL1 - Atlas lidských proteinů". www.proteinatlas.org. Citováno 2017-10-03.

[8] "Exprese ASRGL1 v rakovině endometria - Atlas lidského proteinu". www.proteinatlas.org. Citováno 2017-10-03.

[9] Edqvist, Per-Henrik D .; Huvila, Jutta; Forsström, Björn; Talve, Lauri; Carpén, Olli; Salvesen, Helga B .; Krakstad, Camilla; Grénman, Seija; Johannesson, Henrik (2015). „Ztráta exprese ASRGL1 je nezávislým biomarkerem pro přežití specifické pro onemocnění u endometrioidního karcinomu endometria“. Gynekologická onkologie. 137 (3): 529–537. doi:10.1016 / j.ygyno.2015.03.055. PMID 25858696.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]