ARMCX6 - ARMCX6
| ARMCX6 | |||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Identifikátory | |||||||||||||||||||||||||
| Aliasy | ARMCX6, GASP10, pásovec obsahující repetici, X-vázaný 6, pásovec repetice obsahující X-vázaný 6 | ||||||||||||||||||||||||
| Externí ID | MGI: 2147993 HomoloGene: 10373 Genové karty: ARMCX6 | ||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||
| Ortology | |||||||||||||||||||||||||
| Druh | Člověk | Myš | |||||||||||||||||||||||
| Entrez | |||||||||||||||||||||||||
| Ensembl | |||||||||||||||||||||||||
| UniProt | |||||||||||||||||||||||||
| RefSeq (mRNA) | |||||||||||||||||||||||||
| RefSeq (protein) | |||||||||||||||||||||||||
| Místo (UCSC) | Chr X: 101,62 - 101,62 Mb | Chr X: 134,75 - 134,75 Mb | |||||||||||||||||||||||
| PubMed Vyhledávání | [3] | [4] | |||||||||||||||||||||||
| Wikidata | |||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||
Opakování pásovce obsahující X-vázané 6 je protein že u lidí je kódován ARMCX6 gen nachází se na X-chromozomu.[5]
Je to jeden ze šesti pásovec se opakuje obsahující proteiny vázané na X (ARMCX1, ARMCX2, ARMCX3, ARMCX4, ARMCX5 a ARMCX6 (tento protein)).
Funkce tohoto proteinu není v tuto chvíli známa.
Sekvence proteinů
1 MGRAREVGWM AAGLMIGAGA CYCVYKLTIG RDDSEKLEEE 41 GEEEWDDDQE LDEEEPDIWF DFETMARPWT EDGDWTEPGA 81 PGGTEDRPSG GGKANRAHPI KQRPFPYEHK NTWSAQNCKN 121 GSCVLDLSKC LFIQGKLLFA EPKDAGFPFS QDINSHLASL 161 SMARNTSPTP DPTVREALCA PDNLNASIES QGQIKMYINE 201 VCRETVSRCC NSFLQQAGLN LLISMTVINN MLAKSASDLK 241 FPLISEGSGC AKVQVLKPLM GLSEKPVLAG ELVGAQMLFS 301 FMSLFIRNGN REILLETPAP
Homologie
ARMCX6 je konzervován v mnoha eukaryotických organismech.
Ortology
| taxonomický název | běžné jméno | Vstup NCBI | Procento podobnosti sekvence | Délka (AA) | komentáře |
| Homo sapiens | Člověk | [2] | 100% | 300 | pásovec opakování obsahující X-vázané 6 |
| Macaca mulatta | Rhesus opice | [3] | 97.0% | 300 | PŘEDPOKLÁDANÉ: podobné jako u amrmadillové repetice obsahující izoformu 1 vázanou na X (H. sapiens) 1 |
| Equus caballus | Kůň | [4] | 90.0% | 300 | PŘEDPOKLÁDANÉ: podobné opakování pásovce, vázané na X 6 |
| Danio rerio | zebrafish | [5] | 84.0% | 301 | Podobně jako RIKEN cDNA 0610039K22 |
| Mus musculus | House Mouse | [6] | 97.7% | 393 | pásovec obsahující opakování, X-vázané 6 (H. sapiens) podobné |
| Bos taurus | kráva | [7] | 83.0% | 301 | obsahující pásovce opakování, X-vázané 6 |
| Mus musculus | Myš | [8] | 82.0% | 301 | obsahující pásovce opakování, X-vázané 6 |
| Takifugu rubripes | Tetradontoidea | [9] | 66.0% | 818 | aryl uhlovodíkový receptor 2C |
| Caenorhabditis elegans | C. elegans | [10] | 50.0% | 332 | Serpentinový receptor, člen rodiny třídy H (srh-216) |
| Saccharomyces cerevisiae | Droždí | [11] | 70.0% | 910 | Hul5p |
| Gallus gallus | Kuře | [12] | 52.0% | 317 | PRIPRAVENO: hypotetický protein |
Sekundární struktura
The sekundární struktura ARMCX6 se předpokládá podobně jako cyanáza. Srovnání těchto dvou sekvencí je uvedeno níže.[6][7]
10 20 30 40 .... * .... | .... * .... | .... * .... | .... * .... | .... *. .ARMCX6 231 MLAKSASDLKFPLISEGSGCAKVQVLKPLMGLSEKPVLAGELVGAQM 2771DW9_A 19 LLSKAKKDLSFAEIADGTGLAEAFVTAALLGQQALPADAARLVGAKL 65 + + ++ + + + + + + + + + + +
Cyanázový segment mající identitu s ARMCX6.
Výraz
Data z mikročipu ukazují, že ARMCX6 je vysoce exprimován během nejranějších stadií spermatogeneze u myší.[8][9][10]
Reference
- ^ A b C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000198960 - Ensembl, Květen 2017
- ^ A b C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000050394 - Ensembl, Květen 2017
- ^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
- ^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
- ^ "Entrez Gene: pásovec opakování obsahující".
- ^ SDSC Biology Workbench 2.0
- ^ [1]
- ^ Prohlížeč profilů EST - člověk
- ^ Prohlížeč profilů EST - myš
- ^ Su AI, Wiltshire T, Batalov S, Lapp H a kol. (Duben 2004). „Atlas genů transkriptomů kódujících myš a lidský protein“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 101 (16): 6062–7. doi:10.1073 / pnas.0400782101. PMC 395923. PMID 15075390.
externí odkazy
- Člověk ARMCX6 umístění genomu a ARMCX6 stránka s podrobnostmi o genu v UCSC Genome Browser.
Další čtení
- Ross MT, Grafham DV, Coffey AJ a kol. (2005). „Sekvence DNA lidského chromozomu X“. Příroda. 434 (7031): 325–37. doi:10.1038 / nature03440. PMC 2665286. PMID 15772651.
- Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH a kol. (2002). „Generování a počáteční analýza více než 15 000 lidských a myších cDNA sekvencí plné délky“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (26): 16899–903. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
- Olsen JV, Blagoev B, Gnad F a kol. (2006). „Globální, in vivo a místně specifická dynamika fosforylace v signálních sítích“. Buňka. 127 (3): 635–48. doi:10.1016 / j.cell.2006.09.026. PMID 17081983.
- Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA a kol. (2004). „Stav, kvalita a rozšíření projektu cDNA NIH v plné délce: Mammalian Gene Collection (MGC)“. Genome Res. 14 (10B): 2121–7. doi:10,1101 / gr. 2596504. PMC 528928. PMID 15489334.
- Ota T, Suzuki Y, Nishikawa T a kol. (2004). „Kompletní sekvenování a charakterizace 21 243 lidských cDNA plné délky“. Nat. Genet. 36 (1): 40–5. doi:10.1038 / ng1285. PMID 14702039.
 | Tento článek o gen na člověka X chromozom a / nebo související protein je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to. |