AKAP11 - AKAP11

AKAP11
Identifikátory
Aliasy	AKAP11, AKAP-11, AKAP220, PPP1R44, PRKA11, A-kinázový kotvící protein 11
Externí ID	OMIM: 604696 MGI: 2684060 HomoloGene: 8279 Genové karty: AKAP11
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 13 (lidský)
Konec	42,323,261 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 14 (myš)
Konec	78,536,808 bp
Exprese RNA vzor
	; ;
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• vazba proteinové fosfatázy 1; • vazba protein kinázy A.; • GO: 0001948 vazba na proteiny;
Buněčná složka	• cytoplazma; • peroxisom; • cytoskelet; • organizační centrum mikrotubulů; • jádro; • cytosol; • buněčná membrána;
Biologický proces	• GO: 0007243 transdukce intracelulárního signálu; • regulace signalizace protein kinázy A.; • lokalizace bílkovin;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	11215
	219181
	ENSG00000023516
	ENSMUSG00000022016
	Q9UKA4
	n / a
	NM_016248; NM_144490
	NM_001164503; NM_001346784
	NP_057332
	n / a
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

A-kinázový kotevní protein 11 je enzym že u lidí je kódován AKAP11 gen.^[5]^[6]^[7]

Funkce

A-kinázové kotvící proteiny (AKAP) jsou skupina strukturně odlišných proteinů, které mají společnou funkci vazby na regulační podjednotku protein kináza A (PKA) a omezení holoenzymu na diskrétní místa v buňce. Tento gen kóduje člena rodiny AKAP. Kódovaný protein je exprimován po celou dobu na vysokých úrovních spermatogeneze a ve zralých spermiích. Váže podjednotky RI a RII PKA ve varlatech. Může sloužit jako funkce při kontrole buněčného cyklu jak somatických buněk, tak zárodečných buněk, kromě své domnělé role ve spermatogenezi a funkci spermií.^[7]

Interakce

AKAP11 bylo prokázáno komunikovat s:

GSK3B,^[8]
PPP1CA,^[8]^[9]
PRKAR2A,^[6]^[8]^[10]
PRKAR2B.^[11]
VAPB.^[12] Vazba je prostřednictvím a FFAT motiv v N-koncové části AKAP11, obdobně jako v AKAP3. ^[13]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000023516 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000022016 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Ishikawa K, Nagase T, Suyama M, Miyajima N, Tanaka A, Kotani H, Nomura N, Ohara O (prosinec 1998). "Predikce kódujících sekvencí neidentifikovaných lidských genů. X. Kompletní sekvence 100 nových klonů cDNA z mozku, které mohou kódovat velké proteiny in vitro". DNA Res. 5 (3): 169–76. doi:10.1093 / dnares / 5.3.169. PMID 9734811.
^ ^A ^b Lester LB, Coghlan VM, Nauert B, Scott JD (červen 1996). „Klonování a charakterizace nového proteinu kotvícího A-kinázu. AKAP 220, asociace s testikulárními peroxizomy“ (PDF). J. Biol. Chem. 271 (16): 9460–5. doi:10.1074 / jbc.271.16.9460. PMID 8621616.
^ ^A ^b „Entrez Gene: AKAP11 A kinase (PRKA) anchor protein 11".
^ ^A ^b ^C Tanji C, Yamamoto H, Yorioka N, Kohno N, Kikuchi K, Kikuchi A (říjen 2002). „A-kinázový kotevní protein AKAP220 se váže na glykogensyntázovou kinázu-3beta (GSK-3beta) a zprostředkovává inhibici GSK-3beta závislou na proteinkináze A“. J. Biol. Chem. 277 (40): 36955–61. doi:10,1074 / jbc.M206210200. PMID 12147701.
^ Schillace RV, Scott JD (březen 1999). „Asociace proteinové fosfatázy typu 1 PP1 s A-kinázovým kotvícím proteinem AKAP220“. Curr. Biol. 9 (6): 321–4. doi:10.1016 / S0960-9822 (99) 80141-9. PMID 10209101.
^ Alto NM, Soderling SH, Hoshi N, Langeberg LK, Fayos R, Jennings PA, Scott JD (duben 2003). „Bioinformatický design proteinu kotvícího A-kinázu in silico: silný a selektivní peptidový antagonista ukotvení proteinové kinázy A typu II“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 100 (8): 4445–50. doi:10.1073 / pnas.0330734100. PMC 153575. PMID 12672969.
^ Reinton N, Collas P, Haugen TB, Skâlhegg BS, Hansson V, Jahnsen T, Taskén K (červenec 2000). "Lokalizace nového lidského proteinu kotvícího A-kinázu, hAKAP220, během spermatogeneze". Dev. Biol. 223 (1): 194–204. doi:10,1006 / dbio.2000.9725. PMID 10864471.
^ Huttlin EL, Ting L, Bruckner RJ, Gebreab F, Gygi MP, Szpyt J a kol. (2015). „Síť BioPlex: Systematický průzkum lidského interaktomu“. Buňka. 162 (2): 425–40. doi:10.1016 / j.cell.2015.06.043. PMC 4617211. PMID 26186194.
^ Mikitova V, Levine TP (2012). „Analýza klíčových prvků motivů podobných FFAT identifikuje nové proteiny, které potenciálně vážou VAP na ER, včetně dvou AKAP a FAPP2“. PLOS ONE. 7 (1): e30455. doi:10.1371 / journal.pone.0030455. PMC 3261905. PMID 22276202.

externí odkazy

Člověk AKAP11 umístění genomu a AKAP11 stránka s podrobnostmi o genu v UCSC Genome Browser.

Další čtení

Lester LB, Scott JD (1997). "Ukotvení a lešení proteiny pro kinázy a fosfatázy". Nedávný program. Horm. Res. 52: 409–29, diskuse 429–30. PMID 9238861.
Michel JJ, Scott JD (2002). "AKAP zprostředkovaná transdukce signálu". Annu. Pharmacol. Toxicol. 42: 235–57. doi:10.1146 / annurev.pharmtox.42.083101.135801. PMID 11807172.
Nakajima D, Okazaki N, Yamakawa H, Kikuno R, Ohara O, Nagase T (2002). „Konstrukce klonů cDNA připravených na expresi pro geny KIAA: ruční kurace 330 klonů cDNA KIAA“. DNA Res. 9 (3): 99–106. doi:10.1093 / dnares / 9.3.99. PMID 12168954.
Schillace RV, Scott JD (1999). „Sdružení proteinové fosfatázy typu 1 PP1 s A-kinázovým kotvícím proteinem AKAP220“. Curr. Biol. 9 (6): 321–4. doi:10.1016 / S0960-9822 (99) 80141-9. PMID 10209101.
Reinton N, Collas P, Haugen TB, Skâlhegg BS, Hansson V, Jahnsen T, Taskén K (2000). "Lokalizace nového lidského proteinu kotvícího A-kinázu, hAKAP220, během spermatogeneze". Dev. Biol. 223 (1): 194–204. doi:10,1006 / dbio.2000.9725. PMID 10864471.
Schillace RV, Voltz JW, Sim AT, Shenolikar S, Scott JD (2001). „Několik interakcí v signálním komplexu AKAP220 přispívá k regulaci proteinové fosfatázy 1“. J. Biol. Chem. 276 (15): 12128–34. doi:10,1074 / jbc.M010398200. PMID 11152471.
Schillace RV, Andrews SF, Liberty GA, Davey MP, Carr DW (2002). "Identifikace a charakterizace myeloidního translokačního genu 16b jako nového proteinu kotujícího kinázu v T lymfocytech". J. Immunol. 168 (4): 1590–9. doi:10,4049 / jimmunol.168.4.1590. PMID 11823486.
Tanji C, Yamamoto H, Yorioka N, Kohno N, Kikuchi K, Kikuchi A (2002). „A-kinázový kotevní protein AKAP220 se váže na glykogensyntázovou kinázu-3beta (GSK-3beta) a zprostředkovává inhibici GSK-3beta závislou na proteinkináze A“. J. Biol. Chem. 277 (40): 36955–61. doi:10,1074 / jbc.M206210200. PMID 12147701.
Ewing RM, Chu P, Elisma F, Li H, Taylor P, Climie S, McBroom-Cerajewski L, Robinson MD, O'Connor L, Li M, Taylor R, Dharsee M, Ho Y, Heilbut A, Moore L, Zhang S, Ornatsky O, Bukhman YV, Ethier M, Sheng Y, Vasilescu J, Abu-Farha M, Lambert JP, Duewel HS, Stewart II, Kuehl B, Hogue K, Colwill K, Gladwish K, Muskat B, Kinach R, Adams SL, Moran MF, Morin GB, Topaloglou T, Figeys D (2007). „Mapování interakcí lidských proteinů a proteinů ve velkém měřítku hmotnostní spektrometrií“. Mol. Syst. Biol. 3 (1): 89. doi:10.1038 / msb4100134. PMC 1847948. PMID 17353931.

Tento článek o gen na lidský chromozom 13 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000023516 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000022016 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid9734811-5] Ishikawa K, Nagase T, Suyama M, Miyajima N, Tanaka A, Kotani H, Nomura N, Ohara O (prosinec 1998). "Predikce kódujících sekvencí neidentifikovaných lidských genů. X. Kompletní sekvence 100 nových klonů cDNA z mozku, které mohou kódovat velké proteiny in vitro". DNA Res. 5 (3): 169–76. doi:10.1093 / dnares / 5.3.169. PMID 9734811.

[pmid8621616-6] A ^b Lester LB, Coghlan VM, Nauert B, Scott JD (červen 1996). „Klonování a charakterizace nového proteinu kotvícího A-kinázu. AKAP 220, asociace s testikulárními peroxizomy“ (PDF). J. Biol. Chem. 271 (16): 9460–5. doi:10.1074 / jbc.271.16.9460. PMID 8621616.

[entrez-7] A ^b „Entrez Gene: AKAP11 A kinase (PRKA) anchor protein 11".

[pmid12147701-8] A ^b ^C Tanji C, Yamamoto H, Yorioka N, Kohno N, Kikuchi K, Kikuchi A (říjen 2002). „A-kinázový kotevní protein AKAP220 se váže na glykogensyntázovou kinázu-3beta (GSK-3beta) a zprostředkovává inhibici GSK-3beta závislou na proteinkináze A“. J. Biol. Chem. 277 (40): 36955–61. doi:10,1074 / jbc.M206210200. PMID 12147701.

[pmid10209101-9] Schillace RV, Scott JD (březen 1999). „Asociace proteinové fosfatázy typu 1 PP1 s A-kinázovým kotvícím proteinem AKAP220“. Curr. Biol. 9 (6): 321–4. doi:10.1016 / S0960-9822 (99) 80141-9. PMID 10209101.

[pmid12672969-10] Alto NM, Soderling SH, Hoshi N, Langeberg LK, Fayos R, Jennings PA, Scott JD (duben 2003). „Bioinformatický design proteinu kotvícího A-kinázu in silico: silný a selektivní peptidový antagonista ukotvení proteinové kinázy A typu II“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 100 (8): 4445–50. doi:10.1073 / pnas.0330734100. PMC 153575. PMID 12672969.

[pmid10864471-11] Reinton N, Collas P, Haugen TB, Skâlhegg BS, Hansson V, Jahnsen T, Taskén K (červenec 2000). "Lokalizace nového lidského proteinu kotvícího A-kinázu, hAKAP220, během spermatogeneze". Dev. Biol. 223 (1): 194–204. doi:10,1006 / dbio.2000.9725. PMID 10864471.

[pmid26186194-12] Huttlin EL, Ting L, Bruckner RJ, Gebreab F, Gygi MP, Szpyt J a kol. (2015). „Síť BioPlex: Systematický průzkum lidského interaktomu“. Buňka. 162 (2): 425–40. doi:10.1016 / j.cell.2015.06.043. PMC 4617211. PMID 26186194.

[pmid22276202-13] Mikitova V, Levine TP (2012). „Analýza klíčových prvků motivů podobných FFAT identifikuje nové proteiny, které potenciálně vážou VAP na ER, včetně dvou AKAP a FAPP2“. PLOS ONE. 7 (1): e30455. doi:10.1371 / journal.pone.0030455. PMC 3261905. PMID 22276202.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

[11]

[12]

[13]