ADARB2 - ADARB2

ADARB2
Identifikátory
Aliasy	ADARB2, ADAR3, RED2, adenosindeamináza, RNA specifická B2 (neaktivní), adenosindeamináza RNA specifická B2 (neaktivní)
Externí ID	OMIM: 602065 MGI: 2151118 HomoloGene: 10276 Genové karty: ADARB2
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 10 (lidský)
Konec	1,737,525 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 13 (myš)
Konec	8,768,747 bp
Exprese RNA vzor
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• dvouvláknová vazba RNA; • aktivita hydrolázy; • jednořetězcová vazba RNA; • vazba kovových iontů; • aktivita adenosindeaminázy; • Vazba RNA; • aktivita dvouřetězcové RNA adenosindeaminázy; • tRNA specifická aktivita adenosindeaminázy;
Buněčná složka	• buněčné jádro; • jádro; • cytoplazma;
Biologický proces	• Zpracování mRNA; • Zpracování RNA; • úpravy adenosinu na inosin;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	105
	94191
	ENSG00000185736
	ENSMUSG00000052551
	Q9NS39
	Q9JI20
	NM_018702
	NM_001289530; NM_052977
	NP_061172
	NP_001276459; NP_443209
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Dvouřetězcová RNA specifická editáza B2 je enzym že u lidí je kódován ADARB2 gen.^[5]^[6]^[7]

Funkce

RNA-editující deamináza-2 (RED2 nebo ADARB2) je členem dvouvláknové RNA (dsRNA) adenosindeamináza rodina enzymů editujících RNA. Adenosinová deaminace pre-mRNA vede ke změně v aminokyselinové sekvenci genového produktu, která se liší od sekvence předpovídané sekvencí genomové DNA. Mezi další členy této rodiny patří DRADA (ADAR ) a RED1 (ADARB1 ).^[5]^[7]

Na rozdíl od ADAR1 a ADAR2 ADAR3 neprojevil žádnou schopnost editace in vitro. Ukázalo se, že potlačuje 5-HT2C Editace RNA in vitro prostřednictvím dosud neznámého mechanismu a může tak fungovat jako negativní regulátor.^[8]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000185736 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání Ensembl 89: ENSMUSG00000052551 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ ^A ^b Mittaz L, Antonarakis SE, Higuchi M, Scott HS (září 1997). "Lokalizace nové lidské RNA-editující deaminázy (hRED2 nebo ADARB2) na chromozom 10p15". Genetika člověka. 100 (3–4): 398–400. doi:10,1007 / s004390050523. PMID 9272162. S2CID 13098381.
^ Chen CX, Cho DS, Wang Q, Lai F, Carter KC, Nishikura K (květen 2000). „Třetí člen rodiny genů adenosindeaminázy specifické pro RNA, ADAR3, obsahuje jedno- i dvouvláknové vazebné domény RNA.“. RNA. 6 (5): 755–67. doi:10.1017 / S1355838200000170. PMC 1369955. PMID 10836796.
^ ^A ^b „Entrez Gene: ADARB2 adenosindeaminasa, RNA-specific, B2 (RED2 homolog rat)“.
^ Hong HQ, Lin JS, Chen L (únor 2015). „Regulační faktory upravující úpravu RNA adenosin-na-inozin (A-to-I)“. Zprávy o biologických vědách. 35 (2): 1–8. doi:10.1042 / BSR20140190. PMC 4381283. PMID 25662729.

externí odkazy

Člověk ADARB2 umístění genomu a ADARB2 stránka s podrobnostmi o genu v UCSC Genome Browser.

Další čtení

Valenzuela A, Blanco J, Callebaut C, Jacotot E, Lluis C, Hovanessian AG, Franco R (1997). „Obal HIV-1 gp120 a virové částice blokují vazbu adenosindeaminázy na lidský CD26“. Pokroky v experimentální medicíně a biologii. 421: 185–92. doi:10.1007/978-1-4757-9613-1_24. ISBN 978-1-4757-9615-5. PMID 9330696.
Kimura K, Wakamatsu A, Suzuki Y, Ota T, Nishikawa T, Yamashita R, Yamamoto J, Sekine M, Tsuritani K, Wakaguri H, Ishii S, Sugiyama T, Saito K, Isono Y, Irie R, Kushida N, Yoneyama T , Otsuka R, Kanda K, Yokoi T, Kondo H, Wagatsuma M, Murakawa K, Ishida S, Ishibashi T, Takahashi-Fujii A, Tanase T, Nagai K, Kikuchi H, Nakai K, Isogai T, Sugano S (leden 2006 ). „Diverzifikace transkripční modulace: rozsáhlá identifikace a charakterizace domnělých alternativních promotorů lidských genů“. Výzkum genomu. 16 (1): 55–65. doi:10,1101 / gr. 4039406. PMC 1356129. PMID 16344560.
Andersen JS, Lam YW, Leung AK, Ong SE, Lyon CE, Lamond AI, Mann M (leden 2005). "Dynamika nukleolárního proteomu". Příroda. 433 (7021): 77–83. doi:10.1038 / nature03207. PMID 15635413. S2CID 4344740.
Herrera C, Morimoto C, Blanco J, Mallol J, Arenzana F, Lluis C, Franco R (červen 2001). "Kompozice CXCR4 a CD26 v lidských lymfocytech". The Journal of Biological Chemistry. 276 (22): 19532–9. doi:10,1074 / jbc.M004586200. PMID 11278278.
Blanco J, Valenzuela A, Herrera C, Lluís C, Hovanessian AG, Franco R (červenec 2000). „HIV-1 gp120 inhibuje vazbu adenosindeaminázy na CD26 mechanismem modulovaným expresí CD4 a CXCR4“. FEBS Dopisy. 477 (1–2): 123–8. doi:10.1016 / S0014-5793 (00) 01751-8. PMID 10899322. S2CID 22229481.
Valenzuela A, Blanco J, Callebaut C, Jacotot E, Lluis C, Hovanessian AG, Franco R (duben 1997). „Vazba adenosindeaminázy na lidský CD26 je inhibována HIV-1 obalovým glykoproteinem gp120 a virovými částicemi“. Journal of Immunology. 158 (8): 3721–9. PMID 9103436.
Hillier LD, Lennon G, Becker M, Bonaldo MF, Chiapelli B, Chissoe S, Dietrich N, DuBuque T, Favello A, Gish W, Hawkins M, Hultman M, Kucaba T, Lacy M, Le M, Le N, Mardis E Moore B, Morris M, Parsons J, Prange C, Rifkin L, Rohlfing T, Schellenberg K, Bento Soares M, Tan F, Thierry-Meg J, Trevaskis E, Underwood K, Wohldman P, Waterston R, Wilson R, Marra M (září 1996). „Generování a analýza 280 000 lidských sekvenčních značek“. Výzkum genomu. 6 (9): 807–28. doi:10,1101 / gr. 6.807. PMID 8889549.

Tento článek o gen na lidský chromozom 10 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000185736 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání Ensembl 89: ENSMUSG00000052551 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid9272162-5] A ^b Mittaz L, Antonarakis SE, Higuchi M, Scott HS (září 1997). "Lokalizace nové lidské RNA-editující deaminázy (hRED2 nebo ADARB2) na chromozom 10p15". Genetika člověka. 100 (3–4): 398–400. doi:10,1007 / s004390050523. PMID 9272162. S2CID 13098381.

[pmid10836796-6] Chen CX, Cho DS, Wang Q, Lai F, Carter KC, Nishikura K (květen 2000). „Třetí člen rodiny genů adenosindeaminázy specifické pro RNA, ADAR3, obsahuje jedno- i dvouvláknové vazebné domény RNA.“. RNA. 6 (5): 755–67. doi:10.1017 / S1355838200000170. PMC 1369955. PMID 10836796.

[entrez-7] A ^b „Entrez Gene: ADARB2 adenosindeaminasa, RNA-specific, B2 (RED2 homolog rat)“.

[8] Hong HQ, Lin JS, Chen L (únor 2015). „Regulační faktory upravující úpravu RNA adenosin-na-inozin (A-to-I)“. Zprávy o biologických vědách. 35 (2): 1–8. doi:10.1042 / BSR20140190. PMC 4381283. PMID 25662729.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]