ZMYND11 - ZMYND11

ZMYND11
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	4NS5, 5 HDA
Identifikátory
Aliasy	ZMYND11, BRAM1, BS69, MRD30, zinkový prst typu MYND obsahující 11
Externí ID	OMIM: 608668 MGI: 1913755 HomoloGene: 4828 Genové karty: ZMYND11
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 10 (lidský)
Konec	254,637 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 13 (myš)
Konec	9,765,330 bp
Exprese RNA vzor
	; ;
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• Vazba DNA; • Vazba DNA specifické pro regulační oblast RNA polymerázy II; • vazba chromatinu; • GO: Aktivita transkripčního koregulátoru 0001104; • vazba kovových iontů; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • GO: Aktivita transkripčního corepresoru 0001106; • histonová vazba; • dvouřetězcová vazba DNA; • vazba iontů zinku; • vazba methylovaného histonu;
Buněčná složka	• nukleoplazma; • chromozóm; • buněčné jádro;
Biologický proces	• regulace transkripce, DNA-šablony; • negativní regulace vnější apoptotické signální dráhy; • negativní regulace signalizace I-kappaB kinázy / NF-kappaB; • transkripce, chráněná DNA; • negativní regulace JNK kaskády; • buněčný cyklus; • buněčná proliferace; • GO: virový proces 0022415; • regulace prodlužování transkripce z promotoru RNA polymerázy II; • obranná reakce na virus; • negativní regulace transkripce templátované nukleovou kyselinou; • organizace chromatinu; • negativní regulace transkripce, chráněná DNA;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	10771
	66505
	ENSG00000015171
	ENSMUSG00000021156
	Q15326
	Q8R5C8
NM_001202464; NM_001202465; NM_001202466; NM_001202467; NM_001202468;
	NM_006624; NM_212479; NM_001330057
NM_001199141; NM_144516; NM_001347470; NM_001347471; NM_001347472;
	NM_001347473; NM_001347474; NM_001347476; NM_001347477; NM_001347479; NM_001347480; NM_001347481
NP_001189393; NP_001189394; NP_001189395; NP_001189396; NP_001189397;
	NP_001316986; NP_006615; NP_997644; NP_001357026; NP_001357027; NP_001357028; NP_001357029; NP_001357030; NP_001357031; NP_001357032; NP_001357033; NP_001357034; NP_001357035; NP_001357036; NP_001357037; NP_001357038; NP_001357039; NP_001357040; NP_001357041; NP_001357042; NP_001357043; NP_001357044; NP_001357045; NP_001357046; NP_001357047; NP_001357048; NP_001357049; NP_001357050; NP_001357051; NP_001357052; NP_001357053
NP_001186070; NP_001334399; NP_001334400; NP_001334401; NP_001334402;
	NP_001334403; NP_001334405; NP_001334406; NP_001334408; NP_001334409; NP_001334410; NP_653099
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Protein obsahující MYND doménu se zinkovým prstem 11 je protein že u lidí je kódován ZMYND11 gen.^[5]^[6]^[7]

Funkce

Protein kódovaný tímto genem byl nejprve identifikován podle jeho schopnosti vázat se na protein adenoviru E1A. Protein se lokalizuje do jádra. Funguje jako transkripční represor a exprese E1A inhibuje tuto represi. Alternativně byly identifikovány sestřihové varianty transkriptu kódující různé izoformy.^[7]

Interakce

ZMYND11 bylo prokázáno komunikovat s:

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000015171 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000021156 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Hateboer G, Gennissen A, Ramos YF, Kerkhoven RM, Sonntag-Buck V, Stunnenberg HG, Bernards R (červenec 1995). „BS69, nový protein asociovaný s adenovirem E1A, který inhibuje transaktivaci E1A“. Časopis EMBO. 14 (13): 3159–69. doi:10.1002 / j.1460-2075.1995.tb07318.x. PMC 394377. PMID 7621829.
^ Masselink H, Bernards R (březen 2000). „Adenovirový vazebný protein E1A BS69 je jádrovým represorem transkripce prostřednictvím náboru N-CoR“. Onkogen. 19 (12): 1538–46. doi:10.1038 / sj.onc.1203421. PMID 10734313.
^ ^A ^b „Entrez Gene: ZMYND11 zinkový prst, doména MYND obsahující 11“.
^ ^A ^b Kurozumi K, Nishita M, Yamaguchi K, Fujita T, Ueno N, Shibuya H (duben 1998). "BRAM1, molekula spojená s receptorem BMP zapojená do signalizace BMP". Geny do buněk. 3 (4): 257–64. doi:10.1046 / j.1365-2443.1998.00186.x. PMID 9663660. S2CID 29818690.
^ Hughes-Davies L, Huntsman D, Ruas M, Fuks F, Bye J, Chin SF, Milner J, Brown LA, Hsu F, Gilks B, Nielsen T, Schulzer M, Chia S, Ragaz J, Cahn A, Linger L, Ozdag H, Cattaneo E, Jordanova ES, Schuuring E, Yu DS, Venkitaraman A, Ponder B, Doherty A, Aparicio S, Bentley D, Theillet C, Ponting CP, Caldas C, Kouzarides T (listopad 2003). „EMSY spojuje cestu BRCA2 se sporadickou rakovinou prsu a vaječníků“. Buňka. 115 (5): 523–35. doi:10.1016 / s0092-8674 (03) 00930-9. PMID 14651845. S2CID 18911371.
^ Wei G, Schaffner AE, Baker KM, Mansky KC, Ostrowski MC (2003). "Ets-2 interaguje s ko-represorem BS69, aby potlačil expresi cílového genu". Protinádorový výzkum. 23 (3A): 2173–8. PMID 12894593.
^ Wen, Hong; Li, Yuanyuan; Xi, Yuanxin; Jiang, Shiming; Stratton, Sabrina; Peng, Danni; Tanaka, Kaori; Ren, Yongfeng; Xia, Zheng; Wu, červen; Li, Bing; Barton, Michelle C .; Li, Wei; Li, Haitao; Shi, Xiaobing (2014). „ZMYND11 spojuje histon H3.3K36me3 s prodloužením transkripce a potlačením nádoru“. Příroda. 508 (7495): 263–268. doi:10.1038 / příroda13045. PMC 4142212. PMID 24590075.

Další čtení

Bonaldo MF, Lennon G, Soares MB (září 1996). „Normalizace a odčítání: dva přístupy k usnadnění objevování genů“. Výzkum genomu. 6 (9): 791–806. doi:10,1101 / gr. 6.9.791. PMID 8889548.
Kurozumi K, Nishita M, Yamaguchi K, Fujita T, Ueno N, Shibuya H (duben 1998). "BRAM1, molekula spojená s receptorem BMP zapojená do signalizace BMP". Geny do buněk. 3 (4): 257–64. doi:10.1046 / j.1365-2443.1998.00186.x. PMID 9663660. S2CID 29818690.
Lo KW, Naisbitt S, Fan JS, Sheng M, Zhang M (duben 2001). „Lehký řetězec 8-kDa dyneinu se váže na své cíle pomocí konzervovaného (K / R) XTQT motivu“. The Journal of Biological Chemistry. 276 (17): 14059–66. doi:10,1074 / jbc.M010320200. PMID 11148209.
Ansieau S, Leutz A (únor 2002). „Konzervovaná Myndova doména BS69 váže buněčné a onkovirové proteiny prostřednictvím společného motivu PXLXP“. The Journal of Biological Chemistry. 277 (7): 4906–10. doi:10,1074 / jbc.M110078200. PMID 11733528.
Wei G, Schaffner AE, Baker KM, Mansky KC, Ostrowski MC (2003). "Ets-2 interaguje s ko-represorem BS69, aby potlačil expresi cílového genu". Protinádorový výzkum. 23 (3A): 2173–8. PMID 12894593.
Hughes-Davies L, Huntsman D, Ruas M, Fuks F, Bye J, Chin SF, Milner J, Brown LA, Hsu F, Gilks B, Nielsen T, Schulzer M, Chia S, Ragaz J, Cahn A, Linger L, Ozdag H, Cattaneo E, Jordanova ES, Schuuring E, Yu DS, Venkitaraman A, Ponder B, Doherty A, Aparicio S, Bentley D, Theillet C, Ponting CP, Caldas C, Kouzarides T (listopad 2003). „EMSY spojuje cestu BRCA2 se sporadickou rakovinou prsu a vaječníků“. Buňka. 115 (5): 523–35. doi:10.1016 / S0092-8674 (03) 00930-9. PMID 14651845. S2CID 18911371.
Colland F, Jacq X, Trouplin V, Mougin C, Groizeleau C, Hamburger A, Meil A, Wojcik J, Legrain P, Gauthier JM (červenec 2004). "Funkční proteomické mapování lidské signální dráhy". Výzkum genomu. 14 (7): 1324–32. doi:10,1101 / gr. 2334104. PMC 442148. PMID 15231748.
Rual JF, Venkatesan K, Hao T, Hirozane-Kishikawa T, Dricot A, Li N, Berriz GF, Gibbons FD, Dreze M, Ayivi-Guedehoussou N, Klitgord N, Simon C, Boxem M, Milstein S, Rosenberg J, Goldberg DS, Zhang LV, Wong SL, Franklin G, Li S, Albala JS, Lim J, Fraughton C, Llamosas E, Cevik S, Bex C, Lamesch P, Sikorski RS, Vandenhaute J, Zoghbi HY, Smolyar A, Bosak S, Sequerra R, Doucette-Stamm L, Cusick ME, Hill DE, Roth FP, Vidal M (říjen 2005). „Směrem k mapě lidské interakční sítě protein-protein v měřítku proteomu“. Příroda. 437 (7062): 1173–8. doi:10.1038 / nature04209. PMID 16189514. S2CID 4427026.
Isobe T, Uchida C, Hattori T, Kitagawa K, Oda T, Kitagawa M (leden 2006). „Ubiquitin-dependentní degradace proteinu adenoviru E1A je inhibována BS69“. Sdělení o biochemickém a biofyzikálním výzkumu. 339 (1): 367–74. doi:10.1016 / j.bbrc.2005.11.028. hdl:10271/294. PMID 16300738.
Wan J, Zhang W, Wu L, Bai T, Zhang M, Lo KW, Chui YL, Cui Y, Tao Q, Yamamoto M, Akira S, Wu Z (leden 2006). „BS69, specifický adaptér v dráze c-Jun N-terminální kinázy zprostředkované proteinem latentní membrány 1“. Molekulární a buněčná biologie. 26 (2): 448–56. doi:10.1128 / MCB.26.2.448-456.2006. PMC 1346911. PMID 16382137.
Velasco G, Grkovic S, Ansieau S (červen 2006). „Nové poznatky o funkcích BS69“. The Journal of Biological Chemistry. 281 (24): 16546–50. doi:10,1074 / jbc.M600573200. PMID 16565076.

Tento článek o gen na lidský chromozom 10 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000015171 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000021156 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid7621829-5] Hateboer G, Gennissen A, Ramos YF, Kerkhoven RM, Sonntag-Buck V, Stunnenberg HG, Bernards R (červenec 1995). „BS69, nový protein asociovaný s adenovirem E1A, který inhibuje transaktivaci E1A“. Časopis EMBO. 14 (13): 3159–69. doi:10.1002 / j.1460-2075.1995.tb07318.x. PMC 394377. PMID 7621829.

[pmid10734313-6] Masselink H, Bernards R (březen 2000). „Adenovirový vazebný protein E1A BS69 je jádrovým represorem transkripce prostřednictvím náboru N-CoR“. Onkogen. 19 (12): 1538–46. doi:10.1038 / sj.onc.1203421. PMID 10734313.

[entrez-7] A ^b „Entrez Gene: ZMYND11 zinkový prst, doména MYND obsahující 11“.

[pmid9663660-8] A ^b Kurozumi K, Nishita M, Yamaguchi K, Fujita T, Ueno N, Shibuya H (duben 1998). "BRAM1, molekula spojená s receptorem BMP zapojená do signalizace BMP". Geny do buněk. 3 (4): 257–64. doi:10.1046 / j.1365-2443.1998.00186.x. PMID 9663660. S2CID 29818690.

[pmid14651845-9] Hughes-Davies L, Huntsman D, Ruas M, Fuks F, Bye J, Chin SF, Milner J, Brown LA, Hsu F, Gilks B, Nielsen T, Schulzer M, Chia S, Ragaz J, Cahn A, Linger L, Ozdag H, Cattaneo E, Jordanova ES, Schuuring E, Yu DS, Venkitaraman A, Ponder B, Doherty A, Aparicio S, Bentley D, Theillet C, Ponting CP, Caldas C, Kouzarides T (listopad 2003). „EMSY spojuje cestu BRCA2 se sporadickou rakovinou prsu a vaječníků“. Buňka. 115 (5): 523–35. doi:10.1016 / s0092-8674 (03) 00930-9. PMID 14651845. S2CID 18911371.

[pmid12894593-10] Wei G, Schaffner AE, Baker KM, Mansky KC, Ostrowski MC (2003). "Ets-2 interaguje s ko-represorem BS69, aby potlačil expresi cílového genu". Protinádorový výzkum. 23 (3A): 2173–8. PMID 12894593.

[11] Wen, Hong; Li, Yuanyuan; Xi, Yuanxin; Jiang, Shiming; Stratton, Sabrina; Peng, Danni; Tanaka, Kaori; Ren, Yongfeng; Xia, Zheng; Wu, červen; Li, Bing; Barton, Michelle C .; Li, Wei; Li, Haitao; Shi, Xiaobing (2014). „ZMYND11 spojuje histon H3.3K36me3 s prodloužením transkripce a potlačením nádoru“. Příroda. 508 (7495): 263–268. doi:10.1038 / příroda13045. PMC 4142212. PMID 24590075.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

[11]