ZKSCAN5 - ZKSCAN5

ZKSCAN5
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	2EM5, 2EMM, 2EMZ, 2EN3, 2EOM, 2EON, 2EOO, 2YSO, 2YTG
Identifikátory
Aliasy	ZKSCAN5, ZFP95, ZNF914, ZSCAN37, ZFP-95, zinkový prst s doménami KRAB a SCAN 5
Externí ID	OMIM: 611272 MGI: 107533 HomoloGene: 8734 Genové karty: ZKSCAN5
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 7 (lidský)
Konec	99,534,700 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 5 (myš)
Konec	145,221,750 bp
Exprese RNA vzor
	; ;
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• Vazba DNA; • vazba iontů zinku; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • vazba kovových iontů; • vazba nukleové kyseliny; • GO: 0001131, GO: 0001151, GO: 0001130, GO: 0001204 Aktivita transkripčního faktoru vázajícího DNA; • GO: 0001200, GO: 0001133, GO: 0001201 Aktivita transkripčního faktoru vázajícího DNA, specifická pro RNA polymerázu II;
Buněčná složka	• intracelulární; • buněčné jádro;
Biologický proces	• transkripce, chráněná DNA; • regulace transkripce, DNA-šablony; • regulace transkripce z promotoru RNA polymerázy II;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	23660
	22757
	ENSG00000196652
	ENSMUSG00000055991
	Q9Y2L8
	Q9Z1D8
	NM_014569; NM_145102; NM_001318082; NM_001318083; NM_001318084
NM_001167944; NM_016683; NM_001359187; NM_001359188; NM_001359189;
	NM_001359190; NM_001359191; NM_001359192
	NP_001305011; NP_001305012; NP_001305013; NP_055384; NP_659570
NP_001161416; NP_057892; NP_001346116; NP_001346117; NP_001346118;
	NP_001346119; NP_001346120; NP_001346121
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Protein se zinkovým prstem s doménami KRAB a SCAN 5 je protein že u lidí je kódován ZKSCAN5 gen.^[5]^[6]

Tento gen kóduje a zinkový prst protein z rodiny Krüppel. Protein obsahuje SCAN box a KRAB Doména. Podobný protein u myší je rozdílně exprimován v spermatogenezi. Dva alternativně sestříhané varianty přepisu lišící se pouze v pět nepřekládaných oblastí (5 'UTR) byly popsány. Byly nalezeny další varianty, ale jejich sekvence plné délky nebyly stanoveny.^[6]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000196652 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000055991 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Dreyer SD, Zheng Q, Zabel B, Winterpacht A, Lee B (únor 2000). "Izolace, charakterizace a mapování genu pro zinkový prst, ZFP95, obsahující jak SCAN box, tak alternativně sestříhanou KRAB A doménu". Genomika. 62 (1): 119–22. doi:10.1006 / geno.1999.5981. PMID 10585779.
^ ^A ^b „Entrez Gene: ZKSCAN5 zinkový prst s doménami KRAB a SCAN 5“.

Další čtení

Bonaldo MF, Lennon G, Soares MB (1997). „Normalizace a odčítání: dva přístupy k usnadnění objevování genů“. Genome Res. 6 (9): 791–806. doi:10,1101 / gr. 6.9.791. PMID 8889548.
Nagase T, Ishikawa K, Suyama M a kol. (1999). „Predikce kódujících sekvencí neidentifikovaných lidských genů. XIII. Kompletní sekvence 100 nových cDNA klonů z mozku, které kódují velké proteiny in vitro“. DNA Res. 6 (1): 63–70. doi:10.1093 / dnares / 6.1.63. PMID 10231032.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH a kol. (2003). „Generování a počáteční analýza více než 15 000 lidských a myších cDNA sekvencí plné délky“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (26): 16899–903. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
Scherer SW, Cheung J, MacDonald JR a kol. (2003). „Lidský chromozom 7: sekvence DNA a biologie“. Věda. 300 (5620): 767–72. doi:10.1126 / science.1083423. PMC 2882961. PMID 12690205.
Hillier LW, Fulton RS, Fulton LA a kol. (2003). „Sekvence DNA lidského chromozomu 7“. Příroda. 424 (6945): 157–64. doi:10.1038 / nature01782. PMID 12853948.
Ota T, Suzuki Y, Nishikawa T a kol. (2004). „Kompletní sekvenování a charakterizace 21 243 lidských cDNA plné délky“. Nat. Genet. 36 (1): 40–5. doi:10.1038 / ng1285. PMID 14702039.
Thompson EE, Kuttab-Boulos H, Yang L a kol. (2006). „Sekvenční diverzita a struktura haplotypu v lidském klastru CYP3A“. Farmakogenomika J.. 6 (2): 105–14. doi:10.1038 / sj.tpj.6500347. PMID 16314882.
Kimura K, Wakamatsu A, Suzuki Y a kol. (2006). „Diverzifikace transkripční modulace: rozsáhlá identifikace a charakterizace domnělých alternativních promotorů lidských genů“. Genome Res. 16 (1): 55–65. doi:10,1101 / gr. 4039406. PMC 1356129. PMID 16344560.

Tento článek o gen na lidský chromozom 7 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000196652 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000055991 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid10585779-5] Dreyer SD, Zheng Q, Zabel B, Winterpacht A, Lee B (únor 2000). "Izolace, charakterizace a mapování genu pro zinkový prst, ZFP95, obsahující jak SCAN box, tak alternativně sestříhanou KRAB A doménu". Genomika. 62 (1): 119–22. doi:10.1006 / geno.1999.5981. PMID 10585779.

[entrez-6] A ^b „Entrez Gene: ZKSCAN5 zinkový prst s doménami KRAB a SCAN 5“.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]