VPS29 - VPS29 - Wikipedia
VPS29 je člověk gen kódování vakuolárního třídění proteinů protein Vps29, součást retromer komplex.[5]
Kvasnicový homolog
Homologní protein (ten, který plní stejnou funkci) v kvasinkách je Vakuový proteinový třídění 29 homolog (S. cerevisiae).[6]
Funkce
VPS29 patří do skupiny genů kódujících proteiny vakuolárního třídění proteinů (VPS), které, když jsou funkčně narušeny, narušují efektivní dodávání vakuolární hydrolázy.[7] Protein kódovaný tímto genem, Vps29, je součástí velkého multimerního komplexu, nazývaného retromer komplex, který se podílí na retrográdním transportu proteinů z endosomů do trans-Golgiho síť. Vps29 se může podílet na tvorbě vnitřního pláště retromerového pláště retrográdních váčků opouštějících prevakulární část.[8] Alternativní spojení varianty kódující různé izoformy a použití více polyadenylace pro tento gen byly nalezeny stránky.[6]
Reference
- ^ A b C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000111237 - Ensembl, Květen 2017
- ^ A b C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000029462 - Ensembl, Květen 2017
- ^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
- ^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
- ^ Edgar AJ, Polak JM (listopad 2000). "Lidské homology kvasinkového vakuolárního proteinu třídění 29 a 35". Biochem. Biophys. Res. Commun. 277 (3): 622–30. doi:10,1006 / bbrc.2000.3727. PMID 11062004.
- ^ A b "Entrez Gene: VPS29 vakuolární proteinový třídění 29 homolog (S. cerevisiae)".
- ^ Haft CR, de la Luz Sierra M, Bafford R, Lesniak MA, Barr VA, Taylor SI (prosinec 2000). „Lidské ortology kvasinek Vakuové proteiny třídění proteinů Vps26, 29 a 35: Sestavování do multimerních komplexů“. Mol. Biol. Buňka. 11 (12): 4105–16. doi:10,1091 / mbc.11.12.4105. PMC 15060. PMID 11102511.
- ^ Bonifacino JS, Hurley JH (srpen 2008). "Retromer". Curr. Opin. Cell Biol. 20 (4): 427–36. doi:10.1016 / j.ceb.2008.03.009. PMC 2833274. PMID 18472259.
Další čtení
- Seaman MN, McCaffery JM, Emr SD (1998). „Komplex membránového nátěru nezbytný pro retrográdní transport endosomu po Golgiho v kvasnicích“. J. Cell Biol. 142 (3): 665–81. doi:10.1083 / jcb.142.3.665. PMC 2148169. PMID 9700157.
- Edgar AJ, Polak JM (2000). "Lidské homology kvasinkového vakuolárního proteinu třídění 29 a 35". Biochem. Biophys. Res. Commun. 277 (3): 622–30. doi:10,1006 / bbrc.2000,3727. PMID 11062004.
- Hartley JL, Temple GF, Brasch MA (2001). „Klonování DNA pomocí in vitro specifické specifické rekombinace“. Genome Res. 10 (11): 1788–95. doi:10,1101 / gr. 143000. PMC 310948. PMID 11076863.
- Haft CR, de la Luz Sierra M, Bafford R, et al. (2001). „Lidské ortology kvasinek Vakuové proteiny třídění proteinů Vps26, 29 a 35: Sestavování do multimerních komplexů“. Mol. Biol. Buňka. 11 (12): 4105–16. doi:10,1091 / mbc.11.12.4105. PMC 15060. PMID 11102511.
- Wiemann S, Weil B, Wellenreuther R a kol. (2001). „Směrem ke katalogu lidských genů a proteinů: Sekvenování a analýza 500 nových kompletních lidských cDNA kódujících proteiny“. Genome Res. 11 (3): 422–35. doi:10,1101 / gr. GR1547R. PMC 311072. PMID 11230166.
- Simpson JC, Wellenreuther R, Poustka A a kol. (2001). „Systematická subcelulární lokalizace nových proteinů identifikovaných sekvenováním cDNA ve velkém měřítku“. EMBO Rep. 1 (3): 287–92. doi:10.1093 / embo-reports / kvd058. PMC 1083732. PMID 11256614.
- Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH a kol. (2003). „Generování a počáteční analýza více než 15 000 lidských a myších cDNA sekvencí plné délky“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (26): 16899–903. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
- Vergés M, Luton F, Gruber C a kol. (2004). „Savčí retromer reguluje transcytózu polymerního imunoglobulinového receptoru“. Nat. Cell Biol. 6 (8): 763–9. doi:10.1038 / ncb1153. PMID 15247922. S2CID 22296469.
- Mingot JM, Bohnsack MT, Jäkle U, Görlich D (2005). „Exportin 7 definuje novou obecnou cestu exportu jaderných zbraní“. EMBO J.. 23 (16): 3227–36. doi:10.1038 / sj.emboj.7600338. PMC 514512. PMID 15282546.
- Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA a kol. (2004). „Stav, kvalita a rozšíření projektu cDNA NIH v plné délce: Sbírka genů savců (MGC)“. Genome Res. 14 (10B): 2121–7. doi:10,1101 / gr. 2596504. PMC 528928. PMID 15489334.
- Wiemann S, Arlt D, Huber W a kol. (2004). „Od ORFeome k biologii: potrubí funkční genomiky“. Genome Res. 14 (10B): 2136–44. doi:10,1101 / gr. 2576704. PMC 528930. PMID 15489336.
- Wang D, Guo M, Liang Z a kol. (2005). „Krystalová struktura proteinu 29 pro třídění lidského vakuolárního proteinu odhaluje záhyb podobný fosfodiesteráze / nukleáze a dvě interakční místa protein-protein“. J. Biol. Chem. 280 (24): 22962–7. doi:10,1074 / jbc.M500464200. PMID 15788412.
- Mehrle A, Rosenfelder H, Schupp I a kol. (2006). „Databáze LIFEdb v roce 2006“. Nucleic Acids Res. 34 (Problém s databází): D415–8. doi:10.1093 / nar / gkj139. PMC 1347501. PMID 16381901.
- Damen E, Krieger E, Nielsen JE a kol. (2006). „Lidská složka Vps29 retromeru je metalofosfoesteráza pro peptid substrátového substrátu nezávislého na kationu manosového 6-fosfátu“. Biochem. J. 398 (3): 399–409. doi:10.1042 / BJ20060033. PMC 1559457. PMID 16737443.
- Rojas R, Kametaka S, Haft CR, Bonifacino JS (2007). „Zaměnitelné, ale základní funkce SNX1 a SNX2 ve sdružení retromeru s endosomy a obchodování s manosovými 6-fosfátovými receptory“. Mol. Buňka. Biol. 27 (3): 1112–24. doi:10.1128 / MCB.00156-06. PMC 1800681. PMID 17101778.
- Hierro A, Rojas AL, Rojas R a kol. (2007). „Funkční architektura komplexu pro rozpoznávání nákladu retromeru“. Příroda. 449 (7165): 1063–7. doi:10.1038 / nature06216. PMC 2377034. PMID 17891154.
Galerie PDB | |
|---|---|
|
 | Tento článek o gen na lidský chromozom 12 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to. |