VPS11 - VPS11

VPS11
Identifikátory
Aliasy	VPS11, END1, PEP5, RNF108, hHLD12, základní podjednotka CORVET / HOPS, základní podjednotka VPS11 komplexů CORVET a HOPS
Externí ID	OMIM: 608549 MGI: 1918982 HomoloGene: 6673 Genové karty: VPS11
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 11 (lidský)
Konec	119,081,978 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 9 (myš)
Konec	44,361,670 bp
Exprese RNA vzor
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• vazba nukleotidů; • vazba na bílkoviny, přemostění; • specifické vazby na proteinovou doménu; • vazba kovových iontů; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • syntaxinová vazba;
Buněčná složka	• Komplex HOPS; • endozom; • pozdní endosom; • membrána pozdního endozomu; • membrána; • endocytický váček; • autofagozom; • lysozomální membrána; • časný endosom; • lysozom; • cytoplazmatický váček; • vezikul potažený klatrinem;
Biologický proces	• fúze endozomálních vezikul; • regulace stability proteinu; • regulace montáže organel; • pozitivní regulace cílení proteinů na mitochondrie; • transport endosomu k lysozomu; • autofagie; • pozitivní regulace raného endosomu na transport pozdního endosomu; • transport bílkovin; • transport intracelulárních proteinů; • transport zprostředkovaný vezikuly; • regulace sestavy komplexu SNARE; • organizace lysozomů; • organizace endosomu; • dokování vezikul zapojené do exocytózy; • doprava;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	55823
	71732
	ENSG00000160695; ENSG00000280616
	ENSMUSG00000032127
	Q9H270
	Q91W86
	NM_001290185; NM_021729
	NM_027889; NM_001357393
NP_001277114; NP_068375; NP_001365147; NP_001365148; NP_001365149;
	NP_001365150
	NP_082165; NP_001344322
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Homolog proteinu 11 spojeného s tříděním vakua je protein že u lidí je kódován VPS11 gen.^[5]

Funkce

Třídění bílkovin zprostředkovaných vezikuly hraje důležitou roli při segregaci intracelulárních molekul do odlišných organel. Genetické studie v kvasinkách identifikovaly více než 40 genů vakuolárního třídění proteinů (VPS) zapojených do transportu vezikul do vakuol. Tento gen kóduje lidský homolog proteinu Vps11 třídy C kvasinek. Proteiny Vps třídy C savců jsou převážně asociovány s pozdními endosomy / lysozomy a stejně jako jejich protějšky z kvasinek mohou zprostředkovat kroky přenosu vezikul v cestě endosom / lysozom.^[5]

Interakce

Bylo prokázáno, že VPS11 komunikovat s VPS18,^[6] VPS33A^[6] a STX7.^[6]

Reference

^ ^A ^b ^C ENSG00000280616 GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000160695, ENSG00000280616 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000032127 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ ^A ^b "Entrez Gene: VPS11 vakuolární protein třídění 11 homolog (S. cerevisiae)".
^ ^A ^b ^C Kim BY, Krämer H, Yamamoto A, Kominami E, Kohsaka S, Akazawa C (srpen 2001). „Molekulární charakterizace savčích homologů Vps proteinů třídy C, které interagují se syntaxinem-7“. J. Biol. Chem. 276 (31): 29393–402. doi:10,1074 / jbc.M101778200. PMID 11382755.

Další čtení

Maruyama K, Sugano S (1994). „Oligo-capping: jednoduchá metoda k nahrazení struktury cap eukaryotických mRNA oligoribonukleotidy“. Gen. 138 (1–2): 171–4. doi:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID 8125298.
Suzuki Y, Yoshitomo-Nakagawa K, Maruyama K, Suyama A, Sugano S (1997). "Konstrukce a charakterizace knihovny cDNA obohacené o celou délku a 5'-end". Gen. 200 (1–2): 149–56. doi:10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3. PMID 9373149.
Huizing M, Didier A, Walenta J, Anikster Y, Gahl WA, Krämer H (2001). "Molekulární klonování a charakterizace lidských VPS18, VPS 11, VPS16 a VPS33". Gen. 264 (2): 241–7. doi:10.1016 / S0378-1119 (01) 00333-X. PMID 11250079.
Kim BY, Krämer H, Yamamoto A, Kominami E, Kohsaka S, Akazawa C (2001). „Molekulární charakterizace savčích homologů Vps proteinů třídy C, které interagují se syntaxinem-7“. J. Biol. Chem. 276 (31): 29393–402. doi:10,1074 / jbc.M101778200. PMID 11382755.
Kim BY, Ueda M, Kominami E, Akagawa K, Kohsaka S, Akazawa C (2004). "Identifikace myší Vps16 a biochemická charakterizace komplexu Vps savců třídy C". Biochem. Biophys. Res. Commun. 311 (3): 577–82. doi:10.1016 / j.bbrc.2003.10.030. PMID 14623309.
Lehner B, Sanderson CM (2004). „Rámec interakce proteinů pro degradaci lidské mRNA“. Genome Res. 14 (7): 1315–23. doi:10,1101 / gr. 2122004. PMC 442147. PMID 15231747.
Wan D, Gong Y, Qin W, Zhang P, Li J, Wei L, Zhou X, Li H, Qiu X, Zhong F, He L, Yu J, Yao G, Jiang H, Qian L, Yu Y, Shu H , Chen X, Xu H, Guo M, Pan Z, Chen Y, Ge C, Yang S, Gu J (2004). „Rozsáhlý screening transfekce cDNA na geny související s vývojem a progresí rakoviny“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 101 (44): 15724–9. doi:10.1073 / pnas.0404089101. PMC 524842. PMID 15498874.
Rual JF, Venkatesan K, Hao T, Hirozane-Kishikawa T, Dricot A, Li N, Berriz GF, Gibbons FD, Dreze M, Ayivi-Guedehoussou N, Klitgord N, Simon C, Boxem M, Milstein S, Rosenberg J, Goldberg DS, Zhang LV, Wong SL, Franklin G, Li S, Albala JS, Lim J, Fraughton C, Llamosas E, Cevik S, Bex C, Lamesch P, Sikorski RS, Vandenhaute J, Zoghbi HY, Smolyar A, Bosak S, Sequerra R, Doucette-Stamm L, Cusick ME, Hill DE, Roth FP, Vidal M (2005). „Směrem k mapě interakční sítě lidský protein-protein v měřítku proteomu“. Příroda. 437 (7062): 1173–8. doi:10.1038 / nature04209. PMID 16189514. S2CID 4427026.

Tento článek o gen na lidský chromozom 11 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C ENSG00000280616 GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000160695, ENSG00000280616 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000032127 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[entrez-5] A ^b "Entrez Gene: VPS11 vakuolární protein třídění 11 homolog (S. cerevisiae)".

[pmid11382755-6] A ^b ^C Kim BY, Krämer H, Yamamoto A, Kominami E, Kohsaka S, Akazawa C (srpen 2001). „Molekulární charakterizace savčích homologů Vps proteinů třídy C, které interagují se syntaxinem-7“. J. Biol. Chem. 276 (31): 29393–402. doi:10,1074 / jbc.M101778200. PMID 11382755.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]